MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
133001	NC_010524	GGT	2	6	4732447	4732452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060888
133002	NC_010524	T	6	6	4732472	4732477	0 %	100 %	0 %	0 %	171060888
133003	NC_010524	GCC	2	6	4732549	4732554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060888
133004	NC_010524	GCC	2	6	4732585	4732590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060888
133005	NC_010524	GC	3	6	4732644	4732649	0 %	0 %	50 %	50 %	171060888
133006	NC_010524	TCG	2	6	4732695	4732700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133007	NC_010524	CTG	2	6	4732703	4732708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133008	NC_010524	TCG	2	6	4732722	4732727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133009	NC_010524	CTG	2	6	4732730	4732735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133010	NC_010524	ACC	2	6	4732781	4732786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060888
133011	NC_010524	CGGC	2	8	4732818	4732825	0 %	0 %	50 %	50 %	171060888
133012	NC_010524	CGG	2	6	4732843	4732848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060888
133013	NC_010524	GCC	2	6	4732858	4732863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060888
133014	NC_010524	CGG	2	6	4732873	4732878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060888
133015	NC_010524	GCC	2	6	4732918	4732923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060888
133016	NC_010524	CGA	2	6	4732927	4732932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133017	NC_010524	CCGG	2	8	4732943	4732950	0 %	0 %	50 %	50 %	171060888
133018	NC_010524	GCC	2	6	4732993	4732998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060888
133019	NC_010524	CGG	2	6	4733016	4733021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060888
133020	NC_010524	GCC	2	6	4733057	4733062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060888
133021	NC_010524	TGA	2	6	4733082	4733087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060888
133022	NC_010524	TGC	3	9	4733115	4733123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133023	NC_010524	TTC	2	6	4733129	4733134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060888
133024	NC_010524	TGA	2	6	4733145	4733150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060888
133025	NC_010524	TCG	2	6	4733151	4733156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133026	NC_010524	CCGA	2	8	4733192	4733199	25 %	0 %	25 %	50 %	171060888
133027	NC_010524	GGC	2	6	4733200	4733205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060888
133028	NC_010524	GC	3	6	4733214	4733219	0 %	0 %	50 %	50 %	171060888
133029	NC_010524	CGG	2	6	4733221	4733226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060888
133030	NC_010524	CTG	3	9	4733228	4733236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133031	NC_010524	CAT	2	6	4733317	4733322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060888
133032	NC_010524	GTC	2	6	4733329	4733334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133033	NC_010524	GCTG	2	8	4733367	4733374	0 %	25 %	50 %	25 %	171060888
133034	NC_010524	TCG	2	6	4733376	4733381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133035	NC_010524	TCG	2	6	4733384	4733389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133036	NC_010524	TCT	2	6	4733391	4733396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060888
133037	NC_010524	GCT	2	6	4733410	4733415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133038	NC_010524	GGGC	2	8	4733416	4733423	0 %	0 %	75 %	25 %	171060888
133039	NC_010524	GAC	2	6	4733461	4733466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133040	NC_010524	TGC	2	6	4733478	4733483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133041	NC_010524	TCA	2	6	4733493	4733498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060888
133042	NC_010524	ATC	2	6	4733534	4733539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060888
133043	NC_010524	GCT	2	6	4733566	4733571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133044	NC_010524	TTC	2	6	4733597	4733602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060888
133045	NC_010524	GCT	2	6	4733605	4733610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133046	NC_010524	CCG	2	6	4733645	4733650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060888
133047	NC_010524	GGC	2	6	4733659	4733664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060888
133048	NC_010524	CGC	2	6	4733688	4733693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060888
133049	NC_010524	TGC	2	6	4733724	4733729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133050	NC_010524	CTG	2	6	4733762	4733767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133051	NC_010524	GGT	2	6	4733803	4733808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060888
133052	NC_010524	ACG	2	6	4733844	4733849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060889
133053	NC_010524	GCCA	2	8	4733878	4733885	25 %	0 %	25 %	50 %	171060889
133054	NC_010524	CCA	2	6	4733912	4733917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060889
133055	NC_010524	CAGC	2	8	4733952	4733959	25 %	0 %	25 %	50 %	171060889
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133057	NC_010524	CAGCGC	2	12	4734012	4734023	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171060889
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133059	NC_010524	GGT	2	6	4734086	4734091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060889
133060	NC_010524	GCA	2	6	4734095	4734100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060889
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133063	NC_010524	CAGC	2	8	4734198	4734205	25 %	0 %	25 %	50 %	171060889
133064	NC_010524	CAG	2	6	4734210	4734215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060889
133065	NC_010524	CAG	2	6	4734267	4734272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060889
133066	NC_010524	GCA	2	6	4734293	4734298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060889
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133069	NC_010524	CGGG	2	8	4734368	4734375	0 %	0 %	75 %	25 %	171060889
133070	NC_010524	CGGA	2	8	4734377	4734384	25 %	0 %	50 %	25 %	171060889
133071	NC_010524	CAGG	2	8	4734423	4734430	25 %	0 %	50 %	25 %	171060889
133072	NC_010524	CCG	2	6	4734478	4734483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133073	NC_010524	GC	3	6	4734519	4734524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133074	NC_010524	CCA	2	6	4734529	4734534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133075	NC_010524	GCC	2	6	4734549	4734554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133076	NC_010524	GC	3	6	4734589	4734594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133077	NC_010524	CCGCC	2	10	4734615	4734624	0 %	0 %	20 %	80 %	171060890
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133081	NC_010524	GCC	2	6	4734754	4734759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060890
133082	NC_010524	TCCCGA	2	12	4734866	4734877	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171060890
133083	NC_010524	CGGCT	2	10	4734887	4734896	0 %	20 %	40 %	40 %	171060890
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133085	NC_010524	GC	4	8	4734925	4734932	0 %	0 %	50 %	50 %	171060890
133086	NC_010524	GC	3	6	4734998	4735003	0 %	0 %	50 %	50 %	171060890
133087	NC_010524	GGC	2	6	4735014	4735019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060890
133088	NC_010524	GCG	2	6	4735086	4735091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060890
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133096	NC_010524	CGGC	2	8	4735217	4735224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133097	NC_010524	CGCGG	2	10	4735258	4735267	0 %	0 %	60 %	40 %	171060891
133098	NC_010524	CTG	2	6	4735294	4735299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060891
133099	NC_010524	GCGCTG	2	12	4735303	4735314	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171060891
133100	NC_010524	TCG	2	6	4735322	4735327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060891
133101	NC_010524	TCG	2	6	4735364	4735369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060891
133102	NC_010524	CG	3	6	4735399	4735404	0 %	0 %	50 %	50 %	171060891
133103	NC_010524	GCA	2	6	4735461	4735466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060891
133104	NC_010524	CCATG	2	10	4735530	4735539	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133105	NC_010524	GCC	2	6	4735557	4735562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133106	NC_010524	CG	4	8	4735704	4735711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133107	NC_010524	GGC	2	6	4735753	4735758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133108	NC_010524	TCG	2	6	4735788	4735793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133109	NC_010524	GCG	2	6	4735859	4735864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060892
133110	NC_010524	GCTG	2	8	4735903	4735910	0 %	25 %	50 %	25 %	171060892
133111	NC_010524	GCC	2	6	4735938	4735943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060892
133112	NC_010524	GCC	2	6	4735988	4735993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060892
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133115	NC_010524	CGT	2	6	4736069	4736074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060892
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133230	NC_010524	GGC	2	6	4740025	4740030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060896
133231	NC_010524	CGG	2	6	4740034	4740039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060896
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133297	NC_010524	GCC	2	6	4742101	4742106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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133339	NC_010524	CG	4	8	4743619	4743626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133340	NC_010524	GC	3	6	4743641	4743646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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133459	NC_010524	GCT	2	6	4747426	4747431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060904
133460	NC_010524	TAC	2	6	4747457	4747462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060904
133461	NC_010524	CAA	2	6	4747483	4747488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060904
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133466	NC_010524	GCT	2	6	4747684	4747689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060904
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133481	NC_010524	CG	3	6	4748346	4748351	0 %	0 %	50 %	50 %	171060905
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