MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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132502	NC_010524	CG	3	6	4716360	4716365	0 %	0 %	50 %	50 %	171060875
132503	NC_010524	GCGG	2	8	4716376	4716383	0 %	0 %	75 %	25 %	171060875
132504	NC_010524	GGCTGA	2	12	4716407	4716418	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171060875
132505	NC_010524	GGT	2	6	4716508	4716513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060875
132506	NC_010524	TCG	2	6	4716519	4716524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060875
132507	NC_010524	CG	3	6	4716545	4716550	0 %	0 %	50 %	50 %	171060875
132508	NC_010524	CTG	2	6	4716583	4716588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060875
132509	NC_010524	CGAT	2	8	4716623	4716630	25 %	25 %	25 %	25 %	171060875
132510	NC_010524	CTG	2	6	4716640	4716645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060875
132511	NC_010524	GCC	2	6	4716673	4716678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060875
132512	NC_010524	CGC	2	6	4716706	4716711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060875
132513	NC_010524	ATGCCG	2	12	4716722	4716733	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060875
132514	NC_010524	ACA	2	6	4716752	4716757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060875
132515	NC_010524	CGG	2	6	4716764	4716769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060875
132516	NC_010524	ATTG	2	8	4716838	4716845	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132517	NC_010524	CCCA	2	8	4716848	4716855	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
132518	NC_010524	GGTC	2	8	4716862	4716869	0 %	25 %	50 %	25 %	171060876
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132524	NC_010524	CTT	2	6	4717057	4717062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060876
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132533	NC_010524	GC	3	6	4717595	4717600	0 %	0 %	50 %	50 %	171060876
132534	NC_010524	TCG	2	6	4717679	4717684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060876
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132540	NC_010524	GC	3	6	4717911	4717916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132541	NC_010524	CCGG	2	8	4717926	4717933	0 %	0 %	50 %	50 %	171060877
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132614	NC_010524	GC	3	6	4720086	4720091	0 %	0 %	50 %	50 %	171060877
132615	NC_010524	CGG	2	6	4720097	4720102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060877
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132619	NC_010524	GCG	2	6	4720244	4720249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060877
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132625	NC_010524	TCG	2	6	4720327	4720332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060877
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132634	NC_010524	CG	3	6	4720515	4720520	0 %	0 %	50 %	50 %	171060877
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132958	NC_010524	TCT	2	6	4731280	4731285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060887
132959	NC_010524	ATC	2	6	4731333	4731338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060887
132960	NC_010524	ATG	2	6	4731357	4731362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060887
132961	NC_010524	GGCC	2	8	4731386	4731393	0 %	0 %	50 %	50 %	171060887
132962	NC_010524	GCG	2	6	4731400	4731405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060887
132963	NC_010524	CTT	2	6	4731419	4731424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060887
132964	NC_010524	CGCA	2	8	4731432	4731439	25 %	0 %	25 %	50 %	171060887
132965	NC_010524	CGA	2	6	4731442	4731447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060887
132966	NC_010524	CTT	2	6	4731470	4731475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060887
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132968	NC_010524	CCG	2	6	4731570	4731575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060887
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132970	NC_010524	TCG	2	6	4731634	4731639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060887
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132973	NC_010524	GTCGAC	2	12	4731708	4731719	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060887
132974	NC_010524	CGCC	2	8	4731758	4731765	0 %	0 %	25 %	75 %	171060887
132975	NC_010524	CGT	2	6	4731776	4731781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060887
132976	NC_010524	GCA	2	6	4731782	4731787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060887
132977	NC_010524	ATC	2	6	4731845	4731850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060888
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132981	NC_010524	CAT	2	6	4731961	4731966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060888
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132983	NC_010524	TTC	2	6	4732010	4732015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060888
132984	NC_010524	GGCT	2	8	4732016	4732023	0 %	25 %	50 %	25 %	171060888
132985	NC_010524	GGCC	2	8	4732051	4732058	0 %	0 %	50 %	50 %	171060888
132986	NC_010524	GC	3	6	4732084	4732089	0 %	0 %	50 %	50 %	171060888
132987	NC_010524	ACG	2	6	4732107	4732112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060888
132988	NC_010524	CTGGCG	2	12	4732199	4732210	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171060888
132989	NC_010524	CCA	2	6	4732236	4732241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060888
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132991	NC_010524	TCG	2	6	4732278	4732283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
132992	NC_010524	GGT	2	6	4732288	4732293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060888
132993	NC_010524	CTG	2	6	4732307	4732312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
132994	NC_010524	TGC	2	6	4732326	4732331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
132995	NC_010524	GC	3	6	4732330	4732335	0 %	0 %	50 %	50 %	171060888
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132998	NC_010524	CCG	2	6	4732400	4732405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060888
132999	NC_010524	TGC	2	6	4732410	4732415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060888
133000	NC_010524	CCG	2	6	4732434	4732439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060888

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