MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
132001	NC_010524	GGGTCA	2	12	4698039	4698050	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171060859
132002	NC_010524	TGT	2	6	4698090	4698095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060859
132003	NC_010524	GC	3	6	4698149	4698154	0 %	0 %	50 %	50 %	171060859
132004	NC_010524	CGCC	2	8	4698195	4698202	0 %	0 %	25 %	75 %	171060859
132005	NC_010524	GCA	2	6	4698243	4698248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060859
132006	NC_010524	AGC	2	6	4698290	4698295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060859
132007	NC_010524	CGA	2	6	4698312	4698317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060859
132008	NC_010524	GTCG	2	8	4698379	4698386	0 %	25 %	50 %	25 %	171060859
132009	NC_010524	GGTG	2	8	4698411	4698418	0 %	25 %	75 %	0 %	171060859
132010	NC_010524	CCCTTG	2	12	4698422	4698433	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	171060859
132011	NC_010524	CAC	2	6	4698472	4698477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060859
132012	NC_010524	GCG	2	6	4698480	4698485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060859
132013	NC_010524	GCC	2	6	4698514	4698519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060859
132014	NC_010524	GCA	2	6	4698534	4698539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060859
132015	NC_010524	GCG	2	6	4698545	4698550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060859
132016	NC_010524	AGC	2	6	4698677	4698682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060859
132017	NC_010524	GGT	2	6	4698703	4698708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060859
132018	NC_010524	GCT	2	6	4698747	4698752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060859
132019	NC_010524	CGG	2	6	4698766	4698771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060859
132020	NC_010524	GCC	2	6	4698798	4698803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060859
132021	NC_010524	CGGC	2	8	4698804	4698811	0 %	0 %	50 %	50 %	171060859
132022	NC_010524	TGC	2	6	4698819	4698824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060859
132023	NC_010524	GC	3	6	4698823	4698828	0 %	0 %	50 %	50 %	171060859
132024	NC_010524	CGC	2	6	4698854	4698859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060859
132025	NC_010524	GAC	2	6	4698922	4698927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060859
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132027	NC_010524	TCG	2	6	4699004	4699009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060859
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132029	NC_010524	TCG	2	6	4699037	4699042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060859
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132034	NC_010524	GC	4	8	4699155	4699162	0 %	0 %	50 %	50 %	171060859
132035	NC_010524	CGG	2	6	4699167	4699172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060859
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132037	NC_010524	CGA	2	6	4699227	4699232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060859
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132045	NC_010524	TGCT	2	8	4699400	4699407	0 %	50 %	25 %	25 %	171060859
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132048	NC_010524	GC	3	6	4699541	4699546	0 %	0 %	50 %	50 %	171060859
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132053	NC_010524	GCT	2	6	4699809	4699814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060859
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132057	NC_010524	CGA	2	6	4699914	4699919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060859
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132107	NC_010524	TGGTC	2	10	4701762	4701771	0 %	40 %	40 %	20 %	171060859
132108	NC_010524	GATCGC	2	12	4701772	4701783	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060859
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132111	NC_010524	GGCG	2	8	4701840	4701847	0 %	0 %	75 %	25 %	171060859
132112	NC_010524	CAC	2	6	4701940	4701945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060859
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132114	NC_010524	TTC	2	6	4701980	4701985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060859
132115	NC_010524	GC	4	8	4701997	4702004	0 %	0 %	50 %	50 %	171060859
132116	NC_010524	TGG	2	6	4702038	4702043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060859
132117	NC_010524	G	6	6	4702042	4702047	0 %	0 %	100 %	0 %	171060859
132118	NC_010524	TGG	2	6	4702065	4702070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060859
132119	NC_010524	TGGGC	2	10	4702191	4702200	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
132120	NC_010524	GCG	2	6	4702347	4702352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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132131	NC_010524	CCCG	2	8	4702685	4702692	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132132	NC_010524	CGA	2	6	4702772	4702777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060861
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132223	NC_010524	GCT	2	6	4706416	4706421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060864
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132345	NC_010524	GCA	2	6	4710819	4710824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060870
132346	NC_010524	GCT	2	6	4710888	4710893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060870
132347	NC_010524	GTG	2	6	4710931	4710936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060870
132348	NC_010524	GCA	2	6	4710996	4711001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060870
132349	NC_010524	CAT	2	6	4711002	4711007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060870
132350	NC_010524	GCG	3	9	4711028	4711036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060870
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132352	NC_010524	CGC	2	6	4711116	4711121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060870
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132358	NC_010524	CCGC	2	8	4711307	4711314	0 %	0 %	25 %	75 %	171060870
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132366	NC_010524	GCC	2	6	4711621	4711626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060871
132367	NC_010524	GCA	2	6	4711647	4711652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060871
132368	NC_010524	GCT	2	6	4711674	4711679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060871
132369	NC_010524	ACCA	2	8	4711681	4711688	50 %	0 %	0 %	50 %	171060871
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132378	NC_010524	GTC	2	6	4712019	4712024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060871
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132380	NC_010524	CGA	2	6	4712115	4712120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060871
132381	NC_010524	CTG	2	6	4712164	4712169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060871
132382	NC_010524	CG	3	6	4712184	4712189	0 %	0 %	50 %	50 %	171060871
132383	NC_010524	CGAT	2	8	4712242	4712249	25 %	25 %	25 %	25 %	171060871
132384	NC_010524	ACC	2	6	4712336	4712341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060871
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132399	NC_010524	CGC	2	6	4713051	4713056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060871
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132406	NC_010524	CTG	2	6	4713288	4713293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060872
132407	NC_010524	CTCG	2	8	4713305	4713312	0 %	25 %	25 %	50 %	171060872
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132416	NC_010524	TCG	2	6	4713568	4713573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060872
132417	NC_010524	CGG	2	6	4713575	4713580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060872
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132420	NC_010524	ATCGA	2	10	4713777	4713786	40 %	20 %	20 %	20 %	171060872
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132423	NC_010524	CGG	2	6	4713860	4713865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060872
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132425	NC_010524	ACG	2	6	4713883	4713888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060872
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132428	NC_010524	CCG	2	6	4713961	4713966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060872
132429	NC_010524	CAG	2	6	4713974	4713979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060872
132430	NC_010524	GCC	2	6	4713993	4713998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060872
132431	NC_010524	CGCA	2	8	4714027	4714034	25 %	0 %	25 %	50 %	171060872
132432	NC_010524	CGCC	2	8	4714108	4714115	0 %	0 %	25 %	75 %	171060872
132433	NC_010524	CAA	2	6	4714124	4714129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060872
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132437	NC_010524	CGG	2	6	4714256	4714261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060872
132438	NC_010524	GC	3	6	4714267	4714272	0 %	0 %	50 %	50 %	171060872
132439	NC_010524	GC	4	8	4714297	4714304	0 %	0 %	50 %	50 %	171060872
132440	NC_010524	TCG	2	6	4714306	4714311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060872
132441	NC_010524	GC	3	6	4714324	4714329	0 %	0 %	50 %	50 %	171060872
132442	NC_010524	CGG	2	6	4714373	4714378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060872
132443	NC_010524	TTGAA	2	10	4714422	4714431	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132444	NC_010524	CCT	2	6	4714432	4714437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132445	NC_010524	ACGCC	2	10	4714494	4714503	20 %	0 %	20 %	60 %	171060873
132446	NC_010524	TCACCC	2	12	4714521	4714532	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	171060873
132447	NC_010524	GCA	2	6	4714540	4714545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060873
132448	NC_010524	GCGT	2	8	4714548	4714555	0 %	25 %	50 %	25 %	171060873
132449	NC_010524	GGC	2	6	4714556	4714561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060873
132450	NC_010524	GCT	2	6	4714672	4714677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060873
132451	NC_010524	TGGC	2	8	4714697	4714704	0 %	25 %	50 %	25 %	171060873
132452	NC_010524	TGC	2	6	4714713	4714718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060873
132453	NC_010524	GCG	2	6	4714742	4714747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060873
132454	NC_010524	GGCGA	2	10	4714754	4714763	20 %	0 %	60 %	20 %	171060873
132455	NC_010524	CCG	2	6	4714785	4714790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060873
132456	NC_010524	CCG	2	6	4714806	4714811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060873
132457	NC_010524	GCG	2	6	4714812	4714817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060873
132458	NC_010524	TTC	2	6	4714862	4714867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060873
132459	NC_010524	TCT	2	6	4714911	4714916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060873
132460	NC_010524	TGC	2	6	4714926	4714931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060873
132461	NC_010524	GAC	2	6	4714963	4714968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060873
132462	NC_010524	TGC	2	6	4714998	4715003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060873
132463	NC_010524	GC	3	6	4715007	4715012	0 %	0 %	50 %	50 %	171060873
132464	NC_010524	GCC	2	6	4715021	4715026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060873
132465	NC_010524	TGG	2	6	4715037	4715042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060873
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132489	NC_010524	GAA	2	6	4715851	4715856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060874
132490	NC_010524	GGGC	2	8	4715892	4715899	0 %	0 %	75 %	25 %	171060874
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132492	NC_010524	CCAG	2	8	4715912	4715919	25 %	0 %	25 %	50 %	171060874
132493	NC_010524	GGC	2	6	4715949	4715954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060874
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132495	NC_010524	ACC	2	6	4716002	4716007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060874
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132497	NC_010524	CGC	2	6	4716075	4716080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060874
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