MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
131501	NC_010524	CGAC	2	8	4680072	4680079	25 %	0 %	25 %	50 %	171060840
131502	NC_010524	TGG	2	6	4680135	4680140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060840
131503	NC_010524	CG	4	8	4680144	4680151	0 %	0 %	50 %	50 %	171060840
131504	NC_010524	GCT	2	6	4680199	4680204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060840
131505	NC_010524	GAT	2	6	4680256	4680261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060840
131506	NC_010524	TCT	2	6	4680285	4680290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060840
131507	NC_010524	TGG	2	6	4680300	4680305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060840
131508	NC_010524	CCG	2	6	4680306	4680311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060840
131509	NC_010524	GAT	2	6	4680325	4680330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060840
131510	NC_010524	GGC	2	6	4680331	4680336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060840
131511	NC_010524	GCC	2	6	4680351	4680356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060840
131512	NC_010524	CG	3	6	4680357	4680362	0 %	0 %	50 %	50 %	171060840
131513	NC_010524	CG	3	6	4680364	4680369	0 %	0 %	50 %	50 %	171060840
131514	NC_010524	GC	3	6	4680390	4680395	0 %	0 %	50 %	50 %	171060840
131515	NC_010524	GGC	2	6	4680397	4680402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060840
131516	NC_010524	GCT	2	6	4680412	4680417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060840
131517	NC_010524	TTC	2	6	4680473	4680478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060840
131518	NC_010524	TCG	2	6	4680494	4680499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060840
131519	NC_010524	CGC	3	9	4680562	4680570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060840
131520	NC_010524	CCGG	2	8	4680594	4680601	0 %	0 %	50 %	50 %	171060840
131521	NC_010524	GTG	2	6	4680629	4680634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060840
131522	NC_010524	CGGCG	2	10	4680635	4680644	0 %	0 %	60 %	40 %	171060840
131523	NC_010524	GCCTTC	2	12	4680659	4680670	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	171060840
131524	NC_010524	GCTGTG	2	12	4680673	4680684	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	171060840
131525	NC_010524	CGC	2	6	4680688	4680693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060840
131526	NC_010524	GCT	3	9	4680712	4680720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060840
131527	NC_010524	TGG	2	6	4680756	4680761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060840
131528	NC_010524	CAC	2	6	4680766	4680771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060840
131529	NC_010524	GC	3	6	4680852	4680857	0 %	0 %	50 %	50 %	171060840
131530	NC_010524	TCG	2	6	4680882	4680887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060840
131531	NC_010524	GC	3	6	4680894	4680899	0 %	0 %	50 %	50 %	171060840
131532	NC_010524	CGC	2	6	4680919	4680924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060840
131533	NC_010524	GC	3	6	4680927	4680932	0 %	0 %	50 %	50 %	171060840
131534	NC_010524	CGG	2	6	4680939	4680944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060840
131535	NC_010524	GC	3	6	4680976	4680981	0 %	0 %	50 %	50 %	171060840
131536	NC_010524	CGG	3	9	4680984	4680992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060840
131537	NC_010524	CGA	2	6	4681036	4681041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060841
131538	NC_010524	CCT	2	6	4681062	4681067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060841
131539	NC_010524	CG	3	6	4681087	4681092	0 %	0 %	50 %	50 %	171060841
131540	NC_010524	CCA	2	6	4681186	4681191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060841
131541	NC_010524	GCA	2	6	4681207	4681212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060841
131542	NC_010524	TGC	2	6	4681218	4681223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060841
131543	NC_010524	GGCC	2	8	4681234	4681241	0 %	0 %	50 %	50 %	171060841
131544	NC_010524	CGC	2	6	4681267	4681272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060841
131545	NC_010524	TGC	3	9	4681287	4681295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060841
131546	NC_010524	GCT	2	6	4681306	4681311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060841
131547	NC_010524	GGCTGG	2	12	4681313	4681324	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	171060841
131548	NC_010524	GCC	3	9	4681347	4681355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060842
131549	NC_010524	GCA	2	6	4681357	4681362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060842
131550	NC_010524	CG	3	6	4681378	4681383	0 %	0 %	50 %	50 %	171060842
131551	NC_010524	CGCAG	2	10	4681420	4681429	20 %	0 %	40 %	40 %	171060842
131552	NC_010524	CTC	2	6	4681451	4681456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060842
131553	NC_010524	TGT	2	6	4681531	4681536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060842
131554	NC_010524	CGA	2	6	4681558	4681563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060842
131555	NC_010524	AGC	2	6	4681581	4681586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060842
131556	NC_010524	GCGA	2	8	4681611	4681618	25 %	0 %	50 %	25 %	171060842
131557	NC_010524	GTC	2	6	4681637	4681642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060842
131558	NC_010524	CG	3	6	4681664	4681669	0 %	0 %	50 %	50 %	171060842
131559	NC_010524	TCGATG	2	12	4681731	4681742	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171060842
131560	NC_010524	CGG	2	6	4681744	4681749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060842
131561	NC_010524	GCC	2	6	4681754	4681759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060842
131562	NC_010524	CTC	2	6	4681760	4681765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060842
131563	NC_010524	GTC	2	6	4681796	4681801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060842
131564	NC_010524	GCG	2	6	4681840	4681845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060842
131565	NC_010524	CG	4	8	4681879	4681886	0 %	0 %	50 %	50 %	171060842
131566	NC_010524	GCGCA	2	10	4681887	4681896	20 %	0 %	40 %	40 %	171060842
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131568	NC_010524	AGC	2	6	4681938	4681943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060842
131569	NC_010524	GCG	2	6	4681957	4681962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060842
131570	NC_010524	GCA	2	6	4681993	4681998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060842
131571	NC_010524	GCG	2	6	4682018	4682023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060842
131572	NC_010524	CGG	2	6	4682158	4682163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060842
131573	NC_010524	CCG	2	6	4682182	4682187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060842
131574	NC_010524	GCC	2	6	4682219	4682224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060842
131575	NC_010524	GTC	2	6	4682225	4682230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060842
131576	NC_010524	CAG	2	6	4682264	4682269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060842
131577	NC_010524	GC	3	6	4682349	4682354	0 %	0 %	50 %	50 %	171060842
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131579	NC_010524	AGC	2	6	4682427	4682432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060842
131580	NC_010524	AGC	2	6	4682451	4682456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060842
131581	NC_010524	GGC	2	6	4682470	4682475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060842
131582	NC_010524	ATC	2	6	4682490	4682495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060842
131583	NC_010524	GGC	2	6	4682549	4682554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060842
131584	NC_010524	GTA	2	6	4682618	4682623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060842
131585	NC_010524	CTG	2	6	4682645	4682650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060842
131586	NC_010524	GCA	2	6	4682695	4682700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060842
131587	NC_010524	TCATC	2	10	4682704	4682713	20 %	40 %	0 %	40 %	171060842
131588	NC_010524	GAA	2	6	4682720	4682725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060842
131589	NC_010524	ACC	2	6	4682775	4682780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060842
131590	NC_010524	GC	3	6	4682797	4682802	0 %	0 %	50 %	50 %	171060842
131591	NC_010524	CGC	2	6	4682843	4682848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060842
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131596	NC_010524	CGCGCA	2	12	4683088	4683099	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171060842
131597	NC_010524	CGG	2	6	4683147	4683152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060842
131598	NC_010524	GAC	2	6	4683197	4683202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060842
131599	NC_010524	ATC	2	6	4683228	4683233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060842
131600	NC_010524	ATCG	2	8	4683245	4683252	25 %	25 %	25 %	25 %	171060842
131601	NC_010524	CGC	2	6	4683262	4683267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060842
131602	NC_010524	GCG	2	6	4683269	4683274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060842
131603	NC_010524	GC	3	6	4683290	4683295	0 %	0 %	50 %	50 %	171060842
131604	NC_010524	C	6	6	4683300	4683305	0 %	0 %	0 %	100 %	171060842
131605	NC_010524	CGGC	2	8	4683314	4683321	0 %	0 %	50 %	50 %	171060842
131606	NC_010524	C	8	8	4683321	4683328	0 %	0 %	0 %	100 %	171060842
131607	NC_010524	GC	3	6	4683339	4683344	0 %	0 %	50 %	50 %	171060842
131608	NC_010524	CGTG	2	8	4683355	4683362	0 %	25 %	50 %	25 %	171060842
131609	NC_010524	GCA	2	6	4683379	4683384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060842
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131612	NC_010524	GCG	2	6	4683651	4683656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060842
131613	NC_010524	AGC	2	6	4683666	4683671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060842
131614	NC_010524	TCG	3	9	4683675	4683683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060842
131615	NC_010524	CAG	3	9	4683716	4683724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060842
131616	NC_010524	GCG	2	6	4683778	4683783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060842
131617	NC_010524	CCG	2	6	4683823	4683828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060842
131618	NC_010524	GCGG	2	8	4683841	4683848	0 %	0 %	75 %	25 %	171060842
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131621	NC_010524	CG	5	10	4683986	4683995	0 %	0 %	50 %	50 %	171060842
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131623	NC_010524	CAG	3	9	4684061	4684069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060842
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131627	NC_010524	CAC	2	6	4684199	4684204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060842
131628	NC_010524	CCGG	2	8	4684205	4684212	0 %	0 %	50 %	50 %	171060842
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131630	NC_010524	GCTCGG	2	12	4684264	4684275	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171060842
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131644	NC_010524	GCA	2	6	4684806	4684811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060843
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131647	NC_010524	CG	3	6	4684902	4684907	0 %	0 %	50 %	50 %	171060843
131648	NC_010524	CAG	2	6	4684909	4684914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060843
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131653	NC_010524	GTC	2	6	4685184	4685189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060844
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131661	NC_010524	GC	3	6	4685435	4685440	0 %	0 %	50 %	50 %	171060844
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131666	NC_010524	GCG	2	6	4685633	4685638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060844
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131672	NC_010524	GCA	2	6	4685939	4685944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060844
131673	NC_010524	CGGG	2	8	4685975	4685982	0 %	0 %	75 %	25 %	171060844
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131684	NC_010524	GTC	2	6	4686303	4686308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060844
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131713	NC_010524	GC	3	6	4687465	4687470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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