MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
130501	NC_010524	CAT	2	6	4641359	4641364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060801
130502	NC_010524	GGCC	2	8	4641534	4641541	0 %	0 %	50 %	50 %	171060802
130503	NC_010524	GCC	2	6	4641598	4641603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060802
130504	NC_010524	GC	3	6	4641608	4641613	0 %	0 %	50 %	50 %	171060802
130505	NC_010524	GCT	2	6	4641636	4641641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060802
130506	NC_010524	GCC	2	6	4641649	4641654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060802
130507	NC_010524	GGTCTG	2	12	4641688	4641699	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	171060802
130508	NC_010524	CGGTGC	2	12	4641741	4641752	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171060802
130509	NC_010524	GCC	3	9	4641760	4641768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060802
130510	NC_010524	GGT	2	6	4641789	4641794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060802
130511	NC_010524	CAG	2	6	4641814	4641819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060802
130512	NC_010524	CGC	2	6	4641825	4641830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060802
130513	NC_010524	GCC	2	6	4641837	4641842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060802
130514	NC_010524	GCT	2	6	4641856	4641861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060802
130515	NC_010524	CGC	3	9	4641891	4641899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060802
130516	NC_010524	TGA	2	6	4641933	4641938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060802
130517	NC_010524	CAGG	2	8	4641973	4641980	25 %	0 %	50 %	25 %	171060802
130518	NC_010524	ATCGAG	2	12	4641983	4641994	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	171060802
130519	NC_010524	CCG	2	6	4641999	4642004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060802
130520	NC_010524	GCC	3	9	4642057	4642065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060802
130521	NC_010524	GCG	2	6	4642104	4642109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060802
130522	NC_010524	AGA	2	6	4642146	4642151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060802
130523	NC_010524	GTT	2	6	4642177	4642182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060802
130524	NC_010524	CCGG	2	8	4642187	4642194	0 %	0 %	50 %	50 %	171060802
130525	NC_010524	TGCC	2	8	4642233	4642240	0 %	25 %	25 %	50 %	171060802
130526	NC_010524	GCT	2	6	4642246	4642251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060802
130527	NC_010524	CAG	2	6	4642258	4642263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060802
130528	NC_010524	GGC	2	6	4642270	4642275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060802
130529	NC_010524	CGC	2	6	4642291	4642296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060802
130530	NC_010524	C	6	6	4642296	4642301	0 %	0 %	0 %	100 %	171060802
130531	NC_010524	GGTT	2	8	4642351	4642358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130532	NC_010524	CGT	2	6	4642363	4642368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130533	NC_010524	CAG	2	6	4642411	4642416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130534	NC_010524	CA	3	6	4642433	4642438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130535	NC_010524	CGC	2	6	4642488	4642493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130536	NC_010524	GCG	2	6	4642571	4642576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060803
130537	NC_010524	GCG	2	6	4642609	4642614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060803
130538	NC_010524	TCG	2	6	4642672	4642677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060803
130539	NC_010524	GCA	2	6	4642694	4642699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060803
130540	NC_010524	GC	3	6	4642704	4642709	0 %	0 %	50 %	50 %	171060803
130541	NC_010524	CGA	2	6	4642736	4642741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060803
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130543	NC_010524	CG	3	6	4642843	4642848	0 %	0 %	50 %	50 %	171060803
130544	NC_010524	ACC	3	9	4642912	4642920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060803
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130550	NC_010524	CCGG	2	8	4643116	4643123	0 %	0 %	50 %	50 %	171060803
130551	NC_010524	GC	3	6	4643159	4643164	0 %	0 %	50 %	50 %	171060803
130552	NC_010524	CGC	3	9	4643162	4643170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060803
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130554	NC_010524	CG	3	6	4643214	4643219	0 %	0 %	50 %	50 %	171060803
130555	NC_010524	CGG	2	6	4643249	4643254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060803
130556	NC_010524	CGTCGA	2	12	4643255	4643266	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060803
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130560	NC_010524	GCT	2	6	4643435	4643440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060803
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130570	NC_010524	TGCA	2	8	4643596	4643603	25 %	25 %	25 %	25 %	171060803
130571	NC_010524	GGC	2	6	4643604	4643609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060803
130572	NC_010524	GCA	2	6	4643612	4643617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060803
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130602	NC_010524	GCCGAG	2	12	4644638	4644649	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171060805
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130834	NC_010524	CAAAC	2	10	4653018	4653027	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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130846	NC_010524	TGGG	2	8	4653567	4653574	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
130847	NC_010524	GTT	2	6	4653591	4653596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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130850	NC_010524	GCA	2	6	4653746	4653751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130851	NC_010524	GTC	2	6	4653820	4653825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130852	NC_010524	GTG	2	6	4653853	4653858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130853	NC_010524	GC	3	6	4653932	4653937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130854	NC_010524	TGG	2	6	4654018	4654023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130855	NC_010524	TGG	2	6	4654072	4654077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130856	NC_010524	CT	3	6	4654098	4654103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130857	NC_010524	TCG	2	6	4654191	4654196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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130969	NC_010524	AAG	2	6	4658591	4658596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060821
130970	NC_010524	CG	3	6	4658626	4658631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130971	NC_010524	CAC	2	6	4658675	4658680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130972	NC_010524	CG	3	6	4658806	4658811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130973	NC_010524	CT	3	6	4658834	4658839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130974	NC_010524	ACC	2	6	4658848	4658853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130975	NC_010524	TGAT	2	8	4658858	4658865	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130976	NC_010524	CCG	2	6	4658891	4658896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130977	NC_010524	CGA	2	6	4658897	4658902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130978	NC_010524	GC	3	6	4658923	4658928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130979	NC_010524	GCA	2	6	4658942	4658947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130980	NC_010524	CCCGG	2	10	4658978	4658987	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
130981	NC_010524	GGC	2	6	4659032	4659037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130982	NC_010524	GTC	2	6	4659044	4659049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130983	NC_010524	GCC	2	6	4659086	4659091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130984	NC_010524	CATG	2	8	4659092	4659099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130985	NC_010524	TGCACA	2	12	4659160	4659171	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130986	NC_010524	CG	3	6	4659238	4659243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130987	NC_010524	TGCA	2	8	4659271	4659278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130988	NC_010524	G	6	6	4659392	4659397	0 %	0 %	100 %	0 %	171060822
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130990	NC_010524	CCGAG	2	10	4659445	4659454	20 %	0 %	40 %	40 %	171060822
130991	NC_010524	CAG	2	6	4659455	4659460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060822
130992	NC_010524	CGG	2	6	4659541	4659546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060822
130993	NC_010524	GCC	2	6	4659568	4659573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060822
130994	NC_010524	CGT	2	6	4659586	4659591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060822
130995	NC_010524	CG	3	6	4659603	4659608	0 %	0 %	50 %	50 %	171060822
130996	NC_010524	GCCGC	2	10	4659626	4659635	0 %	0 %	40 %	60 %	171060822
130997	NC_010524	CGG	2	6	4659649	4659654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060822
130998	NC_010524	CCT	2	6	4659655	4659660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060822
130999	NC_010524	CCAG	2	8	4659664	4659671	25 %	0 %	25 %	50 %	171060822
131000	NC_010524	CGA	2	6	4659673	4659678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060822

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