MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_010524	GCG	2	6	433162	433167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057083
12502	NC_010524	GTG	2	6	433199	433204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057083
12503	NC_010524	GCTG	2	8	433255	433262	0 %	25 %	50 %	25 %	171057083
12504	NC_010524	GCG	2	6	433263	433268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057083
12505	NC_010524	CAG	3	9	433295	433303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057083
12506	NC_010524	CGGT	2	8	433314	433321	0 %	25 %	50 %	25 %	171057083
12507	NC_010524	TCG	2	6	433389	433394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057083
12508	NC_010524	CAC	2	6	433403	433408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057083
12509	NC_010524	AGCG	2	8	433470	433477	25 %	0 %	50 %	25 %	171057083
12510	NC_010524	GC	4	8	433534	433541	0 %	0 %	50 %	50 %	171057083
12511	NC_010524	GCGG	2	8	433591	433598	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12512	NC_010524	GGC	2	6	433632	433637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_010524	GTG	2	6	433638	433643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_010524	CGG	2	6	433653	433658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_010524	GCG	2	6	433670	433675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_010524	GCG	2	6	433678	433683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_010524	GGTC	2	8	433684	433691	0 %	25 %	50 %	25 %	171057084
12518	NC_010524	GGC	2	6	433693	433698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057084
12519	NC_010524	GAC	2	6	433723	433728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057084
12520	NC_010524	CAG	2	6	433777	433782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057084
12521	NC_010524	GCC	2	6	433783	433788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057084
12522	NC_010524	GGTC	2	8	433896	433903	0 %	25 %	50 %	25 %	171057084
12523	NC_010524	CCT	2	6	433950	433955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057084
12524	NC_010524	CAG	2	6	433981	433986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057084
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12527	NC_010524	CGA	2	6	434025	434030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057084
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12529	NC_010524	ATC	2	6	434078	434083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057084
12530	NC_010524	CAC	2	6	434086	434091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057084
12531	NC_010524	GCG	2	6	434104	434109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057084
12532	NC_010524	GGC	2	6	434152	434157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057084
12533	NC_010524	CCG	2	6	434166	434171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057084
12534	NC_010524	CGTAGC	2	12	434172	434183	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057084
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12536	NC_010524	CTT	2	6	434263	434268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057084
12537	NC_010524	CGA	2	6	434340	434345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057084
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12539	NC_010524	GCG	2	6	434432	434437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057084
12540	NC_010524	CG	3	6	434436	434441	0 %	0 %	50 %	50 %	171057084
12541	NC_010524	TGGG	2	8	434459	434466	0 %	25 %	75 %	0 %	171057084
12542	NC_010524	TCA	2	6	434481	434486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057084
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12544	NC_010524	GCT	2	6	434574	434579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057085
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12547	NC_010524	GCG	2	6	434671	434676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057085
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12550	NC_010524	CGCC	2	8	434707	434714	0 %	0 %	25 %	75 %	171057085
12551	NC_010524	AGC	2	6	434755	434760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057085
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12553	NC_010524	CGC	2	6	434846	434851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057085
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12555	NC_010524	GCA	2	6	434947	434952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057085
12556	NC_010524	GGCC	2	8	435017	435024	0 %	0 %	50 %	50 %	171057085
12557	NC_010524	AAC	2	6	435081	435086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057085
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12567	NC_010524	CTG	2	6	435619	435624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057086
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12569	NC_010524	GCT	2	6	435681	435686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12570	NC_010524	GTG	2	6	435736	435741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_010524	GAG	2	6	435752	435757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_010524	CGC	2	6	435772	435777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057087
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12590	NC_010524	CGA	2	6	436395	436400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057087
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12593	NC_010524	TGG	2	6	436481	436486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057087
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12599	NC_010524	ACT	2	6	436760	436765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057087
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12604	NC_010524	GC	4	8	436870	436877	0 %	0 %	50 %	50 %	171057088
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12721	NC_010524	CGG	3	9	440887	440895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12862	NC_010524	CGGCCA	2	12	445405	445416	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057097
12863	NC_010524	CGC	4	12	445429	445440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057097
12864	NC_010524	CGG	2	6	445512	445517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057098
12865	NC_010524	GCC	2	6	445520	445525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057098
12866	NC_010524	CTG	2	6	445544	445549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057098
12867	NC_010524	GGC	2	6	445561	445566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057098
12868	NC_010524	CGC	2	6	445567	445572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057098
12869	NC_010524	CTG	2	6	445598	445603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057098
12870	NC_010524	GCA	2	6	445606	445611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057098
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12872	NC_010524	CTT	2	6	445654	445659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057098
12873	NC_010524	TGA	2	6	445677	445682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057098
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12877	NC_010524	CGG	2	6	445786	445791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057098
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12879	NC_010524	GCT	2	6	445834	445839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057098
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12882	NC_010524	CCG	2	6	445925	445930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057098
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12888	NC_010524	AGC	2	6	446109	446114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057098
12889	NC_010524	TGC	2	6	446139	446144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057098
12890	NC_010524	ATC	2	6	446153	446158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057098
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12892	NC_010524	CGG	2	6	446232	446237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057098
12893	NC_010524	GGCC	2	8	446287	446294	0 %	0 %	50 %	50 %	171057098
12894	NC_010524	GTG	2	6	446306	446311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057098
12895	NC_010524	CTG	2	6	446312	446317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057098
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12898	NC_010524	CTG	2	6	446438	446443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057098
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12901	NC_010524	CAT	2	6	446551	446556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057098
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12903	NC_010524	CAC	2	6	446602	446607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057098
12904	NC_010524	TCA	2	6	446613	446618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057098
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12909	NC_010524	ACG	2	6	446823	446828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057099
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12911	NC_010524	TCG	2	6	446898	446903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057099
12912	NC_010524	CGA	2	6	446920	446925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057099
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12923	NC_010524	CTG	2	6	447248	447253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057099
12924	NC_010524	GC	3	6	447254	447259	0 %	0 %	50 %	50 %	171057099
12925	NC_010524	ACG	2	6	447288	447293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057099
12926	NC_010524	CGG	2	6	447318	447323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057099
12927	NC_010524	CGA	2	6	447334	447339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057099
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12930	NC_010524	TTC	2	6	447410	447415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057099
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12933	NC_010524	TCGA	2	8	447488	447495	25 %	25 %	25 %	25 %	171057099
12934	NC_010524	GCCCA	2	10	447527	447536	20 %	0 %	20 %	60 %	171057099
12935	NC_010524	GCCGC	2	10	447537	447546	0 %	0 %	40 %	60 %	171057099
12936	NC_010524	CGG	2	6	447585	447590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057099
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12939	NC_010524	CGCGT	2	10	447672	447681	0 %	20 %	40 %	40 %	171057100
12940	NC_010524	GCA	2	6	447691	447696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057100
12941	NC_010524	GGT	2	6	447716	447721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057100
12942	NC_010524	TCGA	2	8	447732	447739	25 %	25 %	25 %	25 %	171057100
12943	NC_010524	GC	3	6	447751	447756	0 %	0 %	50 %	50 %	171057100
12944	NC_010524	CAG	2	6	447758	447763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057100
12945	NC_010524	CGCGAT	2	12	447788	447799	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057100
12946	NC_010524	CGGCG	2	10	448021	448030	0 %	0 %	60 %	40 %	171057100
12947	NC_010524	GC	3	6	448072	448077	0 %	0 %	50 %	50 %	171057100
12948	NC_010524	GCG	2	6	448086	448091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057100
12949	NC_010524	TCTCGC	2	12	448120	448131	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	171057100
12950	NC_010524	CG	3	6	448140	448145	0 %	0 %	50 %	50 %	171057100
12951	NC_010524	GGC	3	9	448150	448158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057100
12952	NC_010524	CGC	3	9	448183	448191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057100
12953	NC_010524	GCC	2	6	448199	448204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057100
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12958	NC_010524	CGAC	2	8	448381	448388	25 %	0 %	25 %	50 %	171057100
12959	NC_010524	AGC	2	6	448389	448394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057100
12960	NC_010524	GTG	2	6	448454	448459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057100
12961	NC_010524	CGA	2	6	448474	448479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057100
12962	NC_010524	GC	4	8	448492	448499	0 %	0 %	50 %	50 %	171057100
12963	NC_010524	GCG	2	6	448538	448543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057100
12964	NC_010524	CTC	2	6	448601	448606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057100
12965	NC_010524	CGA	2	6	448619	448624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057100
12966	NC_010524	GGC	2	6	448625	448630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057100
12967	NC_010524	GCGG	3	12	448654	448665	0 %	0 %	75 %	25 %	171057100
12968	NC_010524	CCG	2	6	448708	448713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12969	NC_010524	GCT	2	6	448732	448737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057101
12970	NC_010524	GCC	2	6	448743	448748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057101
12971	NC_010524	ACC	2	6	448833	448838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057101
12972	NC_010524	CG	3	6	448839	448844	0 %	0 %	50 %	50 %	171057101
12973	NC_010524	TGA	2	6	448852	448857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057101
12974	NC_010524	CGT	2	6	448864	448869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057101
12975	NC_010524	GC	3	6	448881	448886	0 %	0 %	50 %	50 %	171057101
12976	NC_010524	GCGCG	2	10	448912	448921	0 %	0 %	60 %	40 %	171057101
12977	NC_010524	TTG	2	6	448935	448940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057101
12978	NC_010524	ATGCCG	2	12	448953	448964	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057101
12979	NC_010524	CAG	2	6	448976	448981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057101
12980	NC_010524	CGC	2	6	448996	449001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057101
12981	NC_010524	GC	3	6	449000	449005	0 %	0 %	50 %	50 %	171057101
12982	NC_010524	CGTG	2	8	449059	449066	0 %	25 %	50 %	25 %	171057101
12983	NC_010524	GCG	2	6	449094	449099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057101
12984	NC_010524	GGC	2	6	449132	449137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057101
12985	NC_010524	TCG	2	6	449139	449144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057101
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12987	NC_010524	GGC	2	6	449299	449304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12988	NC_010524	GGC	2	6	449329	449334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12989	NC_010524	TCA	3	9	449407	449415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12990	NC_010524	TCA	2	6	449471	449476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057102
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12993	NC_010524	CGC	2	6	449529	449534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057102
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12996	NC_010524	GGC	2	6	449620	449625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057102
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12998	NC_010524	GC	3	6	449736	449741	0 %	0 %	50 %	50 %	171057102
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13000	NC_010524	GCCT	2	8	449764	449771	0 %	25 %	25 %	50 %	171057102

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