MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
127001	NC_010524	CGC	2	6	4527780	4527785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060710
127002	NC_010524	CGC	2	6	4527807	4527812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060710
127003	NC_010524	GCG	2	6	4527826	4527831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060710
127004	NC_010524	CCA	2	6	4527836	4527841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060710
127005	NC_010524	TCT	2	6	4527860	4527865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060710
127006	NC_010524	CGC	2	6	4527867	4527872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060710
127007	NC_010524	CG	3	6	4527904	4527909	0 %	0 %	50 %	50 %	171060710
127008	NC_010524	TCG	2	6	4527929	4527934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060710
127009	NC_010524	CG	3	6	4528004	4528009	0 %	0 %	50 %	50 %	171060710
127010	NC_010524	ACG	2	6	4528118	4528123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060710
127011	NC_010524	GC	4	8	4528209	4528216	0 %	0 %	50 %	50 %	171060710
127012	NC_010524	CGG	2	6	4528223	4528228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060710
127013	NC_010524	GGT	2	6	4528257	4528262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060710
127014	NC_010524	GCG	2	6	4528268	4528273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060710
127015	NC_010524	CCG	2	6	4528281	4528286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060710
127016	NC_010524	CGA	2	6	4528287	4528292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060710
127017	NC_010524	CGA	2	6	4528332	4528337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060710
127018	NC_010524	TGC	2	6	4528388	4528393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060710
127019	NC_010524	CTG	2	6	4528396	4528401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060710
127020	NC_010524	CACCCG	2	12	4528422	4528433	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	171060710
127021	NC_010524	CGA	2	6	4528440	4528445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060710
127022	NC_010524	GAG	2	6	4528531	4528536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060710
127023	NC_010524	ACG	2	6	4528602	4528607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127024	NC_010524	CCG	2	6	4528662	4528667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060711
127025	NC_010524	CGG	2	6	4528677	4528682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060711
127026	NC_010524	GCCG	2	8	4528690	4528697	0 %	0 %	50 %	50 %	171060711
127027	NC_010524	GGC	2	6	4528699	4528704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060711
127028	NC_010524	GGCG	2	8	4528726	4528733	0 %	0 %	75 %	25 %	171060711
127029	NC_010524	GTGGCG	2	12	4528753	4528764	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	171060711
127030	NC_010524	CTG	2	6	4528765	4528770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060711
127031	NC_010524	CTG	2	6	4528813	4528818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060711
127032	NC_010524	GGC	3	9	4528819	4528827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060711
127033	NC_010524	CACGC	2	10	4528866	4528875	20 %	0 %	20 %	60 %	171060711
127034	NC_010524	GCCGC	2	10	4528876	4528885	0 %	0 %	40 %	60 %	171060711
127035	NC_010524	TCG	2	6	4528904	4528909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060711
127036	NC_010524	GGTGCT	2	12	4528983	4528994	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	171060711
127037	NC_010524	CAC	2	6	4529004	4529009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060711
127038	NC_010524	GCG	2	6	4529035	4529040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060711
127039	NC_010524	ACCTCG	2	12	4529078	4529089	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171060711
127040	NC_010524	CTT	2	6	4529091	4529096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060711
127041	NC_010524	GC	3	6	4529120	4529125	0 %	0 %	50 %	50 %	171060711
127042	NC_010524	GTG	2	6	4529149	4529154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060711
127043	NC_010524	CCA	2	6	4529169	4529174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060711
127044	NC_010524	GCG	2	6	4529189	4529194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060711
127045	NC_010524	CAC	2	6	4529302	4529307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060711
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127047	NC_010524	CGA	2	6	4529346	4529351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060711
127048	NC_010524	CGA	2	6	4529379	4529384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060711
127049	NC_010524	CGG	2	6	4529403	4529408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060711
127050	NC_010524	CACG	2	8	4529430	4529437	25 %	0 %	25 %	50 %	171060711
127051	NC_010524	GCA	2	6	4529438	4529443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060711
127052	NC_010524	AGC	2	6	4529447	4529452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060711
127053	NC_010524	CTG	2	6	4529605	4529610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127054	NC_010524	CGG	5	15	4529622	4529636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127055	NC_010524	TTC	2	6	4529638	4529643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127056	NC_010524	GCG	2	6	4529651	4529656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127057	NC_010524	CTG	2	6	4529659	4529664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127058	NC_010524	GCG	2	6	4529690	4529695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127059	NC_010524	CTGG	2	8	4529701	4529708	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127060	NC_010524	CTG	4	12	4529716	4529727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127061	NC_010524	GGC	2	6	4529731	4529736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127062	NC_010524	CAG	2	6	4529815	4529820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127063	NC_010524	CAC	2	6	4529952	4529957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127064	NC_010524	CAGGC	2	10	4529964	4529973	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127065	NC_010524	CGA	2	6	4529996	4530001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127066	NC_010524	CGA	2	6	4530029	4530034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127067	NC_010524	CGG	2	6	4530053	4530058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127068	NC_010524	CACG	2	8	4530080	4530087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127069	NC_010524	GCA	2	6	4530088	4530093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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127072	NC_010524	CGG	5	15	4530272	4530286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060712
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127074	NC_010524	GCG	2	6	4530301	4530306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060712
127075	NC_010524	CTG	2	6	4530309	4530314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060712
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127077	NC_010524	CTGG	2	8	4530351	4530358	0 %	25 %	50 %	25 %	171060712
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127088	NC_010524	CGG	2	6	4530749	4530754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060712
127089	NC_010524	TGGC	2	8	4530772	4530779	0 %	25 %	50 %	25 %	171060712
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127095	NC_010524	TCG	2	6	4531024	4531029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060712
127096	NC_010524	CG	3	6	4531028	4531033	0 %	0 %	50 %	50 %	171060712
127097	NC_010524	GCCACC	2	12	4531081	4531092	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	171060712
127098	NC_010524	TGC	2	6	4531115	4531120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060712
127099	NC_010524	GC	3	6	4531119	4531124	0 %	0 %	50 %	50 %	171060712
127100	NC_010524	CAG	3	9	4531164	4531172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060712
127101	NC_010524	CAGC	2	8	4531175	4531182	25 %	0 %	25 %	50 %	171060712
127102	NC_010524	GC	3	6	4531223	4531228	0 %	0 %	50 %	50 %	171060712
127103	NC_010524	GCA	2	6	4531232	4531237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060712
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127105	NC_010524	GGC	4	12	4531377	4531388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060712
127106	NC_010524	GCGG	2	8	4531392	4531399	0 %	0 %	75 %	25 %	171060712
127107	NC_010524	CATGTC	2	12	4531413	4531424	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	171060712
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127111	NC_010524	GC	3	6	4531510	4531515	0 %	0 %	50 %	50 %	171060712
127112	NC_010524	CGC	2	6	4531545	4531550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060712
127113	NC_010524	GC	3	6	4531561	4531566	0 %	0 %	50 %	50 %	171060712
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127346	NC_010524	GCTG	2	8	4539856	4539863	0 %	25 %	50 %	25 %	171060721
127347	NC_010524	GTG	2	6	4539939	4539944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060721
127348	NC_010524	GCT	2	6	4539967	4539972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060721
127349	NC_010524	TCG	2	6	4539973	4539978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060721
127350	NC_010524	GCA	2	6	4539997	4540002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060721
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127357	NC_010524	CCG	2	6	4540202	4540207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127358	NC_010524	GGC	2	6	4540208	4540213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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127363	NC_010524	GCT	2	6	4540376	4540381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060722
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127367	NC_010524	GC	3	6	4540506	4540511	0 %	0 %	50 %	50 %	171060722
127368	NC_010524	CGC	2	6	4540514	4540519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060722
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127372	NC_010524	GAG	2	6	4540630	4540635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060722
127373	NC_010524	GC	3	6	4540743	4540748	0 %	0 %	50 %	50 %	171060722
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127452	NC_010524	CCG	2	6	4543061	4543066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060724
127453	NC_010524	GGT	3	9	4543141	4543149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060724
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127460	NC_010524	GCG	2	6	4543246	4543251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060724
127461	NC_010524	CGG	2	6	4543276	4543281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060724
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127464	NC_010524	GCT	2	6	4543384	4543389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060724
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