MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
126001	NC_010524	AGA	2	6	4494057	4494062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060680
126002	NC_010524	GCT	2	6	4494064	4494069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060680
126003	NC_010524	GCC	2	6	4494087	4494092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060680
126004	NC_010524	GC	4	8	4494169	4494176	0 %	0 %	50 %	50 %	171060680
126005	NC_010524	GCT	2	6	4494217	4494222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060680
126006	NC_010524	CTG	2	6	4494239	4494244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060680
126007	NC_010524	CGA	2	6	4494286	4494291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060680
126008	NC_010524	CTG	3	9	4494293	4494301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060680
126009	NC_010524	GCT	2	6	4494304	4494309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060680
126010	NC_010524	AAC	2	6	4494315	4494320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060680
126011	NC_010524	GCT	3	9	4494334	4494342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060680
126012	NC_010524	CGG	2	6	4494361	4494366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060680
126013	NC_010524	TCG	2	6	4494369	4494374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060680
126014	NC_010524	GGC	2	6	4494377	4494382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060680
126015	NC_010524	GCT	2	6	4494409	4494414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060680
126016	NC_010524	TGT	2	6	4494420	4494425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060680
126017	NC_010524	GCA	2	6	4494484	4494489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126018	NC_010524	TGC	2	6	4494595	4494600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060681
126019	NC_010524	AGA	2	6	4494601	4494606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060681
126020	NC_010524	GCG	2	6	4494640	4494645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060681
126021	NC_010524	GC	3	6	4494670	4494675	0 %	0 %	50 %	50 %	171060681
126022	NC_010524	CGG	2	6	4494725	4494730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060681
126023	NC_010524	GCC	2	6	4494732	4494737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060681
126024	NC_010524	GCG	4	12	4494747	4494758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060681
126025	NC_010524	CAG	2	6	4494773	4494778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060681
126026	NC_010524	GCCG	2	8	4494788	4494795	0 %	0 %	50 %	50 %	171060681
126027	NC_010524	CGC	2	6	4494800	4494805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060681
126028	NC_010524	CGC	2	6	4494832	4494837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060681
126029	NC_010524	GCG	2	6	4494847	4494852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060681
126030	NC_010524	GCACCG	2	12	4494874	4494885	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126031	NC_010524	CCCCT	2	10	4494886	4494895	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
126032	NC_010524	GAA	2	6	4494918	4494923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060682
126033	NC_010524	CAT	2	6	4494927	4494932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060682
126034	NC_010524	GGT	2	6	4494987	4494992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060682
126035	NC_010524	GCT	2	6	4495020	4495025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060682
126036	NC_010524	CGGTG	2	10	4495035	4495044	0 %	20 %	60 %	20 %	171060682
126037	NC_010524	GCCG	2	8	4495047	4495054	0 %	0 %	50 %	50 %	171060682
126038	NC_010524	TGC	3	9	4495103	4495111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060682
126039	NC_010524	TGC	2	6	4495124	4495129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060682
126040	NC_010524	TCG	2	6	4495142	4495147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060682
126041	NC_010524	TCG	2	6	4495154	4495159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060682
126042	NC_010524	GTG	2	6	4495164	4495169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060682
126043	NC_010524	AGC	2	6	4495261	4495266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060682
126044	NC_010524	CGG	2	6	4495347	4495352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060682
126045	NC_010524	CGA	2	6	4495374	4495379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060682
126046	NC_010524	CGA	2	6	4495400	4495405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060682
126047	NC_010524	CTT	2	6	4495425	4495430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060682
126048	NC_010524	CG	3	6	4495442	4495447	0 %	0 %	50 %	50 %	171060682
126049	NC_010524	CGA	2	6	4495476	4495481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060682
126050	NC_010524	CAT	2	6	4495494	4495499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060682
126051	NC_010524	ACGGCA	2	12	4495523	4495534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060682
126052	NC_010524	C	6	6	4495588	4495593	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
126053	NC_010524	GCC	2	6	4495611	4495616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126054	NC_010524	CAGG	2	8	4495635	4495642	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126055	NC_010524	GCA	2	6	4495673	4495678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060683
126056	NC_010524	CGG	2	6	4495758	4495763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060683
126057	NC_010524	CCG	2	6	4495844	4495849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060683
126058	NC_010524	TCG	2	6	4495880	4495885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060683
126059	NC_010524	GC	5	10	4495893	4495902	0 %	0 %	50 %	50 %	171060683
126060	NC_010524	CGC	2	6	4495988	4495993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060683
126061	NC_010524	CGA	3	9	4496004	4496012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060683
126062	NC_010524	ACC	2	6	4496026	4496031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060683
126063	NC_010524	GCC	2	6	4496060	4496065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060683
126064	NC_010524	AGA	2	6	4496075	4496080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060683
126065	NC_010524	TGC	2	6	4496087	4496092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060683
126066	NC_010524	CATCGA	2	12	4496142	4496153	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	171060683
126067	NC_010524	ACG	2	6	4496219	4496224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060683
126068	NC_010524	TTC	2	6	4496230	4496235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060683
126069	NC_010524	AGC	2	6	4496264	4496269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060683
126070	NC_010524	TGG	2	6	4496276	4496281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060683
126071	NC_010524	CTA	2	6	4496295	4496300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060683
126072	NC_010524	CGA	2	6	4496322	4496327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060683
126073	NC_010524	GC	3	6	4496334	4496339	0 %	0 %	50 %	50 %	171060683
126074	NC_010524	TCT	2	6	4496588	4496593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060683
126075	NC_010524	CCGCGC	2	12	4496594	4496605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060683
126076	NC_010524	CGT	2	6	4496622	4496627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060683
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126079	NC_010524	ACG	2	6	4496735	4496740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060683
126080	NC_010524	ACG	2	6	4496789	4496794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060683
126081	NC_010524	ATC	2	6	4496809	4496814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060683
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126083	NC_010524	GGT	2	6	4496871	4496876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060683
126084	NC_010524	GC	3	6	4496891	4496896	0 %	0 %	50 %	50 %	171060683
126085	NC_010524	AAG	2	6	4496929	4496934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060683
126086	NC_010524	GGT	2	6	4496970	4496975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060683
126087	NC_010524	ACG	3	9	4496996	4497004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060683
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126091	NC_010524	CGC	3	9	4497260	4497268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060683
126092	NC_010524	TGGCC	2	10	4497273	4497282	0 %	20 %	40 %	40 %	171060683
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126094	NC_010524	GC	3	6	4497360	4497365	0 %	0 %	50 %	50 %	171060683
126095	NC_010524	CTG	2	6	4497373	4497378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060683
126096	NC_010524	GC	3	6	4497383	4497388	0 %	0 %	50 %	50 %	171060683
126097	NC_010524	CGA	2	6	4497399	4497404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060683
126098	NC_010524	AGC	2	6	4497407	4497412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060683
126099	NC_010524	CGGC	2	8	4497449	4497456	0 %	0 %	50 %	50 %	171060683
126100	NC_010524	CACC	2	8	4497474	4497481	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
126101	NC_010524	CG	3	6	4497495	4497500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126102	NC_010524	CGC	2	6	4497599	4497604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126103	NC_010524	CCCGG	2	10	4497666	4497675	0 %	0 %	40 %	60 %	171060684
126104	NC_010524	GTC	2	6	4497683	4497688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060684
126105	NC_010524	GCT	2	6	4497691	4497696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060684
126106	NC_010524	TGC	2	6	4497702	4497707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060684
126107	NC_010524	GCG	2	6	4497732	4497737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060684
126108	NC_010524	CGG	2	6	4497754	4497759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060684
126109	NC_010524	GCT	3	9	4497769	4497777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060684
126110	NC_010524	GCT	2	6	4497781	4497786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060684
126111	NC_010524	ACGC	2	8	4497788	4497795	25 %	0 %	25 %	50 %	171060684
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126113	NC_010524	GTG	2	6	4497890	4497895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060684
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126228	NC_010524	GCG	2	6	4501591	4501596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060688
126229	NC_010524	AGC	2	6	4501606	4501611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060688
126230	NC_010524	CAC	2	6	4501620	4501625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060688
126231	NC_010524	GGT	2	6	4501626	4501631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060688
126232	NC_010524	CAC	2	6	4501674	4501679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060688
126233	NC_010524	TCA	2	6	4501730	4501735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060688
126234	NC_010524	TCG	2	6	4501813	4501818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060688
126235	NC_010524	GCA	2	6	4501832	4501837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060688
126236	NC_010524	GC	3	6	4501953	4501958	0 %	0 %	50 %	50 %	171060688
126237	NC_010524	CCAG	2	8	4501970	4501977	25 %	0 %	25 %	50 %	171060688
126238	NC_010524	TGA	2	6	4502003	4502008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060688
126239	NC_010524	TCA	2	6	4502045	4502050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060688
126240	NC_010524	GCC	2	6	4502067	4502072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060688
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126245	NC_010524	GCG	2	6	4502254	4502259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126246	NC_010524	CTCGG	2	10	4502263	4502272	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126247	NC_010524	GC	3	6	4502331	4502336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126248	NC_010524	GCC	2	6	4502343	4502348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126249	NC_010524	CCG	2	6	4502385	4502390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126250	NC_010524	CAG	2	6	4502438	4502443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060689
126251	NC_010524	GCC	2	6	4502450	4502455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060689
126252	NC_010524	CGA	2	6	4502498	4502503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060689
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126254	NC_010524	TGG	2	6	4502550	4502555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060689
126255	NC_010524	TGC	2	6	4502593	4502598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060689
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126261	NC_010524	CCA	3	9	4502755	4502763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060689
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126264	NC_010524	GGCCA	2	10	4502918	4502927	20 %	0 %	40 %	40 %	171060689
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126270	NC_010524	GGC	2	6	4503192	4503197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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126273	NC_010524	CAGCGT	2	12	4503312	4503323	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060690
126274	NC_010524	GC	3	6	4503392	4503397	0 %	0 %	50 %	50 %	171060690
126275	NC_010524	CGT	2	6	4503401	4503406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060690
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126304	NC_010524	CCG	2	6	4504055	4504060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060690
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126307	NC_010524	ATG	2	6	4504126	4504131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060690
126308	NC_010524	CG	3	6	4504134	4504139	0 %	0 %	50 %	50 %	171060690
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126311	NC_010524	GCG	2	6	4504180	4504185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060690
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126314	NC_010524	CG	3	6	4504258	4504263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126315	NC_010524	AAG	2	6	4504309	4504314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060691
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126318	NC_010524	CGA	2	6	4504376	4504381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060691
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126322	NC_010524	ATC	2	6	4504453	4504458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060691
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126327	NC_010524	GCC	2	6	4504602	4504607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060691
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126329	NC_010524	CG	4	8	4504673	4504680	0 %	0 %	50 %	50 %	171060691
126330	NC_010524	CGT	2	6	4504685	4504690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060691
126331	NC_010524	GGTC	2	8	4504808	4504815	0 %	25 %	50 %	25 %	171060691
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126334	NC_010524	ACC	2	6	4504927	4504932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060691
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126336	NC_010524	TCTGGA	2	12	4505006	4505017	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171060691
126337	NC_010524	CGG	2	6	4505021	4505026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060691
126338	NC_010524	GAT	2	6	4505040	4505045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060692
126339	NC_010524	TCT	3	9	4505051	4505059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060692
126340	NC_010524	GAC	2	6	4505106	4505111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060692
126341	NC_010524	GGC	2	6	4505112	4505117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060692
126342	NC_010524	AGGT	2	8	4505122	4505129	25 %	25 %	50 %	0 %	171060692
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126346	NC_010524	GCA	2	6	4505252	4505257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060692
126347	NC_010524	GCA	2	6	4505276	4505281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060692
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126352	NC_010524	GCCG	2	8	4505441	4505448	0 %	0 %	50 %	50 %	171060692
126353	NC_010524	CAG	2	6	4505451	4505456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060692
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126453	NC_010524	CCG	2	6	4509017	4509022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060696
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126489	NC_010524	CGG	2	6	4510217	4510222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060696
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126494	NC_010524	G	6	6	4510397	4510402	0 %	0 %	100 %	0 %	171060696
126495	NC_010524	GCG	2	6	4510422	4510427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060696
126496	NC_010524	TGA	2	6	4510457	4510462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126497	NC_010524	GCG	2	6	4510521	4510526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060697
126498	NC_010524	TGC	2	6	4510554	4510559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060697
126499	NC_010524	ATGCCG	2	12	4510565	4510576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060697
126500	NC_010524	CGG	2	6	4510606	4510611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060697

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