MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
125501	NC_010524	TCGACA	2	12	4474347	4474358	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	171060657
125502	NC_010524	CCG	2	6	4474359	4474364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060657
125503	NC_010524	GTCGA	2	10	4474367	4474376	20 %	20 %	40 %	20 %	171060657
125504	NC_010524	GCT	2	6	4474486	4474491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060657
125505	NC_010524	TGT	2	6	4474500	4474505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060657
125506	NC_010524	GGCG	2	8	4474519	4474526	0 %	0 %	75 %	25 %	171060657
125507	NC_010524	CGA	2	6	4474564	4474569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060657
125508	NC_010524	CTG	2	6	4474634	4474639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060657
125509	NC_010524	GCC	2	6	4474644	4474649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060657
125510	NC_010524	GCCG	2	8	4474660	4474667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125511	NC_010524	CCT	2	6	4474692	4474697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060658
125512	NC_010524	GTC	2	6	4474724	4474729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060658
125513	NC_010524	GGCC	2	8	4474816	4474823	0 %	0 %	50 %	50 %	171060658
125514	NC_010524	CGC	2	6	4474877	4474882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060658
125515	NC_010524	CGGC	2	8	4474973	4474980	0 %	0 %	50 %	50 %	171060658
125516	NC_010524	GC	4	8	4475005	4475012	0 %	0 %	50 %	50 %	171060658
125517	NC_010524	GCG	2	6	4475032	4475037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060658
125518	NC_010524	CAC	2	6	4475091	4475096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060658
125519	NC_010524	CCGGC	2	10	4475202	4475211	0 %	0 %	40 %	60 %	171060658
125520	NC_010524	CGC	3	9	4475221	4475229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060658
125521	NC_010524	CGA	2	6	4475230	4475235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060658
125522	NC_010524	CGAGGC	2	12	4475248	4475259	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171060658
125523	NC_010524	GGCC	2	8	4475274	4475281	0 %	0 %	50 %	50 %	171060658
125524	NC_010524	GAACA	2	10	4475339	4475348	60 %	0 %	20 %	20 %	171060658
125525	NC_010524	ACG	2	6	4475376	4475381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060658
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125527	NC_010524	CGA	2	6	4475398	4475403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060658
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125529	NC_010524	CGG	2	6	4475487	4475492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060658
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125531	NC_010524	TGG	2	6	4475531	4475536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060658
125532	NC_010524	CTG	3	9	4475555	4475563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060658
125533	NC_010524	GCG	2	6	4475564	4475569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060658
125534	NC_010524	CTGTGC	2	12	4475572	4475583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060658
125535	NC_010524	TGC	3	9	4475595	4475603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060658
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125537	NC_010524	GC	3	6	4475676	4475681	0 %	0 %	50 %	50 %	171060658
125538	NC_010524	TGG	2	6	4475724	4475729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060658
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125541	NC_010524	CGC	2	6	4475848	4475853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060658
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125543	NC_010524	CAGG	2	8	4475896	4475903	25 %	0 %	50 %	25 %	171060658
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125545	NC_010524	CGC	2	6	4475986	4475991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060658
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125547	NC_010524	GACCG	2	10	4476045	4476054	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
125548	NC_010524	AGG	2	6	4476076	4476081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125549	NC_010524	GGC	2	6	4476085	4476090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060659
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125553	NC_010524	CAT	2	6	4476274	4476279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060659
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125565	NC_010524	A	7	7	4476635	4476641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125566	NC_010524	CG	3	6	4476735	4476740	0 %	0 %	50 %	50 %	171060660
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125589	NC_010524	ACG	2	6	4477691	4477696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060663
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125600	NC_010524	CG	3	6	4478104	4478109	0 %	0 %	50 %	50 %	171060663
125601	NC_010524	GCG	2	6	4478119	4478124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060663
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125606	NC_010524	CG	3	6	4478352	4478357	0 %	0 %	50 %	50 %	171060663
125607	NC_010524	GCG	2	6	4478363	4478368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060663
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125615	NC_010524	GACC	2	8	4478772	4478779	25 %	0 %	25 %	50 %	171060664
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125622	NC_010524	CT	3	6	4479161	4479166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125623	NC_010524	CTT	2	6	4479172	4479177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060666
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