MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
125001	NC_010524	CGG	2	6	4456816	4456821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060638
125002	NC_010524	GCA	2	6	4456839	4456844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060638
125003	NC_010524	CTGCG	2	10	4456897	4456906	0 %	20 %	40 %	40 %	171060638
125004	NC_010524	CCGAG	2	10	4456974	4456983	20 %	0 %	40 %	40 %	171060638
125005	NC_010524	GCT	3	9	4456989	4456997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060638
125006	NC_010524	CGA	2	6	4457002	4457007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060638
125007	NC_010524	CGC	2	6	4457037	4457042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060638
125008	NC_010524	CGGGCG	2	12	4457043	4457054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060638
125009	NC_010524	GCCG	2	8	4457071	4457078	0 %	0 %	50 %	50 %	171060638
125010	NC_010524	GCC	2	6	4457107	4457112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060638
125011	NC_010524	TGA	2	6	4457130	4457135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060638
125012	NC_010524	CGC	2	6	4457137	4457142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060638
125013	NC_010524	GTGG	2	8	4457155	4457162	0 %	25 %	75 %	0 %	171060638
125014	NC_010524	GTC	2	6	4457206	4457211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060638
125015	NC_010524	TCG	2	6	4457243	4457248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060638
125016	NC_010524	GTT	2	6	4457263	4457268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060638
125017	NC_010524	AGA	2	6	4457353	4457358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125018	NC_010524	GAA	2	6	4457382	4457387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060639
125019	NC_010524	TCG	2	6	4457393	4457398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060639
125020	NC_010524	CCG	2	6	4457438	4457443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060639
125021	NC_010524	CGT	2	6	4457445	4457450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060639
125022	NC_010524	CCG	2	6	4457459	4457464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060639
125023	NC_010524	CGA	2	6	4457583	4457588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060639
125024	NC_010524	ACC	2	6	4457654	4457659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060639
125025	NC_010524	CGC	2	6	4457670	4457675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060639
125026	NC_010524	CAG	2	6	4457722	4457727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060639
125027	NC_010524	GCCA	2	8	4457798	4457805	25 %	0 %	25 %	50 %	171060639
125028	NC_010524	TTG	2	6	4457882	4457887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060639
125029	NC_010524	CCT	2	6	4457903	4457908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060640
125030	NC_010524	TCT	2	6	4457925	4457930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060640
125031	NC_010524	TCG	2	6	4457939	4457944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060640
125032	NC_010524	GAC	2	6	4457959	4457964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060640
125033	NC_010524	CG	3	6	4458060	4458065	0 %	0 %	50 %	50 %	171060640
125034	NC_010524	CAC	2	6	4458106	4458111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060640
125035	NC_010524	ATCAGG	2	12	4458116	4458127	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	171060640
125036	NC_010524	GCG	2	6	4458148	4458153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060640
125037	NC_010524	TCG	2	6	4458161	4458166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060640
125038	NC_010524	CGG	2	6	4458174	4458179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060640
125039	NC_010524	GGC	2	6	4458198	4458203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060640
125040	NC_010524	CAG	2	6	4458205	4458210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060640
125041	NC_010524	CCA	2	6	4458246	4458251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060640
125042	NC_010524	TGT	2	6	4458258	4458263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060640
125043	NC_010524	GCA	2	6	4458288	4458293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125044	NC_010524	CCG	2	6	4458343	4458348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125045	NC_010524	GCA	2	6	4458388	4458393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060641
125046	NC_010524	CG	3	6	4458448	4458453	0 %	0 %	50 %	50 %	171060641
125047	NC_010524	GAC	2	6	4458477	4458482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060641
125048	NC_010524	TGA	2	6	4458523	4458528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060641
125049	NC_010524	AGA	2	6	4458574	4458579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060641
125050	NC_010524	CAC	2	6	4458638	4458643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060641
125051	NC_010524	GCC	2	6	4458650	4458655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060641
125052	NC_010524	GTC	2	6	4458698	4458703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060641
125053	NC_010524	CACG	2	8	4458733	4458740	25 %	0 %	25 %	50 %	171060641
125054	NC_010524	GCT	2	6	4458774	4458779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060641
125055	NC_010524	ATCAC	2	10	4458806	4458815	40 %	20 %	0 %	40 %	171060642
125056	NC_010524	TCGA	2	8	4459129	4459136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125057	NC_010524	GA	3	6	4459154	4459159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125058	NC_010524	TGA	2	6	4459176	4459181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060643
125059	NC_010524	ACC	2	6	4459268	4459273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060643
125060	NC_010524	CGG	2	6	4459279	4459284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060643
125061	NC_010524	CGC	2	6	4459309	4459314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060643
125062	NC_010524	GGC	2	6	4459319	4459324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060643
125063	NC_010524	CAC	2	6	4459342	4459347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060643
125064	NC_010524	CCG	2	6	4459365	4459370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060643
125065	NC_010524	GGT	2	6	4459405	4459410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060643
125066	NC_010524	CCG	2	6	4459476	4459481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060643
125067	NC_010524	CGA	3	9	4459564	4459572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060643
125068	NC_010524	CGC	2	6	4459576	4459581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060643
125069	NC_010524	AGA	2	6	4459647	4459652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060643
125070	NC_010524	CTG	2	6	4459667	4459672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060643
125071	NC_010524	CCG	2	6	4459694	4459699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060643
125072	NC_010524	GC	3	6	4459703	4459708	0 %	0 %	50 %	50 %	171060643
125073	NC_010524	TGGCGG	2	12	4459713	4459724	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	171060643
125074	NC_010524	CAA	2	6	4459774	4459779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060643
125075	NC_010524	CGC	2	6	4459803	4459808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060643
125076	NC_010524	CGC	2	6	4459846	4459851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060643
125077	NC_010524	GCT	2	6	4459894	4459899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060643
125078	NC_010524	GGCCT	2	10	4459937	4459946	0 %	20 %	40 %	40 %	171060643
125079	NC_010524	CCGGC	2	10	4459975	4459984	0 %	0 %	40 %	60 %	171060643
125080	NC_010524	TCT	2	6	4460010	4460015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060643
125081	NC_010524	GCC	2	6	4460023	4460028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060643
125082	NC_010524	GAA	2	6	4460033	4460038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060643
125083	NC_010524	GAA	2	6	4460042	4460047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060643
125084	NC_010524	CCG	2	6	4460084	4460089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060643
125085	NC_010524	ACA	2	6	4460110	4460115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060643
125086	NC_010524	GC	3	6	4460119	4460124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125087	NC_010524	AGC	2	6	4460166	4460171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060644
125088	NC_010524	CGG	2	6	4460210	4460215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060644
125089	NC_010524	CGC	2	6	4460257	4460262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060644
125090	NC_010524	CG	4	8	4460270	4460277	0 %	0 %	50 %	50 %	171060644
125091	NC_010524	GAT	2	6	4460345	4460350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060644
125092	NC_010524	CGGCCA	2	12	4460354	4460365	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171060644
125093	NC_010524	CGG	2	6	4460380	4460385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060644
125094	NC_010524	GCC	2	6	4460394	4460399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060644
125095	NC_010524	GC	3	6	4460419	4460424	0 %	0 %	50 %	50 %	171060644
125096	NC_010524	GGC	2	6	4460513	4460518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060644
125097	NC_010524	GCA	2	6	4460557	4460562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060644
125098	NC_010524	GCT	2	6	4460581	4460586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060644
125099	NC_010524	GCT	2	6	4460606	4460611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060644
125100	NC_010524	CGGC	2	8	4460656	4460663	0 %	0 %	50 %	50 %	171060644
125101	NC_010524	GCC	2	6	4460666	4460671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060644
125102	NC_010524	GGT	2	6	4460675	4460680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060644
125103	NC_010524	GCA	2	6	4460681	4460686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060644
125104	NC_010524	AGC	2	6	4460716	4460721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060644
125105	NC_010524	TGA	2	6	4460764	4460769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060644
125106	NC_010524	CGTG	2	8	4460798	4460805	0 %	25 %	50 %	25 %	171060644
125107	NC_010524	GCA	2	6	4460846	4460851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060644
125108	NC_010524	GC	3	6	4460854	4460859	0 %	0 %	50 %	50 %	171060644
125109	NC_010524	CGA	2	6	4460870	4460875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060644
125110	NC_010524	GC	3	6	4460908	4460913	0 %	0 %	50 %	50 %	171060644
125111	NC_010524	CGG	3	9	4460978	4460986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060644
125112	NC_010524	CTG	2	6	4461030	4461035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060644
125113	NC_010524	CAGC	2	8	4461122	4461129	25 %	0 %	25 %	50 %	171060644
125114	NC_010524	CTT	2	6	4461134	4461139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060644
125115	NC_010524	CGC	2	6	4461162	4461167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060644
125116	NC_010524	TGC	2	6	4461185	4461190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060644
125117	NC_010524	GGC	2	6	4461191	4461196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060644
125118	NC_010524	TCG	2	6	4461214	4461219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060644
125119	NC_010524	GGC	2	6	4461231	4461236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060644
125120	NC_010524	CTT	3	9	4461245	4461253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060644
125121	NC_010524	CGAC	2	8	4461304	4461311	25 %	0 %	25 %	50 %	171060644
125122	NC_010524	GC	3	6	4461315	4461320	0 %	0 %	50 %	50 %	171060644
125123	NC_010524	CTT	2	6	4461329	4461334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060644
125124	NC_010524	GCC	2	6	4461399	4461404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060644
125125	NC_010524	CG	4	8	4461440	4461447	0 %	0 %	50 %	50 %	171060644
125126	NC_010524	CTG	2	6	4461493	4461498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125127	NC_010524	CG	3	6	4461535	4461540	0 %	0 %	50 %	50 %	171060645
125128	NC_010524	CCA	2	6	4461542	4461547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060645
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125130	NC_010524	TGC	3	9	4461622	4461630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060645
125131	NC_010524	CGA	2	6	4461665	4461670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060645
125132	NC_010524	CGG	2	6	4461691	4461696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060645
125133	NC_010524	GC	3	6	4461712	4461717	0 %	0 %	50 %	50 %	171060645
125134	NC_010524	CAG	2	6	4461759	4461764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060645
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125137	NC_010524	CG	3	6	4461879	4461884	0 %	0 %	50 %	50 %	171060645
125138	NC_010524	CAA	2	6	4461962	4461967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060645
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125142	NC_010524	CGT	2	6	4462109	4462114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060645
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125177	NC_010524	GGC	2	6	4463581	4463586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060647
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125217	NC_010524	CCGG	2	8	4464886	4464893	0 %	0 %	50 %	50 %	171060647
125218	NC_010524	CGG	2	6	4464919	4464924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060647
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125224	NC_010524	TCG	2	6	4465048	4465053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060648
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125227	NC_010524	GCC	2	6	4465134	4465139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060648
125228	NC_010524	CGC	2	6	4465142	4465147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060648
125229	NC_010524	GGC	3	9	4465149	4465157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060648
125230	NC_010524	GCT	2	6	4465164	4465169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060648
125231	NC_010524	GGCC	2	8	4465187	4465194	0 %	0 %	50 %	50 %	171060648
125232	NC_010524	GCTC	2	8	4465217	4465224	0 %	25 %	25 %	50 %	171060648
125233	NC_010524	GGC	2	6	4465225	4465230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060648
125234	NC_010524	GGCTG	2	10	4465256	4465265	0 %	20 %	60 %	20 %	171060648
125235	NC_010524	CGG	2	6	4465268	4465273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060648
125236	NC_010524	GC	3	6	4465300	4465305	0 %	0 %	50 %	50 %	171060648
125237	NC_010524	GC	3	6	4465312	4465317	0 %	0 %	50 %	50 %	171060648
125238	NC_010524	TCT	2	6	4465361	4465366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060648
125239	NC_010524	CGA	2	6	4465383	4465388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060648
125240	NC_010524	GC	3	6	4465392	4465397	0 %	0 %	50 %	50 %	171060648
125241	NC_010524	CGC	2	6	4465407	4465412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060648
125242	NC_010524	GCC	2	6	4465418	4465423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060648
125243	NC_010524	CGA	2	6	4465455	4465460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060648
125244	NC_010524	CGC	2	6	4465593	4465598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060648
125245	NC_010524	CGAGC	2	10	4465607	4465616	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
125246	NC_010524	CAC	2	6	4465632	4465637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125247	NC_010524	CAT	2	6	4465678	4465683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060649
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125249	NC_010524	ACCG	2	8	4465844	4465851	25 %	0 %	25 %	50 %	171060649
125250	NC_010524	CGG	2	6	4465854	4465859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060649
125251	NC_010524	TGG	2	6	4465869	4465874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060649
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125253	NC_010524	CAA	2	6	4465915	4465920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060649
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125256	NC_010524	GC	3	6	4465996	4466001	0 %	0 %	50 %	50 %	171060649
125257	NC_010524	GC	3	6	4466013	4466018	0 %	0 %	50 %	50 %	171060649
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125260	NC_010524	ACG	2	6	4466268	4466273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060649
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125262	NC_010524	GAG	2	6	4466300	4466305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060649
125263	NC_010524	CGA	2	6	4466335	4466340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060649
125264	NC_010524	GCCG	2	8	4466396	4466403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125265	NC_010524	GC	3	6	4466409	4466414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125266	NC_010524	GCCG	2	8	4466504	4466511	0 %	0 %	50 %	50 %	171060650
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125269	NC_010524	GCCG	2	8	4466614	4466621	0 %	0 %	50 %	50 %	171060650
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125271	NC_010524	CG	4	8	4466716	4466723	0 %	0 %	50 %	50 %	171060650
125272	NC_010524	GCA	2	6	4466752	4466757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060650
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125274	NC_010524	ACT	2	6	4466793	4466798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060650
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125283	NC_010524	GC	4	8	4467034	4467041	0 %	0 %	50 %	50 %	171060650
125284	NC_010524	CTG	2	6	4467050	4467055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060650
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125293	NC_010524	TGC	2	6	4467390	4467395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060650
125294	NC_010524	CGA	2	6	4467397	4467402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060650
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125309	NC_010524	GCCAG	2	10	4467897	4467906	20 %	0 %	40 %	40 %	171060650
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125314	NC_010524	GCT	2	6	4468102	4468107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060650
125315	NC_010524	ATC	2	6	4468112	4468117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060650
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125322	NC_010524	GC	3	6	4468276	4468281	0 %	0 %	50 %	50 %	171060650
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125324	NC_010524	GC	3	6	4468308	4468313	0 %	0 %	50 %	50 %	171060650
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125330	NC_010524	GCCGC	2	10	4468442	4468451	0 %	0 %	40 %	60 %	171060650
125331	NC_010524	CAC	2	6	4468513	4468518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060650
125332	NC_010524	GCCC	2	8	4468537	4468544	0 %	0 %	25 %	75 %	171060650
125333	NC_010524	CGTGA	2	10	4468561	4468570	20 %	20 %	40 %	20 %	171060651
125334	NC_010524	GCT	2	6	4468623	4468628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060651
125335	NC_010524	TCG	2	6	4468670	4468675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060651
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125339	NC_010524	CAG	2	6	4468737	4468742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060651
125340	NC_010524	CGC	2	6	4468751	4468756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060651
125341	NC_010524	CGG	3	9	4468791	4468799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060651
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125343	NC_010524	GCC	2	6	4468833	4468838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060651
125344	NC_010524	ACC	2	6	4468846	4468851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060651
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125460	NC_010524	ATC	2	6	4472841	4472846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060656
125461	NC_010524	GCG	4	12	4472857	4472868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060656
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