MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
124501	NC_010524	CGG	2	6	4440048	4440053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060631
124502	NC_010524	GC	4	8	4440057	4440064	0 %	0 %	50 %	50 %	171060631
124503	NC_010524	CAT	2	6	4440099	4440104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060632
124504	NC_010524	CAG	4	12	4440117	4440128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060632
124505	NC_010524	GCT	2	6	4440143	4440148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060632
124506	NC_010524	GAT	2	6	4440165	4440170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060632
124507	NC_010524	AGCC	2	8	4440193	4440200	25 %	0 %	25 %	50 %	171060632
124508	NC_010524	CTT	2	6	4440215	4440220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060632
124509	NC_010524	CTT	2	6	4440267	4440272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060632
124510	NC_010524	TGG	2	6	4440314	4440319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060632
124511	NC_010524	GCC	2	6	4440330	4440335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060632
124512	NC_010524	TCG	2	6	4440370	4440375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060632
124513	NC_010524	GCA	2	6	4440389	4440394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060632
124514	NC_010524	GCC	2	6	4440420	4440425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060632
124515	NC_010524	TCG	2	6	4440439	4440444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060632
124516	NC_010524	TTC	2	6	4440490	4440495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060632
124517	NC_010524	ACC	2	6	4440565	4440570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060632
124518	NC_010524	CATC	2	8	4440587	4440594	25 %	25 %	0 %	50 %	171060632
124519	NC_010524	CCT	2	6	4440698	4440703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060633
124520	NC_010524	CGC	2	6	4440729	4440734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060633
124521	NC_010524	CGC	2	6	4440783	4440788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060633
124522	NC_010524	CGA	2	6	4440819	4440824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060633
124523	NC_010524	CGC	2	6	4440828	4440833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060633
124524	NC_010524	GAA	2	6	4440858	4440863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060633
124525	NC_010524	CG	3	6	4440913	4440918	0 %	0 %	50 %	50 %	171060633
124526	NC_010524	CGG	2	6	4440922	4440927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060633
124527	NC_010524	CCA	2	6	4440939	4440944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060633
124528	NC_010524	TCG	2	6	4440950	4440955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060633
124529	NC_010524	CTG	2	6	4440967	4440972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060633
124530	NC_010524	CGC	2	6	4441086	4441091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060633
124531	NC_010524	GC	3	6	4441096	4441101	0 %	0 %	50 %	50 %	171060633
124532	NC_010524	GCGCG	2	10	4441113	4441122	0 %	0 %	60 %	40 %	171060633
124533	NC_010524	CGA	2	6	4441179	4441184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060633
124534	NC_010524	GAA	2	6	4441245	4441250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060633
124535	NC_010524	CTA	2	6	4441260	4441265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060633
124536	NC_010524	GC	3	6	4441269	4441274	0 %	0 %	50 %	50 %	171060633
124537	NC_010524	GC	3	6	4441298	4441303	0 %	0 %	50 %	50 %	171060633
124538	NC_010524	CGG	2	6	4441316	4441321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060633
124539	NC_010524	CCGA	2	8	4441366	4441373	25 %	0 %	25 %	50 %	171060633
124540	NC_010524	GCC	2	6	4441378	4441383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060633
124541	NC_010524	GCG	2	6	4441406	4441411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060633
124542	NC_010524	GCT	3	9	4441416	4441424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060633
124543	NC_010524	CG	3	6	4441460	4441465	0 %	0 %	50 %	50 %	171060633
124544	NC_010524	TGG	2	6	4441562	4441567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060633
124545	NC_010524	CAC	3	9	4441636	4441644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060633
124546	NC_010524	CG	3	6	4441646	4441651	0 %	0 %	50 %	50 %	171060633
124547	NC_010524	GCGCT	2	10	4441684	4441693	0 %	20 %	40 %	40 %	171060633
124548	NC_010524	AGC	2	6	4441715	4441720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060633
124549	NC_010524	CGC	2	6	4441725	4441730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060633
124550	NC_010524	ATC	2	6	4441759	4441764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060633
124551	NC_010524	TGC	2	6	4441775	4441780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060633
124552	NC_010524	ACCGG	2	10	4441787	4441796	20 %	0 %	40 %	40 %	171060633
124553	NC_010524	TGG	3	9	4441820	4441828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060633
124554	NC_010524	CGC	2	6	4441911	4441916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060633
124555	NC_010524	CAA	2	6	4441917	4441922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060633
124556	NC_010524	CGG	2	6	4441923	4441928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060633
124557	NC_010524	GGC	2	6	4441938	4441943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060633
124558	NC_010524	CCG	2	6	4442031	4442036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060633
124559	NC_010524	CG	3	6	4442065	4442070	0 %	0 %	50 %	50 %	171060633
124560	NC_010524	GGC	2	6	4442112	4442117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060633
124561	NC_010524	GGT	2	6	4442151	4442156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060633
124562	NC_010524	GC	3	6	4442170	4442175	0 %	0 %	50 %	50 %	171060633
124563	NC_010524	GC	3	6	4442188	4442193	0 %	0 %	50 %	50 %	171060633
124564	NC_010524	GCG	2	6	4442212	4442217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060633
124565	NC_010524	GCCAC	2	10	4442241	4442250	20 %	0 %	20 %	60 %	171060634
124566	NC_010524	GCA	2	6	4442260	4442265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060634
124567	NC_010524	CGT	2	6	4442287	4442292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060634
124568	NC_010524	ACC	2	6	4442307	4442312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060634
124569	NC_010524	CAG	2	6	4442321	4442326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060634
124570	NC_010524	CCG	2	6	4442352	4442357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060634
124571	NC_010524	GTC	2	6	4442445	4442450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060634
124572	NC_010524	GC	3	6	4442466	4442471	0 %	0 %	50 %	50 %	171060634
124573	NC_010524	CGCGG	2	10	4442497	4442506	0 %	0 %	60 %	40 %	171060634
124574	NC_010524	CGGCG	2	10	4442512	4442521	0 %	0 %	60 %	40 %	171060634
124575	NC_010524	CAG	2	6	4442543	4442548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060634
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124577	NC_010524	CAG	2	6	4442627	4442632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060634
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124579	NC_010524	CAG	2	6	4442705	4442710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060634
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124582	NC_010524	GCT	2	6	4442827	4442832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060634
124583	NC_010524	GGCAG	2	10	4442841	4442850	20 %	0 %	60 %	20 %	171060634
124584	NC_010524	GCC	2	6	4442859	4442864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060634
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124586	NC_010524	GCC	2	6	4442993	4442998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060634
124587	NC_010524	GCT	2	6	4443016	4443021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060634
124588	NC_010524	GCA	2	6	4443022	4443027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060634
124589	NC_010524	CAC	2	6	4443062	4443067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060634
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124591	NC_010524	TGG	2	6	4443127	4443132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060634
124592	NC_010524	GGT	2	6	4443161	4443166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060634
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124595	NC_010524	GCA	2	6	4443202	4443207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060634
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124597	NC_010524	GCA	2	6	4443298	4443303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060634
124598	NC_010524	CGT	2	6	4443313	4443318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060634
124599	NC_010524	CAGCAC	2	12	4443326	4443337	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	171060634
124600	NC_010524	GCC	2	6	4443353	4443358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060634
124601	NC_010524	GCCGC	2	10	4443495	4443504	0 %	0 %	40 %	60 %	171060634
124602	NC_010524	CCG	3	9	4443534	4443542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060634
124603	NC_010524	GC	3	6	4443574	4443579	0 %	0 %	50 %	50 %	171060634
124604	NC_010524	CGA	2	6	4443580	4443585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060634
124605	NC_010524	TGC	2	6	4443628	4443633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060634
124606	NC_010524	GTC	2	6	4443671	4443676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060634
124607	NC_010524	GCA	2	6	4443697	4443702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060634
124608	NC_010524	ATCAGC	2	12	4443708	4443719	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	171060634
124609	NC_010524	A	6	6	4443728	4443733	100 %	0 %	0 %	0 %	171060634
124610	NC_010524	CGC	3	9	4443734	4443742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060634
124611	NC_010524	TCA	2	6	4443802	4443807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060634
124612	NC_010524	CGC	2	6	4443826	4443831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060634
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124614	NC_010524	GCC	2	6	4443858	4443863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060634
124615	NC_010524	ATC	2	6	4443864	4443869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060634
124616	NC_010524	CCA	3	9	4443886	4443894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060634
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124623	NC_010524	CGT	2	6	4444111	4444116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060634
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124633	NC_010524	CGGCTG	2	12	4444449	4444460	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171060634
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124700	NC_010524	GCA	2	6	4446434	4446439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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124720	NC_010524	GCC	2	6	4446923	4446928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060636
124721	NC_010524	GTC	2	6	4446944	4446949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060636
124722	NC_010524	TGC	2	6	4446961	4446966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060636
124723	NC_010524	ATG	2	6	4446969	4446974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060636
124724	NC_010524	CCA	2	6	4446979	4446984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060636
124725	NC_010524	TCG	2	6	4446996	4447001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060636
124726	NC_010524	GTCGAT	2	12	4447043	4447054	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171060636
124727	NC_010524	GGC	2	6	4447087	4447092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060636
124728	NC_010524	TCG	2	6	4447155	4447160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060636
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124732	NC_010524	GC	3	6	4447397	4447402	0 %	0 %	50 %	50 %	171060636
124733	NC_010524	TCG	2	6	4447414	4447419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060636
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124736	NC_010524	CTG	2	6	4447508	4447513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060636
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124746	NC_010524	CTT	2	6	4447820	4447825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060637
124747	NC_010524	TGATCA	2	12	4447840	4447851	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	171060637
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124750	NC_010524	CGC	2	6	4448040	4448045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060637
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124829	NC_010524	GC	3	6	4451047	4451052	0 %	0 %	50 %	50 %	171060637
124830	NC_010524	CGG	2	6	4451053	4451058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060637
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124834	NC_010524	TCG	2	6	4451199	4451204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060637
124835	NC_010524	TCG	2	6	4451214	4451219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060637
124836	NC_010524	GCG	2	6	4451233	4451238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060637
124837	NC_010524	TCC	2	6	4451253	4451258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060637
124838	NC_010524	GCGG	2	8	4451292	4451299	0 %	0 %	75 %	25 %	171060637
124839	NC_010524	TCA	2	6	4451301	4451306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060637
124840	NC_010524	TCG	2	6	4451310	4451315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060637
124841	NC_010524	CGA	2	6	4451338	4451343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060637
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124843	NC_010524	GGC	2	6	4451379	4451384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060637
124844	NC_010524	CGT	2	6	4451395	4451400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060637
124845	NC_010524	GGC	2	6	4451430	4451435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060637
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124847	NC_010524	TCG	2	6	4451463	4451468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060637
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