MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_010524	CGG	2	6	415960	415965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057071
12003	NC_010524	GCCG	2	8	415970	415977	0 %	0 %	50 %	50 %	171057071
12004	NC_010524	GC	3	6	416004	416009	0 %	0 %	50 %	50 %	171057071
12005	NC_010524	GCA	2	6	416011	416016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057071
12006	NC_010524	GCC	2	6	416031	416036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057071
12007	NC_010524	GCG	2	6	416039	416044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057071
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12009	NC_010524	GCA	2	6	416069	416074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057071
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12011	NC_010524	CG	3	6	416159	416164	0 %	0 %	50 %	50 %	171057071
12012	NC_010524	CCA	2	6	416171	416176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057071
12013	NC_010524	GC	5	10	416182	416191	0 %	0 %	50 %	50 %	171057071
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12018	NC_010524	CG	4	8	416318	416325	0 %	0 %	50 %	50 %	171057071
12019	NC_010524	CGA	2	6	416342	416347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057071
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12030	NC_010524	CGGCG	2	10	416744	416753	0 %	0 %	60 %	40 %	171057071
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12043	NC_010524	CGA	2	6	417098	417103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057071
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12054	NC_010524	TCG	2	6	417414	417419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057072
12055	NC_010524	CTG	2	6	417560	417565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057072
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12062	NC_010524	CGC	2	6	417788	417793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12063	NC_010524	GCCT	2	8	418008	418015	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12064	NC_010524	GTGC	2	8	418032	418039	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12065	NC_010524	T	7	7	418045	418051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12082	NC_010524	TCGA	2	8	418701	418708	25 %	25 %	25 %	25 %	171057073
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12108	NC_010524	CGCC	2	8	419611	419618	0 %	0 %	25 %	75 %	171057073
12109	NC_010524	GCC	2	6	419661	419666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057073
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12113	NC_010524	CGC	2	6	419815	419820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057073
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12119	NC_010524	ACT	2	6	420019	420024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057073
12120	NC_010524	AAG	2	6	420033	420038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057073
12121	NC_010524	CAT	2	6	420080	420085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057073
12122	NC_010524	GCC	2	6	420207	420212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057073
12123	NC_010524	GCT	2	6	420284	420289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057073
12124	NC_010524	GCG	2	6	420301	420306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057073
12125	NC_010524	CAC	2	6	420329	420334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057073
12126	NC_010524	TGCG	2	8	420352	420359	0 %	25 %	50 %	25 %	171057073
12127	NC_010524	CAT	2	6	420428	420433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057073
12128	NC_010524	TCGA	2	8	420447	420454	25 %	25 %	25 %	25 %	171057073
12129	NC_010524	GAC	2	6	420555	420560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057073
12130	NC_010524	GTGATG	2	12	420561	420572	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	171057073
12131	NC_010524	AGA	2	6	420620	420625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057073
12132	NC_010524	AAG	2	6	420753	420758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057073
12133	NC_010524	GAC	2	6	420800	420805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057073
12134	NC_010524	CTA	2	6	420806	420811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057073
12135	NC_010524	CGGCT	2	10	420893	420902	0 %	20 %	40 %	40 %	171057073
12136	NC_010524	GCCG	2	8	420908	420915	0 %	0 %	50 %	50 %	171057073
12137	NC_010524	CGA	2	6	420962	420967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057073
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12139	NC_010524	GCGCA	2	10	420998	421007	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12140	NC_010524	ACA	2	6	421058	421063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12141	NC_010524	TC	3	6	421160	421165	0 %	50 %	0 %	50 %	171057074
12142	NC_010524	GCC	2	6	421270	421275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057074
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12163	NC_010524	AGAC	2	8	422429	422436	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12164	NC_010524	AAG	2	6	422520	422525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12166	NC_010524	GAA	2	6	422591	422596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12167	NC_010524	AAG	2	6	422661	422666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12168	NC_010524	GAA	2	6	422675	422680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12179	NC_010524	AAG	2	6	422847	422852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12185	NC_010524	GGC	2	6	423062	423067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12231	NC_010524	ACC	2	6	424550	424555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057077
12232	NC_010524	GC	3	6	424558	424563	0 %	0 %	50 %	50 %	171057077
12233	NC_010524	GTT	2	6	424603	424608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057077
12234	NC_010524	GGTC	2	8	424614	424621	0 %	25 %	50 %	25 %	171057077
12235	NC_010524	CAG	2	6	424654	424659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057077
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12237	NC_010524	CG	3	6	424740	424745	0 %	0 %	50 %	50 %	171057077
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12240	NC_010524	CGC	2	6	424805	424810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057077
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12242	NC_010524	CTG	2	6	424864	424869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057077
12243	NC_010524	TGGC	2	8	425005	425012	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12244	NC_010524	GCAGC	2	10	425013	425022	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12245	NC_010524	GGCG	2	8	425077	425084	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12246	NC_010524	GCC	2	6	425093	425098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12247	NC_010524	AAG	2	6	425114	425119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12248	NC_010524	GCTC	2	8	425144	425151	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12249	NC_010524	TC	3	6	425150	425155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12250	NC_010524	CGCC	2	8	425166	425173	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12251	NC_010524	GAG	2	6	425209	425214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12252	NC_010524	AGA	2	6	425223	425228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12253	NC_010524	CTG	2	6	425236	425241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12258	NC_010524	TGG	2	6	425477	425482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12264	NC_010524	GC	3	6	425754	425759	0 %	0 %	50 %	50 %	171057079
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12275	NC_010524	GTGG	2	8	426119	426126	0 %	25 %	75 %	0 %	171057079
12276	NC_010524	CGG	2	6	426127	426132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057079
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12360	NC_010524	GC	3	6	428939	428944	0 %	0 %	50 %	50 %	171057081
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12483	NC_010524	GGT	2	6	432725	432730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057083
12484	NC_010524	GCG	2	6	432733	432738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057083
12485	NC_010524	TGGC	2	8	432747	432754	0 %	25 %	50 %	25 %	171057083
12486	NC_010524	GTC	2	6	432764	432769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057083
12487	NC_010524	ACC	2	6	432777	432782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057083
12488	NC_010524	CTG	2	6	432788	432793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057083
12489	NC_010524	CG	3	6	432800	432805	0 %	0 %	50 %	50 %	171057083
12490	NC_010524	GCA	2	6	432817	432822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057083
12491	NC_010524	TGC	2	6	432829	432834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057083
12492	NC_010524	GCGCG	2	10	432904	432913	0 %	0 %	60 %	40 %	171057083
12493	NC_010524	CGGGT	2	10	432953	432962	0 %	20 %	60 %	20 %	171057083
12494	NC_010524	TGG	2	6	432987	432992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057083
12495	NC_010524	GCCG	2	8	433051	433058	0 %	0 %	50 %	50 %	171057083
12496	NC_010524	GCC	2	6	433091	433096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057083
12497	NC_010524	CGC	2	6	433108	433113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057083
12498	NC_010524	CTG	2	6	433130	433135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057083
12499	NC_010524	GC	3	6	433144	433149	0 %	0 %	50 %	50 %	171057083
12500	NC_010524	CAC	2	6	433154	433159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057083

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