MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
123501	NC_010524	GCT	2	6	4402615	4402620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060587
123502	NC_010524	GCT	3	9	4402627	4402635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060587
123503	NC_010524	CTG	2	6	4402652	4402657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060587
123504	NC_010524	GCA	2	6	4402669	4402674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060587
123505	NC_010524	GGC	3	9	4402717	4402725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060587
123506	NC_010524	ACA	2	6	4402752	4402757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060587
123507	NC_010524	GCA	2	6	4402768	4402773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060587
123508	NC_010524	CGA	2	6	4402792	4402797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060587
123509	NC_010524	GC	4	8	4402831	4402838	0 %	0 %	50 %	50 %	171060587
123510	NC_010524	GGCGC	2	10	4402863	4402872	0 %	0 %	60 %	40 %	171060587
123511	NC_010524	CGC	2	6	4402902	4402907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060587
123512	NC_010524	CG	3	6	4402937	4402942	0 %	0 %	50 %	50 %	171060587
123513	NC_010524	GCC	2	6	4402964	4402969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060587
123514	NC_010524	GGGC	2	8	4403032	4403039	0 %	0 %	75 %	25 %	171060587
123515	NC_010524	GGT	2	6	4403050	4403055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060587
123516	NC_010524	GCC	2	6	4403085	4403090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060587
123517	NC_010524	GGCTC	2	10	4403091	4403100	0 %	20 %	40 %	40 %	171060587
123518	NC_010524	CTG	2	6	4403177	4403182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060587
123519	NC_010524	GCA	2	6	4403217	4403222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060587
123520	NC_010524	CGC	2	6	4403313	4403318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060587
123521	NC_010524	TG	3	6	4403367	4403372	0 %	50 %	50 %	0 %	171060587
123522	NC_010524	CGG	2	6	4403373	4403378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060587
123523	NC_010524	TGCTGG	2	12	4403379	4403390	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	171060587
123524	NC_010524	ACG	2	6	4403394	4403399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060587
123525	NC_010524	GCG	3	9	4403401	4403409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060587
123526	NC_010524	GCC	2	6	4403414	4403419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060587
123527	NC_010524	TGGCC	2	10	4403425	4403434	0 %	20 %	40 %	40 %	171060587
123528	NC_010524	GGA	2	6	4403461	4403466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060587
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123530	NC_010524	TGG	2	6	4403541	4403546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060587
123531	NC_010524	GC	3	6	4403553	4403558	0 %	0 %	50 %	50 %	171060587
123532	NC_010524	GC	3	6	4403566	4403571	0 %	0 %	50 %	50 %	171060587
123533	NC_010524	CGC	2	6	4403592	4403597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060587
123534	NC_010524	GCC	2	6	4403605	4403610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060587
123535	NC_010524	CGCCAG	2	12	4403630	4403641	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171060587
123536	NC_010524	GCC	2	6	4403665	4403670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060587
123537	NC_010524	GACG	2	8	4403750	4403757	25 %	0 %	50 %	25 %	171060587
123538	NC_010524	CGGC	2	8	4403758	4403765	0 %	0 %	50 %	50 %	171060587
123539	NC_010524	GC	3	6	4403799	4403804	0 %	0 %	50 %	50 %	171060587
123540	NC_010524	GAG	2	6	4403816	4403821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060587
123541	NC_010524	CAG	3	9	4403831	4403839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060587
123542	NC_010524	CGA	2	6	4403868	4403873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060587
123543	NC_010524	GCT	2	6	4403890	4403895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060587
123544	NC_010524	GGC	2	6	4403920	4403925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060587
123545	NC_010524	GCTC	2	8	4403946	4403953	0 %	25 %	25 %	50 %	171060587
123546	NC_010524	CTG	2	6	4403957	4403962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060587
123547	NC_010524	ACG	2	6	4403976	4403981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060587
123548	NC_010524	TGA	2	6	4404006	4404011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060587
123549	NC_010524	CGCCA	2	10	4404014	4404023	20 %	0 %	20 %	60 %	171060587
123550	NC_010524	GCC	2	6	4404032	4404037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060587
123551	NC_010524	CGTG	2	8	4404115	4404122	0 %	25 %	50 %	25 %	171060587
123552	NC_010524	GCT	2	6	4404130	4404135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060587
123553	NC_010524	GGC	2	6	4404163	4404168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060587
123554	NC_010524	GCG	2	6	4404169	4404174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060587
123555	NC_010524	CGC	2	6	4404213	4404218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060587
123556	NC_010524	TGC	2	6	4404252	4404257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060587
123557	NC_010524	CGC	2	6	4404300	4404305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060587
123558	NC_010524	AGG	2	6	4404306	4404311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060587
123559	NC_010524	GC	3	6	4404332	4404337	0 %	0 %	50 %	50 %	171060587
123560	NC_010524	GATC	2	8	4404370	4404377	25 %	25 %	25 %	25 %	171060587
123561	NC_010524	CCCG	2	8	4404391	4404398	0 %	0 %	25 %	75 %	171060587
123562	NC_010524	CG	3	6	4404403	4404408	0 %	0 %	50 %	50 %	171060587
123563	NC_010524	CTT	2	6	4404424	4404429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060587
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123568	NC_010524	GCC	2	6	4404577	4404582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060587
123569	NC_010524	CGT	2	6	4404653	4404658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060588
123570	NC_010524	CGA	3	9	4404659	4404667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060588
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123572	NC_010524	TGC	2	6	4404697	4404702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060588
123573	NC_010524	CGC	2	6	4404708	4404713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060588
123574	NC_010524	GCG	2	6	4404766	4404771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060588
123575	NC_010524	GC	3	6	4404776	4404781	0 %	0 %	50 %	50 %	171060588
123576	NC_010524	CGA	2	6	4404782	4404787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060588
123577	NC_010524	TGC	2	6	4404799	4404804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060588
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123580	NC_010524	TCG	2	6	4404955	4404960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060588
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123582	NC_010524	CGAGGT	2	12	4405088	4405099	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171060588
123583	NC_010524	GC	3	6	4405121	4405126	0 %	0 %	50 %	50 %	171060588
123584	NC_010524	CAA	2	6	4405127	4405132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060588
123585	NC_010524	CGG	2	6	4405216	4405221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060588
123586	NC_010524	CTG	2	6	4405236	4405241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060588
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123588	NC_010524	CCG	2	6	4405294	4405299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123589	NC_010524	CTG	2	6	4405326	4405331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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123591	NC_010524	GCC	2	6	4405347	4405352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123592	NC_010524	TCA	2	6	4405357	4405362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060589
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123595	NC_010524	GC	3	6	4405444	4405449	0 %	0 %	50 %	50 %	171060589
123596	NC_010524	GGCGCC	2	12	4405454	4405465	0 %	0 %	50 %	50 %	171060589
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123599	NC_010524	GCG	2	6	4405588	4405593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060589
123600	NC_010524	CGA	2	6	4405637	4405642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060589
123601	NC_010524	CTGG	2	8	4405646	4405653	0 %	25 %	50 %	25 %	171060589
123602	NC_010524	GC	3	6	4405662	4405667	0 %	0 %	50 %	50 %	171060589
123603	NC_010524	CGG	2	6	4405709	4405714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060589
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123606	NC_010524	TGC	2	6	4405783	4405788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060589
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123609	NC_010524	CCG	2	6	4405900	4405905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060589
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123615	NC_010524	GCCAC	2	10	4406093	4406102	20 %	0 %	20 %	60 %	171060589
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123627	NC_010524	CGCGT	2	10	4406400	4406409	0 %	20 %	40 %	40 %	171060590
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123664	NC_010524	GTC	2	6	4408016	4408021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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123828	NC_010524	TTG	3	9	4416010	4416018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060607
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123844	NC_010524	TGA	2	6	4417116	4417121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060610
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123846	NC_010524	CAT	2	6	4417229	4417234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060610
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123874	NC_010524	TGAT	2	8	4418296	4418303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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123989	NC_010524	TCG	2	6	4422338	4422343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060614
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