MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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123003	NC_010524	CAG	2	6	4385576	4385581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060573
123004	NC_010524	GAA	2	6	4385654	4385659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060573
123005	NC_010524	CCA	2	6	4385693	4385698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060573
123006	NC_010524	CTG	2	6	4385738	4385743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060573
123007	NC_010524	CCA	2	6	4385767	4385772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060573
123008	NC_010524	CAG	2	6	4385777	4385782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060573
123009	NC_010524	ACA	2	6	4385880	4385885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123010	NC_010524	CGG	2	6	4385919	4385924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060574
123011	NC_010524	CGAG	2	8	4385969	4385976	25 %	0 %	50 %	25 %	171060574
123012	NC_010524	CCA	2	6	4386059	4386064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060574
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123347	NC_010524	ACCT	2	8	4397633	4397640	25 %	25 %	0 %	50 %	171060582
123348	NC_010524	ACGTG	2	10	4397650	4397659	20 %	20 %	40 %	20 %	171060582
123349	NC_010524	CGCGCC	2	12	4397660	4397671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060582
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123351	NC_010524	AGC	2	6	4397704	4397709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060582
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123353	NC_010524	GACC	2	8	4397846	4397853	25 %	0 %	25 %	50 %	171060583
123354	NC_010524	GGT	2	6	4397855	4397860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060583
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123358	NC_010524	ACA	2	6	4398028	4398033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060583
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123370	NC_010524	CTG	2	6	4398300	4398305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060583
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123378	NC_010524	CG	3	6	4398561	4398566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123379	NC_010524	ACCA	2	8	4398625	4398632	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123380	NC_010524	GCT	2	6	4398651	4398656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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123383	NC_010524	GCG	2	6	4398710	4398715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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123415	NC_010524	CGC	2	6	4399917	4399922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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123459	NC_010524	CGT	2	6	4401330	4401335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060586
123460	NC_010524	CCT	2	6	4401351	4401356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060586
123461	NC_010524	TGC	2	6	4401414	4401419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060586
123462	NC_010524	GCT	2	6	4401429	4401434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060586
123463	NC_010524	CGC	2	6	4401441	4401446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060586
123464	NC_010524	CGA	2	6	4401477	4401482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060586
123465	NC_010524	GCG	2	6	4401504	4401509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060586
123466	NC_010524	GCCA	2	8	4401571	4401578	25 %	0 %	25 %	50 %	171060586
123467	NC_010524	CGGTGA	2	12	4401582	4401593	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171060586
123468	NC_010524	CG	3	6	4401600	4401605	0 %	0 %	50 %	50 %	171060586
123469	NC_010524	CAG	2	6	4401622	4401627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060586
123470	NC_010524	CAGG	2	8	4401631	4401638	25 %	0 %	50 %	25 %	171060586
123471	NC_010524	GCC	2	6	4401644	4401649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060586
123472	NC_010524	CGA	2	6	4401661	4401666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060586
123473	NC_010524	AGC	2	6	4401716	4401721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060586
123474	NC_010524	GCG	2	6	4401722	4401727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060586
123475	NC_010524	CAC	2	6	4401730	4401735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060586
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123477	NC_010524	ACC	2	6	4401844	4401849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060586
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123479	NC_010524	GCT	2	6	4401900	4401905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060586
123480	NC_010524	CTT	2	6	4401940	4401945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060586
123481	NC_010524	GCC	2	6	4401980	4401985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060586
123482	NC_010524	CGG	2	6	4402014	4402019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060586
123483	NC_010524	ACC	2	6	4402031	4402036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060586
123484	NC_010524	CG	3	6	4402050	4402055	0 %	0 %	50 %	50 %	171060586
123485	NC_010524	CGA	2	6	4402086	4402091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060586
123486	NC_010524	CGCCAG	2	12	4402126	4402137	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171060586
123487	NC_010524	TGG	2	6	4402161	4402166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060586
123488	NC_010524	CGCGAT	2	12	4402168	4402179	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060586
123489	NC_010524	GCG	2	6	4402219	4402224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060586
123490	NC_010524	GC	3	6	4402232	4402237	0 %	0 %	50 %	50 %	171060586
123491	NC_010524	TCT	2	6	4402241	4402246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060586
123492	NC_010524	GCT	2	6	4402259	4402264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123493	NC_010524	GCC	3	9	4402317	4402325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123494	NC_010524	GTGC	2	8	4402355	4402362	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123495	NC_010524	CGA	2	6	4402390	4402395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123496	NC_010524	GC	3	6	4402456	4402461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123497	NC_010524	GCC	2	6	4402472	4402477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123498	NC_010524	GCA	2	6	4402532	4402537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060587
123499	NC_010524	GGC	2	6	4402593	4402598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060587
123500	NC_010524	GCG	2	6	4402601	4402606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060587

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