MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
122501	NC_010524	GCC	2	6	4368365	4368370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060563
122502	NC_010524	CCG	2	6	4368426	4368431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060563
122503	NC_010524	CCG	2	6	4368446	4368451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060563
122504	NC_010524	CCG	2	6	4368459	4368464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060563
122505	NC_010524	CAC	2	6	4368469	4368474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060563
122506	NC_010524	GCC	2	6	4368562	4368567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060563
122507	NC_010524	TGC	2	6	4368603	4368608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060563
122508	NC_010524	CGT	2	6	4368609	4368614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060563
122509	NC_010524	CGT	2	6	4368624	4368629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060563
122510	NC_010524	GTT	3	9	4368679	4368687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060563
122511	NC_010524	GGT	2	6	4368691	4368696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060563
122512	NC_010524	ACC	2	6	4368728	4368733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060563
122513	NC_010524	GC	6	12	4368815	4368826	0 %	0 %	50 %	50 %	171060563
122514	NC_010524	CAC	2	6	4368829	4368834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060563
122515	NC_010524	CAG	2	6	4368856	4368861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060563
122516	NC_010524	CGG	2	6	4368882	4368887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060563
122517	NC_010524	TGG	2	6	4368929	4368934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060563
122518	NC_010524	TCG	3	9	4368959	4368967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060563
122519	NC_010524	GGT	2	6	4368996	4369001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060563
122520	NC_010524	CCG	2	6	4369019	4369024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060563
122521	NC_010524	GCG	2	6	4369034	4369039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060563
122522	NC_010524	GGCC	2	8	4369062	4369069	0 %	0 %	50 %	50 %	171060563
122523	NC_010524	CCG	2	6	4369119	4369124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060563
122524	NC_010524	CGGTG	2	10	4369144	4369153	0 %	20 %	60 %	20 %	171060563
122525	NC_010524	CGC	2	6	4369176	4369181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060563
122526	NC_010524	CTG	2	6	4369183	4369188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060563
122527	NC_010524	CGG	2	6	4369197	4369202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060563
122528	NC_010524	CAG	2	6	4369204	4369209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060563
122529	NC_010524	CAG	2	6	4369219	4369224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060563
122530	NC_010524	CTT	2	6	4369243	4369248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060563
122531	NC_010524	CCA	2	6	4369315	4369320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060563
122532	NC_010524	CGT	2	6	4369323	4369328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060563
122533	NC_010524	CGGCC	2	10	4369356	4369365	0 %	0 %	40 %	60 %	171060563
122534	NC_010524	CGC	2	6	4369426	4369431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060563
122535	NC_010524	TGG	2	6	4369506	4369511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060563
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122537	NC_010524	CAT	2	6	4369579	4369584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060563
122538	NC_010524	GCCG	2	8	4369600	4369607	0 %	0 %	50 %	50 %	171060563
122539	NC_010524	CGC	2	6	4369614	4369619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060563
122540	NC_010524	CGG	3	9	4369627	4369635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060563
122541	NC_010524	TGA	2	6	4369650	4369655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060563
122542	NC_010524	CGGT	2	8	4369697	4369704	0 %	25 %	50 %	25 %	171060563
122543	NC_010524	CAC	2	6	4369828	4369833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060563
122544	NC_010524	CCA	3	9	4369908	4369916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060563
122545	NC_010524	CG	3	6	4369944	4369949	0 %	0 %	50 %	50 %	171060563
122546	NC_010524	CGG	2	6	4369951	4369956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060563
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122548	NC_010524	GCC	2	6	4370275	4370280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060563
122549	NC_010524	GC	3	6	4370325	4370330	0 %	0 %	50 %	50 %	171060563
122550	NC_010524	GCT	2	6	4370352	4370357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060563
122551	NC_010524	CCG	2	6	4370388	4370393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060563
122552	NC_010524	CTG	2	6	4370425	4370430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060563
122553	NC_010524	CGTG	2	8	4370454	4370461	0 %	25 %	50 %	25 %	171060563
122554	NC_010524	GAT	2	6	4370464	4370469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060563
122555	NC_010524	GAC	2	6	4370500	4370505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060563
122556	NC_010524	GTC	2	6	4370528	4370533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060563
122557	NC_010524	GC	3	6	4370536	4370541	0 %	0 %	50 %	50 %	171060563
122558	NC_010524	GCC	2	6	4370566	4370571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060563
122559	NC_010524	CG	3	6	4370621	4370626	0 %	0 %	50 %	50 %	171060563
122560	NC_010524	GCA	2	6	4370643	4370648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060563
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122562	NC_010524	TCG	2	6	4370663	4370668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060563
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122565	NC_010524	GAT	2	6	4370809	4370814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060563
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122567	NC_010524	GTC	2	6	4370839	4370844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060563
122568	NC_010524	GTA	2	6	4370851	4370856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060563
122569	NC_010524	TGG	2	6	4370876	4370881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060563
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122574	NC_010524	TCG	2	6	4371173	4371178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060563
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122576	NC_010524	GTA	2	6	4371364	4371369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060563
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122587	NC_010524	CGA	2	6	4371795	4371800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060563
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122589	NC_010524	CGT	2	6	4371900	4371905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060563
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122599	NC_010524	GCC	2	6	4372465	4372470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060563
122600	NC_010524	CGCC	2	8	4372503	4372510	0 %	0 %	25 %	75 %	171060563
122601	NC_010524	TCG	2	6	4372574	4372579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060563
122602	NC_010524	GCCG	2	8	4372666	4372673	0 %	0 %	50 %	50 %	171060563
122603	NC_010524	CGGCC	2	10	4372693	4372702	0 %	0 %	40 %	60 %	171060563
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122606	NC_010524	TCA	2	6	4372758	4372763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060563
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122610	NC_010524	CGG	2	6	4372869	4372874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060563
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122612	NC_010524	CTT	2	6	4372920	4372925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060563
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122614	NC_010524	CGA	2	6	4372965	4372970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060563
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122833	NC_010524	GC	3	6	4380311	4380316	0 %	0 %	50 %	50 %	171060569
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122837	NC_010524	CGCCAG	2	12	4380534	4380545	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171060569
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122841	NC_010524	GGCG	2	8	4380737	4380744	0 %	0 %	75 %	25 %	171060569
122842	NC_010524	GCT	2	6	4380891	4380896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060570
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122845	NC_010524	GAA	2	6	4381046	4381051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060570
122846	NC_010524	CCA	2	6	4381075	4381080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060570
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122959	NC_010524	CGC	2	6	4384019	4384024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060572
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122988	NC_010524	GC	4	8	4385041	4385048	0 %	0 %	50 %	50 %	171060573
122989	NC_010524	TCG	2	6	4385094	4385099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060573
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