MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
121501	NC_010524	GCC	2	6	4332545	4332550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060534
121502	NC_010524	CTG	2	6	4332584	4332589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060534
121503	NC_010524	CAT	2	6	4332613	4332618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060534
121504	NC_010524	CGA	2	6	4332646	4332651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060534
121505	NC_010524	GCT	2	6	4332658	4332663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060534
121506	NC_010524	GCT	2	6	4332691	4332696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060534
121507	NC_010524	GAC	2	6	4332719	4332724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060534
121508	NC_010524	CAT	2	6	4332793	4332798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060534
121509	NC_010524	GC	3	6	4332841	4332846	0 %	0 %	50 %	50 %	171060534
121510	NC_010524	GTG	2	6	4332908	4332913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060534
121511	NC_010524	CAT	2	6	4332934	4332939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060534
121512	NC_010524	TCG	2	6	4332963	4332968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060534
121513	NC_010524	ACC	2	6	4332989	4332994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060534
121514	NC_010524	GCT	2	6	4333021	4333026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060534
121515	NC_010524	GGCG	2	8	4333039	4333046	0 %	0 %	75 %	25 %	171060534
121516	NC_010524	CTG	2	6	4333061	4333066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060534
121517	NC_010524	GAA	2	6	4333172	4333177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060534
121518	NC_010524	GGC	2	6	4333178	4333183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060534
121519	NC_010524	TTC	2	6	4333196	4333201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060534
121520	NC_010524	AAC	2	6	4333202	4333207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060534
121521	NC_010524	CCGC	2	8	4333210	4333217	0 %	0 %	25 %	75 %	171060534
121522	NC_010524	CAC	2	6	4333231	4333236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060534
121523	NC_010524	CAAGGA	2	12	4333264	4333275	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	171060534
121524	NC_010524	GAA	2	6	4333337	4333342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060534
121525	NC_010524	GGC	2	6	4333367	4333372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060534
121526	NC_010524	CGT	2	6	4333390	4333395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060534
121527	NC_010524	ATC	2	6	4333403	4333408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060534
121528	NC_010524	GCAAAA	2	12	4333497	4333508	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	171060535
121529	NC_010524	TCG	2	6	4333568	4333573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060535
121530	NC_010524	CGC	2	6	4333655	4333660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060535
121531	NC_010524	CAA	2	6	4333665	4333670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060535
121532	NC_010524	CACC	2	8	4333698	4333705	25 %	0 %	0 %	75 %	171060535
121533	NC_010524	TCG	2	6	4333721	4333726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060535
121534	NC_010524	CCGA	2	8	4333729	4333736	25 %	0 %	25 %	50 %	171060535
121535	NC_010524	TGA	2	6	4333754	4333759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060535
121536	NC_010524	AGC	2	6	4333806	4333811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060535
121537	NC_010524	GCA	2	6	4333822	4333827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121538	NC_010524	T	6	6	4333869	4333874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121539	NC_010524	TTGGTC	2	12	4333903	4333914	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121540	NC_010524	CGC	2	6	4333948	4333953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121541	NC_010524	A	6	6	4333995	4334000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121542	NC_010524	AAT	2	6	4334180	4334185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121543	NC_010524	GCC	2	6	4334193	4334198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121544	NC_010524	A	6	6	4334238	4334243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121545	NC_010524	GT	3	6	4334307	4334312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121546	NC_010524	CCG	2	6	4334324	4334329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060536
121547	NC_010524	CAGC	2	8	4334366	4334373	25 %	0 %	25 %	50 %	171060536
121548	NC_010524	CCT	2	6	4334384	4334389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060536
121549	NC_010524	GTC	2	6	4334415	4334420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121550	NC_010524	GC	3	6	4334439	4334444	0 %	0 %	50 %	50 %	171060536
121551	NC_010524	CGA	2	6	4334486	4334491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121552	NC_010524	TCG	2	6	4334518	4334523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121553	NC_010524	ATG	2	6	4334533	4334538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060536
121554	NC_010524	GCC	2	6	4334539	4334544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060536
121555	NC_010524	GGAA	2	8	4334570	4334577	50 %	0 %	50 %	0 %	171060536
121556	NC_010524	GCC	2	6	4334578	4334583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060536
121557	NC_010524	GTCG	2	8	4334595	4334602	0 %	25 %	50 %	25 %	171060536
121558	NC_010524	CAG	2	6	4334625	4334630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121559	NC_010524	GC	4	8	4334663	4334670	0 %	0 %	50 %	50 %	171060536
121560	NC_010524	GCA	2	6	4334762	4334767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121561	NC_010524	TCG	2	6	4334839	4334844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121562	NC_010524	GC	3	6	4334853	4334858	0 %	0 %	50 %	50 %	171060536
121563	NC_010524	CAG	2	6	4334874	4334879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121564	NC_010524	GGCCG	2	10	4334901	4334910	0 %	0 %	60 %	40 %	171060536
121565	NC_010524	GAT	2	6	4334913	4334918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060536
121566	NC_010524	TTG	2	6	4334929	4334934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060536
121567	NC_010524	ACC	2	6	4334935	4334940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060536
121568	NC_010524	CAC	2	6	4334952	4334957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060536
121569	NC_010524	CCG	2	6	4335133	4335138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060536
121570	NC_010524	TCT	2	6	4335152	4335157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060536
121571	NC_010524	GC	3	6	4335227	4335232	0 %	0 %	50 %	50 %	171060536
121572	NC_010524	AGC	2	6	4335301	4335306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121573	NC_010524	CAC	2	6	4335321	4335326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060536
121574	NC_010524	ACC	2	6	4335358	4335363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060536
121575	NC_010524	TCG	2	6	4335385	4335390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121576	NC_010524	CTT	2	6	4335413	4335418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060536
121577	NC_010524	TGA	2	6	4335455	4335460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060536
121578	NC_010524	ACGCTC	2	12	4335558	4335569	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171060536
121579	NC_010524	TGA	3	9	4335587	4335595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060536
121580	NC_010524	CAC	2	6	4335615	4335620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060536
121581	NC_010524	GAT	2	6	4335669	4335674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060536
121582	NC_010524	GC	3	6	4335712	4335717	0 %	0 %	50 %	50 %	171060536
121583	NC_010524	GCCGC	2	10	4335721	4335730	0 %	0 %	40 %	60 %	171060536
121584	NC_010524	GCG	2	6	4335784	4335789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060536
121585	NC_010524	GCC	2	6	4335822	4335827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060536
121586	NC_010524	TCG	2	6	4335907	4335912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121587	NC_010524	GCC	2	6	4335919	4335924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060536
121588	NC_010524	TCG	2	6	4335946	4335951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121589	NC_010524	CGAGCA	2	12	4335965	4335976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121590	NC_010524	GTC	2	6	4336104	4336109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121591	NC_010524	GTGG	2	8	4336212	4336219	0 %	25 %	75 %	0 %	171060536
121592	NC_010524	GAT	2	6	4336278	4336283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060536
121593	NC_010524	GGC	2	6	4336338	4336343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060536
121594	NC_010524	CG	3	6	4336351	4336356	0 %	0 %	50 %	50 %	171060536
121595	NC_010524	CAT	2	6	4336368	4336373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060536
121596	NC_010524	TCA	2	6	4336448	4336453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060536
121597	NC_010524	TCG	2	6	4336468	4336473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121598	NC_010524	ACC	2	6	4336495	4336500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060536
121599	NC_010524	TTG	2	6	4336501	4336506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060536
121600	NC_010524	GCCG	2	8	4336515	4336522	0 %	0 %	50 %	50 %	171060536
121601	NC_010524	CTG	2	6	4336542	4336547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121602	NC_010524	TCTGCT	2	12	4336589	4336600	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	171060536
121603	NC_010524	GTC	2	6	4336614	4336619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121604	NC_010524	GCA	2	6	4336667	4336672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121605	NC_010524	ACC	2	6	4336687	4336692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060536
121606	NC_010524	CTT	3	9	4336746	4336754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060536
121607	NC_010524	TCA	2	6	4336766	4336771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060536
121608	NC_010524	CAG	2	6	4336806	4336811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121609	NC_010524	GTG	2	6	4336825	4336830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060536
121610	NC_010524	ACC	2	6	4336924	4336929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060536
121611	NC_010524	TTG	2	6	4336930	4336935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060536
121612	NC_010524	GC	3	6	4336942	4336947	0 %	0 %	50 %	50 %	171060536
121613	NC_010524	GTA	2	6	4337013	4337018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060536
121614	NC_010524	CAC	2	6	4337028	4337033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060536
121615	NC_010524	GTT	2	6	4337082	4337087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060536
121616	NC_010524	TCGA	2	8	4337125	4337132	25 %	25 %	25 %	25 %	171060536
121617	NC_010524	GCCTT	2	10	4337212	4337221	0 %	40 %	20 %	40 %	171060536
121618	NC_010524	CAC	2	6	4337325	4337330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060536
121619	NC_010524	CTTC	2	8	4337348	4337355	0 %	50 %	0 %	50 %	171060536
121620	NC_010524	TGG	2	6	4337369	4337374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060536
121621	NC_010524	TGA	2	6	4337483	4337488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060536
121622	NC_010524	AGT	2	6	4337501	4337506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060536
121623	NC_010524	TTG	2	6	4337587	4337592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060536
121624	NC_010524	AGC	2	6	4337629	4337634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121625	NC_010524	CCT	2	6	4337645	4337650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060536
121626	NC_010524	GCA	2	6	4337651	4337656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121627	NC_010524	GAT	2	6	4337676	4337681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060536
121628	NC_010524	AGC	2	6	4337701	4337706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060536
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121632	NC_010524	CGG	2	6	4337808	4337813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060536
121633	NC_010524	GCA	2	6	4337822	4337827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060536
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121635	NC_010524	TTC	2	6	4337899	4337904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060536
121636	NC_010524	GCA	2	6	4337975	4337980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121637	NC_010524	GCT	2	6	4337981	4337986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121638	NC_010524	CGA	2	6	4338011	4338016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060536
121639	NC_010524	TCG	2	6	4338019	4338024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060536
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121642	NC_010524	ATG	2	6	4338064	4338069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060536
121643	NC_010524	CTT	2	6	4338075	4338080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060536
121644	NC_010524	CAC	2	6	4338105	4338110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060536
121645	NC_010524	GC	3	6	4338206	4338211	0 %	0 %	50 %	50 %	171060536
121646	NC_010524	GCC	2	6	4338217	4338222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060536
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121648	NC_010524	CGC	2	6	4338296	4338301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060536
121649	NC_010524	CTT	2	6	4338423	4338428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060536
121650	NC_010524	TCT	2	6	4338455	4338460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060536
121651	NC_010524	AGT	2	6	4338529	4338534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060536
121652	NC_010524	TCT	2	6	4338546	4338551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121653	NC_010524	GCTCGA	2	12	4338563	4338574	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060537
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121656	NC_010524	GCA	2	6	4338722	4338727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060537
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121662	NC_010524	GGT	2	6	4338872	4338877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060537
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121665	NC_010524	GTC	2	6	4338996	4339001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060537
121666	NC_010524	TCT	2	6	4339033	4339038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060537
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121670	NC_010524	GCA	2	6	4339211	4339216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060537
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121672	NC_010524	TTG	2	6	4339390	4339395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060537
121673	NC_010524	CGGC	2	8	4339402	4339409	0 %	0 %	50 %	50 %	171060537
121674	NC_010524	GGC	2	6	4339430	4339435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060537
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121682	NC_010524	CAG	2	6	4339710	4339715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060537
121683	NC_010524	CGA	2	6	4339745	4339750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060537
121684	NC_010524	TCG	3	9	4339792	4339800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060537
121685	NC_010524	CTG	2	6	4339806	4339811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060537
121686	NC_010524	GC	3	6	4339813	4339818	0 %	0 %	50 %	50 %	171060537
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121688	NC_010524	CAG	2	6	4339941	4339946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060537
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121693	NC_010524	GGT	2	6	4340375	4340380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060537
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121700	NC_010524	CGT	3	9	4340621	4340629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060537
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121702	NC_010524	TCG	2	6	4340752	4340757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060537
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121707	NC_010524	GGCG	2	8	4340906	4340913	0 %	0 %	75 %	25 %	171060537
121708	NC_010524	GC	3	6	4341019	4341024	0 %	0 %	50 %	50 %	171060537
121709	NC_010524	GCC	2	6	4341036	4341041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060537
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121714	NC_010524	CGG	2	6	4341292	4341297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060537
121715	NC_010524	GGT	2	6	4341305	4341310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060537
121716	NC_010524	GTC	2	6	4341315	4341320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060537
121717	NC_010524	GCCGTT	2	12	4341327	4341338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060537
121718	NC_010524	GAC	2	6	4341360	4341365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060537
121719	NC_010524	GTC	2	6	4341375	4341380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060537
121720	NC_010524	CG	3	6	4341449	4341454	0 %	0 %	50 %	50 %	171060537
121721	NC_010524	TCGG	2	8	4341514	4341521	0 %	25 %	50 %	25 %	171060537
121722	NC_010524	CAT	2	6	4341537	4341542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060537
121723	NC_010524	CG	4	8	4341557	4341564	0 %	0 %	50 %	50 %	171060537
121724	NC_010524	CGG	2	6	4341575	4341580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060537
121725	NC_010524	TGA	2	6	4341605	4341610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060537
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121959	NC_010524	CGC	2	6	4350800	4350805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060547
121960	NC_010524	CTT	2	6	4350909	4350914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060547
121961	NC_010524	ATC	2	6	4350943	4350948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060547
121962	NC_010524	CGC	2	6	4350962	4350967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060547
121963	NC_010524	ATG	2	6	4350970	4350975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060547
121964	NC_010524	TCG	2	6	4350997	4351002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060547
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121966	NC_010524	CTC	2	6	4351066	4351071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121967	NC_010524	GTCGG	2	10	4351083	4351092	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
121968	NC_010524	TTC	2	6	4351124	4351129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060548
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121977	NC_010524	TCG	2	6	4351574	4351579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060548
121978	NC_010524	ATC	2	6	4351658	4351663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060548
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121981	NC_010524	GT	3	6	4351711	4351716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121982	NC_010524	CGT	2	6	4351720	4351725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121983	NC_010524	CGGG	2	8	4351813	4351820	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121984	NC_010524	GC	4	8	4351937	4351944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121985	NC_010524	GCG	2	6	4351994	4351999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060549
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121988	NC_010524	GCT	2	6	4352175	4352180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060549
121989	NC_010524	CTG	2	6	4352215	4352220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060549
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121992	NC_010524	CCG	2	6	4352332	4352337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060549
121993	NC_010524	TCG	2	6	4352342	4352347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060549
121994	NC_010524	GC	3	6	4352355	4352360	0 %	0 %	50 %	50 %	171060549
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121996	NC_010524	ACC	2	6	4352411	4352416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060549
121997	NC_010524	AGC	2	6	4352417	4352422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060549
121998	NC_010524	CCG	3	9	4352433	4352441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060549
121999	NC_010524	CGT	2	6	4352442	4352447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060549
122000	NC_010524	GCTGAT	2	12	4352466	4352477	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171060549

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