MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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120502	NC_010524	CAG	2	6	4297098	4297103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060503
120503	NC_010524	TCG	2	6	4297105	4297110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060503
120504	NC_010524	G	6	6	4297142	4297147	0 %	0 %	100 %	0 %	171060503
120505	NC_010524	GGCC	2	8	4297175	4297182	0 %	0 %	50 %	50 %	171060503
120506	NC_010524	GATC	2	8	4297220	4297227	25 %	25 %	25 %	25 %	171060503
120507	NC_010524	GCT	2	6	4297235	4297240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060503
120508	NC_010524	TCG	2	6	4297267	4297272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060503
120509	NC_010524	CCGGG	2	10	4297280	4297289	0 %	0 %	60 %	40 %	171060503
120510	NC_010524	GC	3	6	4297363	4297368	0 %	0 %	50 %	50 %	171060503
120511	NC_010524	GAC	2	6	4297447	4297452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120512	NC_010524	GACA	2	8	4297509	4297516	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120513	NC_010524	CCA	2	6	4297557	4297562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120514	NC_010524	CCA	2	6	4297612	4297617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060504
120515	NC_010524	ACC	2	6	4297647	4297652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060504
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120517	NC_010524	TGG	2	6	4297744	4297749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060504
120518	NC_010524	ATC	2	6	4297767	4297772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060504
120519	NC_010524	CTG	2	6	4297793	4297798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060504
120520	NC_010524	GCGAC	2	10	4297839	4297848	20 %	0 %	40 %	40 %	171060504
120521	NC_010524	CGT	2	6	4297877	4297882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060504
120522	NC_010524	ACC	2	6	4297890	4297895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060504
120523	NC_010524	CCCGG	2	10	4297908	4297917	0 %	0 %	40 %	60 %	171060504
120524	NC_010524	CTT	2	6	4297928	4297933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060504
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120533	NC_010524	GATC	2	8	4298228	4298235	25 %	25 %	25 %	25 %	171060504
120534	NC_010524	CGA	2	6	4298252	4298257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060504
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120548	NC_010524	GCCTG	2	10	4298611	4298620	0 %	20 %	40 %	40 %	171060504
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120550	NC_010524	CG	3	6	4298690	4298695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120551	NC_010524	ATC	2	6	4298796	4298801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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120553	NC_010524	CA	3	6	4298884	4298889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120554	NC_010524	TGG	2	6	4298902	4298907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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120844	NC_010524	GCG	2	6	4309019	4309024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060514
120845	NC_010524	CGA	2	6	4309044	4309049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060514
120846	NC_010524	CCG	2	6	4309056	4309061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060514
120847	NC_010524	GAC	2	6	4309078	4309083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060514
120848	NC_010524	TCA	2	6	4309100	4309105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060514
120849	NC_010524	CGC	2	6	4309120	4309125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060514
120850	NC_010524	GCG	3	9	4309130	4309138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060514
120851	NC_010524	GCT	2	6	4309140	4309145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060514
120852	NC_010524	CCGCAT	2	12	4309152	4309163	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171060514
120853	NC_010524	CG	3	6	4309193	4309198	0 %	0 %	50 %	50 %	171060514
120854	NC_010524	GCTC	2	8	4309208	4309215	0 %	25 %	25 %	50 %	171060514
120855	NC_010524	CG	3	6	4309220	4309225	0 %	0 %	50 %	50 %	171060514
120856	NC_010524	TGA	2	6	4309370	4309375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060514
120857	NC_010524	GCC	2	6	4309390	4309395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060514
120858	NC_010524	TCG	2	6	4309436	4309441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060514
120859	NC_010524	CAA	2	6	4309446	4309451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060514
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120862	NC_010524	GCC	2	6	4309624	4309629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060514
120863	NC_010524	GCAC	2	8	4309682	4309689	25 %	0 %	25 %	50 %	171060514
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120867	NC_010524	CAG	2	6	4309801	4309806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060514
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120872	NC_010524	CGT	2	6	4309974	4309979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060514
120873	NC_010524	CAC	2	6	4310019	4310024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060514
120874	NC_010524	CAA	2	6	4310034	4310039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060514
120875	NC_010524	CCG	2	6	4310132	4310137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060514
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120879	NC_010524	CGA	2	6	4310361	4310366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060514
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120892	NC_010524	AACG	2	8	4310950	4310957	50 %	0 %	25 %	25 %	171060514
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120904	NC_010524	GCA	2	6	4311323	4311328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060514
120905	NC_010524	AC	3	6	4311366	4311371	50 %	0 %	0 %	50 %	171060514
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120907	NC_010524	CGA	2	6	4311420	4311425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060514
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120940	NC_010524	GACG	2	8	4312690	4312697	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120941	NC_010524	GCA	2	6	4312712	4312717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120942	NC_010524	CCGGC	3	15	4312797	4312811	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
120943	NC_010524	CCG	2	6	4312844	4312849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120944	NC_010524	CCAT	2	8	4312872	4312879	25 %	25 %	0 %	50 %	171060516
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120947	NC_010524	C	6	6	4312926	4312931	0 %	0 %	0 %	100 %	171060516
120948	NC_010524	GCA	2	6	4313002	4313007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060516
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120950	NC_010524	CCT	2	6	4313098	4313103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120951	NC_010524	TCG	2	6	4313111	4313116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120952	NC_010524	GC	3	6	4313210	4313215	0 %	0 %	50 %	50 %	171060517
120953	NC_010524	GC	3	6	4313226	4313231	0 %	0 %	50 %	50 %	171060517
120954	NC_010524	GGC	2	6	4313258	4313263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060517
120955	NC_010524	GC	3	6	4313279	4313284	0 %	0 %	50 %	50 %	171060517
120956	NC_010524	ACG	2	6	4313287	4313292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060517
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120958	NC_010524	GGT	2	6	4313309	4313314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060517
120959	NC_010524	CGA	2	6	4313354	4313359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060517
120960	NC_010524	GCT	2	6	4313366	4313371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060517
120961	NC_010524	CGC	2	6	4313378	4313383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060517
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120964	NC_010524	TCG	2	6	4313440	4313445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060517
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120970	NC_010524	GAT	2	6	4313825	4313830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060517
120971	NC_010524	GC	3	6	4313840	4313845	0 %	0 %	50 %	50 %	171060517
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120983	NC_010524	GGT	2	6	4314212	4314217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060517
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120987	NC_010524	CGG	4	12	4314416	4314427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060517
120988	NC_010524	TCA	2	6	4314460	4314465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060517
120989	NC_010524	TGC	2	6	4314508	4314513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060517
120990	NC_010524	CGT	2	6	4314514	4314519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060517
120991	NC_010524	ACC	2	6	4314712	4314717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060517
120992	NC_010524	CGGC	2	8	4314745	4314752	0 %	0 %	50 %	50 %	171060517
120993	NC_010524	GCGG	2	8	4314768	4314775	0 %	0 %	75 %	25 %	171060517
120994	NC_010524	CAT	2	6	4314776	4314781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060517
120995	NC_010524	GC	3	6	4314842	4314847	0 %	0 %	50 %	50 %	171060517
120996	NC_010524	GCCCG	2	10	4314861	4314870	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
120997	NC_010524	GCC	2	6	4314885	4314890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060518
120998	NC_010524	GCA	2	6	4314923	4314928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060518
120999	NC_010524	GC	3	6	4314935	4314940	0 %	0 %	50 %	50 %	171060518
121000	NC_010524	CAT	2	6	4314948	4314953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060518

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