MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
120001	NC_010524	GGC	2	6	4279326	4279331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060484
120002	NC_010524	GC	3	6	4279348	4279353	0 %	0 %	50 %	50 %	171060484
120003	NC_010524	GCTGTG	2	12	4279374	4279385	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	171060484
120004	NC_010524	GCG	2	6	4279457	4279462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060484
120005	NC_010524	GC	3	6	4279495	4279500	0 %	0 %	50 %	50 %	171060484
120006	NC_010524	CAG	2	6	4279501	4279506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060484
120007	NC_010524	CGC	2	6	4279521	4279526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060484
120008	NC_010524	CAGC	2	8	4279527	4279534	25 %	0 %	25 %	50 %	171060484
120009	NC_010524	CGC	2	6	4279551	4279556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060484
120010	NC_010524	GC	4	8	4279560	4279567	0 %	0 %	50 %	50 %	171060484
120011	NC_010524	GAC	2	6	4279600	4279605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060484
120012	NC_010524	GGC	2	6	4279624	4279629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060484
120013	NC_010524	TGGGCC	2	12	4279676	4279687	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171060484
120014	NC_010524	CG	4	8	4279692	4279699	0 %	0 %	50 %	50 %	171060484
120015	NC_010524	CG	3	6	4279712	4279717	0 %	0 %	50 %	50 %	171060484
120016	NC_010524	GCCTGG	2	12	4279736	4279747	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171060484
120017	NC_010524	CCG	2	6	4279833	4279838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060484
120018	NC_010524	GCCG	2	8	4279942	4279949	0 %	0 %	50 %	50 %	171060484
120019	NC_010524	CCG	2	6	4279973	4279978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060484
120020	NC_010524	GGT	2	6	4279980	4279985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060484
120021	NC_010524	TGC	2	6	4279991	4279996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060484
120022	NC_010524	GGC	2	6	4280025	4280030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060484
120023	NC_010524	C	6	6	4280067	4280072	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
120024	NC_010524	CTG	2	6	4280112	4280117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060485
120025	NC_010524	ACCGCC	2	12	4280134	4280145	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	171060485
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120027	NC_010524	CCAG	2	8	4280264	4280271	25 %	0 %	25 %	50 %	171060485
120028	NC_010524	CGGC	2	8	4280276	4280283	0 %	0 %	50 %	50 %	171060485
120029	NC_010524	ACC	2	6	4280287	4280292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060485
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120031	NC_010524	GGC	2	6	4280384	4280389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060485
120032	NC_010524	CGGCG	2	10	4280420	4280429	0 %	0 %	60 %	40 %	171060485
120033	NC_010524	CAG	2	6	4280430	4280435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060485
120034	NC_010524	GTC	2	6	4280439	4280444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060485
120035	NC_010524	GGC	2	6	4280493	4280498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060485
120036	NC_010524	GCGG	2	8	4280574	4280581	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120037	NC_010524	GCC	2	6	4280593	4280598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120038	NC_010524	GC	3	6	4280633	4280638	0 %	0 %	50 %	50 %	171060486
120039	NC_010524	GCCGC	2	10	4280661	4280670	0 %	0 %	40 %	60 %	171060486
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120042	NC_010524	CGA	2	6	4280728	4280733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060486
120043	NC_010524	GC	3	6	4280744	4280749	0 %	0 %	50 %	50 %	171060486
120044	NC_010524	TCG	2	6	4280811	4280816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060486
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120051	NC_010524	TCA	2	6	4281025	4281030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060486
120052	NC_010524	GC	3	6	4281077	4281082	0 %	0 %	50 %	50 %	171060486
120053	NC_010524	CGG	3	9	4281137	4281145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060486
120054	NC_010524	CGGCG	2	10	4281218	4281227	0 %	0 %	60 %	40 %	171060486
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120060	NC_010524	TCG	2	6	4281403	4281408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060486
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120062	NC_010524	C	6	6	4281456	4281461	0 %	0 %	0 %	100 %	171060487
120063	NC_010524	GCCGG	2	10	4281483	4281492	0 %	0 %	60 %	40 %	171060487
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120075	NC_010524	GTCCG	2	10	4281809	4281818	0 %	20 %	40 %	40 %	171060487
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120081	NC_010524	CGA	2	6	4282118	4282123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060487
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120089	NC_010524	GTG	2	6	4282518	4282523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120090	NC_010524	CAA	2	6	4282610	4282615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120091	NC_010524	GCA	2	6	4282649	4282654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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120103	NC_010524	CG	3	6	4283241	4283246	0 %	0 %	50 %	50 %	171060488
120104	NC_010524	TGG	2	6	4283308	4283313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060488
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120115	NC_010524	GCC	2	6	4283658	4283663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060488
120116	NC_010524	CCA	2	6	4283666	4283671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060488
120117	NC_010524	GGT	2	6	4283720	4283725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060488
120118	NC_010524	TGC	2	6	4283758	4283763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060488
120119	NC_010524	AAC	2	6	4283775	4283780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060488
120120	NC_010524	AGC	2	6	4283800	4283805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060488
120121	NC_010524	CGC	2	6	4283822	4283827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060488
120122	NC_010524	TCA	2	6	4283830	4283835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060488
120123	NC_010524	AAC	2	6	4283847	4283852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060488
120124	NC_010524	GCCG	2	8	4283882	4283889	0 %	0 %	50 %	50 %	171060488
120125	NC_010524	ATCC	2	8	4283934	4283941	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120126	NC_010524	GAC	2	6	4283978	4283983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060489
120127	NC_010524	GAC	2	6	4283996	4284001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060489
120128	NC_010524	CAC	3	9	4284002	4284010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060489
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120131	NC_010524	TGA	2	6	4284096	4284101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060489
120132	NC_010524	CGG	2	6	4284103	4284108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060489
120133	NC_010524	GCT	2	6	4284118	4284123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060489
120134	NC_010524	CAC	2	6	4284187	4284192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060489
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120138	NC_010524	AAC	2	6	4284305	4284310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060489
120139	NC_010524	TGA	2	6	4284324	4284329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060489
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120142	NC_010524	CGG	2	6	4284370	4284375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060489
120143	NC_010524	CGC	2	6	4284405	4284410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060489
120144	NC_010524	GATG	2	8	4284433	4284440	25 %	25 %	50 %	0 %	171060489
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120146	NC_010524	CAT	2	6	4284496	4284501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060489
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120148	NC_010524	TGA	2	6	4284540	4284545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060489
120149	NC_010524	CTG	2	6	4284587	4284592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060489
120150	NC_010524	GACC	2	8	4284637	4284644	25 %	0 %	25 %	50 %	171060489
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120152	NC_010524	GGC	3	9	4284677	4284685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060489
120153	NC_010524	TCT	2	6	4284708	4284713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060489
120154	NC_010524	TTC	2	6	4284716	4284721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060489
120155	NC_010524	CAT	2	6	4284739	4284744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060489
120156	NC_010524	CAT	2	6	4284763	4284768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060489
120157	NC_010524	CAC	2	6	4284872	4284877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060489
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120159	NC_010524	CGA	2	6	4284927	4284932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060489
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120164	NC_010524	CTA	2	6	4285183	4285188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060489
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120166	NC_010524	TTC	2	6	4285277	4285282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060489
120167	NC_010524	GGC	2	6	4285373	4285378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060489
120168	NC_010524	CTT	2	6	4285405	4285410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060489
120169	NC_010524	TCG	2	6	4285416	4285421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060489
120170	NC_010524	GAT	2	6	4285429	4285434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060489
120171	NC_010524	GCCACC	2	12	4285550	4285561	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	171060489
120172	NC_010524	CGA	2	6	4285587	4285592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060490
120173	NC_010524	GCC	2	6	4285598	4285603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060490
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120177	NC_010524	ATG	2	6	4285678	4285683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060490
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120182	NC_010524	TTCGGC	2	12	4285808	4285819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060491
120183	NC_010524	CGGC	2	8	4285920	4285927	0 %	0 %	50 %	50 %	171060491
120184	NC_010524	CG	4	8	4285978	4285985	0 %	0 %	50 %	50 %	171060491
120185	NC_010524	GGTGCA	2	12	4286017	4286028	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171060491
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120189	NC_010524	GGT	2	6	4286203	4286208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060491
120190	NC_010524	GATC	2	8	4286215	4286222	25 %	25 %	25 %	25 %	171060491
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120198	NC_010524	CGGCG	2	10	4286517	4286526	0 %	0 %	60 %	40 %	171060492
120199	NC_010524	TCA	2	6	4286531	4286536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060492
120200	NC_010524	GCG	2	6	4286573	4286578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060492
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120204	NC_010524	AGAC	2	8	4286661	4286668	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120205	NC_010524	TAC	2	6	4286724	4286729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060493
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120212	NC_010524	GC	3	6	4287001	4287006	0 %	0 %	50 %	50 %	171060493
120213	NC_010524	CG	3	6	4287018	4287023	0 %	0 %	50 %	50 %	171060493
120214	NC_010524	GCT	2	6	4287059	4287064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060493
120215	NC_010524	GCCG	2	8	4287119	4287126	0 %	0 %	50 %	50 %	171060493
120216	NC_010524	TCG	2	6	4287130	4287135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060493
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120218	NC_010524	GCT	3	9	4287185	4287193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060493
120219	NC_010524	CAC	2	6	4287222	4287227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060493
120220	NC_010524	GC	3	6	4287245	4287250	0 %	0 %	50 %	50 %	171060493
120221	NC_010524	TGC	2	6	4287280	4287285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060493
120222	NC_010524	TCG	2	6	4287357	4287362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060493
120223	NC_010524	CTT	2	6	4287380	4287385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060493
120224	NC_010524	ATGCTG	2	12	4287426	4287437	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171060493
120225	NC_010524	TCA	2	6	4287442	4287447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060493
120226	NC_010524	TGA	2	6	4287457	4287462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060493
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120228	NC_010524	GTC	2	6	4287555	4287560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060493
120229	NC_010524	CGG	2	6	4287583	4287588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120230	NC_010524	GCA	2	6	4287616	4287621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120231	NC_010524	A	6	6	4287631	4287636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120232	NC_010524	GT	3	6	4287663	4287668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120233	NC_010524	CAG	2	6	4287729	4287734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060494
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120235	NC_010524	CGA	2	6	4287863	4287868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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120343	NC_010524	GGC	2	6	4291345	4291350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060498
120344	NC_010524	GGC	2	6	4291389	4291394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060498
120345	NC_010524	GC	3	6	4291421	4291426	0 %	0 %	50 %	50 %	171060498
120346	NC_010524	GCT	2	6	4291459	4291464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060498
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120452	NC_010524	GCGT	2	8	4295027	4295034	0 %	25 %	50 %	25 %	171060502
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