MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
119501	NC_010524	AGC	2	6	4262255	4262260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060468
119502	NC_010524	GCC	2	6	4262269	4262274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060468
119503	NC_010524	TGC	3	9	4262288	4262296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060468
119504	NC_010524	CGA	2	6	4262385	4262390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060468
119505	NC_010524	GTG	2	6	4262395	4262400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060468
119506	NC_010524	GGT	2	6	4262409	4262414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060468
119507	NC_010524	GCG	2	6	4262453	4262458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060468
119508	NC_010524	TCA	2	6	4262507	4262512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060468
119509	NC_010524	TCA	2	6	4262528	4262533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060468
119510	NC_010524	AGG	2	6	4262621	4262626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060468
119511	NC_010524	GC	3	6	4262636	4262641	0 %	0 %	50 %	50 %	171060468
119512	NC_010524	GTG	2	6	4262692	4262697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060468
119513	NC_010524	ACG	2	6	4262699	4262704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060468
119514	NC_010524	CG	3	6	4262708	4262713	0 %	0 %	50 %	50 %	171060468
119515	NC_010524	CGG	2	6	4262840	4262845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060468
119516	NC_010524	GCA	2	6	4262912	4262917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060468
119517	NC_010524	TCA	2	6	4262921	4262926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060468
119518	NC_010524	CGA	2	6	4262934	4262939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060468
119519	NC_010524	CGG	3	9	4262940	4262948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060468
119520	NC_010524	CAGCGA	2	12	4263015	4263026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060468
119521	NC_010524	CCG	2	6	4263062	4263067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060468
119522	NC_010524	GGGCAC	2	12	4263165	4263176	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171060468
119523	NC_010524	CAT	2	6	4263210	4263215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060468
119524	NC_010524	GAG	2	6	4263274	4263279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060468
119525	NC_010524	TGC	2	6	4263335	4263340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060468
119526	NC_010524	CGC	4	12	4263377	4263388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060468
119527	NC_010524	TCG	2	6	4263401	4263406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060468
119528	NC_010524	AGC	2	6	4263422	4263427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060468
119529	NC_010524	GC	3	6	4263426	4263431	0 %	0 %	50 %	50 %	171060468
119530	NC_010524	TGG	2	6	4263437	4263442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060468
119531	NC_010524	TCA	2	6	4263473	4263478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060468
119532	NC_010524	TCA	2	6	4263575	4263580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060468
119533	NC_010524	GCCA	2	8	4263653	4263660	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119534	NC_010524	GGC	2	6	4263671	4263676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119535	NC_010524	CA	3	6	4263689	4263694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119536	NC_010524	CGC	3	9	4263718	4263726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119537	NC_010524	CGGC	2	8	4263746	4263753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119538	NC_010524	TC	3	6	4263777	4263782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119539	NC_010524	GCT	4	12	4263861	4263872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060469
119540	NC_010524	ACG	2	6	4263971	4263976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060469
119541	NC_010524	CG	3	6	4263999	4264004	0 %	0 %	50 %	50 %	171060469
119542	NC_010524	CGA	2	6	4264035	4264040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060469
119543	NC_010524	TCG	2	6	4264067	4264072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060469
119544	NC_010524	ACG	2	6	4264148	4264153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060469
119545	NC_010524	CCA	2	6	4264154	4264159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060469
119546	NC_010524	GAC	2	6	4264161	4264166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060469
119547	NC_010524	TCG	2	6	4264178	4264183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060469
119548	NC_010524	GAG	2	6	4264201	4264206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060469
119549	NC_010524	CCGG	2	8	4264260	4264267	0 %	0 %	50 %	50 %	171060469
119550	NC_010524	CAC	2	6	4264272	4264277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060469
119551	NC_010524	GTC	2	6	4264282	4264287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060469
119552	NC_010524	CGC	2	6	4264356	4264361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060469
119553	NC_010524	GCT	2	6	4264374	4264379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060469
119554	NC_010524	GGT	2	6	4264464	4264469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060469
119555	NC_010524	ACTTCG	2	12	4264499	4264510	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	171060469
119556	NC_010524	GGT	2	6	4264545	4264550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060469
119557	NC_010524	GGC	2	6	4264617	4264622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060469
119558	NC_010524	GCC	2	6	4264738	4264743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060469
119559	NC_010524	AAC	2	6	4264825	4264830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060469
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119561	NC_010524	GGCCGC	2	12	4264863	4264874	0 %	0 %	50 %	50 %	171060469
119562	NC_010524	CGT	2	6	4264905	4264910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060469
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119566	NC_010524	GCA	2	6	4265052	4265057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060469
119567	NC_010524	TGG	2	6	4265099	4265104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060469
119568	NC_010524	CGG	2	6	4265142	4265147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060469
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119570	NC_010524	ACG	2	6	4265189	4265194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060469
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119573	NC_010524	GAG	2	6	4265362	4265367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060469
119574	NC_010524	TCGA	2	8	4265377	4265384	25 %	25 %	25 %	25 %	171060469
119575	NC_010524	GGC	2	6	4265451	4265456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060469
119576	NC_010524	CGG	2	6	4265472	4265477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060469
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119578	NC_010524	AAG	2	6	4265521	4265526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060469
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119583	NC_010524	CG	4	8	4265592	4265599	0 %	0 %	50 %	50 %	171060469
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119588	NC_010524	GCT	2	6	4265733	4265738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060469
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119597	NC_010524	GCA	2	6	4265937	4265942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060469
119598	NC_010524	CTT	2	6	4265952	4265957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060469
119599	NC_010524	GCCG	2	8	4266009	4266016	0 %	0 %	50 %	50 %	171060469
119600	NC_010524	GGC	2	6	4266034	4266039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060469
119601	NC_010524	CCGG	2	8	4266082	4266089	0 %	0 %	50 %	50 %	171060469
119602	NC_010524	CGA	2	6	4266099	4266104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060469
119603	NC_010524	TCA	2	6	4266113	4266118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060469
119604	NC_010524	CGG	2	6	4266128	4266133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119605	NC_010524	CAT	2	6	4266136	4266141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119606	NC_010524	AC	3	6	4266158	4266163	50 %	0 %	0 %	50 %	171060470
119607	NC_010524	GCG	2	6	4266170	4266175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060470
119608	NC_010524	CGG	2	6	4266211	4266216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060470
119609	NC_010524	ATC	2	6	4266254	4266259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060470
119610	NC_010524	GAT	2	6	4266286	4266291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060470
119611	NC_010524	GCGCG	2	10	4266322	4266331	0 %	0 %	60 %	40 %	171060470
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119613	NC_010524	CGC	2	6	4266378	4266383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060470
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