MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_010524	GC	3	6	399361	399366	0 %	0 %	50 %	50 %	171057055
11502	NC_010524	CGT	2	6	399369	399374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057055
11503	NC_010524	CCT	2	6	399396	399401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057055
11504	NC_010524	GCG	2	6	399416	399421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057055
11505	NC_010524	CGG	2	6	399444	399449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057055
11506	NC_010524	CGA	2	6	399540	399545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057055
11507	NC_010524	TCG	2	6	399641	399646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057055
11508	NC_010524	GGC	2	6	399682	399687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057055
11509	NC_010524	GCT	2	6	399714	399719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057055
11510	NC_010524	AGC	2	6	399752	399757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057055
11511	NC_010524	GCT	3	9	399762	399770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057055
11512	NC_010524	GCA	2	6	399933	399938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057056
11513	NC_010524	GTC	2	6	399985	399990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057056
11514	NC_010524	CGA	2	6	400008	400013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057056
11515	NC_010524	GC	3	6	400034	400039	0 %	0 %	50 %	50 %	171057056
11516	NC_010524	CAT	2	6	400059	400064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057056
11517	NC_010524	CGG	2	6	400074	400079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057056
11518	NC_010524	GCC	2	6	400105	400110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057056
11519	NC_010524	ACC	2	6	400114	400119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057056
11520	NC_010524	AGCA	2	8	400147	400154	50 %	0 %	25 %	25 %	171057056
11521	NC_010524	GCC	2	6	400240	400245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057056
11522	NC_010524	ACG	2	6	400283	400288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057056
11523	NC_010524	GCT	2	6	400293	400298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057056
11524	NC_010524	TGA	2	6	400363	400368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057056
11525	NC_010524	CTG	2	6	400395	400400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057057
11526	NC_010524	GCG	2	6	400456	400461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057057
11527	NC_010524	CGC	2	6	400487	400492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057057
11528	NC_010524	GCA	2	6	400493	400498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057057
11529	NC_010524	CCA	2	6	400534	400539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057057
11530	NC_010524	CGGC	2	8	400543	400550	0 %	0 %	50 %	50 %	171057057
11531	NC_010524	CGC	2	6	400589	400594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057057
11532	NC_010524	CGA	2	6	400613	400618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057057
11533	NC_010524	CAC	2	6	400631	400636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057057
11534	NC_010524	GCCC	2	8	400652	400659	0 %	0 %	25 %	75 %	171057057
11535	NC_010524	GCCG	2	8	400684	400691	0 %	0 %	50 %	50 %	171057057
11536	NC_010524	CGC	2	6	400733	400738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057057
11537	NC_010524	CGC	2	6	400754	400759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057057
11538	NC_010524	GCG	2	6	400762	400767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057057
11539	NC_010524	GC	4	8	400774	400781	0 %	0 %	50 %	50 %	171057057
11540	NC_010524	ACC	2	6	400783	400788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057057
11541	NC_010524	CGC	2	6	400823	400828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057057
11542	NC_010524	GCT	2	6	400829	400834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057057
11543	NC_010524	CG	3	6	400853	400858	0 %	0 %	50 %	50 %	171057057
11544	NC_010524	ACG	2	6	400867	400872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057057
11545	NC_010524	GCC	2	6	400911	400916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057057
11546	NC_010524	CGTGC	2	10	400937	400946	0 %	20 %	40 %	40 %	171057057
11547	NC_010524	TCG	2	6	400990	400995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057057
11548	NC_010524	GCA	2	6	401033	401038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057057
11549	NC_010524	CGT	2	6	401072	401077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057057
11550	NC_010524	CGGC	2	8	401125	401132	0 %	0 %	50 %	50 %	171057057
11551	NC_010524	TTC	2	6	401178	401183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057057
11552	NC_010524	CGGC	2	8	401195	401202	0 %	0 %	50 %	50 %	171057057
11553	NC_010524	TGG	2	6	401203	401208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057057
11554	NC_010524	CTG	2	6	401355	401360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057057
11555	NC_010524	CGC	3	9	401378	401386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057057
11556	NC_010524	GCC	2	6	401397	401402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057057
11557	NC_010524	GGC	2	6	401419	401424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057057
11558	NC_010524	GC	3	6	401443	401448	0 %	0 %	50 %	50 %	171057057
11559	NC_010524	CGGCG	2	10	401473	401482	0 %	0 %	60 %	40 %	171057057
11560	NC_010524	CG	3	6	401531	401536	0 %	0 %	50 %	50 %	171057057
11561	NC_010524	GCT	2	6	401561	401566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057057
11562	NC_010524	CCG	3	9	401637	401645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057058
11563	NC_010524	CCGA	2	8	401696	401703	25 %	0 %	25 %	50 %	171057058
11564	NC_010524	CGA	2	6	401731	401736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057058
11565	NC_010524	GGT	2	6	401746	401751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057058
11566	NC_010524	CGC	2	6	401761	401766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057058
11567	NC_010524	GCCG	2	8	401772	401779	0 %	0 %	50 %	50 %	171057058
11568	NC_010524	GCC	2	6	401845	401850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057058
11569	NC_010524	GC	3	6	401855	401860	0 %	0 %	50 %	50 %	171057058
11570	NC_010524	GGCCC	2	10	401880	401889	0 %	0 %	40 %	60 %	171057058
11571	NC_010524	GGC	5	15	401923	401937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057058
11572	NC_010524	CGG	2	6	401938	401943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057058
11573	NC_010524	TGC	2	6	401994	401999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057058
11574	NC_010524	GC	3	6	401998	402003	0 %	0 %	50 %	50 %	171057058
11575	NC_010524	CGC	3	9	402001	402009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057058
11576	NC_010524	CGGC	2	8	402012	402019	0 %	0 %	50 %	50 %	171057058
11577	NC_010524	GGC	2	6	402031	402036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057058
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11579	NC_010524	CGA	2	6	402091	402096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057058
11580	NC_010524	CGG	2	6	402130	402135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057058
11581	NC_010524	TCG	2	6	402165	402170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057058
11582	NC_010524	CG	3	6	402177	402182	0 %	0 %	50 %	50 %	171057058
11583	NC_010524	TGC	3	9	402192	402200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057058
11584	NC_010524	CGGC	2	8	402237	402244	0 %	0 %	50 %	50 %	171057058
11585	NC_010524	CG	3	6	402258	402263	0 %	0 %	50 %	50 %	171057058
11586	NC_010524	CGCGC	2	10	402307	402316	0 %	0 %	40 %	60 %	171057058
11587	NC_010524	CAG	2	6	402341	402346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057058
11588	NC_010524	TGC	2	6	402366	402371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057058
11589	NC_010524	GCCG	2	8	402382	402389	0 %	0 %	50 %	50 %	171057058
11590	NC_010524	GCC	2	6	402404	402409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057058
11591	NC_010524	CG	3	6	402438	402443	0 %	0 %	50 %	50 %	171057058
11592	NC_010524	GTT	2	6	402517	402522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057058
11593	NC_010524	TGC	2	6	402528	402533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057058
11594	NC_010524	AGC	2	6	402573	402578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057058
11595	NC_010524	GC	3	6	402622	402627	0 %	0 %	50 %	50 %	171057058
11596	NC_010524	CGG	2	6	402630	402635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057058
11597	NC_010524	CCG	2	6	402655	402660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11598	NC_010524	TGA	2	6	402688	402693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057059
11599	NC_010524	CG	4	8	402710	402717	0 %	0 %	50 %	50 %	171057059
11600	NC_010524	CTGCG	2	10	402720	402729	0 %	20 %	40 %	40 %	171057059
11601	NC_010524	GCC	2	6	402732	402737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057059
11602	NC_010524	CTG	2	6	402756	402761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057059
11603	NC_010524	CGA	2	6	402824	402829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057059
11604	NC_010524	GCA	2	6	402853	402858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057059
11605	NC_010524	CG	3	6	402895	402900	0 %	0 %	50 %	50 %	171057059
11606	NC_010524	AGC	2	6	403062	403067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057059
11607	NC_010524	GGC	2	6	403101	403106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057059
11608	NC_010524	TCA	2	6	403117	403122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057059
11609	NC_010524	ACA	2	6	403129	403134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057059
11610	NC_010524	GC	3	6	403178	403183	0 %	0 %	50 %	50 %	171057059
11611	NC_010524	GGCC	2	8	403199	403206	0 %	0 %	50 %	50 %	171057059
11612	NC_010524	CAA	2	6	403223	403228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057059
11613	NC_010524	CGG	2	6	403354	403359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057059
11614	NC_010524	ACG	2	6	403393	403398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057059
11615	NC_010524	TGG	2	6	403414	403419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057059
11616	NC_010524	CGA	2	6	403424	403429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057059
11617	NC_010524	TGC	2	6	403432	403437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057059
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11619	NC_010524	GCC	2	6	403494	403499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057059
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11979	NC_010524	TGCAGG	2	12	415082	415093	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171057070
11980	NC_010524	CCG	2	6	415118	415123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057070
11981	NC_010524	GGCC	2	8	415134	415141	0 %	0 %	50 %	50 %	171057070
11982	NC_010524	ACC	2	6	415199	415204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057070
11983	NC_010524	GCC	2	6	415256	415261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057070
11984	NC_010524	GTGCAG	2	12	415276	415287	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171057070
11985	NC_010524	CG	3	6	415289	415294	0 %	0 %	50 %	50 %	171057070
11986	NC_010524	CGA	2	6	415299	415304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057070
11987	NC_010524	GGT	2	6	415305	415310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057070
11988	NC_010524	CTT	2	6	415374	415379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057070
11989	NC_010524	CCA	2	6	415448	415453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057070
11990	NC_010524	CCGC	2	8	415461	415468	0 %	0 %	25 %	75 %	171057070
11991	NC_010524	GTGCCG	2	12	415522	415533	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057070
11992	NC_010524	GC	3	6	415540	415545	0 %	0 %	50 %	50 %	171057070
11993	NC_010524	CTG	2	6	415584	415589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057071
11994	NC_010524	TGA	2	6	415595	415600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057071
11995	NC_010524	GCT	2	6	415634	415639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057071
11996	NC_010524	GAG	2	6	415677	415682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057071
11997	NC_010524	GCT	2	6	415760	415765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057071
11998	NC_010524	GCG	2	6	415766	415771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057071
11999	NC_010524	AGCG	2	8	415791	415798	25 %	0 %	50 %	25 %	171057071
12000	NC_010524	TCA	2	6	415807	415812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057071

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