MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
111501	NC_010524	GCA	3	9	3981704	3981712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060232
111502	NC_010524	GC	3	6	3981714	3981719	0 %	0 %	50 %	50 %	171060232
111503	NC_010524	GCC	2	6	3981764	3981769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060232
111504	NC_010524	GCG	2	6	3981802	3981807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060232
111505	NC_010524	GC	3	6	3981815	3981820	0 %	0 %	50 %	50 %	171060232
111506	NC_010524	GCG	2	6	3981837	3981842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060232
111507	NC_010524	CCA	2	6	3981875	3981880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060232
111508	NC_010524	CTG	2	6	3981921	3981926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060232
111509	NC_010524	CGG	2	6	3981971	3981976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060232
111510	NC_010524	GGCC	2	8	3981989	3981996	0 %	0 %	50 %	50 %	171060232
111511	NC_010524	CAG	2	6	3982005	3982010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060232
111512	NC_010524	GCT	2	6	3982011	3982016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060232
111513	NC_010524	CGG	2	6	3982043	3982048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060232
111514	NC_010524	CACG	2	8	3982121	3982128	25 %	0 %	25 %	50 %	171060232
111515	NC_010524	GC	3	6	3982133	3982138	0 %	0 %	50 %	50 %	171060232
111516	NC_010524	CGT	2	6	3982146	3982151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060232
111517	NC_010524	CACAGC	2	12	3982179	3982190	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	171060233
111518	NC_010524	GC	3	6	3982189	3982194	0 %	0 %	50 %	50 %	171060233
111519	NC_010524	CCG	3	9	3982207	3982215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060233
111520	NC_010524	CAT	2	6	3982241	3982246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060233
111521	NC_010524	CCGG	2	8	3982325	3982332	0 %	0 %	50 %	50 %	171060234
111522	NC_010524	GC	3	6	3982435	3982440	0 %	0 %	50 %	50 %	171060234
111523	NC_010524	CG	3	6	3982462	3982467	0 %	0 %	50 %	50 %	171060234
111524	NC_010524	GCG	2	6	3982544	3982549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060234
111525	NC_010524	GCG	2	6	3982563	3982568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060234
111526	NC_010524	CGGC	2	8	3982577	3982584	0 %	0 %	50 %	50 %	171060234
111527	NC_010524	TGC	2	6	3982623	3982628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060234
111528	NC_010524	GGCCG	2	10	3982633	3982642	0 %	0 %	60 %	40 %	171060234
111529	NC_010524	GAC	2	6	3982781	3982786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111530	NC_010524	AC	4	8	3982785	3982792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111531	NC_010524	GCG	2	6	3982826	3982831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111532	NC_010524	CCG	2	6	3982886	3982891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060235
111533	NC_010524	GCT	2	6	3982896	3982901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060235
111534	NC_010524	CGC	2	6	3982922	3982927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060235
111535	NC_010524	CGC	2	6	3983000	3983005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060235
111536	NC_010524	GCC	3	9	3983043	3983051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060235
111537	NC_010524	GC	3	6	3983066	3983071	0 %	0 %	50 %	50 %	171060235
111538	NC_010524	CAC	2	6	3983076	3983081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060235
111539	NC_010524	CGG	2	6	3983129	3983134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060235
111540	NC_010524	CGC	2	6	3983150	3983155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060235
111541	NC_010524	CCG	2	6	3983171	3983176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060235
111542	NC_010524	CGG	2	6	3983186	3983191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060235
111543	NC_010524	CGA	2	6	3983220	3983225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060235
111544	NC_010524	CTT	2	6	3983244	3983249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060235
111545	NC_010524	CTG	2	6	3983274	3983279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060235
111546	NC_010524	GCG	2	6	3983293	3983298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060235
111547	NC_010524	TCG	2	6	3983311	3983316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060235
111548	NC_010524	GC	4	8	3983318	3983325	0 %	0 %	50 %	50 %	171060235
111549	NC_010524	CAC	2	6	3983330	3983335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060235
111550	NC_010524	CGG	2	6	3983354	3983359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060235
111551	NC_010524	CGG	2	6	3983384	3983389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060235
111552	NC_010524	CGG	3	9	3983414	3983422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060235
111553	NC_010524	CGA	3	9	3983486	3983494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060235
111554	NC_010524	CAG	2	6	3983543	3983548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111555	NC_010524	ACA	2	6	3983631	3983636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111556	NC_010524	CGCAC	2	10	3983642	3983651	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
111557	NC_010524	C	6	6	3983653	3983658	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111558	NC_010524	GCC	2	6	3983662	3983667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111559	NC_010524	GCG	2	6	3983687	3983692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111560	NC_010524	GCC	2	6	3983716	3983721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111561	NC_010524	AGC	2	6	3983862	3983867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060236
111562	NC_010524	GCC	2	6	3983888	3983893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060236
111563	NC_010524	CGT	2	6	3983920	3983925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060236
111564	NC_010524	AAG	2	6	3983936	3983941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060236
111565	NC_010524	GGC	2	6	3983942	3983947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060236
111566	NC_010524	AGC	2	6	3983979	3983984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060236
111567	NC_010524	GC	3	6	3983996	3984001	0 %	0 %	50 %	50 %	171060236
111568	NC_010524	CAAGAT	2	12	3984028	3984039	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	171060236
111569	NC_010524	CGC	2	6	3984040	3984045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060236
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111571	NC_010524	GCC	2	6	3984119	3984124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060236
111572	NC_010524	AAG	2	6	3984161	3984166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060236
111573	NC_010524	GCC	2	6	3984167	3984172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060236
111574	NC_010524	CCG	2	6	3984177	3984182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060236
111575	NC_010524	GCCG	2	8	3984187	3984194	0 %	0 %	50 %	50 %	171060236
111576	NC_010524	CGG	2	6	3984214	3984219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060236
111577	NC_010524	GAACCT	2	12	3984280	3984291	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	171060237
111578	NC_010524	CCG	2	6	3984299	3984304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060237
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111581	NC_010524	GCA	2	6	3984344	3984349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060237
111582	NC_010524	GC	3	6	3984377	3984382	0 %	0 %	50 %	50 %	171060237
111583	NC_010524	GCC	2	6	3984391	3984396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060237
111584	NC_010524	TGA	2	6	3984404	3984409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060237
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111586	NC_010524	TCG	2	6	3984472	3984477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060237
111587	NC_010524	GC	3	6	3984525	3984530	0 %	0 %	50 %	50 %	171060237
111588	NC_010524	GAC	2	6	3984534	3984539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060237
111589	NC_010524	CG	3	6	3984540	3984545	0 %	0 %	50 %	50 %	171060237
111590	NC_010524	CCA	2	6	3984557	3984562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060237
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111592	NC_010524	GCC	2	6	3984613	3984618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060237
111593	NC_010524	CGA	2	6	3984656	3984661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060237
111594	NC_010524	GCGATC	2	12	3984700	3984711	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060237
111595	NC_010524	TCA	2	6	3984722	3984727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060237
111596	NC_010524	CAG	2	6	3984738	3984743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060237
111597	NC_010524	GC	4	8	3984767	3984774	0 %	0 %	50 %	50 %	171060237
111598	NC_010524	GCC	2	6	3984829	3984834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060237
111599	NC_010524	TCG	2	6	3984973	3984978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060237
111600	NC_010524	GGC	2	6	3985002	3985007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060237
111601	NC_010524	GCG	2	6	3985029	3985034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060237
111602	NC_010524	CGG	2	6	3985109	3985114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060237
111603	NC_010524	CAT	3	9	3985212	3985220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060237
111604	NC_010524	CCAGCG	2	12	3985226	3985237	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171060237
111605	NC_010524	TCC	2	6	3985267	3985272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111606	NC_010524	CGC	2	6	3985285	3985290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111607	NC_010524	CGG	2	6	3985303	3985308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111608	NC_010524	CCA	2	6	3985347	3985352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060238
111609	NC_010524	CCA	2	6	3985374	3985379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060238
111610	NC_010524	TGGT	2	8	3985391	3985398	0 %	50 %	50 %	0 %	171060238
111611	NC_010524	CCA	2	6	3985416	3985421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060238
111612	NC_010524	AGCGC	2	10	3985524	3985533	20 %	0 %	40 %	40 %	171060238
111613	NC_010524	CGC	2	6	3985588	3985593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060238
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111615	NC_010524	GCC	2	6	3985693	3985698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060238
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111730	NC_010524	TCT	2	6	3989835	3989840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060242
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