MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
110001	NC_010524	CAA	2	6	3928929	3928934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110002	NC_010524	GTC	2	6	3928937	3928942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110003	NC_010524	CCG	2	6	3929029	3929034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060187
110004	NC_010524	CGT	2	6	3929080	3929085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060187
110005	NC_010524	GAAG	2	8	3929122	3929129	50 %	0 %	50 %	0 %	171060187
110006	NC_010524	CCG	2	6	3929150	3929155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060187
110007	NC_010524	TCT	2	6	3929190	3929195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060187
110008	NC_010524	GAC	2	6	3929203	3929208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060187
110009	NC_010524	TGC	2	6	3929229	3929234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060187
110010	NC_010524	GC	3	6	3929242	3929247	0 %	0 %	50 %	50 %	171060187
110011	NC_010524	ACA	2	6	3929250	3929255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060187
110012	NC_010524	CACG	2	8	3929293	3929300	25 %	0 %	25 %	50 %	171060187
110013	NC_010524	TGA	2	6	3929334	3929339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060187
110014	NC_010524	TCG	2	6	3929340	3929345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060187
110015	NC_010524	CCG	2	6	3929358	3929363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060187
110016	NC_010524	TCT	2	6	3929364	3929369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060187
110017	NC_010524	ACGGCG	2	12	3929370	3929381	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171060187
110018	NC_010524	TCA	2	6	3929382	3929387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060187
110019	NC_010524	CGG	2	6	3929409	3929414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060187
110020	NC_010524	TGC	2	6	3929457	3929462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060187
110021	NC_010524	CGG	2	6	3929515	3929520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060187
110022	NC_010524	TCG	2	6	3929592	3929597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060187
110023	NC_010524	CGG	2	6	3929604	3929609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060187
110024	NC_010524	CTT	2	6	3929644	3929649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060187
110025	NC_010524	GGT	2	6	3929689	3929694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060187
110026	NC_010524	CGG	2	6	3929707	3929712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060187
110027	NC_010524	ACT	2	6	3929802	3929807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060187
110028	NC_010524	TGC	2	6	3929823	3929828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060187
110029	NC_010524	CGG	2	6	3929910	3929915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060187
110030	NC_010524	CGG	2	6	3929946	3929951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060187
110031	NC_010524	TCG	2	6	3930107	3930112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060187
110032	NC_010524	CAC	2	6	3930160	3930165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060187
110033	NC_010524	CAT	2	6	3930166	3930171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060187
110034	NC_010524	GCTGTG	2	12	3930208	3930219	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	171060187
110035	NC_010524	CGC	2	6	3930223	3930228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060187
110036	NC_010524	CTT	3	9	3930235	3930243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060187
110037	NC_010524	CAT	2	6	3930244	3930249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060187
110038	NC_010524	CTT	2	6	3930259	3930264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060187
110039	NC_010524	CGG	3	9	3930289	3930297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060187
110040	NC_010524	CG	3	6	3930359	3930364	0 %	0 %	50 %	50 %	171060187
110041	NC_010524	CGA	2	6	3930385	3930390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060187
110042	NC_010524	GCCC	2	8	3930432	3930439	0 %	0 %	25 %	75 %	171060187
110043	NC_010524	CGG	2	6	3930456	3930461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060187
110044	NC_010524	GCT	2	6	3930499	3930504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060187
110045	NC_010524	CAA	2	6	3930520	3930525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060187
110046	NC_010524	TGC	2	6	3930528	3930533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060187
110047	NC_010524	CCA	2	6	3930562	3930567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060187
110048	NC_010524	AGC	2	6	3930609	3930614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060187
110049	NC_010524	GCC	2	6	3930618	3930623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060187
110050	NC_010524	CTG	2	6	3930625	3930630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060187
110051	NC_010524	GCT	2	6	3930688	3930693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060187
110052	NC_010524	CGA	2	6	3930715	3930720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060187
110053	NC_010524	CGG	4	12	3930825	3930836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060187
110054	NC_010524	TCG	2	6	3930867	3930872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060187
110055	NC_010524	CCG	2	6	3930917	3930922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060188
110056	NC_010524	CAG	2	6	3930948	3930953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060188
110057	NC_010524	CGC	2	6	3930968	3930973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060188
110058	NC_010524	CGGCC	2	10	3931026	3931035	0 %	0 %	40 %	60 %	171060188
110059	NC_010524	AGC	2	6	3931060	3931065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060188
110060	NC_010524	GGCC	2	8	3931067	3931074	0 %	0 %	50 %	50 %	171060188
110061	NC_010524	CCG	2	6	3931079	3931084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060188
110062	NC_010524	GCA	2	6	3931157	3931162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060188
110063	NC_010524	CCG	2	6	3931174	3931179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060188
110064	NC_010524	CAG	2	6	3931203	3931208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060188
110065	NC_010524	GGCCA	2	10	3931225	3931234	20 %	0 %	40 %	40 %	171060188
110066	NC_010524	GCCCAG	2	12	3931237	3931248	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171060188
110067	NC_010524	CGG	2	6	3931260	3931265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060188
110068	NC_010524	CAA	2	6	3931281	3931286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060188
110069	NC_010524	CCA	2	6	3931289	3931294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060188
110070	NC_010524	GCCA	2	8	3931315	3931322	25 %	0 %	25 %	50 %	171060188
110071	NC_010524	GGC	2	6	3931347	3931352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060188
110072	NC_010524	CCA	2	6	3931356	3931361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060188
110073	NC_010524	CGGCCC	2	12	3931373	3931384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060188
110074	NC_010524	AGC	2	6	3931438	3931443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060188
110075	NC_010524	CAG	3	9	3931452	3931460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060188
110076	NC_010524	CGC	2	6	3931517	3931522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110077	NC_010524	GCC	2	6	3931584	3931589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060189
110078	NC_010524	TCG	2	6	3931629	3931634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110079	NC_010524	CGG	2	6	3931684	3931689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060189
110080	NC_010524	GCA	2	6	3931705	3931710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110081	NC_010524	CCAGCA	2	12	3931789	3931800	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	171060189
110082	NC_010524	GCC	2	6	3931829	3931834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060189
110083	NC_010524	CG	3	6	3931880	3931885	0 %	0 %	50 %	50 %	171060189
110084	NC_010524	CCT	2	6	3931909	3931914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060189
110085	NC_010524	CG	3	6	3931933	3931938	0 %	0 %	50 %	50 %	171060189
110086	NC_010524	GC	3	6	3931939	3931944	0 %	0 %	50 %	50 %	171060189
110087	NC_010524	GCG	2	6	3931955	3931960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060189
110088	NC_010524	GC	3	6	3932006	3932011	0 %	0 %	50 %	50 %	171060189
110089	NC_010524	TGC	2	6	3932050	3932055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110090	NC_010524	CTG	2	6	3932063	3932068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110091	NC_010524	ACG	2	6	3932080	3932085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110092	NC_010524	CAG	2	6	3932099	3932104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110093	NC_010524	GC	3	6	3932149	3932154	0 %	0 %	50 %	50 %	171060189
110094	NC_010524	CCG	2	6	3932155	3932160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060189
110095	NC_010524	GC	3	6	3932192	3932197	0 %	0 %	50 %	50 %	171060189
110096	NC_010524	CGG	2	6	3932215	3932220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060189
110097	NC_010524	TCG	3	9	3932226	3932234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110098	NC_010524	GCC	2	6	3932285	3932290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060189
110099	NC_010524	TGGCGC	2	12	3932334	3932345	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171060189
110100	NC_010524	TGC	2	6	3932349	3932354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110101	NC_010524	GTC	2	6	3932405	3932410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110102	NC_010524	TGG	2	6	3932475	3932480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060189
110103	NC_010524	GC	3	6	3932481	3932486	0 %	0 %	50 %	50 %	171060189
110104	NC_010524	AGC	2	6	3932499	3932504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110105	NC_010524	CTC	2	6	3932507	3932512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060189
110106	NC_010524	TCG	2	6	3932550	3932555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110107	NC_010524	GC	3	6	3932600	3932605	0 %	0 %	50 %	50 %	171060189
110108	NC_010524	TCG	2	6	3932616	3932621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110109	NC_010524	TGC	2	6	3932634	3932639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110110	NC_010524	GC	3	6	3932660	3932665	0 %	0 %	50 %	50 %	171060189
110111	NC_010524	CAG	2	6	3932672	3932677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110112	NC_010524	GCA	2	6	3932680	3932685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110113	NC_010524	CAG	2	6	3932714	3932719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110114	NC_010524	GCA	2	6	3932740	3932745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110115	NC_010524	GCA	2	6	3932770	3932775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110116	NC_010524	TCG	2	6	3932781	3932786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110117	NC_010524	GAT	2	6	3932819	3932824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060189
110118	NC_010524	GCG	2	6	3932825	3932830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060189
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110120	NC_010524	GC	3	6	3932861	3932866	0 %	0 %	50 %	50 %	171060189
110121	NC_010524	TCG	2	6	3932868	3932873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060189
110122	NC_010524	GCA	3	9	3932875	3932883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060189
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110129	NC_010524	GCA	2	6	3933037	3933042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060189
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110132	NC_010524	GCT	2	6	3933085	3933090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060189
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110135	NC_010524	GCA	2	6	3933169	3933174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060189
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110167	NC_010524	GCA	2	6	3934201	3934206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060189
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110170	NC_010524	GGGGT	2	10	3934284	3934293	0 %	20 %	80 %	0 %	171060189
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110172	NC_010524	GCC	3	9	3934401	3934409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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110213	NC_010524	GCGCC	2	10	3935762	3935771	0 %	0 %	40 %	60 %	171060190
110214	NC_010524	GC	3	6	3935778	3935783	0 %	0 %	50 %	50 %	171060190
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110216	NC_010524	GCCG	2	8	3935823	3935830	0 %	0 %	50 %	50 %	171060190
110217	NC_010524	ACCG	2	8	3935832	3935839	25 %	0 %	25 %	50 %	171060190
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110219	NC_010524	GCG	2	6	3935858	3935863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060190
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110221	NC_010524	GCCG	2	8	3935883	3935890	0 %	0 %	50 %	50 %	171060190
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110224	NC_010524	GC	3	6	3935940	3935945	0 %	0 %	50 %	50 %	171060190
110225	NC_010524	GGCT	2	8	3935947	3935954	0 %	25 %	50 %	25 %	171060190
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110338	NC_010524	GCG	2	6	3939680	3939685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110339	NC_010524	CAT	2	6	3939710	3939715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060192
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110343	NC_010524	GC	3	6	3939908	3939913	0 %	0 %	50 %	50 %	171060192
110344	NC_010524	GCG	2	6	3939918	3939923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060192
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110451	NC_010524	GCA	2	6	3943425	3943430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110452	NC_010524	GC	3	6	3943546	3943551	0 %	0 %	50 %	50 %	171060194
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110459	NC_010524	CGT	2	6	3943889	3943894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060194
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