MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_010524	GCT	2	6	365956	365961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057027
10502	NC_010524	CGGCC	2	10	365984	365993	0 %	0 %	40 %	60 %	171057027
10503	NC_010524	CAA	2	6	366032	366037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057027
10504	NC_010524	CGA	2	6	366084	366089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057028
10505	NC_010524	CGT	2	6	366096	366101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057028
10506	NC_010524	TGC	3	9	366212	366220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057028
10507	NC_010524	GGC	2	6	366322	366327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057028
10508	NC_010524	GCC	2	6	366349	366354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057028
10509	NC_010524	GCGGTG	2	12	366358	366369	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	171057028
10510	NC_010524	AGC	2	6	366395	366400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057028
10511	NC_010524	GGC	3	9	366441	366449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057028
10512	NC_010524	GC	3	6	366448	366453	0 %	0 %	50 %	50 %	171057028
10513	NC_010524	TGC	2	6	366471	366476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057028
10514	NC_010524	GCGCC	2	10	366479	366488	0 %	0 %	40 %	60 %	171057028
10515	NC_010524	GCC	3	9	366493	366501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057028
10516	NC_010524	CCG	2	6	366506	366511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057028
10517	NC_010524	CAA	2	6	366558	366563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057028
10518	NC_010524	CGG	2	6	366588	366593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057028
10519	NC_010524	GCCG	2	8	366627	366634	0 %	0 %	50 %	50 %	171057028
10520	NC_010524	CGG	2	6	366780	366785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057028
10521	NC_010524	GCGCC	2	10	366801	366810	0 %	0 %	40 %	60 %	171057028
10522	NC_010524	TAC	2	6	366820	366825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057028
10523	NC_010524	CCG	2	6	366844	366849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057028
10524	NC_010524	GCC	2	6	366892	366897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057028
10525	NC_010524	CAT	2	6	366924	366929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057028
10526	NC_010524	CGA	2	6	366945	366950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057028
10527	NC_010524	GC	4	8	366953	366960	0 %	0 %	50 %	50 %	171057028
10528	NC_010524	ACG	2	6	366977	366982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057028
10529	NC_010524	GCG	2	6	366983	366988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057028
10530	NC_010524	CGT	2	6	367020	367025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057028
10531	NC_010524	AGG	2	6	367040	367045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057028
10532	NC_010524	CGA	2	6	367065	367070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057028
10533	NC_010524	GC	3	6	367133	367138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10534	NC_010524	CGGG	2	8	367142	367149	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10535	NC_010524	GCC	2	6	367174	367179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10536	NC_010524	CGA	2	6	367274	367279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057029
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10538	NC_010524	GCT	2	6	367337	367342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057029
10539	NC_010524	GGT	2	6	367400	367405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057029
10540	NC_010524	CGG	2	6	367424	367429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057029
10541	NC_010524	CTG	2	6	367446	367451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057029
10542	NC_010524	CTG	2	6	367563	367568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057029
10543	NC_010524	GCT	2	6	367592	367597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057029
10544	NC_010524	GC	4	8	367639	367646	0 %	0 %	50 %	50 %	171057029
10545	NC_010524	TGC	2	6	367652	367657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057029
10546	NC_010524	CG	3	6	367682	367687	0 %	0 %	50 %	50 %	171057029
10547	NC_010524	GGT	2	6	367700	367705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057029
10548	NC_010524	GCC	2	6	367725	367730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057029
10549	NC_010524	CGG	2	6	367775	367780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057029
10550	NC_010524	GCG	2	6	367810	367815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10551	NC_010524	CGAT	2	8	367819	367826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10552	NC_010524	ACC	2	6	367924	367929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057030
10553	NC_010524	CG	3	6	367975	367980	0 %	0 %	50 %	50 %	171057030
10554	NC_010524	CG	3	6	367997	368002	0 %	0 %	50 %	50 %	171057030
10555	NC_010524	GCT	2	6	368003	368008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057030
10556	NC_010524	CGC	2	6	368036	368041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057030
10557	NC_010524	CAA	2	6	368054	368059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057030
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10559	NC_010524	GC	5	10	368101	368110	0 %	0 %	50 %	50 %	171057030
10560	NC_010524	TGC	2	6	368158	368163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057030
10561	NC_010524	CGA	2	6	368216	368221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057030
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10569	NC_010524	CG	4	8	368369	368376	0 %	0 %	50 %	50 %	171057030
10570	NC_010524	TGA	2	6	368377	368382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057030
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10576	NC_010524	GCC	2	6	368491	368496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057030
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10587	NC_010524	GC	3	6	368862	368867	0 %	0 %	50 %	50 %	171057030
10588	NC_010524	CGAC	2	8	368911	368918	25 %	0 %	25 %	50 %	171057030
10589	NC_010524	ACC	2	6	368950	368955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057030
10590	NC_010524	GAG	2	6	368970	368975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057030
10591	NC_010524	CGGG	2	8	369010	369017	0 %	0 %	75 %	25 %	171057030
10592	NC_010524	CTG	2	6	369069	369074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057030
10593	NC_010524	GAC	2	6	369084	369089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057030
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10595	NC_010524	CAC	2	6	369140	369145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057030
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10599	NC_010524	AAGCC	2	10	369319	369328	40 %	0 %	20 %	40 %	171057030
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10603	NC_010524	GC	3	6	369408	369413	0 %	0 %	50 %	50 %	171057030
10604	NC_010524	AAC	2	6	369417	369422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057030
10605	NC_010524	TCG	2	6	369433	369438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057030
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10612	NC_010524	GCT	2	6	369755	369760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057030
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10620	NC_010524	GCCG	2	8	369926	369933	0 %	0 %	50 %	50 %	171057030
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10862	NC_010524	CTG	2	6	376612	376617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057034
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10933	NC_010524	CGGG	2	8	379062	379069	0 %	0 %	75 %	25 %	171057036
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10961	NC_010524	CGA	3	9	380159	380167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057037
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10967	NC_010524	GC	3	6	380342	380347	0 %	0 %	50 %	50 %	171057037
10968	NC_010524	G	6	6	380349	380354	0 %	0 %	100 %	0 %	171057037
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10973	NC_010524	CCGGG	2	10	380578	380587	0 %	0 %	60 %	40 %	171057037
10974	NC_010524	CGC	2	6	380615	380620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057037
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10976	NC_010524	GGC	2	6	380637	380642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057037
10977	NC_010524	CG	3	6	380651	380656	0 %	0 %	50 %	50 %	171057037
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10980	NC_010524	CGG	2	6	380752	380757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057037
10981	NC_010524	CG	3	6	380779	380784	0 %	0 %	50 %	50 %	171057037
10982	NC_010524	CGG	2	6	380794	380799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057037
10983	NC_010524	GCG	3	9	380809	380817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057037
10984	NC_010524	CGC	2	6	380826	380831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057037
10985	NC_010524	GAA	2	6	380841	380846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057037
10986	NC_010524	TGA	2	6	380854	380859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057037
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10988	NC_010524	ACG	2	6	381010	381015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057037
10989	NC_010524	CG	4	8	381044	381051	0 %	0 %	50 %	50 %	171057037
10990	NC_010524	GGC	2	6	381158	381163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057037
10991	NC_010524	TCG	2	6	381196	381201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057037
10992	NC_010524	CTG	2	6	381219	381224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057037
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10994	NC_010524	TGC	2	6	381283	381288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057037
10995	NC_010524	TCG	2	6	381298	381303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057037
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10998	NC_010524	GGT	2	6	381440	381445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057037
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11000	NC_010524	ACT	2	6	381517	381522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057037

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