MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
109001	NC_010524	CAC	3	9	3889808	3889816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060149
109002	NC_010524	CGA	2	6	3889837	3889842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060149
109003	NC_010524	ACG	2	6	3889849	3889854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060149
109004	NC_010524	CGA	2	6	3889868	3889873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060149
109005	NC_010524	CGC	2	6	3889907	3889912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060149
109006	NC_010524	CTG	2	6	3889917	3889922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060149
109007	NC_010524	GGGCA	2	10	3889929	3889938	20 %	0 %	60 %	20 %	171060149
109008	NC_010524	AGGC	2	8	3889968	3889975	25 %	0 %	50 %	25 %	171060149
109009	NC_010524	GC	3	6	3889977	3889982	0 %	0 %	50 %	50 %	171060149
109010	NC_010524	CTG	2	6	3889989	3889994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060149
109011	NC_010524	AG	3	6	3890012	3890017	50 %	0 %	50 %	0 %	171060149
109012	NC_010524	ATG	2	6	3890028	3890033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060149
109013	NC_010524	GCG	2	6	3890143	3890148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060149
109014	NC_010524	CAG	2	6	3890184	3890189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060149
109015	NC_010524	TGG	2	6	3890221	3890226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060149
109016	NC_010524	GGCGC	2	10	3890327	3890336	0 %	0 %	60 %	40 %	171060149
109017	NC_010524	TGGC	2	8	3890439	3890446	0 %	25 %	50 %	25 %	171060149
109018	NC_010524	TTC	2	6	3890505	3890510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060149
109019	NC_010524	CCGG	2	8	3890605	3890612	0 %	0 %	50 %	50 %	171060149
109020	NC_010524	TGC	2	6	3890623	3890628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060149
109021	NC_010524	AGCG	2	8	3890739	3890746	25 %	0 %	50 %	25 %	171060149
109022	NC_010524	CG	3	6	3890818	3890823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109023	NC_010524	TGCAG	2	10	3890836	3890845	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109024	NC_010524	AGC	2	6	3891005	3891010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109025	NC_010524	CAC	2	6	3891029	3891034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109026	NC_010524	CGGGT	2	10	3891094	3891103	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
109027	NC_010524	GCA	2	6	3891151	3891156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109028	NC_010524	GCACCA	2	12	3891161	3891172	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109029	NC_010524	ACC	2	6	3891176	3891181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109030	NC_010524	GAAC	2	8	3891204	3891211	50 %	0 %	25 %	25 %	171060150
109031	NC_010524	GCCGAC	2	12	3891235	3891246	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171060150
109032	NC_010524	GGC	2	6	3891311	3891316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060150
109033	NC_010524	GC	3	6	3891353	3891358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109034	NC_010524	GGCT	2	8	3891359	3891366	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109035	NC_010524	CAG	2	6	3891438	3891443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060151
109036	NC_010524	GAC	2	6	3891461	3891466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060151
109037	NC_010524	ATG	2	6	3891542	3891547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060151
109038	NC_010524	CAA	2	6	3891574	3891579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060151
109039	NC_010524	CAA	2	6	3891614	3891619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060151
109040	NC_010524	GCC	2	6	3891680	3891685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060151
109041	NC_010524	CGG	2	6	3891837	3891842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060151
109042	NC_010524	ACC	2	6	3891866	3891871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060151
109043	NC_010524	GCA	2	6	3891877	3891882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060151
109044	NC_010524	CAA	2	6	3891886	3891891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060151
109045	NC_010524	GCAC	2	8	3891894	3891901	25 %	0 %	25 %	50 %	171060151
109046	NC_010524	CG	3	6	3891920	3891925	0 %	0 %	50 %	50 %	171060151
109047	NC_010524	A	6	6	3891927	3891932	100 %	0 %	0 %	0 %	171060151
109048	NC_010524	ACT	2	6	3891952	3891957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060151
109049	NC_010524	GGC	2	6	3892004	3892009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060151
109050	NC_010524	GC	3	6	3892023	3892028	0 %	0 %	50 %	50 %	171060151
109051	NC_010524	CACG	2	8	3892054	3892061	25 %	0 %	25 %	50 %	171060151
109052	NC_010524	CATCG	2	10	3892076	3892085	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109053	NC_010524	GC	4	8	3892109	3892116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109054	NC_010524	TGC	2	6	3892150	3892155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109055	NC_010524	TGG	2	6	3892171	3892176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109056	NC_010524	GCG	2	6	3892195	3892200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109057	NC_010524	CCG	2	6	3892204	3892209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109058	NC_010524	GATC	2	8	3892217	3892224	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109059	NC_010524	GTC	2	6	3892226	3892231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109060	NC_010524	GCC	2	6	3892301	3892306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060152
109061	NC_010524	GCC	2	6	3892343	3892348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060152
109062	NC_010524	CGC	2	6	3892359	3892364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060152
109063	NC_010524	AGC	2	6	3892365	3892370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060152
109064	NC_010524	TCA	2	6	3892436	3892441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109065	NC_010524	AGT	2	6	3892458	3892463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109066	NC_010524	ACC	2	6	3892566	3892571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109067	NC_010524	CAA	2	6	3892612	3892617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109068	NC_010524	GCC	2	6	3892685	3892690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109069	NC_010524	AGGT	2	8	3892704	3892711	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109070	NC_010524	TGC	2	6	3892759	3892764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109071	NC_010524	CCCG	2	8	3892782	3892789	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109072	NC_010524	GC	3	6	3892823	3892828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109073	NC_010524	GAT	2	6	3892832	3892837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109074	NC_010524	CAGG	2	8	3892846	3892853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109075	NC_010524	CAAA	2	8	3892869	3892876	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109076	NC_010524	GCC	2	6	3892880	3892885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109077	NC_010524	GC	3	6	3892922	3892927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109078	NC_010524	CTG	2	6	3892990	3892995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109079	NC_010524	GGCTT	2	10	3893124	3893133	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109080	NC_010524	GGC	2	6	3893163	3893168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109081	NC_010524	GCC	2	6	3893176	3893181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109082	NC_010524	CGGT	2	8	3893183	3893190	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109083	NC_010524	GCT	2	6	3893199	3893204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060153
109084	NC_010524	AGT	2	6	3893355	3893360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060153
109085	NC_010524	CAG	2	6	3893377	3893382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060153
109086	NC_010524	CGG	2	6	3893400	3893405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060153
109087	NC_010524	GCTT	2	8	3893457	3893464	0 %	50 %	25 %	25 %	171060153
109088	NC_010524	TCG	2	6	3893465	3893470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060153
109089	NC_010524	CAC	2	6	3893521	3893526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060153
109090	NC_010524	GCCA	2	8	3893567	3893574	25 %	0 %	25 %	50 %	171060153
109091	NC_010524	GGC	2	6	3893584	3893589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060153
109092	NC_010524	GC	3	6	3893638	3893643	0 %	0 %	50 %	50 %	171060153
109093	NC_010524	ACG	2	6	3893675	3893680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060153
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109101	NC_010524	CGGC	2	8	3894060	3894067	0 %	0 %	50 %	50 %	171060153
109102	NC_010524	GTC	2	6	3894076	3894081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060153
109103	NC_010524	CTT	2	6	3894088	3894093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060153
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109105	NC_010524	GCAT	2	8	3894149	3894156	25 %	25 %	25 %	25 %	171060153
109106	NC_010524	GCG	2	6	3894179	3894184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060153
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109108	NC_010524	GCG	2	6	3894215	3894220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060153
109109	NC_010524	TGC	2	6	3894309	3894314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109110	NC_010524	CCGA	2	8	3894372	3894379	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109111	NC_010524	GC	3	6	3894411	3894416	0 %	0 %	50 %	50 %	171060154
109112	NC_010524	CGA	2	6	3894430	3894435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060154
109113	NC_010524	CTTG	2	8	3894520	3894527	0 %	50 %	25 %	25 %	171060154
109114	NC_010524	CGT	2	6	3894568	3894573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060154
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109116	NC_010524	TGT	2	6	3894685	3894690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060154
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109118	NC_010524	CGG	2	6	3894772	3894777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060154
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109234	NC_010524	GCC	2	6	3898743	3898748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060157
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