MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
108001	NC_010524	CTT	2	6	3854979	3854984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060127
108002	NC_010524	GGCC	2	8	3855050	3855057	0 %	0 %	50 %	50 %	171060127
108003	NC_010524	CGGC	2	8	3855086	3855093	0 %	0 %	50 %	50 %	171060127
108004	NC_010524	CAC	2	6	3855142	3855147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060127
108005	NC_010524	CGC	2	6	3855149	3855154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060127
108006	NC_010524	GTC	2	6	3855157	3855162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060127
108007	NC_010524	CTT	2	6	3855192	3855197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060127
108008	NC_010524	TGA	2	6	3855215	3855220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060127
108009	NC_010524	TCG	2	6	3855295	3855300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060127
108010	NC_010524	GCA	2	6	3855308	3855313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060127
108011	NC_010524	GCC	2	6	3855351	3855356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060127
108012	NC_010524	GC	3	6	3855371	3855376	0 %	0 %	50 %	50 %	171060127
108013	NC_010524	CCTT	2	8	3855382	3855389	0 %	50 %	0 %	50 %	171060127
108014	NC_010524	TTG	2	6	3855406	3855411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060127
108015	NC_010524	ACC	2	6	3855418	3855423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060127
108016	NC_010524	GC	3	6	3855452	3855457	0 %	0 %	50 %	50 %	171060127
108017	NC_010524	GGGGAT	2	12	3855492	3855503	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	171060127
108018	NC_010524	GCC	2	6	3855540	3855545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060127
108019	NC_010524	GGC	2	6	3855606	3855611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060127
108020	NC_010524	CGG	2	6	3855656	3855661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060127
108021	NC_010524	GGT	2	6	3855693	3855698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060127
108022	NC_010524	TTG	2	6	3855712	3855717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060127
108023	NC_010524	CGA	2	6	3855776	3855781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060127
108024	NC_010524	CGG	2	6	3855815	3855820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060127
108025	NC_010524	TGCG	2	8	3855824	3855831	0 %	25 %	50 %	25 %	171060127
108026	NC_010524	CACC	2	8	3855860	3855867	25 %	0 %	0 %	75 %	171060127
108027	NC_010524	CTTC	2	8	3855953	3855960	0 %	50 %	0 %	50 %	171060127
108028	NC_010524	GCC	2	6	3855979	3855984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060127
108029	NC_010524	TCA	2	6	3856016	3856021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060127
108030	NC_010524	TTGG	2	8	3856030	3856037	0 %	50 %	50 %	0 %	171060127
108031	NC_010524	TC	3	6	3856052	3856057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108032	NC_010524	GGC	3	9	3856089	3856097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108033	NC_010524	CCT	2	6	3856113	3856118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108034	NC_010524	CAG	2	6	3856271	3856276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060128
108035	NC_010524	CCG	3	9	3856314	3856322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060128
108036	NC_010524	CGGC	2	8	3856366	3856373	0 %	0 %	50 %	50 %	171060128
108037	NC_010524	CAGC	2	8	3856405	3856412	25 %	0 %	25 %	50 %	171060128
108038	NC_010524	GCCGT	2	10	3856416	3856425	0 %	20 %	40 %	40 %	171060128
108039	NC_010524	CCGG	2	8	3856439	3856446	0 %	0 %	50 %	50 %	171060128
108040	NC_010524	TGT	4	12	3856453	3856464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060128
108041	NC_010524	GTA	2	6	3856472	3856477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060128
108042	NC_010524	CAG	2	6	3856478	3856483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060128
108043	NC_010524	CAG	2	6	3856493	3856498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060128
108044	NC_010524	GGCC	2	8	3856546	3856553	0 %	0 %	50 %	50 %	171060128
108045	NC_010524	CGT	2	6	3856561	3856566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060128
108046	NC_010524	GCCAC	2	10	3856594	3856603	20 %	0 %	20 %	60 %	171060128
108047	NC_010524	GCC	2	6	3856634	3856639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060128
108048	NC_010524	GAC	2	6	3856670	3856675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060128
108049	NC_010524	CCT	2	6	3856681	3856686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060128
108050	NC_010524	CG	3	6	3856693	3856698	0 %	0 %	50 %	50 %	171060128
108051	NC_010524	GC	3	6	3856706	3856711	0 %	0 %	50 %	50 %	171060128
108052	NC_010524	GTT	2	6	3856715	3856720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060128
108053	NC_010524	GAA	2	6	3856748	3856753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060128
108054	NC_010524	TCT	2	6	3856801	3856806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060128
108055	NC_010524	CA	3	6	3857010	3857015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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108057	NC_010524	TGG	2	6	3857188	3857193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060129
108058	NC_010524	GCA	2	6	3857203	3857208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060129
108059	NC_010524	CTGG	2	8	3857219	3857226	0 %	25 %	50 %	25 %	171060129
108060	NC_010524	CGCCCT	2	12	3857236	3857247	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	171060129
108061	NC_010524	GCA	2	6	3857260	3857265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060129
108062	NC_010524	CGC	2	6	3857272	3857277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060129
108063	NC_010524	CAG	2	6	3857294	3857299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060129
108064	NC_010524	CG	3	6	3857302	3857307	0 %	0 %	50 %	50 %	171060129
108065	NC_010524	GCC	2	6	3857311	3857316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060129
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108068	NC_010524	GCCG	2	8	3857357	3857364	0 %	0 %	50 %	50 %	171060129
108069	NC_010524	GCG	2	6	3857383	3857388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060129
108070	NC_010524	GC	3	6	3857428	3857433	0 %	0 %	50 %	50 %	171060129
108071	NC_010524	CACC	2	8	3857434	3857441	25 %	0 %	0 %	75 %	171060129
108072	NC_010524	CGG	2	6	3857446	3857451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060129
108073	NC_010524	GC	3	6	3857514	3857519	0 %	0 %	50 %	50 %	171060129
108074	NC_010524	GC	3	6	3857532	3857537	0 %	0 %	50 %	50 %	171060129
108075	NC_010524	CGAACA	2	12	3857563	3857574	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	171060129
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108080	NC_010524	CAG	2	6	3857777	3857782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060129
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108084	NC_010524	CAT	2	6	3857891	3857896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060129
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108086	NC_010524	CAG	2	6	3857939	3857944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060129
108087	NC_010524	GCG	2	6	3857952	3857957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060129
108088	NC_010524	TCAT	2	8	3858009	3858016	25 %	50 %	0 %	25 %	171060129
108089	NC_010524	GTGC	2	8	3858018	3858025	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108090	NC_010524	GAG	2	6	3858047	3858052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060130
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108092	NC_010524	CAG	3	9	3858113	3858121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060130
108093	NC_010524	CGC	2	6	3858178	3858183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060130
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108096	NC_010524	GCCG	2	8	3858238	3858245	0 %	0 %	50 %	50 %	171060130
108097	NC_010524	CGA	2	6	3858253	3858258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060130
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108100	NC_010524	CGG	2	6	3858316	3858321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060130
108101	NC_010524	GGCC	2	8	3858340	3858347	0 %	0 %	50 %	50 %	171060130
108102	NC_010524	GCC	2	6	3858350	3858355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060130
108103	NC_010524	CGA	2	6	3858389	3858394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060130
108104	NC_010524	CGC	3	9	3858410	3858418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060130
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108106	NC_010524	CGC	2	6	3858482	3858487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060130
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108108	NC_010524	GCA	2	6	3858700	3858705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060130
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108111	NC_010524	GC	3	6	3858829	3858834	0 %	0 %	50 %	50 %	171060130
108112	NC_010524	AC	3	6	3858884	3858889	50 %	0 %	0 %	50 %	171060130
108113	NC_010524	CGA	2	6	3858970	3858975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060130
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108115	NC_010524	CAG	2	6	3859034	3859039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060130
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108230	NC_010524	GAAC	2	8	3863097	3863104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108231	NC_010524	CACC	2	8	3863171	3863178	25 %	0 %	0 %	75 %	171060134
108232	NC_010524	GCA	2	6	3863225	3863230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060134
108233	NC_010524	GCG	2	6	3863255	3863260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060134
108234	NC_010524	GCG	2	6	3863333	3863338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060134
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