MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
107501	NC_010524	GCC	2	6	3837028	3837033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060108
107502	NC_010524	ATC	2	6	3837112	3837117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060108
107503	NC_010524	CGGC	2	8	3837135	3837142	0 %	0 %	50 %	50 %	171060108
107504	NC_010524	GCG	2	6	3837149	3837154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060108
107505	NC_010524	ACG	2	6	3837158	3837163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060108
107506	NC_010524	TTC	2	6	3837205	3837210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060108
107507	NC_010524	AGG	2	6	3837221	3837226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060108
107508	NC_010524	TCA	2	6	3837266	3837271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060108
107509	NC_010524	TGC	2	6	3837452	3837457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060108
107510	NC_010524	CGA	2	6	3837474	3837479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060108
107511	NC_010524	TCA	2	6	3837518	3837523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060108
107512	NC_010524	ACG	2	6	3837557	3837562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060108
107513	NC_010524	GGT	2	6	3837588	3837593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060108
107514	NC_010524	GCAGCG	2	12	3837611	3837622	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171060108
107515	NC_010524	GGC	2	6	3837675	3837680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060108
107516	NC_010524	ACGA	2	8	3837690	3837697	50 %	0 %	25 %	25 %	171060109
107517	NC_010524	CGG	2	6	3837749	3837754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060109
107518	NC_010524	GC	3	6	3837803	3837808	0 %	0 %	50 %	50 %	171060109
107519	NC_010524	CAT	2	6	3837809	3837814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060109
107520	NC_010524	GCA	2	6	3837883	3837888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060109
107521	NC_010524	GCC	2	6	3837925	3837930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060109
107522	NC_010524	GCAC	2	8	3837951	3837958	25 %	0 %	25 %	50 %	171060109
107523	NC_010524	ACA	2	6	3838000	3838005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060109
107524	NC_010524	ATGAAG	2	12	3838023	3838034	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	171060109
107525	NC_010524	CAG	2	6	3838047	3838052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060109
107526	NC_010524	GCC	2	6	3838071	3838076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060109
107527	NC_010524	CG	3	6	3838095	3838100	0 %	0 %	50 %	50 %	171060109
107528	NC_010524	ATC	2	6	3838113	3838118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060109
107529	NC_010524	CG	3	6	3838200	3838205	0 %	0 %	50 %	50 %	171060109
107530	NC_010524	TGC	3	9	3838225	3838233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060109
107531	NC_010524	CGA	2	6	3838235	3838240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060109
107532	NC_010524	GAG	2	6	3838263	3838268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060109
107533	NC_010524	ACG	2	6	3838303	3838308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060109
107534	NC_010524	CAC	2	6	3838316	3838321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060109
107535	NC_010524	GTG	2	6	3838350	3838355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060109
107536	NC_010524	CGT	2	6	3838373	3838378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060109
107537	NC_010524	AAG	2	6	3838395	3838400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060109
107538	NC_010524	GC	3	6	3838427	3838432	0 %	0 %	50 %	50 %	171060109
107539	NC_010524	TCA	2	6	3838444	3838449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060109
107540	NC_010524	TGA	2	6	3838473	3838478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060109
107541	NC_010524	TGCGC	2	10	3838499	3838508	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107542	NC_010524	C	6	6	3838511	3838516	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107543	NC_010524	CGG	2	6	3838546	3838551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107544	NC_010524	CAT	2	6	3838571	3838576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060110
107545	NC_010524	CGG	2	6	3838601	3838606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060110
107546	NC_010524	GCG	2	6	3838669	3838674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060110
107547	NC_010524	GC	3	6	3838725	3838730	0 %	0 %	50 %	50 %	171060110
107548	NC_010524	GCT	2	6	3838751	3838756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060110
107549	NC_010524	ACA	2	6	3838765	3838770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060110
107550	NC_010524	GAT	2	6	3838814	3838819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060110
107551	NC_010524	GCT	2	6	3838883	3838888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060110
107552	NC_010524	CTGTTC	2	12	3838989	3839000	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	171060110
107553	NC_010524	GCG	2	6	3839017	3839022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060110
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107555	NC_010524	CGC	2	6	3839048	3839053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060110
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107557	NC_010524	TGG	2	6	3839071	3839076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060110
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107560	NC_010524	CG	3	6	3839115	3839120	0 %	0 %	50 %	50 %	171060110
107561	NC_010524	TGCG	2	8	3839122	3839129	0 %	25 %	50 %	25 %	171060110
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107581	NC_010524	TGG	2	6	3839635	3839640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060111
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107613	NC_010524	CCG	2	6	3840784	3840789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060112
107614	NC_010524	GCT	2	6	3840821	3840826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060112
107615	NC_010524	GAT	2	6	3840896	3840901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060112
107616	NC_010524	CGG	2	6	3840914	3840919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060112
107617	NC_010524	CAAGGG	2	12	3841001	3841012	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	171060112
107618	NC_010524	GATC	2	8	3841022	3841029	25 %	25 %	25 %	25 %	171060112
107619	NC_010524	CGG	3	9	3841114	3841122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060112
107620	NC_010524	GGC	2	6	3841128	3841133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060112
107621	NC_010524	AAG	2	6	3841206	3841211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060112
107622	NC_010524	GGC	2	6	3841215	3841220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060112
107623	NC_010524	AAG	2	6	3841239	3841244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060112
107624	NC_010524	GCT	2	6	3841292	3841297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060112
107625	NC_010524	CGA	2	6	3841298	3841303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060112
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107627	NC_010524	CAG	2	6	3841392	3841397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060112
107628	NC_010524	TGC	2	6	3841411	3841416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060112
107629	NC_010524	TGGGGC	2	12	3841419	3841430	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	171060112
107630	NC_010524	TGA	2	6	3841432	3841437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060112
107631	NC_010524	CG	3	6	3841477	3841482	0 %	0 %	50 %	50 %	171060112
107632	NC_010524	AGA	2	6	3841483	3841488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060112
107633	NC_010524	TGG	2	6	3841500	3841505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060112
107634	NC_010524	CAG	2	6	3841584	3841589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060112
107635	NC_010524	ATC	2	6	3841689	3841694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060112
107636	NC_010524	CG	3	6	3841722	3841727	0 %	0 %	50 %	50 %	171060112
107637	NC_010524	GGCAAG	2	12	3841740	3841751	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	171060112
107638	NC_010524	CGA	2	6	3841799	3841804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060112
107639	NC_010524	AAG	2	6	3841806	3841811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060112
107640	NC_010524	CGA	2	6	3841946	3841951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060112
107641	NC_010524	GAT	2	6	3841952	3841957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060112
107642	NC_010524	GAA	2	6	3842003	3842008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060112
107643	NC_010524	CGCGC	2	10	3842014	3842023	0 %	0 %	40 %	60 %	171060112
107644	NC_010524	CA	3	6	3842057	3842062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107645	NC_010524	TGC	2	6	3842103	3842108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107646	NC_010524	TCAACG	2	12	3842152	3842163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	171060113
107647	NC_010524	GTG	2	6	3842235	3842240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060113
107648	NC_010524	GCT	2	6	3842243	3842248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060113
107649	NC_010524	GGC	2	6	3842250	3842255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060113
107650	NC_010524	GAC	2	6	3842270	3842275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060113
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107652	NC_010524	CTG	2	6	3842298	3842303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060113
107653	NC_010524	GCG	2	6	3842314	3842319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060113
107654	NC_010524	GCA	2	6	3842332	3842337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060113
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107667	NC_010524	TGC	2	6	3842635	3842640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060113
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107675	NC_010524	TGCG	2	8	3842948	3842955	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107676	NC_010524	GCT	2	6	3842981	3842986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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107681	NC_010524	GGC	2	6	3843205	3843210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060114
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107692	NC_010524	GCT	2	6	3843489	3843494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060115
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107696	NC_010524	CGG	2	6	3843583	3843588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060115
107697	NC_010524	ACT	2	6	3843638	3843643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060115
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107702	NC_010524	GC	3	6	3843749	3843754	0 %	0 %	50 %	50 %	171060115
107703	NC_010524	GTG	2	6	3843782	3843787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060115
107704	NC_010524	AGTTGC	2	12	3843800	3843811	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171060115
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107709	NC_010524	CCG	2	6	3844007	3844012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060115
107710	NC_010524	CGA	2	6	3844062	3844067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060115
107711	NC_010524	GTG	2	6	3844072	3844077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060115
107712	NC_010524	TCA	2	6	3844139	3844144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060115
107713	NC_010524	CGG	2	6	3844196	3844201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060115
107714	NC_010524	TGC	2	6	3844202	3844207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060115
107715	NC_010524	GCA	2	6	3844229	3844234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060115
107716	NC_010524	GCTG	2	8	3844250	3844257	0 %	25 %	50 %	25 %	171060115
107717	NC_010524	GGCCG	2	10	3844258	3844267	0 %	0 %	60 %	40 %	171060115
107718	NC_010524	ACC	2	6	3844273	3844278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060115
107719	NC_010524	GGT	2	6	3844320	3844325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060115
107720	NC_010524	CTG	2	6	3844342	3844347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060115
107721	NC_010524	TGG	2	6	3844358	3844363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060115
107722	NC_010524	CA	3	6	3844445	3844450	50 %	0 %	0 %	50 %	171060115
107723	NC_010524	GC	3	6	3844473	3844478	0 %	0 %	50 %	50 %	171060115
107724	NC_010524	GCT	2	6	3844488	3844493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060115
107725	NC_010524	ACG	2	6	3844514	3844519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060115
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