MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
106501	NC_010524	GGC	2	6	3801303	3801308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060090
106502	NC_010524	GCG	2	6	3801368	3801373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060090
106503	NC_010524	TCG	2	6	3801401	3801406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060090
106504	NC_010524	GC	3	6	3801411	3801416	0 %	0 %	50 %	50 %	171060090
106505	NC_010524	GAG	2	6	3801427	3801432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060090
106506	NC_010524	GAG	2	6	3801463	3801468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060090
106507	NC_010524	GTTC	2	8	3801473	3801480	0 %	50 %	25 %	25 %	171060090
106508	NC_010524	CGA	2	6	3801540	3801545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060090
106509	NC_010524	TCG	2	6	3801563	3801568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060090
106510	NC_010524	CGCA	2	8	3801580	3801587	25 %	0 %	25 %	50 %	171060090
106511	NC_010524	ACG	2	6	3801653	3801658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060090
106512	NC_010524	CCA	2	6	3801681	3801686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060090
106513	NC_010524	CGG	2	6	3801690	3801695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060090
106514	NC_010524	GGC	2	6	3801708	3801713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060090
106515	NC_010524	AACG	2	8	3801715	3801722	50 %	0 %	25 %	25 %	171060090
106516	NC_010524	TGG	2	6	3801848	3801853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060090
106517	NC_010524	GTTT	2	8	3801950	3801957	0 %	75 %	25 %	0 %	171060090
106518	NC_010524	GCCGA	2	10	3801984	3801993	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106519	NC_010524	CAA	2	6	3801994	3801999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106520	NC_010524	GGCC	2	8	3802095	3802102	0 %	0 %	50 %	50 %	171060091
106521	NC_010524	GCT	2	6	3802182	3802187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060091
106522	NC_010524	GTC	2	6	3802224	3802229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060091
106523	NC_010524	GCC	2	6	3802238	3802243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060091
106524	NC_010524	CGA	2	6	3802260	3802265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060091
106525	NC_010524	CAG	2	6	3802306	3802311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060091
106526	NC_010524	CGC	2	6	3802349	3802354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060091
106527	NC_010524	CAT	2	6	3802371	3802376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060091
106528	NC_010524	GC	3	6	3802378	3802383	0 %	0 %	50 %	50 %	171060091
106529	NC_010524	TCGA	2	8	3802525	3802532	25 %	25 %	25 %	25 %	171060091
106530	NC_010524	GGC	2	6	3802533	3802538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060091
106531	NC_010524	TGG	2	6	3802631	3802636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060091
106532	NC_010524	TGC	2	6	3802637	3802642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060091
106533	NC_010524	CGG	2	6	3802701	3802706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060091
106534	NC_010524	GAT	2	6	3802719	3802724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060091
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106536	NC_010524	GCCA	2	8	3802807	3802814	25 %	0 %	25 %	50 %	171060091
106537	NC_010524	GCCGG	2	10	3802819	3802828	0 %	0 %	60 %	40 %	171060091
106538	NC_010524	ACT	2	6	3802835	3802840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060091
106539	NC_010524	GCA	2	6	3802853	3802858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060091
106540	NC_010524	CCACG	2	10	3802896	3802905	20 %	0 %	20 %	60 %	171060091
106541	NC_010524	CGC	2	6	3802971	3802976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060091
106542	NC_010524	GCG	2	6	3802981	3802986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060091
106543	NC_010524	TGT	2	6	3802988	3802993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060091
106544	NC_010524	GAA	2	6	3803032	3803037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060091
106545	NC_010524	CCG	2	6	3803057	3803062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060091
106546	NC_010524	TCA	2	6	3803075	3803080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060091
106547	NC_010524	CGG	2	6	3803099	3803104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106548	NC_010524	GC	3	6	3803142	3803147	0 %	0 %	50 %	50 %	171060092
106549	NC_010524	GGC	2	6	3803227	3803232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060092
106550	NC_010524	CAC	2	6	3803409	3803414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060092
106551	NC_010524	CAC	2	6	3803478	3803483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060092
106552	NC_010524	CG	4	8	3803489	3803496	0 %	0 %	50 %	50 %	171060092
106553	NC_010524	ACC	2	6	3803515	3803520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060092
106554	NC_010524	CGG	2	6	3803573	3803578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060092
106555	NC_010524	CAAA	2	8	3803591	3803598	75 %	0 %	0 %	25 %	171060092
106556	NC_010524	CCAT	2	8	3803723	3803730	25 %	25 %	0 %	50 %	171060092
106557	NC_010524	TGC	2	6	3803742	3803747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106558	NC_010524	CGA	2	6	3803755	3803760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106559	NC_010524	ATG	2	6	3803763	3803768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106560	NC_010524	CCCA	2	8	3803775	3803782	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
106561	NC_010524	TGA	2	6	3803826	3803831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060093
106562	NC_010524	GC	3	6	3803869	3803874	0 %	0 %	50 %	50 %	171060093
106563	NC_010524	TGG	2	6	3803904	3803909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060093
106564	NC_010524	ATC	2	6	3803918	3803923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060093
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106573	NC_010524	GCT	2	6	3804329	3804334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060094
106574	NC_010524	CTG	2	6	3804339	3804344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060094
106575	NC_010524	TCG	2	6	3804346	3804351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060094
106576	NC_010524	CAT	2	6	3804356	3804361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060094
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106583	NC_010524	CGG	2	6	3804533	3804538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060094
106584	NC_010524	GCCT	2	8	3804583	3804590	0 %	25 %	25 %	50 %	171060094
106585	NC_010524	GCTG	2	8	3804595	3804602	0 %	25 %	50 %	25 %	171060094
106586	NC_010524	CAT	2	6	3804677	3804682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060094
106587	NC_010524	CAG	3	9	3804714	3804722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060094
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106589	NC_010524	GCC	2	6	3804797	3804802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106590	NC_010524	TGG	2	6	3804830	3804835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060095
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106595	NC_010524	GGC	2	6	3804924	3804929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060095
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106599	NC_010524	TGG	2	6	3805043	3805048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060095
106600	NC_010524	CCGAAC	2	12	3805060	3805071	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	171060095
106601	NC_010524	GGCC	2	8	3805108	3805115	0 %	0 %	50 %	50 %	171060095
106602	NC_010524	GCT	2	6	3805116	3805121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060095
106603	NC_010524	CG	3	6	3805176	3805181	0 %	0 %	50 %	50 %	171060096
106604	NC_010524	C	6	6	3805185	3805190	0 %	0 %	0 %	100 %	171060096
106605	NC_010524	TGG	2	6	3805304	3805309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060096
106606	NC_010524	GCT	2	6	3805347	3805352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060096
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106610	NC_010524	GCT	2	6	3805584	3805589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060096
106611	NC_010524	CAG	2	6	3805659	3805664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060096
106612	NC_010524	GCG	2	6	3805691	3805696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060096
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106615	NC_010524	ACCCG	2	10	3805719	3805728	20 %	0 %	20 %	60 %	171060096
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