MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
105001	NC_010524	CAG	2	6	3744585	3744590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060042
105002	NC_010524	GC	3	6	3744596	3744601	0 %	0 %	50 %	50 %	171060042
105003	NC_010524	AGC	2	6	3744631	3744636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060042
105004	NC_010524	CAG	2	6	3744642	3744647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060042
105005	NC_010524	GCC	2	6	3744663	3744668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060042
105006	NC_010524	ACC	2	6	3744685	3744690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060042
105007	NC_010524	CAG	2	6	3744762	3744767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060042
105008	NC_010524	TGG	2	6	3744803	3744808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060042
105009	NC_010524	CGA	2	6	3744830	3744835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060042
105010	NC_010524	CCA	2	6	3744854	3744859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060042
105011	NC_010524	GCCG	2	8	3744860	3744867	0 %	0 %	50 %	50 %	171060042
105012	NC_010524	GCC	2	6	3744879	3744884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060042
105013	NC_010524	GCC	2	6	3744897	3744902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060042
105014	NC_010524	CGC	2	6	3745007	3745012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060042
105015	NC_010524	TGC	2	6	3745016	3745021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060042
105016	NC_010524	GTG	2	6	3745045	3745050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060042
105017	NC_010524	GC	3	6	3745079	3745084	0 %	0 %	50 %	50 %	171060042
105018	NC_010524	CAG	3	9	3745089	3745097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060042
105019	NC_010524	CAT	2	6	3745200	3745205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060042
105020	NC_010524	CGT	2	6	3745298	3745303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105021	NC_010524	CCTC	2	8	3745305	3745312	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
105022	NC_010524	CAT	2	6	3745357	3745362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060043
105023	NC_010524	GCG	4	12	3745395	3745406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060043
105024	NC_010524	CGCC	2	8	3745416	3745423	0 %	0 %	25 %	75 %	171060043
105025	NC_010524	GCG	2	6	3745482	3745487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060043
105026	NC_010524	GC	3	6	3745519	3745524	0 %	0 %	50 %	50 %	171060043
105027	NC_010524	CG	4	8	3745528	3745535	0 %	0 %	50 %	50 %	171060043
105028	NC_010524	CGCC	2	8	3745588	3745595	0 %	0 %	25 %	75 %	171060043
105029	NC_010524	CAC	2	6	3745615	3745620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060043
105030	NC_010524	GCC	2	6	3745644	3745649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060043
105031	NC_010524	ACC	2	6	3745652	3745657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060043
105032	NC_010524	GC	3	6	3745729	3745734	0 %	0 %	50 %	50 %	171060043
105033	NC_010524	GCCG	2	8	3745748	3745755	0 %	0 %	50 %	50 %	171060043
105034	NC_010524	GCCG	2	8	3745835	3745842	0 %	0 %	50 %	50 %	171060043
105035	NC_010524	CGA	2	6	3746053	3746058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060043
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105037	NC_010524	GC	3	6	3746132	3746137	0 %	0 %	50 %	50 %	171060043
105038	NC_010524	CTG	2	6	3746150	3746155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060043
105039	NC_010524	ACG	2	6	3746235	3746240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060043
105040	NC_010524	CGAC	2	8	3746278	3746285	25 %	0 %	25 %	50 %	171060043
105041	NC_010524	GCA	2	6	3746295	3746300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060043
105042	NC_010524	CTG	2	6	3746333	3746338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060043
105043	NC_010524	CGA	2	6	3746359	3746364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060043
105044	NC_010524	TAC	2	6	3746408	3746413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060043
105045	NC_010524	CGC	2	6	3746509	3746514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105046	NC_010524	AAAGG	2	10	3746519	3746528	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105047	NC_010524	CGC	2	6	3746588	3746593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060044
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105049	NC_010524	TGC	2	6	3746628	3746633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060044
105050	NC_010524	CGC	2	6	3746677	3746682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060044
105051	NC_010524	CAG	2	6	3746687	3746692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060044
105052	NC_010524	TCG	2	6	3746727	3746732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060044
105053	NC_010524	CTG	2	6	3746762	3746767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060044
105054	NC_010524	GGC	2	6	3746792	3746797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060044
105055	NC_010524	GTA	2	6	3746810	3746815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060044
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105057	NC_010524	GTA	2	6	3746909	3746914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060044
105058	NC_010524	GCA	2	6	3746962	3746967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060044
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105061	NC_010524	GC	3	6	3747520	3747525	0 %	0 %	50 %	50 %	171060044
105062	NC_010524	GCT	2	6	3747656	3747661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060044
105063	NC_010524	TGCG	2	8	3747672	3747679	0 %	25 %	50 %	25 %	171060044
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105065	NC_010524	CAGA	2	8	3747779	3747786	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105066	NC_010524	CGG	2	6	3747858	3747863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105067	NC_010524	GCC	2	6	3747931	3747936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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105088	NC_010524	CGA	2	6	3748599	3748604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060046
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105093	NC_010524	GGCCA	2	10	3748681	3748690	20 %	0 %	40 %	40 %	171060046
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105217	NC_010524	CGA	2	6	3752571	3752576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060049
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105226	NC_010524	GCG	2	6	3753152	3753157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060051
105227	NC_010524	GCT	2	6	3753197	3753202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060051
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105229	NC_010524	CGC	2	6	3753260	3753265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060051
105230	NC_010524	GCT	2	6	3753281	3753286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060051
105231	NC_010524	AGGT	2	8	3753292	3753299	25 %	25 %	50 %	0 %	171060051
105232	NC_010524	GCG	2	6	3753310	3753315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060051
105233	NC_010524	TGCCCA	2	12	3753338	3753349	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171060051
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105236	NC_010524	GTC	2	6	3753402	3753407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060051
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105241	NC_010524	GC	3	6	3753521	3753526	0 %	0 %	50 %	50 %	171060052
105242	NC_010524	GTC	2	6	3753534	3753539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060052
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105332	NC_010524	CGA	2	6	3756667	3756672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060053
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105337	NC_010524	GC	3	6	3756846	3756851	0 %	0 %	50 %	50 %	171060053
105338	NC_010524	TGC	2	6	3756861	3756866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060053
105339	NC_010524	CAC	2	6	3756928	3756933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060053
105340	NC_010524	GCGCG	2	10	3756960	3756969	0 %	0 %	60 %	40 %	171060053
105341	NC_010524	CGG	3	9	3757004	3757012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060054
105342	NC_010524	GGC	2	6	3757017	3757022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060054
105343	NC_010524	GCC	2	6	3757111	3757116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060054
105344	NC_010524	GTT	2	6	3757134	3757139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060054
105345	NC_010524	CGT	2	6	3757157	3757162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060054
105346	NC_010524	GC	6	12	3757210	3757221	0 %	0 %	50 %	50 %	171060054
105347	NC_010524	GCG	3	9	3757239	3757247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060054
105348	NC_010524	TCG	3	9	3757252	3757260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060054
105349	NC_010524	GTC	2	6	3757323	3757328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060054
105350	NC_010524	CG	3	6	3757333	3757338	0 %	0 %	50 %	50 %	171060054
105351	NC_010524	GC	3	6	3757346	3757351	0 %	0 %	50 %	50 %	171060054
105352	NC_010524	CTG	2	6	3757371	3757376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060054
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105355	NC_010524	GGT	2	6	3757449	3757454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060054
105356	NC_010524	AGC	2	6	3757546	3757551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060054
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105359	NC_010524	CAC	2	6	3757701	3757706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060054
105360	NC_010524	CCA	2	6	3757751	3757756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060054
105361	NC_010524	GCG	2	6	3757794	3757799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060054
105362	NC_010524	GCTG	2	8	3757853	3757860	0 %	25 %	50 %	25 %	171060054
105363	NC_010524	TCG	2	6	3757912	3757917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060054
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105372	NC_010524	CGT	2	6	3758071	3758076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060055
105373	NC_010524	GCGCC	2	10	3758086	3758095	0 %	0 %	40 %	60 %	171060055
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105375	NC_010524	GC	3	6	3758210	3758215	0 %	0 %	50 %	50 %	171060055
105376	NC_010524	GGC	2	6	3758272	3758277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060055
105377	NC_010524	CGA	2	6	3758305	3758310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060055
105378	NC_010524	TTGACG	2	12	3758340	3758351	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171060055
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105380	NC_010524	CGG	2	6	3758378	3758383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060055
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105392	NC_010524	GCG	2	6	3758707	3758712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060055
105393	NC_010524	GTG	2	6	3758784	3758789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060055
105394	NC_010524	GCA	2	6	3758794	3758799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060055
105395	NC_010524	CGG	2	6	3758815	3758820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060055
105396	NC_010524	ACG	2	6	3758844	3758849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060055
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105400	NC_010524	GCG	2	6	3758896	3758901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060055
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105408	NC_010524	GCC	2	6	3759101	3759106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060055
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105410	NC_010524	GCC	2	6	3759167	3759172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060055
105411	NC_010524	CGG	2	6	3759235	3759240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060055
105412	NC_010524	GGC	2	6	3759294	3759299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060055
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105423	NC_010524	GGC	2	6	3759644	3759649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060055
105424	NC_010524	GCG	2	6	3759654	3759659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060055
105425	NC_010524	AGC	2	6	3759690	3759695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060055
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105427	NC_010524	CGC	2	6	3759722	3759727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060055
105428	NC_010524	GCA	2	6	3759742	3759747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060055
105429	NC_010524	CG	3	6	3759795	3759800	0 %	0 %	50 %	50 %	171060055
105430	NC_010524	GCA	2	6	3759901	3759906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060055
105431	NC_010524	TGCG	2	8	3759921	3759928	0 %	25 %	50 %	25 %	171060055
105432	NC_010524	GA	3	6	3759940	3759945	50 %	0 %	50 %	0 %	171060055
105433	NC_010524	GC	3	6	3759958	3759963	0 %	0 %	50 %	50 %	171060055
105434	NC_010524	GTGG	2	8	3759965	3759972	0 %	25 %	75 %	0 %	171060055
105435	NC_010524	GTG	2	6	3760107	3760112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060055
105436	NC_010524	CGG	3	9	3760126	3760134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060055
105437	NC_010524	TCA	2	6	3760173	3760178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105438	NC_010524	GAT	2	6	3760229	3760234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105439	NC_010524	GC	3	6	3760251	3760256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105440	NC_010524	CCGA	2	8	3760278	3760285	25 %	0 %	25 %	50 %	171060056
105441	NC_010524	GAG	2	6	3760374	3760379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060056
105442	NC_010524	CCG	2	6	3760387	3760392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060056
105443	NC_010524	GTG	2	6	3760395	3760400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060056
105444	NC_010524	GC	3	6	3760401	3760406	0 %	0 %	50 %	50 %	171060056
105445	NC_010524	CAT	2	6	3760466	3760471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060056
105446	NC_010524	GC	3	6	3760505	3760510	0 %	0 %	50 %	50 %	171060056
105447	NC_010524	GCC	2	6	3760561	3760566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060056
105448	NC_010524	ACG	2	6	3760594	3760599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060056
105449	NC_010524	TGC	2	6	3760612	3760617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060056
105450	NC_010524	GAA	2	6	3760689	3760694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060056
105451	NC_010524	GGC	4	12	3760695	3760706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060056
105452	NC_010524	GC	4	8	3760705	3760712	0 %	0 %	50 %	50 %	171060056
105453	NC_010524	GAT	2	6	3760715	3760720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060056
105454	NC_010524	GGC	2	6	3760787	3760792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060056
105455	NC_010524	CGA	2	6	3760819	3760824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060056
105456	NC_010524	CATCAC	2	12	3760847	3760858	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	171060056
105457	NC_010524	CGC	2	6	3760874	3760879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060056
105458	NC_010524	CAA	2	6	3760955	3760960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060056
105459	NC_010524	CGAC	2	8	3760966	3760973	25 %	0 %	25 %	50 %	171060056
105460	NC_010524	GCG	2	6	3760974	3760979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060056
105461	NC_010524	GAT	2	6	3760994	3760999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060056
105462	NC_010524	CCA	2	6	3761014	3761019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060056
105463	NC_010524	GTG	2	6	3761022	3761027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060056
105464	NC_010524	AGC	2	6	3761092	3761097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060056
105465	NC_010524	CGA	2	6	3761192	3761197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060056
105466	NC_010524	GCG	2	6	3761212	3761217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060056
105467	NC_010524	GCA	2	6	3761222	3761227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060056
105468	NC_010524	GGT	2	6	3761228	3761233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060056
105469	NC_010524	GGA	2	6	3761276	3761281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060056
105470	NC_010524	CTT	2	6	3761288	3761293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060056
105471	NC_010524	ATGGCG	2	12	3761332	3761343	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171060056
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105474	NC_010524	CTG	2	6	3761507	3761512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060057
105475	NC_010524	ACG	2	6	3761517	3761522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060057
105476	NC_010524	GCT	2	6	3761530	3761535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060057
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105481	NC_010524	CGCGCC	2	12	3761657	3761668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060057
105482	NC_010524	CTG	2	6	3761678	3761683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060057
105483	NC_010524	GACCA	2	10	3761687	3761696	40 %	0 %	20 %	40 %	171060057
105484	NC_010524	CCG	2	6	3761708	3761713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060057
105485	NC_010524	CTG	2	6	3761720	3761725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060057
105486	NC_010524	CGG	2	6	3761734	3761739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060057
105487	NC_010524	CG	3	6	3761764	3761769	0 %	0 %	50 %	50 %	171060057
105488	NC_010524	CGC	3	9	3761845	3761853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060057
105489	NC_010524	TGC	2	6	3761859	3761864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060057
105490	NC_010524	GCTGCA	2	12	3761871	3761882	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060057
105491	NC_010524	GGA	2	6	3761893	3761898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060057
105492	NC_010524	CGA	2	6	3761902	3761907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060057
105493	NC_010524	CAG	2	6	3761941	3761946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060057
105494	NC_010524	CGA	2	6	3761980	3761985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060057
105495	NC_010524	GCC	2	6	3761989	3761994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060057
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105499	NC_010524	CG	3	6	3762091	3762096	0 %	0 %	50 %	50 %	171060057
105500	NC_010524	ACG	2	6	3762129	3762134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060057

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