MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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103002	NC_010524	GCA	2	6	3671637	3671642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059978
103003	NC_010524	GGCC	2	8	3671706	3671713	0 %	0 %	50 %	50 %	171059978
103004	NC_010524	GGCCG	2	10	3671731	3671740	0 %	0 %	60 %	40 %	171059978
103005	NC_010524	GCCA	2	8	3671768	3671775	25 %	0 %	25 %	50 %	171059978
103006	NC_010524	CAG	2	6	3671824	3671829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059978
103007	NC_010524	CAG	2	6	3671839	3671844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059978
103008	NC_010524	GGCCG	2	10	3671857	3671866	0 %	0 %	60 %	40 %	171059978
103009	NC_010524	TCA	2	6	3671877	3671882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059978
103010	NC_010524	GC	3	6	3671897	3671902	0 %	0 %	50 %	50 %	171059978
103011	NC_010524	CGG	2	6	3671940	3671945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059978
103012	NC_010524	GC	4	8	3671949	3671956	0 %	0 %	50 %	50 %	171059978
103013	NC_010524	GCC	2	6	3671965	3671970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059978
103014	NC_010524	GTC	2	6	3671983	3671988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059978
103015	NC_010524	GCG	2	6	3671989	3671994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059978
103016	NC_010524	GGC	3	9	3672004	3672012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059978
103017	NC_010524	GT	3	6	3672015	3672020	0 %	50 %	50 %	0 %	171059978
103018	NC_010524	CTGG	2	8	3672028	3672035	0 %	25 %	50 %	25 %	171059978
103019	NC_010524	TCCA	2	8	3672043	3672050	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103020	NC_010524	A	6	6	3672074	3672079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103021	NC_010524	CAAT	2	8	3672129	3672136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103022	NC_010524	CAT	2	6	3672140	3672145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103023	NC_010524	TCA	2	6	3672159	3672164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103024	NC_010524	CTT	2	6	3672176	3672181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103025	NC_010524	CAT	2	6	3672193	3672198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103026	NC_010524	GCC	3	9	3672237	3672245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059979
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103037	NC_010524	GCT	2	6	3672697	3672702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059979
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103052	NC_010524	GC	3	6	3673111	3673116	0 %	0 %	50 %	50 %	171059979
103053	NC_010524	CGCA	2	8	3673162	3673169	25 %	0 %	25 %	50 %	171059979
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103062	NC_010524	CGC	2	6	3673396	3673401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059980
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103116	NC_010524	GCA	2	6	3675756	3675761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059983
103117	NC_010524	CCA	2	6	3675803	3675808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059983
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103121	NC_010524	GAC	2	6	3675985	3675990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059984
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103162	NC_010524	GCGG	2	8	3677002	3677009	0 %	0 %	75 %	25 %	171059984
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103165	NC_010524	GC	3	6	3677106	3677111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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103203	NC_010524	G	6	6	3678275	3678280	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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103213	NC_010524	TCG	2	6	3678534	3678539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059986
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103230	NC_010524	CAT	2	6	3679088	3679093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059986
103231	NC_010524	TGA	2	6	3679096	3679101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059986
103232	NC_010524	GTC	2	6	3679103	3679108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059986
103233	NC_010524	GCTC	2	8	3679117	3679124	0 %	25 %	25 %	50 %	171059986
103234	NC_010524	TCG	2	6	3679170	3679175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059986
103235	NC_010524	GAT	2	6	3679247	3679252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059986
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103238	NC_010524	TGCG	2	8	3679431	3679438	0 %	25 %	50 %	25 %	171059986
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103243	NC_010524	GAT	2	6	3679649	3679654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059986
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103249	NC_010524	CCG	2	6	3679880	3679885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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103252	NC_010524	GCGG	2	8	3679903	3679910	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103253	NC_010524	CG	3	6	3679953	3679958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103254	NC_010524	GCAG	2	8	3679972	3679979	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103255	NC_010524	GCT	2	6	3680063	3680068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059987
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103257	NC_010524	CGCC	2	8	3680147	3680154	0 %	0 %	25 %	75 %	171059987
103258	NC_010524	CGA	2	6	3680195	3680200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059987
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103287	NC_010524	CGCCC	2	10	3681119	3681128	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
103288	NC_010524	TGA	2	6	3681141	3681146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059988
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103334	NC_010524	CCGA	2	8	3682544	3682551	25 %	0 %	25 %	50 %	171059988
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