MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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102003	NC_010524	CAG	2	6	3636595	3636600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102004	NC_010524	GC	3	6	3636670	3636675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102005	NC_010524	CGA	2	6	3636809	3636814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059948
102006	NC_010524	GC	3	6	3636821	3636826	0 %	0 %	50 %	50 %	171059948
102007	NC_010524	GC	3	6	3636833	3636838	0 %	0 %	50 %	50 %	171059948
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102009	NC_010524	GCA	2	6	3636952	3636957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059948
102010	NC_010524	TCG	2	6	3636969	3636974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059948
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102012	NC_010524	GC	3	6	3636988	3636993	0 %	0 %	50 %	50 %	171059948
102013	NC_010524	CGT	2	6	3636994	3636999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059948
102014	NC_010524	GGT	2	6	3637027	3637032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059948
102015	NC_010524	GC	3	6	3637049	3637054	0 %	0 %	50 %	50 %	171059948
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102017	NC_010524	GCA	2	6	3637114	3637119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059948
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102024	NC_010524	TCG	2	6	3637416	3637421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059948
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102115	NC_010524	GTG	2	6	3641228	3641233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059953
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102232	NC_010524	CG	3	6	3645556	3645561	0 %	0 %	50 %	50 %	171059959
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102344	NC_010524	GC	3	6	3648709	3648714	0 %	0 %	50 %	50 %	171059960
102345	NC_010524	GCA	2	6	3648737	3648742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059960
102346	NC_010524	GCA	2	6	3648761	3648766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059960
102347	NC_010524	CGG	3	9	3648773	3648781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059960
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102352	NC_010524	GC	3	6	3648870	3648875	0 %	0 %	50 %	50 %	171059960
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102354	NC_010524	GTC	2	6	3648999	3649004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059960
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102359	NC_010524	GCG	2	6	3649179	3649184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059960
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102364	NC_010524	GGTG	2	8	3649310	3649317	0 %	25 %	75 %	0 %	171059960
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102376	NC_010524	CG	3	6	3649657	3649662	0 %	0 %	50 %	50 %	171059960
102377	NC_010524	CCG	2	6	3649669	3649674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059960
102378	NC_010524	CGT	2	6	3649707	3649712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059960
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102380	NC_010524	CG	3	6	3649821	3649826	0 %	0 %	50 %	50 %	171059960
102381	NC_010524	CGT	2	6	3649847	3649852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059960
102382	NC_010524	CAG	2	6	3649854	3649859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059960
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102390	NC_010524	GCA	2	6	3650015	3650020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059960
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102393	NC_010524	CG	4	8	3650097	3650104	0 %	0 %	50 %	50 %	171059960
102394	NC_010524	GC	3	6	3650132	3650137	0 %	0 %	50 %	50 %	171059960
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102398	NC_010524	CAG	2	6	3650214	3650219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059960
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102402	NC_010524	TCG	2	6	3650327	3650332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059960
102403	NC_010524	CAG	2	6	3650379	3650384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059960
102404	NC_010524	TGG	2	6	3650408	3650413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059960
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102406	NC_010524	AGC	2	6	3650460	3650465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102407	NC_010524	GCC	2	6	3650466	3650471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102408	NC_010524	GGT	2	6	3650518	3650523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059961
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102410	NC_010524	CG	3	6	3650652	3650657	0 %	0 %	50 %	50 %	171059961
102411	NC_010524	CTG	2	6	3650716	3650721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059961
102412	NC_010524	CCA	2	6	3650766	3650771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059961
102413	NC_010524	TGC	2	6	3650814	3650819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059961
102414	NC_010524	CAG	2	6	3650833	3650838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059961
102415	NC_010524	CAG	2	6	3650935	3650940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059961
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102423	NC_010524	TGC	2	6	3651257	3651262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059961
102424	NC_010524	GGCG	2	8	3651270	3651277	0 %	0 %	75 %	25 %	171059961
102425	NC_010524	GGC	2	6	3651291	3651296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059961
102426	NC_010524	AGC	2	6	3651329	3651334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059961
102427	NC_010524	TGCGG	2	10	3651353	3651362	0 %	20 %	60 %	20 %	171059961
102428	NC_010524	TTTG	2	8	3651486	3651493	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102429	NC_010524	ACC	2	6	3651560	3651565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102430	NC_010524	CA	4	8	3651598	3651605	50 %	0 %	0 %	50 %	171059962
102431	NC_010524	CCGCC	2	10	3651613	3651622	0 %	0 %	20 %	80 %	171059962
102432	NC_010524	TCG	2	6	3651633	3651638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059962
102433	NC_010524	CGG	2	6	3651652	3651657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059962
102434	NC_010524	GC	3	6	3651658	3651663	0 %	0 %	50 %	50 %	171059962
102435	NC_010524	TGC	2	6	3651726	3651731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059962
102436	NC_010524	CGC	2	6	3651744	3651749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059962
102437	NC_010524	GC	3	6	3651792	3651797	0 %	0 %	50 %	50 %	171059962
102438	NC_010524	GC	3	6	3651799	3651804	0 %	0 %	50 %	50 %	171059962
102439	NC_010524	CGC	3	9	3651802	3651810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059962
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102441	NC_010524	TCG	2	6	3651840	3651845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059962
102442	NC_010524	CGC	2	6	3651913	3651918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059962
102443	NC_010524	GCT	3	9	3651919	3651927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059962
102444	NC_010524	CGG	2	6	3651934	3651939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059962
102445	NC_010524	CGCA	2	8	3651943	3651950	25 %	0 %	25 %	50 %	171059962
102446	NC_010524	CTG	3	9	3652049	3652057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059962
102447	NC_010524	CGG	3	9	3652060	3652068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059962
102448	NC_010524	GGC	2	6	3652087	3652092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059962
102449	NC_010524	GC	3	6	3652097	3652102	0 %	0 %	50 %	50 %	171059962
102450	NC_010524	GC	3	6	3652134	3652139	0 %	0 %	50 %	50 %	171059962
102451	NC_010524	GCT	2	6	3652144	3652149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059962
102452	NC_010524	GC	3	6	3652176	3652181	0 %	0 %	50 %	50 %	171059962
102453	NC_010524	GC	3	6	3652252	3652257	0 %	0 %	50 %	50 %	171059962
102454	NC_010524	CGGC	2	8	3652261	3652268	0 %	0 %	50 %	50 %	171059962
102455	NC_010524	GCA	2	6	3652290	3652295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059962
102456	NC_010524	CGT	2	6	3652312	3652317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059962
102457	NC_010524	TCGGCA	2	12	3652320	3652331	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171059962
102458	NC_010524	GCC	2	6	3652358	3652363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059962
102459	NC_010524	TCG	2	6	3652386	3652391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059962
102460	NC_010524	CCA	2	6	3652407	3652412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059962
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102462	NC_010524	CCG	3	9	3652521	3652529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059962
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102469	NC_010524	GC	3	6	3652788	3652793	0 %	0 %	50 %	50 %	171059962
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102473	NC_010524	AGA	2	6	3652888	3652893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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102493	NC_010524	GCCG	2	8	3653395	3653402	0 %	0 %	50 %	50 %	171059963
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102498	NC_010524	GCA	3	9	3653641	3653649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059963
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