MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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98002	NC_010524	CGAGC	2	10	3498875	3498884	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98003	NC_010524	GAA	2	6	3498925	3498930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98004	NC_010524	CT	3	6	3498934	3498939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98005	NC_010524	AG	3	6	3499031	3499036	50 %	0 %	50 %	0 %	171059841
98006	NC_010524	GTG	2	6	3499072	3499077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059841
98007	NC_010524	GAT	2	6	3499080	3499085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059841
98008	NC_010524	GCG	2	6	3499149	3499154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059841
98009	NC_010524	TGGC	2	8	3499156	3499163	0 %	25 %	50 %	25 %	171059841
98010	NC_010524	GCC	2	6	3499187	3499192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059841
98011	NC_010524	CCG	2	6	3499214	3499219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059841
98012	NC_010524	AGC	2	6	3499220	3499225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059841
98013	NC_010524	GCG	2	6	3499265	3499270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059841
98014	NC_010524	A	7	7	3499284	3499290	100 %	0 %	0 %	0 %	171059841
98015	NC_010524	CTT	2	6	3499299	3499304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059841
98016	NC_010524	TCG	2	6	3499333	3499338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059842
98017	NC_010524	AAG	2	6	3499350	3499355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171059842
98018	NC_010524	CTA	2	6	3499406	3499411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059842
98019	NC_010524	GC	3	6	3499424	3499429	0 %	0 %	50 %	50 %	171059842
98020	NC_010524	CGC	2	6	3499481	3499486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059842
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98022	NC_010524	GC	3	6	3499529	3499534	0 %	0 %	50 %	50 %	171059842
98023	NC_010524	CAC	2	6	3499622	3499627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059842
98024	NC_010524	CTG	2	6	3499662	3499667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059842
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98028	NC_010524	TGGGC	2	10	3499789	3499798	0 %	20 %	60 %	20 %	171059842
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98032	NC_010524	GC	3	6	3499938	3499943	0 %	0 %	50 %	50 %	171059842
98033	NC_010524	GCA	2	6	3499957	3499962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059842
98034	NC_010524	CTG	2	6	3499979	3499984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059842
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98040	NC_010524	A	6	6	3500197	3500202	100 %	0 %	0 %	0 %	171059842
98041	NC_010524	CG	3	6	3500341	3500346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98042	NC_010524	G	6	6	3500352	3500357	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
98043	NC_010524	GCA	2	6	3500360	3500365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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98045	NC_010524	GGC	2	6	3500492	3500497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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98103	NC_010524	T	6	6	3503482	3503487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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98109	NC_010524	TCT	2	6	3503669	3503674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059848
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98120	NC_010524	GCC	2	6	3503995	3504000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059848
98121	NC_010524	TTC	2	6	3504001	3504006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059848
98122	NC_010524	AGC	2	6	3504008	3504013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059848
98123	NC_010524	TGC	2	6	3504020	3504025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059848
98124	NC_010524	CGGC	2	8	3504089	3504096	0 %	0 %	50 %	50 %	171059848
98125	NC_010524	CGC	2	6	3504104	3504109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059848
98126	NC_010524	TCA	2	6	3504209	3504214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059848
98127	NC_010524	CGG	2	6	3504261	3504266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059848
98128	NC_010524	GTG	2	6	3504343	3504348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059848
98129	NC_010524	GCCG	2	8	3504358	3504365	0 %	0 %	50 %	50 %	171059848
98130	NC_010524	GGC	2	6	3504408	3504413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059848
98131	NC_010524	GGC	3	9	3504426	3504434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059848
98132	NC_010524	CGC	2	6	3504456	3504461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059848
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98134	NC_010524	CG	3	6	3504560	3504565	0 %	0 %	50 %	50 %	171059848
98135	NC_010524	CGC	2	6	3504578	3504583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059848
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98137	NC_010524	GC	3	6	3504685	3504690	0 %	0 %	50 %	50 %	171059848
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98140	NC_010524	CGA	2	6	3504723	3504728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059848
98141	NC_010524	GC	3	6	3504772	3504777	0 %	0 %	50 %	50 %	171059848
98142	NC_010524	CTG	2	6	3504790	3504795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059848
98143	NC_010524	TGC	2	6	3504833	3504838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059848
98144	NC_010524	TGC	2	6	3504922	3504927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059848
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98148	NC_010524	GC	3	6	3505074	3505079	0 %	0 %	50 %	50 %	171059848
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98156	NC_010524	CGGG	2	8	3505254	3505261	0 %	0 %	75 %	25 %	171059848
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98161	NC_010524	CGG	2	6	3505443	3505448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059848
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98165	NC_010524	GGC	2	6	3505666	3505671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059848
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98169	NC_010524	TC	3	6	3505880	3505885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98170	NC_010524	CGA	2	6	3505914	3505919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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98178	NC_010524	GCT	2	6	3506209	3506214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059849
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98211	NC_010524	GACCCT	2	12	3507376	3507387	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171059849
98212	NC_010524	GCC	2	6	3507434	3507439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059849
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98215	NC_010524	CGA	2	6	3507547	3507552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059849
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98221	NC_010524	GC	3	6	3507731	3507736	0 %	0 %	50 %	50 %	171059849
98222	NC_010524	GCC	2	6	3507785	3507790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059849
98223	NC_010524	CTG	2	6	3507797	3507802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059849
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98227	NC_010524	CTG	2	6	3507887	3507892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059849
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98229	NC_010524	CTG	2	6	3508019	3508024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059849
98230	NC_010524	GCG	2	6	3508068	3508073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059849
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98232	NC_010524	GGGC	2	8	3508090	3508097	0 %	0 %	75 %	25 %	171059849
98233	NC_010524	TTCGA	2	10	3508107	3508116	20 %	40 %	20 %	20 %	171059849
98234	NC_010524	GGCATC	2	12	3508130	3508141	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171059849
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98238	NC_010524	CGG	2	6	3508210	3508215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059849
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98303	NC_010524	TTG	2	6	3510186	3510191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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98331	NC_010524	TGA	2	6	3511202	3511207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059851
98332	NC_010524	GCC	2	6	3511234	3511239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059851
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98334	NC_010524	CTG	2	6	3511432	3511437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059852
98335	NC_010524	GCC	2	6	3511462	3511467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059852
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98338	NC_010524	CCGTG	2	10	3511628	3511637	0 %	20 %	40 %	40 %	171059852
98339	NC_010524	TCG	2	6	3511652	3511657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059852
98340	NC_010524	GCC	3	9	3511693	3511701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059852
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98342	NC_010524	CCG	2	6	3511733	3511738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059852
98343	NC_010524	GCG	2	6	3511766	3511771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059852
98344	NC_010524	CTC	2	6	3511773	3511778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171059852
98345	NC_010524	TGC	2	6	3511781	3511786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059852
98346	NC_010524	CTG	2	6	3511840	3511845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059852
98347	NC_010524	GCG	2	6	3511850	3511855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059852
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98349	NC_010524	GGGC	2	8	3511905	3511912	0 %	0 %	75 %	25 %	171059852
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98352	NC_010524	CTG	3	9	3511951	3511959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059852
98353	NC_010524	CGA	2	6	3511974	3511979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059852
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98467	NC_010524	GCC	2	6	3516131	3516136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059855
98468	NC_010524	GGC	2	6	3516145	3516150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059855
98469	NC_010524	GCGGT	2	10	3516156	3516165	0 %	20 %	60 %	20 %	171059855
98470	NC_010524	CG	4	8	3516169	3516176	0 %	0 %	50 %	50 %	171059855
98471	NC_010524	CAT	2	6	3516226	3516231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059855
98472	NC_010524	CTG	2	6	3516266	3516271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059855
98473	NC_010524	CGC	2	6	3516280	3516285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059855
98474	NC_010524	GCC	2	6	3516293	3516298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059855
98475	NC_010524	GTC	2	6	3516329	3516334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059855
98476	NC_010524	GCCG	2	8	3516356	3516363	0 %	0 %	50 %	50 %	171059855
98477	NC_010524	GCA	2	6	3516453	3516458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059855
98478	NC_010524	TCG	2	6	3516471	3516476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059855
98479	NC_010524	GCG	2	6	3516484	3516489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059855
98480	NC_010524	CAT	2	6	3516499	3516504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059855
98481	NC_010524	CCG	2	6	3516537	3516542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059855
98482	NC_010524	CGC	2	6	3516598	3516603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059855
98483	NC_010524	CGG	2	6	3516624	3516629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059855
98484	NC_010524	GCCA	2	8	3516641	3516648	25 %	0 %	25 %	50 %	171059855
98485	NC_010524	GC	3	6	3516650	3516655	0 %	0 %	50 %	50 %	171059855
98486	NC_010524	TGG	2	6	3516660	3516665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059855
98487	NC_010524	ACC	2	6	3516722	3516727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98488	NC_010524	GTGG	2	8	3516755	3516762	0 %	25 %	75 %	0 %	171059856
98489	NC_010524	CAT	2	6	3516764	3516769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059856
98490	NC_010524	CAC	2	6	3516770	3516775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059856
98491	NC_010524	CG	3	6	3516793	3516798	0 %	0 %	50 %	50 %	171059856
98492	NC_010524	CAC	2	6	3516818	3516823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059856
98493	NC_010524	GGC	2	6	3516885	3516890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059856
98494	NC_010524	AGC	2	6	3516900	3516905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059856
98495	NC_010524	TGA	2	6	3516910	3516915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059856
98496	NC_010524	CCGGG	2	10	3516916	3516925	0 %	0 %	60 %	40 %	171059856
98497	NC_010524	GAC	2	6	3517005	3517010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059856
98498	NC_010524	GCC	2	6	3517044	3517049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059856
98499	NC_010524	GAT	2	6	3517064	3517069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059856
98500	NC_010524	CG	3	6	3517083	3517088	0 %	0 %	50 %	50 %	171059856

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