MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_010524	GCT	2	6	311173	311178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056985
9002	NC_010524	GCC	2	6	311210	311215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056985
9003	NC_010524	CGG	2	6	311235	311240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056985
9004	NC_010524	GGGCG	2	10	311248	311257	0 %	0 %	80 %	20 %	171056985
9005	NC_010524	CGA	2	6	311268	311273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056985
9006	NC_010524	GGC	2	6	311278	311283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056985
9007	NC_010524	GCG	2	6	311284	311289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056985
9008	NC_010524	CGGG	2	8	311314	311321	0 %	0 %	75 %	25 %	171056985
9009	NC_010524	TGC	2	6	311322	311327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056985
9010	NC_010524	CGG	2	6	311332	311337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056985
9011	NC_010524	CGA	2	6	311421	311426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056985
9012	NC_010524	GCT	2	6	311462	311467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056985
9013	NC_010524	CGG	2	6	311475	311480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056985
9014	NC_010524	CTGCGC	2	12	311483	311494	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171056985
9015	NC_010524	GCT	2	6	311524	311529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056985
9016	NC_010524	CGC	2	6	311535	311540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056985
9017	NC_010524	GC	3	6	311553	311558	0 %	0 %	50 %	50 %	171056985
9018	NC_010524	CGC	2	6	311587	311592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056985
9019	NC_010524	GCC	2	6	311606	311611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056985
9020	NC_010524	TGG	2	6	311661	311666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056985
9021	NC_010524	GGCC	2	8	311728	311735	0 %	0 %	50 %	50 %	171056985
9022	NC_010524	GCC	2	6	311738	311743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056985
9023	NC_010524	GCG	2	6	311746	311751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056985
9024	NC_010524	GCTG	2	8	311770	311777	0 %	25 %	50 %	25 %	171056985
9025	NC_010524	CGC	2	6	311781	311786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056985
9026	NC_010524	GTT	2	6	311830	311835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171056985
9027	NC_010524	GC	3	6	311892	311897	0 %	0 %	50 %	50 %	171056985
9028	NC_010524	CGC	2	6	311910	311915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056985
9029	NC_010524	GTC	2	6	311921	311926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056985
9030	NC_010524	GC	3	6	311940	311945	0 %	0 %	50 %	50 %	171056985
9031	NC_010524	CGG	2	6	312004	312009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056985
9032	NC_010524	GGCG	2	8	312028	312035	0 %	0 %	75 %	25 %	171056985
9033	NC_010524	GCC	2	6	312110	312115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056985
9034	NC_010524	CAT	2	6	312123	312128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056985
9035	NC_010524	CGG	2	6	312129	312134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056985
9036	NC_010524	AGG	2	6	312142	312147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056985
9037	NC_010524	CAA	2	6	312166	312171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_010524	GCC	2	6	312229	312234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056986
9039	NC_010524	GCT	2	6	312236	312241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056986
9040	NC_010524	GCTG	2	8	312289	312296	0 %	25 %	50 %	25 %	171056986
9041	NC_010524	GCG	2	6	312397	312402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056986
9042	NC_010524	GTG	2	6	312405	312410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056986
9043	NC_010524	GAG	2	6	312414	312419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056986
9044	NC_010524	ACCA	2	8	312432	312439	50 %	0 %	0 %	50 %	171056986
9045	NC_010524	CAGC	2	8	312470	312477	25 %	0 %	25 %	50 %	171056986
9046	NC_010524	ACC	2	6	312518	312523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056986
9047	NC_010524	GCC	2	6	312542	312547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056986
9048	NC_010524	CGCGC	2	10	312588	312597	0 %	0 %	40 %	60 %	171056986
9049	NC_010524	AGC	2	6	312601	312606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056986
9050	NC_010524	GGCCG	2	10	312620	312629	0 %	0 %	60 %	40 %	171056986
9051	NC_010524	GCG	2	6	312730	312735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056986
9052	NC_010524	GC	3	6	312771	312776	0 %	0 %	50 %	50 %	171056986
9053	NC_010524	CCG	2	6	312791	312796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056986
9054	NC_010524	GCT	2	6	312809	312814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056986
9055	NC_010524	GCA	2	6	312818	312823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056986
9056	NC_010524	CGC	2	6	312845	312850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056986
9057	NC_010524	CG	4	8	312870	312877	0 %	0 %	50 %	50 %	171056986
9058	NC_010524	GCCC	2	8	312911	312918	0 %	0 %	25 %	75 %	171056987
9059	NC_010524	TGGC	2	8	312922	312929	0 %	25 %	50 %	25 %	171056987
9060	NC_010524	CTG	2	6	312965	312970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056987
9061	NC_010524	GC	5	10	312977	312986	0 %	0 %	50 %	50 %	171056987
9062	NC_010524	GGC	3	9	313097	313105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056987
9063	NC_010524	GCG	2	6	313120	313125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056987
9064	NC_010524	GC	3	6	313139	313144	0 %	0 %	50 %	50 %	171056987
9065	NC_010524	GCG	2	6	313150	313155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056987
9066	NC_010524	GCACG	2	10	313195	313204	20 %	0 %	40 %	40 %	171056987
9067	NC_010524	GGC	2	6	313213	313218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056987
9068	NC_010524	GGC	2	6	313230	313235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056987
9069	NC_010524	TCG	2	6	313248	313253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056987
9070	NC_010524	CGC	2	6	313284	313289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056987
9071	NC_010524	GCTG	2	8	313308	313315	0 %	25 %	50 %	25 %	171056987
9072	NC_010524	TGC	2	6	313326	313331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056987
9073	NC_010524	GC	3	6	313338	313343	0 %	0 %	50 %	50 %	171056987
9074	NC_010524	GCC	3	9	313435	313443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056987
9075	NC_010524	CCG	2	6	313445	313450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056987
9076	NC_010524	AGC	2	6	313455	313460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056987
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9078	NC_010524	GCA	3	9	313540	313548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056987
9079	NC_010524	CGCGG	2	10	313552	313561	0 %	0 %	60 %	40 %	171056987
9080	NC_010524	TGG	3	9	313563	313571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056987
9081	NC_010524	ACG	2	6	313575	313580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056987
9082	NC_010524	GC	3	6	313588	313593	0 %	0 %	50 %	50 %	171056987
9083	NC_010524	GC	4	8	313604	313611	0 %	0 %	50 %	50 %	171056987
9084	NC_010524	TCG	2	6	313644	313649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056987
9085	NC_010524	CG	3	6	313688	313693	0 %	0 %	50 %	50 %	171056987
9086	NC_010524	TCGGTG	3	18	313724	313741	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	171056987
9087	NC_010524	GCT	2	6	313771	313776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056987
9088	NC_010524	GCCG	2	8	313849	313856	0 %	0 %	50 %	50 %	171056987
9089	NC_010524	GCA	2	6	313915	313920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056987
9090	NC_010524	GCT	2	6	313951	313956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056987
9091	NC_010524	GC	3	6	314018	314023	0 %	0 %	50 %	50 %	171056988
9092	NC_010524	CTA	2	6	314049	314054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056988
9093	NC_010524	GC	3	6	314071	314076	0 %	0 %	50 %	50 %	171056988
9094	NC_010524	TGG	2	6	314096	314101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056988
9095	NC_010524	ACG	2	6	314141	314146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056988
9096	NC_010524	GC	4	8	314157	314164	0 %	0 %	50 %	50 %	171056988
9097	NC_010524	GCA	2	6	314169	314174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056988
9098	NC_010524	CCGGCG	2	12	314206	314217	0 %	0 %	50 %	50 %	171056988
9099	NC_010524	GC	3	6	314277	314282	0 %	0 %	50 %	50 %	171056988
9100	NC_010524	CCGC	2	8	314307	314314	0 %	0 %	25 %	75 %	171056988
9101	NC_010524	GGT	2	6	314316	314321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056988
9102	NC_010524	GC	3	6	314359	314364	0 %	0 %	50 %	50 %	171056988
9103	NC_010524	GTG	2	6	314518	314523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056988
9104	NC_010524	TGC	2	6	314528	314533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056988
9105	NC_010524	GCCA	2	8	314554	314561	25 %	0 %	25 %	50 %	171056988
9106	NC_010524	CGA	2	6	314610	314615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056988
9107	NC_010524	CAC	2	6	314625	314630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056988
9108	NC_010524	GC	6	12	314667	314678	0 %	0 %	50 %	50 %	171056988
9109	NC_010524	CGC	3	9	314748	314756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056988
9110	NC_010524	GCT	2	6	314757	314762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056988
9111	NC_010524	CTG	3	9	314782	314790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056988
9112	NC_010524	CGAGCG	2	12	314805	314816	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171056988
9113	NC_010524	CG	4	8	314823	314830	0 %	0 %	50 %	50 %	171056988
9114	NC_010524	GCT	2	6	314895	314900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056988
9115	NC_010524	CAA	2	6	314967	314972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171056988
9116	NC_010524	ATG	2	6	314986	314991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056988
9117	NC_010524	TGC	2	6	315005	315010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056988
9118	NC_010524	GCC	2	6	315066	315071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056988
9119	NC_010524	CGC	2	6	315077	315082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056988
9120	NC_010524	TGCG	2	8	315101	315108	0 %	25 %	50 %	25 %	171056988
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9122	NC_010524	GGC	2	6	315210	315215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056988
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9245	NC_010524	GCG	2	6	319187	319192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056992
9246	NC_010524	GGCG	2	8	319198	319205	0 %	0 %	75 %	25 %	171056992
9247	NC_010524	CGAC	2	8	319227	319234	25 %	0 %	25 %	50 %	171056992
9248	NC_010524	CG	3	6	319274	319279	0 %	0 %	50 %	50 %	171056992
9249	NC_010524	GC	3	6	319319	319324	0 %	0 %	50 %	50 %	171056992
9250	NC_010524	GGCG	2	8	319325	319332	0 %	0 %	75 %	25 %	171056992
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9253	NC_010524	CGGTGA	2	12	319425	319436	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171056992
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9357	NC_010524	CG	3	6	323566	323571	0 %	0 %	50 %	50 %	171056994
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9363	NC_010524	GAG	2	6	323944	323949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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