MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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91002	NC_010524	CG	4	8	3250009	3250016	0 %	0 %	50 %	50 %	171059628
91003	NC_010524	CCA	2	6	3250017	3250022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059628
91004	NC_010524	GCG	2	6	3250059	3250064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059628
91005	NC_010524	CG	3	6	3250063	3250068	0 %	0 %	50 %	50 %	171059628
91006	NC_010524	TTG	2	6	3250073	3250078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171059628
91007	NC_010524	CAC	2	6	3250090	3250095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059628
91008	NC_010524	CGG	2	6	3250110	3250115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059628
91009	NC_010524	GCT	2	6	3250138	3250143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059628
91010	NC_010524	GCCG	2	8	3250182	3250189	0 %	0 %	50 %	50 %	171059628
91011	NC_010524	AGC	2	6	3250199	3250204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059628
91012	NC_010524	GCC	2	6	3250207	3250212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059628
91013	NC_010524	CAC	2	6	3250255	3250260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059628
91014	NC_010524	GC	3	6	3250296	3250301	0 %	0 %	50 %	50 %	171059628
91015	NC_010524	GCT	2	6	3250384	3250389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059628
91016	NC_010524	GC	3	6	3250458	3250463	0 %	0 %	50 %	50 %	171059628
91017	NC_010524	ACCG	2	8	3250465	3250472	25 %	0 %	25 %	50 %	171059628
91018	NC_010524	CGC	2	6	3250517	3250522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059628
91019	NC_010524	GC	3	6	3250521	3250526	0 %	0 %	50 %	50 %	171059628
91020	NC_010524	GAC	2	6	3250531	3250536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059628
91021	NC_010524	GCC	2	6	3250609	3250614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059628
91022	NC_010524	GGT	2	6	3250639	3250644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059628
91023	NC_010524	CAC	2	6	3250684	3250689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059628
91024	NC_010524	TCG	2	6	3250697	3250702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059628
91025	NC_010524	GCA	2	6	3250704	3250709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059628
91026	NC_010524	GCC	2	6	3250711	3250716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059628
91027	NC_010524	CG	3	6	3250746	3250751	0 %	0 %	50 %	50 %	171059628
91028	NC_010524	CAG	2	6	3250771	3250776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059628
91029	NC_010524	GCC	2	6	3250777	3250782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059628
91030	NC_010524	CGA	2	6	3250803	3250808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059628
91031	NC_010524	GCA	2	6	3250866	3250871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059628
91032	NC_010524	GAT	2	6	3250913	3250918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91033	NC_010524	GCG	2	6	3250925	3250930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91034	NC_010524	AG	3	6	3250963	3250968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91035	NC_010524	CGGC	2	8	3250977	3250984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91036	NC_010524	CCG	2	6	3250988	3250993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91037	NC_010524	GCCC	2	8	3251042	3251049	0 %	0 %	25 %	75 %	171059629
91038	NC_010524	GCC	2	6	3251082	3251087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059629
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91040	NC_010524	GCG	2	6	3251148	3251153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059630
91041	NC_010524	TGGTC	2	10	3251233	3251242	0 %	40 %	40 %	20 %	171059630
91042	NC_010524	GCT	2	6	3251243	3251248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059630
91043	NC_010524	GC	3	6	3251269	3251274	0 %	0 %	50 %	50 %	171059630
91044	NC_010524	GCC	2	6	3251278	3251283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059630
91045	NC_010524	TGC	2	6	3251320	3251325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059630
91046	NC_010524	GCT	2	6	3251348	3251353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059630
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91051	NC_010524	CGGC	2	8	3251453	3251460	0 %	0 %	50 %	50 %	171059630
91052	NC_010524	AGC	2	6	3251473	3251478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059630
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91055	NC_010524	GC	3	6	3251548	3251553	0 %	0 %	50 %	50 %	171059630
91056	NC_010524	GGC	2	6	3251576	3251581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059630
91057	NC_010524	CTG	2	6	3251601	3251606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059630
91058	NC_010524	GC	3	6	3251626	3251631	0 %	0 %	50 %	50 %	171059630
91059	NC_010524	GCC	3	9	3251673	3251681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059630
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91062	NC_010524	CGGC	2	8	3251758	3251765	0 %	0 %	50 %	50 %	171059630
91063	NC_010524	GCT	2	6	3251783	3251788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059630
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91067	NC_010524	TGC	2	6	3251836	3251841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059630
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91070	NC_010524	GCGCCC	2	12	3251905	3251916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059630
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91072	NC_010524	ACC	2	6	3252030	3252035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91073	NC_010524	TGC	2	6	3252062	3252067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059631
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91102	NC_010524	CGA	2	6	3252867	3252872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059631
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91104	NC_010524	GCA	2	6	3252888	3252893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059631
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91353	NC_010524	CAA	2	6	3263252	3263257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91354	NC_010524	GGC	2	6	3263312	3263317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91355	NC_010524	GGT	2	6	3263324	3263329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91356	NC_010524	CAG	2	6	3263331	3263336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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91469	NC_010524	GGC	2	6	3267216	3267221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059644
91470	NC_010524	GC	3	6	3267234	3267239	0 %	0 %	50 %	50 %	171059644
91471	NC_010524	GGC	2	6	3267240	3267245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059644
91472	NC_010524	ACC	2	6	3267268	3267273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059644
91473	NC_010524	GCT	2	6	3267320	3267325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059644
91474	NC_010524	CTG	3	9	3267336	3267344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059644
91475	NC_010524	CAG	2	6	3267348	3267353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059644
91476	NC_010524	CG	3	6	3267362	3267367	0 %	0 %	50 %	50 %	171059644
91477	NC_010524	GCG	2	6	3267377	3267382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059644
91478	NC_010524	AGC	2	6	3267388	3267393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059644
91479	NC_010524	GC	3	6	3267398	3267403	0 %	0 %	50 %	50 %	171059644
91480	NC_010524	GTG	2	6	3267448	3267453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059644
91481	NC_010524	GCGA	2	8	3267508	3267515	25 %	0 %	50 %	25 %	171059644
91482	NC_010524	CAG	2	6	3267537	3267542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059644
91483	NC_010524	CAG	3	9	3267549	3267557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059644
91484	NC_010524	GCC	2	6	3267669	3267674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91485	NC_010524	TTC	2	6	3267676	3267681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91486	NC_010524	GCC	2	6	3267682	3267687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91487	NC_010524	CGATT	2	10	3267753	3267762	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91488	NC_010524	CCA	2	6	3267783	3267788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91489	NC_010524	A	6	6	3267820	3267825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91490	NC_010524	CGC	2	6	3267877	3267882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91491	NC_010524	TGCGGC	2	12	3267886	3267897	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91492	NC_010524	GGCT	2	8	3267926	3267933	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91493	NC_010524	CG	3	6	3267960	3267965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91494	NC_010524	CAC	2	6	3267995	3268000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059645
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91496	NC_010524	GCG	2	6	3268070	3268075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059645
91497	NC_010524	GGCC	2	8	3268078	3268085	0 %	0 %	50 %	50 %	171059645
91498	NC_010524	CTGG	2	8	3268118	3268125	0 %	25 %	50 %	25 %	171059645
91499	NC_010524	CCA	2	6	3268126	3268131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059645
91500	NC_010524	GCCG	2	8	3268157	3268164	0 %	0 %	50 %	50 %	171059645

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