MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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90002	NC_010524	CGC	2	6	3216264	3216269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059597
90003	NC_010524	GC	3	6	3216274	3216279	0 %	0 %	50 %	50 %	171059597
90004	NC_010524	CCG	2	6	3216296	3216301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059597
90005	NC_010524	GCT	2	6	3216325	3216330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059597
90006	NC_010524	GCC	3	9	3216331	3216339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059597
90007	NC_010524	GGC	2	6	3216360	3216365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059597
90008	NC_010524	CGC	3	9	3216464	3216472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059597
90009	NC_010524	CGA	3	9	3216483	3216491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059597
90010	NC_010524	ACG	2	6	3216509	3216514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059597
90011	NC_010524	CGC	2	6	3216523	3216528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059597
90012	NC_010524	GCC	2	6	3216541	3216546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059597
90013	NC_010524	AGG	2	6	3216554	3216559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171059597
90014	NC_010524	GCT	2	6	3216582	3216587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059597
90015	NC_010524	CGA	2	6	3216591	3216596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059597
90016	NC_010524	GC	3	6	3216603	3216608	0 %	0 %	50 %	50 %	171059597
90017	NC_010524	GCG	2	6	3216628	3216633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059597
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90019	NC_010524	TGC	2	6	3216707	3216712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059597
90020	NC_010524	GC	3	6	3216722	3216727	0 %	0 %	50 %	50 %	171059597
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90022	NC_010524	GCCG	2	8	3216771	3216778	0 %	0 %	50 %	50 %	171059597
90023	NC_010524	GC	3	6	3216789	3216794	0 %	0 %	50 %	50 %	171059597
90024	NC_010524	TGCGGC	2	12	3216821	3216832	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171059597
90025	NC_010524	TGG	3	9	3216833	3216841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059597
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90030	NC_010524	GGC	2	6	3216942	3216947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059597
90031	NC_010524	CGC	2	6	3216995	3217000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059597
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90035	NC_010524	GAG	2	6	3217330	3217335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171059597
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90037	NC_010524	CGA	2	6	3217350	3217355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059597
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90041	NC_010524	GC	4	8	3217503	3217510	0 %	0 %	50 %	50 %	171059597
90042	NC_010524	GAA	2	6	3217567	3217572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171059597
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90044	NC_010524	CGA	2	6	3217626	3217631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059597
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90053	NC_010524	TCG	2	6	3217847	3217852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059597
90054	NC_010524	GCA	2	6	3217866	3217871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059597
90055	NC_010524	CGA	2	6	3217920	3217925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059597
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90081	NC_010524	TGA	2	6	3218936	3218941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059597
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90084	NC_010524	CCGC	2	8	3219012	3219019	0 %	0 %	25 %	75 %	171059598
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90089	NC_010524	GCT	2	6	3219127	3219132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059598
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90100	NC_010524	TGC	2	6	3219414	3219419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059598
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90102	NC_010524	TGG	2	6	3219435	3219440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059598
90103	NC_010524	CGC	2	6	3219501	3219506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059598
90104	NC_010524	TGG	2	6	3219516	3219521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059598
90105	NC_010524	GCG	2	6	3219523	3219528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059598
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90108	NC_010524	GCA	2	6	3219574	3219579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059598
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90110	NC_010524	CG	3	6	3219609	3219614	0 %	0 %	50 %	50 %	171059598
90111	NC_010524	GTG	2	6	3219623	3219628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059598
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90115	NC_010524	CCA	2	6	3219723	3219728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059598
90116	NC_010524	CGC	2	6	3219732	3219737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059598
90117	NC_010524	TCG	2	6	3219747	3219752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059598
90118	NC_010524	GC	3	6	3219797	3219802	0 %	0 %	50 %	50 %	171059598
90119	NC_010524	TCA	2	6	3219837	3219842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059598
90120	NC_010524	TGC	2	6	3219849	3219854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059598
90121	NC_010524	GCCCGA	2	12	3219952	3219963	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171059598
90122	NC_010524	CGG	2	6	3219993	3219998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059598
90123	NC_010524	CG	3	6	3219999	3220004	0 %	0 %	50 %	50 %	171059598
90124	NC_010524	TCGGGC	2	12	3220115	3220126	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171059598
90125	NC_010524	ACC	2	6	3220130	3220135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059598
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90127	NC_010524	GCT	2	6	3220147	3220152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059598
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90130	NC_010524	GGT	2	6	3220243	3220248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059598
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90132	NC_010524	GCA	2	6	3220401	3220406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059598
90133	NC_010524	GCCAGC	2	12	3220428	3220439	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171059598
90134	NC_010524	CG	3	6	3220450	3220455	0 %	0 %	50 %	50 %	171059598
90135	NC_010524	CG	3	6	3220471	3220476	0 %	0 %	50 %	50 %	171059598
90136	NC_010524	AGCG	2	8	3220520	3220527	25 %	0 %	50 %	25 %	171059598
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90138	NC_010524	CAG	2	6	3220535	3220540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059598
90139	NC_010524	TCGA	2	8	3220541	3220548	25 %	25 %	25 %	25 %	171059598
90140	NC_010524	CAA	2	6	3220561	3220566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171059598
90141	NC_010524	CTGATC	2	12	3220571	3220582	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	171059598
90142	NC_010524	TGA	2	6	3220671	3220676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059598
90143	NC_010524	CGC	2	6	3220727	3220732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90144	NC_010524	GAG	2	6	3220759	3220764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90145	NC_010524	GTT	2	6	3220768	3220773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90146	NC_010524	GC	3	6	3220799	3220804	0 %	0 %	50 %	50 %	171059599
90147	NC_010524	GCGT	2	8	3220808	3220815	0 %	25 %	50 %	25 %	171059599
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90187	NC_010524	GGC	2	6	3222126	3222131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059600
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90194	NC_010524	GCCG	2	8	3222321	3222328	0 %	0 %	50 %	50 %	171059600
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90201	NC_010524	ATCG	2	8	3222443	3222450	25 %	25 %	25 %	25 %	171059600
90202	NC_010524	CGCGG	2	10	3222507	3222516	0 %	0 %	60 %	40 %	171059600
90203	NC_010524	AGC	2	6	3222589	3222594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059600
90204	NC_010524	AGGTGC	2	12	3222623	3222634	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171059600
90205	NC_010524	GGC	2	6	3222648	3222653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059600
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90207	NC_010524	CGGCC	2	10	3222750	3222759	0 %	0 %	40 %	60 %	171059600
90208	NC_010524	GC	3	6	3222794	3222799	0 %	0 %	50 %	50 %	171059600
90209	NC_010524	CAG	3	9	3222837	3222845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059600
90210	NC_010524	CGT	2	6	3222860	3222865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059600
90211	NC_010524	CG	3	6	3222902	3222907	0 %	0 %	50 %	50 %	171059600
90212	NC_010524	CGC	2	6	3222968	3222973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059600
90213	NC_010524	TCG	2	6	3223009	3223014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059600
90214	NC_010524	TGA	2	6	3223076	3223081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059600
90215	NC_010524	CCA	2	6	3223106	3223111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059600
90216	NC_010524	GCG	3	9	3223195	3223203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059600
90217	NC_010524	GGC	2	6	3223238	3223243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059600
90218	NC_010524	GGT	2	6	3223297	3223302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90219	NC_010524	GATG	2	8	3223313	3223320	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90220	NC_010524	AC	3	6	3223440	3223445	50 %	0 %	0 %	50 %	171059601
90221	NC_010524	CA	3	6	3223453	3223458	50 %	0 %	0 %	50 %	171059601
90222	NC_010524	CGC	2	6	3223481	3223486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059601
90223	NC_010524	GC	3	6	3223499	3223504	0 %	0 %	50 %	50 %	171059601
90224	NC_010524	AGC	2	6	3223600	3223605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059601
90225	NC_010524	CG	3	6	3223610	3223615	0 %	0 %	50 %	50 %	171059601
90226	NC_010524	TCA	2	6	3223625	3223630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059601
90227	NC_010524	CCGAC	2	10	3223742	3223751	20 %	0 %	20 %	60 %	171059601
90228	NC_010524	CCGC	2	8	3223805	3223812	0 %	0 %	25 %	75 %	171059601
90229	NC_010524	GCTG	2	8	3223813	3223820	0 %	25 %	50 %	25 %	171059601
90230	NC_010524	CGC	2	6	3223872	3223877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059601
90231	NC_010524	CTG	2	6	3223968	3223973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059601
90232	NC_010524	GCT	2	6	3224054	3224059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059601
90233	NC_010524	CGC	2	6	3224071	3224076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059601
90234	NC_010524	GTC	2	6	3224191	3224196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059602
90235	NC_010524	TCG	2	6	3224246	3224251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059602
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90243	NC_010524	CG	3	6	3224520	3224525	0 %	0 %	50 %	50 %	171059602
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90328	NC_010524	CGGG	2	8	3227213	3227220	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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90332	NC_010524	GCAG	2	8	3227319	3227326	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90333	NC_010524	TGA	2	6	3227426	3227431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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90347	NC_010524	GCC	2	6	3228102	3228107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059606
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90349	NC_010524	TCG	2	6	3228329	3228334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059606
90350	NC_010524	GC	3	6	3228385	3228390	0 %	0 %	50 %	50 %	171059606
90351	NC_010524	GC	3	6	3228410	3228415	0 %	0 %	50 %	50 %	171059606
90352	NC_010524	CGC	3	9	3228413	3228421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059606
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90357	NC_010524	CG	3	6	3228524	3228529	0 %	0 %	50 %	50 %	171059606
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90362	NC_010524	CTG	2	6	3228630	3228635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059606
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90449	NC_010524	CG	4	8	3232295	3232302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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90466	NC_010524	CGCC	2	8	3233086	3233093	0 %	0 %	25 %	75 %	171059611
90467	NC_010524	GCA	2	6	3233095	3233100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059611
90468	NC_010524	CAGC	2	8	3233119	3233126	25 %	0 %	25 %	50 %	171059611
90469	NC_010524	GGC	2	6	3233156	3233161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059611
90470	NC_010524	GCC	2	6	3233174	3233179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059611
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90472	NC_010524	CGA	2	6	3233218	3233223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059611
90473	NC_010524	CCG	2	6	3233226	3233231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059611
90474	NC_010524	CAGCGC	2	12	3233248	3233259	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171059611
90475	NC_010524	GC	3	6	3233265	3233270	0 %	0 %	50 %	50 %	171059611
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90477	NC_010524	TCGACG	2	12	3233304	3233315	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171059611
90478	NC_010524	GCC	2	6	3233319	3233324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059611
90479	NC_010524	GCA	2	6	3233340	3233345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059611
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90484	NC_010524	TGG	2	6	3233471	3233476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059612
90485	NC_010524	GGC	2	6	3233484	3233489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059612
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90488	NC_010524	GC	3	6	3233556	3233561	0 %	0 %	50 %	50 %	171059612
90489	NC_010524	CCG	2	6	3233564	3233569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059612
90490	NC_010524	GCGCC	2	10	3233589	3233598	0 %	0 %	40 %	60 %	171059612
90491	NC_010524	GGC	2	6	3233635	3233640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059612
90492	NC_010524	CCG	3	9	3233693	3233701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059612
90493	NC_010524	GCTACA	2	12	3233711	3233722	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	171059612
90494	NC_010524	ACC	2	6	3233731	3233736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059612
90495	NC_010524	CAACAC	2	12	3233781	3233792	50 %	0 %	0 %	50 %	171059612
90496	NC_010524	CTG	2	6	3233875	3233880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059612
90497	NC_010524	CGGT	2	8	3233914	3233921	0 %	25 %	50 %	25 %	171059612
90498	NC_010524	GCA	3	9	3233963	3233971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059612
90499	NC_010524	ACGC	2	8	3234026	3234033	25 %	0 %	25 %	50 %	171059612
90500	NC_010524	CAG	2	6	3234036	3234041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059612

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