MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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89502	NC_010524	TAC	2	6	3200911	3200916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059585
89503	NC_010524	CGGCAC	2	12	3200934	3200945	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171059585
89504	NC_010524	CGG	2	6	3200955	3200960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059585
89505	NC_010524	GC	3	6	3200972	3200977	0 %	0 %	50 %	50 %	171059585
89506	NC_010524	CGG	2	6	3200978	3200983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059585
89507	NC_010524	TTC	2	6	3200992	3200997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059585
89508	NC_010524	CCA	2	6	3201047	3201052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059585
89509	NC_010524	CCG	2	6	3201056	3201061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059585
89510	NC_010524	CGA	2	6	3201090	3201095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059585
89511	NC_010524	CAA	2	6	3201099	3201104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171059585
89512	NC_010524	CAC	2	6	3201111	3201116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059585
89513	NC_010524	GCTG	2	8	3201152	3201159	0 %	25 %	50 %	25 %	171059585
89514	NC_010524	GGC	2	6	3201209	3201214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059586
89515	NC_010524	CTG	4	12	3201261	3201272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059586
89516	NC_010524	CGC	2	6	3201323	3201328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059586
89517	NC_010524	GCG	2	6	3201374	3201379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059586
89518	NC_010524	TC	3	6	3201397	3201402	0 %	50 %	0 %	50 %	171059586
89519	NC_010524	CGC	2	6	3201409	3201414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059586
89520	NC_010524	ACA	2	6	3201439	3201444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171059586
89521	NC_010524	GC	3	6	3201448	3201453	0 %	0 %	50 %	50 %	171059586
89522	NC_010524	CGT	2	6	3201469	3201474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059586
89523	NC_010524	GGT	2	6	3201476	3201481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059586
89524	NC_010524	GC	3	6	3201573	3201578	0 %	0 %	50 %	50 %	171059586
89525	NC_010524	TCGCCA	2	12	3201583	3201594	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171059586
89526	NC_010524	CAC	2	6	3201626	3201631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059586
89527	NC_010524	ACA	2	6	3201643	3201648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171059586
89528	NC_010524	CAC	2	6	3201662	3201667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059586
89529	NC_010524	AGCC	2	8	3201716	3201723	25 %	0 %	25 %	50 %	171059586
89530	NC_010524	CGG	2	6	3201749	3201754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059586
89531	NC_010524	CCG	2	6	3201775	3201780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059586
89532	NC_010524	CGA	2	6	3201785	3201790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059586
89533	NC_010524	TCT	2	6	3201939	3201944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059587
89534	NC_010524	GC	3	6	3201951	3201956	0 %	0 %	50 %	50 %	171059587
89535	NC_010524	CTG	2	6	3201962	3201967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059587
89536	NC_010524	GAT	2	6	3201982	3201987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059587
89537	NC_010524	CCA	2	6	3201993	3201998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059587
89538	NC_010524	GCG	2	6	3201999	3202004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059587
89539	NC_010524	CGC	2	6	3202021	3202026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059587
89540	NC_010524	CGC	2	6	3202066	3202071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059587
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89542	NC_010524	GCT	2	6	3202095	3202100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059587
89543	NC_010524	TCT	2	6	3202212	3202217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059587
89544	NC_010524	GCA	2	6	3202237	3202242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059587
89545	NC_010524	CGC	2	6	3202313	3202318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059588
89546	NC_010524	GCT	2	6	3202321	3202326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059588
89547	NC_010524	CG	3	6	3202327	3202332	0 %	0 %	50 %	50 %	171059588
89548	NC_010524	GCG	2	6	3202338	3202343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059588
89549	NC_010524	GCA	2	6	3202437	3202442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059588
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89551	NC_010524	GC	3	6	3202473	3202478	0 %	0 %	50 %	50 %	171059588
89552	NC_010524	CGG	3	9	3202534	3202542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059588
89553	NC_010524	GCC	2	6	3202582	3202587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059588
89554	NC_010524	TGG	2	6	3202605	3202610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059588
89555	NC_010524	TCG	2	6	3202620	3202625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059588
89556	NC_010524	TCG	2	6	3202691	3202696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059588
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89558	NC_010524	CGA	2	6	3202759	3202764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059588
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89573	NC_010524	TGG	2	6	3203274	3203279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059588
89574	NC_010524	GCA	2	6	3203283	3203288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059588
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89587	NC_010524	GCA	2	6	3203698	3203703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059589
89588	NC_010524	TCG	2	6	3203722	3203727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059589
89589	NC_010524	GCAC	2	8	3203775	3203782	25 %	0 %	25 %	50 %	171059589
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89591	NC_010524	GACTGG	2	12	3203808	3203819	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171059589
89592	NC_010524	CG	3	6	3203852	3203857	0 %	0 %	50 %	50 %	171059589
89593	NC_010524	GC	3	6	3203907	3203912	0 %	0 %	50 %	50 %	171059589
89594	NC_010524	CAA	2	6	3203933	3203938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171059589
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89597	NC_010524	ACG	2	6	3204028	3204033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059589
89598	NC_010524	GCA	2	6	3204044	3204049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059589
89599	NC_010524	CGTG	2	8	3204080	3204087	0 %	25 %	50 %	25 %	171059589
89600	NC_010524	ACC	2	6	3204105	3204110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059589
89601	NC_010524	CAC	2	6	3204113	3204118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059589
89602	NC_010524	TCGA	2	8	3204145	3204152	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89603	NC_010524	GC	3	6	3204188	3204193	0 %	0 %	50 %	50 %	171059590
89604	NC_010524	CCG	2	6	3204249	3204254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059590
89605	NC_010524	TGC	2	6	3204255	3204260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059590
89606	NC_010524	TGC	2	6	3204264	3204269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059590
89607	NC_010524	GCA	2	6	3204273	3204278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059590
89608	NC_010524	GCC	2	6	3204284	3204289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059590
89609	NC_010524	ACG	2	6	3204332	3204337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059590
89610	NC_010524	CAT	2	6	3204349	3204354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059590
89611	NC_010524	CGA	2	6	3204364	3204369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059590
89612	NC_010524	CGA	2	6	3204400	3204405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059590
89613	NC_010524	CGA	2	6	3204409	3204414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059590
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