MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_010524	GCG	2	6	292496	292501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056969
8502	NC_010524	TGC	2	6	292583	292588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056969
8503	NC_010524	GGCT	2	8	292589	292596	0 %	25 %	50 %	25 %	171056969
8504	NC_010524	CGA	2	6	292623	292628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056969
8505	NC_010524	CG	3	6	292674	292679	0 %	0 %	50 %	50 %	171056969
8506	NC_010524	GC	3	6	292727	292732	0 %	0 %	50 %	50 %	171056969
8507	NC_010524	GGC	2	6	292836	292841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8508	NC_010524	GGCCG	2	10	292848	292857	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8509	NC_010524	CTC	2	6	292910	292915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056970
8510	NC_010524	C	6	6	292917	292922	0 %	0 %	0 %	100 %	171056970
8511	NC_010524	GCC	2	6	292943	292948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056970
8512	NC_010524	CCG	2	6	293002	293007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056970
8513	NC_010524	CG	3	6	293029	293034	0 %	0 %	50 %	50 %	171056970
8514	NC_010524	GCCA	2	8	293039	293046	25 %	0 %	25 %	50 %	171056970
8515	NC_010524	CGC	2	6	293077	293082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056970
8516	NC_010524	CGC	2	6	293193	293198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056970
8517	NC_010524	GCT	2	6	293200	293205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056970
8518	NC_010524	ACC	2	6	293222	293227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056970
8519	NC_010524	CG	3	6	293260	293265	0 %	0 %	50 %	50 %	171056970
8520	NC_010524	GC	3	6	293313	293318	0 %	0 %	50 %	50 %	171056970
8521	NC_010524	CCA	2	6	293344	293349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056970
8522	NC_010524	CTG	2	6	293351	293356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056970
8523	NC_010524	CGA	2	6	293362	293367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056970
8524	NC_010524	CGC	2	6	293392	293397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056970
8525	NC_010524	CGG	2	6	293422	293427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056970
8526	NC_010524	GCGCG	2	10	293476	293485	0 %	0 %	60 %	40 %	171056970
8527	NC_010524	CAC	2	6	293494	293499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056970
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8529	NC_010524	GAT	2	6	293542	293547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056970
8530	NC_010524	CGG	2	6	293575	293580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056970
8531	NC_010524	TCG	2	6	293637	293642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056970
8532	NC_010524	GCCG	2	8	293686	293693	0 %	0 %	50 %	50 %	171056970
8533	NC_010524	TGC	3	9	293721	293729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056970
8534	NC_010524	GCC	2	6	293742	293747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056970
8535	NC_010524	GAC	2	6	293753	293758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056970
8536	NC_010524	TCGG	2	8	293777	293784	0 %	25 %	50 %	25 %	171056970
8537	NC_010524	GCC	2	6	293804	293809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056970
8538	NC_010524	GCTG	2	8	293814	293821	0 %	25 %	50 %	25 %	171056970
8539	NC_010524	CTGGGC	2	12	293840	293851	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171056970
8540	NC_010524	GCC	2	6	293914	293919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056970
8541	NC_010524	GCA	2	6	293923	293928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056970
8542	NC_010524	GC	3	6	293938	293943	0 %	0 %	50 %	50 %	171056970
8543	NC_010524	CGG	2	6	293955	293960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8544	NC_010524	CAG	2	6	293991	293996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056971
8545	NC_010524	CATCGG	2	12	294018	294029	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171056971
8546	NC_010524	CAGGG	2	10	294031	294040	20 %	0 %	60 %	20 %	171056971
8547	NC_010524	GGC	2	6	294045	294050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056971
8548	NC_010524	GC	3	6	294066	294071	0 %	0 %	50 %	50 %	171056971
8549	NC_010524	CG	3	6	294077	294082	0 %	0 %	50 %	50 %	171056971
8550	NC_010524	CGC	2	6	294098	294103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056971
8551	NC_010524	CGG	2	6	294107	294112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056971
8552	NC_010524	GCG	2	6	294173	294178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056971
8553	NC_010524	CCA	2	6	294189	294194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056971
8554	NC_010524	GGCC	2	8	294203	294210	0 %	0 %	50 %	50 %	171056971
8555	NC_010524	GCC	2	6	294231	294236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056971
8556	NC_010524	CGG	2	6	294245	294250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056971
8557	NC_010524	GC	3	6	294284	294289	0 %	0 %	50 %	50 %	171056971
8558	NC_010524	CAG	2	6	294330	294335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056971
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8560	NC_010524	TGC	2	6	294352	294357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056971
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8562	NC_010524	CGG	2	6	294394	294399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056971
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8565	NC_010524	GCC	2	6	294452	294457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056971
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8570	NC_010524	CGA	2	6	294566	294571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056971
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8573	NC_010524	GC	3	6	294756	294761	0 %	0 %	50 %	50 %	171056971
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8582	NC_010524	CGG	2	6	295038	295043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056971
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8584	NC_010524	CAG	2	6	295074	295079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056971
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8587	NC_010524	GAAT	2	8	295144	295151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_010524	CGA	2	6	295204	295209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8596	NC_010524	TGG	2	6	295611	295616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056972
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8602	NC_010524	GC	3	6	295773	295778	0 %	0 %	50 %	50 %	171056972
8603	NC_010524	CTG	2	6	295782	295787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056972
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8605	NC_010524	CTGG	2	8	295955	295962	0 %	25 %	50 %	25 %	171056972
8606	NC_010524	CGG	2	6	295970	295975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056972
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8614	NC_010524	GCT	3	9	296363	296371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056972
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8620	NC_010524	AGCG	2	8	296544	296551	25 %	0 %	50 %	25 %	171056972
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8744	NC_010524	GGC	2	6	300750	300755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056974
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8867	NC_010524	CGC	2	6	305283	305288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056979
8868	NC_010524	CAT	2	6	305298	305303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056979
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8873	NC_010524	GTC	2	6	305598	305603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056979
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8888	NC_010524	GCG	2	6	306228	306233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8985	NC_010524	TGC	2	6	310728	310733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056984
8986	NC_010524	CGC	4	12	310745	310756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056984
8987	NC_010524	TGA	2	6	310762	310767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056984
8988	NC_010524	GAG	2	6	310794	310799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056984
8989	NC_010524	CGC	2	6	310817	310822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056984
8990	NC_010524	CG	3	6	310847	310852	0 %	0 %	50 %	50 %	171056984
8991	NC_010524	GCGCC	2	10	310858	310867	0 %	0 %	40 %	60 %	171056984
8992	NC_010524	CGC	2	6	310868	310873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056984
8993	NC_010524	CCCCG	2	10	310885	310894	0 %	0 %	20 %	80 %	171056985
8994	NC_010524	CTG	2	6	310913	310918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056985
8995	NC_010524	CACGCT	2	12	310924	310935	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171056985
8996	NC_010524	CGG	2	6	310942	310947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056985
8997	NC_010524	GCT	3	9	310969	310977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056985
8998	NC_010524	GGT	2	6	311059	311064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056985
8999	NC_010524	GC	4	8	311099	311106	0 %	0 %	50 %	50 %	171056985
9000	NC_010524	GTC	2	6	311156	311161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056985

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