MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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89002	NC_010524	ATG	2	6	3182643	3182648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059569
89003	NC_010524	TTG	2	6	3182689	3182694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171059570
89004	NC_010524	CCG	3	9	3182801	3182809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059570
89005	NC_010524	GCC	2	6	3182828	3182833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059570
89006	NC_010524	CGA	2	6	3182919	3182924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059570
89007	NC_010524	GCG	2	6	3182964	3182969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059570
89008	NC_010524	CCG	2	6	3182975	3182980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059570
89009	NC_010524	TGACCG	2	12	3183017	3183028	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171059570
89010	NC_010524	CAT	2	6	3183060	3183065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059570
89011	NC_010524	GTC	2	6	3183136	3183141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059570
89012	NC_010524	ACC	2	6	3183155	3183160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059570
89013	NC_010524	CAG	2	6	3183214	3183219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059570
89014	NC_010524	GCC	2	6	3183229	3183234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059570
89015	NC_010524	GGC	2	6	3183340	3183345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059570
89016	NC_010524	CTT	2	6	3183352	3183357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059570
89017	NC_010524	GCG	2	6	3183457	3183462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059570
89018	NC_010524	TCG	2	6	3183467	3183472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059570
89019	NC_010524	CGAGGT	2	12	3183534	3183545	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171059570
89020	NC_010524	GTGCCG	2	12	3183626	3183637	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171059570
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89022	NC_010524	GC	3	6	3183679	3183684	0 %	0 %	50 %	50 %	171059570
89023	NC_010524	TGA	2	6	3183759	3183764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059570
89024	NC_010524	GCT	2	6	3183771	3183776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059570
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89026	NC_010524	CG	3	6	3183893	3183898	0 %	0 %	50 %	50 %	171059570
89027	NC_010524	CAG	2	6	3183910	3183915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059570
89028	NC_010524	TGG	2	6	3183927	3183932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059570
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89032	NC_010524	GC	3	6	3184062	3184067	0 %	0 %	50 %	50 %	171059570
89033	NC_010524	CGT	2	6	3184095	3184100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059570
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89036	NC_010524	GCG	2	6	3184321	3184326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059570
89037	NC_010524	TG	3	6	3184401	3184406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89038	NC_010524	GACA	2	8	3184429	3184436	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89039	NC_010524	GACA	2	8	3184449	3184456	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89040	NC_010524	GC	3	6	3184526	3184531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89041	NC_010524	TAG	2	6	3184547	3184552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89042	NC_010524	TCA	2	6	3184588	3184593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89043	NC_010524	TCG	2	6	3184663	3184668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059571
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89053	NC_010524	GC	3	6	3185070	3185075	0 %	0 %	50 %	50 %	171059571
89054	NC_010524	GC	3	6	3185244	3185249	0 %	0 %	50 %	50 %	171059571
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89059	NC_010524	CAA	2	6	3185556	3185561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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89091	NC_010524	GCC	2	6	3186702	3186707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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89093	NC_010524	CCG	2	6	3186751	3186756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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89102	NC_010524	GCCG	2	8	3187300	3187307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89103	NC_010524	GCG	2	6	3187308	3187313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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89108	NC_010524	CTC	2	6	3187438	3187443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171059574
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89465	NC_010524	CAG	2	6	3199951	3199956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059584
89466	NC_010524	GCC	2	6	3199963	3199968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059584
89467	NC_010524	GCG	2	6	3199969	3199974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059584
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89469	NC_010524	GAC	2	6	3199992	3199997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059584
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89477	NC_010524	GC	3	6	3200217	3200222	0 %	0 %	50 %	50 %	171059584
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89483	NC_010524	CTG	2	6	3200368	3200373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059584
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89487	NC_010524	CG	3	6	3200474	3200479	0 %	0 %	50 %	50 %	171059584
89488	NC_010524	GGCCG	2	10	3200499	3200508	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89489	NC_010524	CGG	2	6	3200562	3200567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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89491	NC_010524	GCG	2	6	3200583	3200588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89492	NC_010524	GC	3	6	3200600	3200605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89493	NC_010524	GAA	2	6	3200635	3200640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89494	NC_010524	CAC	2	6	3200650	3200655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89495	NC_010524	CGC	2	6	3200656	3200661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89496	NC_010524	ACC	2	6	3200687	3200692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059585
89497	NC_010524	C	6	6	3200696	3200701	0 %	0 %	0 %	100 %	171059585
89498	NC_010524	CGG	2	6	3200746	3200751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059585
89499	NC_010524	TGA	2	6	3200780	3200785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059585
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