MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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88502	NC_010524	CG	3	6	3163891	3163896	0 %	0 %	50 %	50 %	171059554
88503	NC_010524	CGA	2	6	3163899	3163904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059554
88504	NC_010524	CGGA	2	8	3163907	3163914	25 %	0 %	50 %	25 %	171059554
88505	NC_010524	CCA	2	6	3163990	3163995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059554
88506	NC_010524	CGC	2	6	3164034	3164039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059554
88507	NC_010524	GGC	2	6	3164063	3164068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059554
88508	NC_010524	CAG	2	6	3164077	3164082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059554
88509	NC_010524	GCA	2	6	3164094	3164099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059554
88510	NC_010524	CGAC	2	8	3164110	3164117	25 %	0 %	25 %	50 %	171059554
88511	NC_010524	CTT	2	6	3164135	3164140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059554
88512	NC_010524	CGGC	2	8	3164143	3164150	0 %	0 %	50 %	50 %	171059554
88513	NC_010524	AGC	2	6	3164156	3164161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059554
88514	NC_010524	GCC	2	6	3164199	3164204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059554
88515	NC_010524	GCT	2	6	3164213	3164218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059554
88516	NC_010524	GTC	2	6	3164237	3164242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059554
88517	NC_010524	GCG	2	6	3164258	3164263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059554
88518	NC_010524	GT	3	6	3164317	3164322	0 %	50 %	50 %	0 %	171059554
88519	NC_010524	GAA	2	6	3164359	3164364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171059555
88520	NC_010524	AAGG	2	8	3164410	3164417	50 %	0 %	50 %	0 %	171059555
88521	NC_010524	CGG	2	6	3164444	3164449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059555
88522	NC_010524	CAA	2	6	3164532	3164537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171059555
88523	NC_010524	GCA	2	6	3164603	3164608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059555
88524	NC_010524	GCT	2	6	3164613	3164618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059555
88525	NC_010524	CGC	2	6	3164648	3164653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059555
88526	NC_010524	ATG	2	6	3164677	3164682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059555
88527	NC_010524	CG	3	6	3164700	3164705	0 %	0 %	50 %	50 %	171059555
88528	NC_010524	CGG	2	6	3164715	3164720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059555
88529	NC_010524	CGC	2	6	3164807	3164812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059555
88530	NC_010524	GC	3	6	3164918	3164923	0 %	0 %	50 %	50 %	171059555
88531	NC_010524	ACC	2	6	3164981	3164986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88532	NC_010524	CAT	2	6	3165075	3165080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88533	NC_010524	TGTGT	2	10	3165101	3165110	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
88534	NC_010524	GTC	2	6	3165138	3165143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88535	NC_010524	CTG	2	6	3165252	3165257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88536	NC_010524	TC	3	6	3165271	3165276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88537	NC_010524	GGC	2	6	3165303	3165308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059556
88538	NC_010524	CG	3	6	3165335	3165340	0 %	0 %	50 %	50 %	171059556
88539	NC_010524	CGGC	2	8	3165358	3165365	0 %	0 %	50 %	50 %	171059556
88540	NC_010524	ATCG	2	8	3165395	3165402	25 %	25 %	25 %	25 %	171059556
88541	NC_010524	GCA	2	6	3165406	3165411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059556
88542	NC_010524	GC	3	6	3165460	3165465	0 %	0 %	50 %	50 %	171059556
88543	NC_010524	TGCG	2	8	3165528	3165535	0 %	25 %	50 %	25 %	171059556
88544	NC_010524	GC	3	6	3165577	3165582	0 %	0 %	50 %	50 %	171059556
88545	NC_010524	CGC	2	6	3165639	3165644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059556
88546	NC_010524	GC	3	6	3165653	3165658	0 %	0 %	50 %	50 %	171059556
88547	NC_010524	CG	3	6	3165691	3165696	0 %	0 %	50 %	50 %	171059556
88548	NC_010524	GCG	2	6	3165715	3165720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059556
88549	NC_010524	CCA	2	6	3165838	3165843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059556
88550	NC_010524	GCC	2	6	3165903	3165908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059556
88551	NC_010524	GCG	2	6	3165909	3165914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059556
88552	NC_010524	CAG	2	6	3165923	3165928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059556
88553	NC_010524	CGC	2	6	3165959	3165964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059556
88554	NC_010524	CAC	2	6	3165971	3165976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059556
88555	NC_010524	GGCC	2	8	3165979	3165986	0 %	0 %	50 %	50 %	171059556
88556	NC_010524	CAG	2	6	3166001	3166006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059556
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88558	NC_010524	CTG	2	6	3166094	3166099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059556
88559	NC_010524	CTT	2	6	3166112	3166117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059556
88560	NC_010524	GCA	2	6	3166129	3166134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059556
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88562	NC_010524	C	6	6	3166158	3166163	0 %	0 %	0 %	100 %	171059556
88563	NC_010524	GA	3	6	3166189	3166194	50 %	0 %	50 %	0 %	171059556
88564	NC_010524	GCA	2	6	3166242	3166247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059556
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88567	NC_010524	TCG	4	12	3166317	3166328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059556
88568	NC_010524	TCG	2	6	3166362	3166367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059556
88569	NC_010524	GTTC	2	8	3166453	3166460	0 %	50 %	25 %	25 %	171059557
88570	NC_010524	CGT	2	6	3166495	3166500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059557
88571	NC_010524	TGC	2	6	3166506	3166511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059557
88572	NC_010524	GCTC	2	8	3166518	3166525	0 %	25 %	25 %	50 %	171059557
88573	NC_010524	GGC	2	6	3166526	3166531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059557
88574	NC_010524	GCC	3	9	3166604	3166612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059557
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88576	NC_010524	GCC	2	6	3166661	3166666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059557
88577	NC_010524	CAG	2	6	3166682	3166687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059557
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88583	NC_010524	CG	3	6	3166896	3166901	0 %	0 %	50 %	50 %	171059557
88584	NC_010524	AGC	2	6	3166920	3166925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059557
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88587	NC_010524	GC	3	6	3167021	3167026	0 %	0 %	50 %	50 %	171059557
88588	NC_010524	TAC	3	9	3167027	3167035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059557
88589	NC_010524	CAG	2	6	3167072	3167077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059557
88590	NC_010524	GAG	2	6	3167111	3167116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171059557
88591	NC_010524	GGC	2	6	3167131	3167136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059557
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88593	NC_010524	GAC	2	6	3167171	3167176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059557
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88599	NC_010524	GCCA	2	8	3167295	3167302	25 %	0 %	25 %	50 %	171059558
88600	NC_010524	GCCTCG	2	12	3167310	3167321	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171059558
88601	NC_010524	CCA	2	6	3167326	3167331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059558
88602	NC_010524	GGC	2	6	3167359	3167364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059558
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88604	NC_010524	CAG	2	6	3167405	3167410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059558
88605	NC_010524	CCG	2	6	3167464	3167469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059558
88606	NC_010524	AGT	2	6	3167482	3167487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059558
88607	NC_010524	GCC	2	6	3167501	3167506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059558
88608	NC_010524	GC	3	6	3167528	3167533	0 %	0 %	50 %	50 %	171059558
88609	NC_010524	GCG	2	6	3167554	3167559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059558
88610	NC_010524	GCAC	2	8	3167581	3167588	25 %	0 %	25 %	50 %	171059558
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88612	NC_010524	CCGC	2	8	3167647	3167654	0 %	0 %	25 %	75 %	171059558
88613	NC_010524	GC	3	6	3167669	3167674	0 %	0 %	50 %	50 %	171059558
88614	NC_010524	GATCG	2	10	3167717	3167726	20 %	20 %	40 %	20 %	171059558
88615	NC_010524	GC	3	6	3167745	3167750	0 %	0 %	50 %	50 %	171059558
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88734	NC_010524	CGA	2	6	3171747	3171752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059562
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88847	NC_010524	CGG	2	6	3175295	3175300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059565
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