MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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87002	NC_010524	GCT	2	6	3108940	3108945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059503
87003	NC_010524	TCG	2	6	3108993	3108998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059503
87004	NC_010524	GGCC	2	8	3109048	3109055	0 %	0 %	50 %	50 %	171059503
87005	NC_010524	GAT	2	6	3109070	3109075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059503
87006	NC_010524	CGT	2	6	3109202	3109207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059503
87007	NC_010524	GAC	2	6	3109262	3109267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059503
87008	NC_010524	TCGA	2	8	3109272	3109279	25 %	25 %	25 %	25 %	171059503
87009	NC_010524	GCC	2	6	3109304	3109309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059503
87010	NC_010524	TTC	2	6	3109320	3109325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059503
87011	NC_010524	TCG	2	6	3109329	3109334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059503
87012	NC_010524	GGC	2	6	3109358	3109363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059503
87013	NC_010524	CGA	2	6	3109406	3109411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059503
87014	NC_010524	CG	3	6	3109420	3109425	0 %	0 %	50 %	50 %	171059503
87015	NC_010524	GAC	2	6	3109439	3109444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059503
87016	NC_010524	GCC	2	6	3109487	3109492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059503
87017	NC_010524	GCA	2	6	3109537	3109542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059503
87018	NC_010524	CGGT	2	8	3109554	3109561	0 %	25 %	50 %	25 %	171059503
87019	NC_010524	TCGA	2	8	3109626	3109633	25 %	25 %	25 %	25 %	171059503
87020	NC_010524	GAT	2	6	3109640	3109645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059503
87021	NC_010524	CAG	2	6	3109715	3109720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059503
87022	NC_010524	GCC	3	9	3109790	3109798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059503
87023	NC_010524	GCC	2	6	3109802	3109807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059503
87024	NC_010524	GCC	2	6	3109847	3109852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059503
87025	NC_010524	CTT	2	6	3109888	3109893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059503
87026	NC_010524	ATC	2	6	3110004	3110009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059503
87027	NC_010524	GC	3	6	3110053	3110058	0 %	0 %	50 %	50 %	171059503
87028	NC_010524	GCC	2	6	3110075	3110080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059503
87029	NC_010524	GAT	2	6	3110117	3110122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059503
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87031	NC_010524	GGTC	2	8	3110179	3110186	0 %	25 %	50 %	25 %	171059503
87032	NC_010524	GC	3	6	3110257	3110262	0 %	0 %	50 %	50 %	171059503
87033	NC_010524	AGT	2	6	3110266	3110271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059503
87034	NC_010524	GAT	3	9	3110291	3110299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059503
87035	NC_010524	GAT	2	6	3110312	3110317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059503
87036	NC_010524	GGAT	2	8	3110320	3110327	25 %	25 %	50 %	0 %	171059503
87037	NC_010524	GC	3	6	3110337	3110342	0 %	0 %	50 %	50 %	171059503
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87041	NC_010524	CGTG	2	8	3110507	3110514	0 %	25 %	50 %	25 %	171059504
87042	NC_010524	CTGG	2	8	3110565	3110572	0 %	25 %	50 %	25 %	171059504
87043	NC_010524	GTG	2	6	3110622	3110627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059504
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87052	NC_010524	GGCC	2	8	3111035	3111042	0 %	0 %	50 %	50 %	171059504
87053	NC_010524	TCG	2	6	3111076	3111081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059504
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87058	NC_010524	ACCGT	2	10	3111478	3111487	20 %	20 %	20 %	40 %	171059504
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87060	NC_010524	GCA	2	6	3111521	3111526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059504
87061	NC_010524	G	6	6	3111625	3111630	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87062	NC_010524	CGA	2	6	3111634	3111639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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87098	NC_010524	T	6	6	3113082	3113087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87099	NC_010524	CCTG	2	8	3113092	3113099	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87100	NC_010524	GCC	3	9	3113122	3113130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059507
87101	NC_010524	GCT	2	6	3113211	3113216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059507
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87233	NC_010524	GTA	2	6	3118173	3118178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059512
87234	NC_010524	TCG	2	6	3118186	3118191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059512
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87236	NC_010524	CGC	2	6	3118215	3118220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059512
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87317	NC_010524	CGGCC	2	10	3121390	3121399	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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87465	NC_010524	ACC	2	6	3126887	3126892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059521
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87467	NC_010524	CGC	2	6	3126934	3126939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059521
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87469	NC_010524	GGCG	2	8	3126954	3126961	0 %	0 %	75 %	25 %	171059521
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87473	NC_010524	CGA	2	6	3127032	3127037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059521
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87480	NC_010524	CG	3	6	3127275	3127280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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87496	NC_010524	CAGCT	2	10	3127880	3127889	20 %	20 %	20 %	40 %	171059523
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87498	NC_010524	GA	3	6	3127905	3127910	50 %	0 %	50 %	0 %	171059523
87499	NC_010524	GCCG	2	8	3127927	3127934	0 %	0 %	50 %	50 %	171059523
87500	NC_010524	TGCCGG	2	12	3128034	3128045	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171059523

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