MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
85501	NC_010524	GCT	2	6	3050818	3050823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059448
85502	NC_010524	CGG	2	6	3050878	3050883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059448
85503	NC_010524	CGGC	2	8	3050886	3050893	0 %	0 %	50 %	50 %	171059448
85504	NC_010524	ATC	2	6	3050966	3050971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059448
85505	NC_010524	GAAG	2	8	3051019	3051026	50 %	0 %	50 %	0 %	171059448
85506	NC_010524	GGA	2	6	3051049	3051054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171059448
85507	NC_010524	CGA	2	6	3051124	3051129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059448
85508	NC_010524	CGC	2	6	3051148	3051153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059448
85509	NC_010524	CTG	2	6	3051194	3051199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059448
85510	NC_010524	CGC	2	6	3051228	3051233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059448
85511	NC_010524	GGC	2	6	3051235	3051240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059448
85512	NC_010524	CGC	2	6	3051253	3051258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059448
85513	NC_010524	CCAGGC	2	12	3051277	3051288	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171059448
85514	NC_010524	TGA	2	6	3051309	3051314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059448
85515	NC_010524	TCA	2	6	3051354	3051359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059448
85516	NC_010524	GAA	2	6	3051368	3051373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171059448
85517	NC_010524	CGG	2	6	3051415	3051420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059448
85518	NC_010524	GAA	2	6	3051434	3051439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171059448
85519	NC_010524	TGC	2	6	3051513	3051518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059448
85520	NC_010524	CTT	2	6	3051550	3051555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059448
85521	NC_010524	CGA	2	6	3051556	3051561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059448
85522	NC_010524	GGC	2	6	3051571	3051576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059448
85523	NC_010524	AGC	2	6	3051597	3051602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059448
85524	NC_010524	GCA	2	6	3051625	3051630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059448
85525	NC_010524	CAG	2	6	3051635	3051640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059448
85526	NC_010524	CGG	2	6	3051664	3051669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059448
85527	NC_010524	CGG	2	6	3051711	3051716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059448
85528	NC_010524	CGC	2	6	3051717	3051722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059448
85529	NC_010524	ACGGCC	2	12	3051777	3051788	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171059448
85530	NC_010524	GCCAGG	2	12	3051792	3051803	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171059448
85531	NC_010524	GTG	2	6	3051833	3051838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059448
85532	NC_010524	GCC	2	6	3051888	3051893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059448
85533	NC_010524	TGGC	2	8	3051905	3051912	0 %	25 %	50 %	25 %	171059448
85534	NC_010524	GCG	3	9	3051949	3051957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85535	NC_010524	CGC	2	6	3051977	3051982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85536	NC_010524	GCA	2	6	3052020	3052025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059449
85537	NC_010524	CAG	2	6	3052063	3052068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059449
85538	NC_010524	TCG	2	6	3052082	3052087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059449
85539	NC_010524	GC	3	6	3052117	3052122	0 %	0 %	50 %	50 %	171059449
85540	NC_010524	GC	3	6	3052126	3052131	0 %	0 %	50 %	50 %	171059449
85541	NC_010524	CCA	2	6	3052161	3052166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059449
85542	NC_010524	GCG	2	6	3052182	3052187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059449
85543	NC_010524	CGAG	2	8	3052254	3052261	25 %	0 %	50 %	25 %	171059449
85544	NC_010524	GATCG	2	10	3052276	3052285	20 %	20 %	40 %	20 %	171059449
85545	NC_010524	CAG	2	6	3052405	3052410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059449
85546	NC_010524	GCC	2	6	3052420	3052425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059449
85547	NC_010524	GCC	2	6	3052433	3052438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059449
85548	NC_010524	TCGGC	2	10	3052539	3052548	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85549	NC_010524	CAA	2	6	3052572	3052577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85550	NC_010524	CGG	2	6	3052587	3052592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85551	NC_010524	GC	3	6	3052597	3052602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85552	NC_010524	AGGCC	2	10	3052627	3052636	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
85553	NC_010524	TGACC	2	10	3052665	3052674	20 %	20 %	20 %	40 %	171059450
85554	NC_010524	GGCG	2	8	3052713	3052720	0 %	0 %	75 %	25 %	171059450
85555	NC_010524	CTT	2	6	3052735	3052740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059450
85556	NC_010524	GC	3	6	3052751	3052756	0 %	0 %	50 %	50 %	171059450
85557	NC_010524	GCC	2	6	3052781	3052786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059450
85558	NC_010524	AGCC	2	8	3052790	3052797	25 %	0 %	25 %	50 %	171059450
85559	NC_010524	GCA	2	6	3052806	3052811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059450
85560	NC_010524	GCCGT	2	10	3052874	3052883	0 %	20 %	40 %	40 %	171059450
85561	NC_010524	CGATGC	2	12	3052932	3052943	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171059450
85562	NC_010524	GTTGAG	2	12	3052984	3052995	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	171059450
85563	NC_010524	GCA	2	6	3053025	3053030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059450
85564	NC_010524	CTG	2	6	3053035	3053040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059450
85565	NC_010524	TTC	2	6	3053087	3053092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059450
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85567	NC_010524	GCC	2	6	3053116	3053121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059450
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85569	NC_010524	TCGA	2	8	3053288	3053295	25 %	25 %	25 %	25 %	171059450
85570	NC_010524	GATGCC	2	12	3053305	3053316	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171059450
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85572	NC_010524	TCC	2	6	3053354	3053359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171059450
85573	NC_010524	TGA	2	6	3053370	3053375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059450
85574	NC_010524	GCAG	2	8	3053514	3053521	25 %	0 %	50 %	25 %	171059450
85575	NC_010524	GAGC	2	8	3053557	3053564	25 %	0 %	50 %	25 %	171059450
85576	NC_010524	GCC	2	6	3053569	3053574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059450
85577	NC_010524	GCA	2	6	3053622	3053627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059450
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85582	NC_010524	ACC	2	6	3053753	3053758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059450
85583	NC_010524	TCT	2	6	3053862	3053867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059450
85584	NC_010524	GTT	2	6	3053914	3053919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85585	NC_010524	GC	3	6	3053961	3053966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85586	NC_010524	GGC	2	6	3053982	3053987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059451
85587	NC_010524	ACG	2	6	3054034	3054039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059451
85588	NC_010524	GC	3	6	3054044	3054049	0 %	0 %	50 %	50 %	171059451
85589	NC_010524	GCC	2	6	3054072	3054077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059451
85590	NC_010524	GGCGCG	2	12	3054090	3054101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059451
85591	NC_010524	GCT	2	6	3054156	3054161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059451
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85594	NC_010524	GGCC	2	8	3054258	3054265	0 %	0 %	50 %	50 %	171059451
85595	NC_010524	GC	3	6	3054269	3054274	0 %	0 %	50 %	50 %	171059451
85596	NC_010524	GCC	2	6	3054283	3054288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059451
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85598	NC_010524	CG	3	6	3054326	3054331	0 %	0 %	50 %	50 %	171059451
85599	NC_010524	GCT	2	6	3054347	3054352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059451
85600	NC_010524	CAG	2	6	3054393	3054398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059451
85601	NC_010524	CAGC	2	8	3054471	3054478	25 %	0 %	25 %	50 %	171059451
85602	NC_010524	CGG	2	6	3054488	3054493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059451
85603	NC_010524	GCCA	2	8	3054549	3054556	25 %	0 %	25 %	50 %	171059451
85604	NC_010524	CTG	2	6	3054570	3054575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059451
85605	NC_010524	CA	3	6	3054614	3054619	50 %	0 %	0 %	50 %	171059451
85606	NC_010524	GCG	2	6	3054632	3054637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059451
85607	NC_010524	AGC	2	6	3054670	3054675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059451
85608	NC_010524	TCA	2	6	3054686	3054691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059451
85609	NC_010524	CG	3	6	3054697	3054702	0 %	0 %	50 %	50 %	171059452
85610	NC_010524	GC	3	6	3054726	3054731	0 %	0 %	50 %	50 %	171059452
85611	NC_010524	CCAGC	2	10	3054773	3054782	20 %	0 %	20 %	60 %	171059452
85612	NC_010524	CAG	2	6	3054815	3054820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059452
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85614	NC_010524	GCCG	2	8	3054916	3054923	0 %	0 %	50 %	50 %	171059452
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85616	NC_010524	ATG	2	6	3054939	3054944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059452
85617	NC_010524	CGGCG	2	10	3054946	3054955	0 %	0 %	60 %	40 %	171059452
85618	NC_010524	GTC	2	6	3054962	3054967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059452
85619	NC_010524	CAC	2	6	3054989	3054994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059452
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85621	NC_010524	GTA	2	6	3055022	3055027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059452
85622	NC_010524	GTC	2	6	3055028	3055033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059452
85623	NC_010524	GCC	2	6	3055147	3055152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059452
85624	NC_010524	TGA	2	6	3055228	3055233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059452
85625	NC_010524	GC	3	6	3055391	3055396	0 %	0 %	50 %	50 %	171059452
85626	NC_010524	CG	3	6	3055465	3055470	0 %	0 %	50 %	50 %	171059452
85627	NC_010524	TCA	2	6	3055477	3055482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059452
85628	NC_010524	TCGATC	2	12	3055623	3055634	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	171059452
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85630	NC_010524	CG	3	6	3055792	3055797	0 %	0 %	50 %	50 %	171059452
85631	NC_010524	TTG	2	6	3055848	3055853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171059452
85632	NC_010524	GCACGT	2	12	3055888	3055899	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171059452
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85635	NC_010524	TGC	2	6	3055939	3055944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059452
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85643	NC_010524	GGC	2	6	3056084	3056089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059452
85644	NC_010524	TCG	2	6	3056140	3056145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059452
85645	NC_010524	TGCCG	2	10	3056163	3056172	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85646	NC_010524	TTCC	2	8	3056301	3056308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85647	NC_010524	GCC	2	6	3056337	3056342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059453
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85681	NC_010524	GCAG	2	8	3057444	3057451	25 %	0 %	50 %	25 %	171059455
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85688	NC_010524	GCC	2	6	3057734	3057739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059456
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85692	NC_010524	CGT	2	6	3057923	3057928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059456
85693	NC_010524	CGT	2	6	3057976	3057981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059456
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85695	NC_010524	GC	3	6	3057989	3057994	0 %	0 %	50 %	50 %	171059456
85696	NC_010524	CG	3	6	3058001	3058006	0 %	0 %	50 %	50 %	171059456
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85711	NC_010524	TGA	3	9	3058402	3058410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059456
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85725	NC_010524	AG	3	6	3059062	3059067	50 %	0 %	50 %	0 %	171059456
85726	NC_010524	GCG	2	6	3059091	3059096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059456
85727	NC_010524	GCCGG	2	10	3059112	3059121	0 %	0 %	60 %	40 %	171059456
85728	NC_010524	GCG	2	6	3059140	3059145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059456
85729	NC_010524	CTG	2	6	3059157	3059162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059456
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85964	NC_010524	CGA	2	6	3067993	3067998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059465
85965	NC_010524	CGA	2	6	3068002	3068007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059465
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