MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_010524	GCCG	2	8	275958	275965	0 %	0 %	50 %	50 %	171056951
8002	NC_010524	TCG	2	6	275986	275991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056951
8003	NC_010524	GCT	2	6	276000	276005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056951
8004	NC_010524	CAGG	2	8	276012	276019	25 %	0 %	50 %	25 %	171056951
8005	NC_010524	CGG	2	6	276035	276040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056951
8006	NC_010524	GCC	2	6	276082	276087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056951
8007	NC_010524	GC	4	8	276114	276121	0 %	0 %	50 %	50 %	171056951
8008	NC_010524	GTC	2	6	276195	276200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056951
8009	NC_010524	GCA	2	6	276245	276250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056951
8010	NC_010524	CAC	3	9	276258	276266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056951
8011	NC_010524	CCG	2	6	276267	276272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056951
8012	NC_010524	GCC	2	6	276306	276311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056951
8013	NC_010524	GCA	2	6	276323	276328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056951
8014	NC_010524	CGG	2	6	276344	276349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056951
8015	NC_010524	GC	3	6	276392	276397	0 %	0 %	50 %	50 %	171056951
8016	NC_010524	CGC	2	6	276416	276421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056951
8017	NC_010524	GCA	2	6	276434	276439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056951
8018	NC_010524	CG	3	6	276442	276447	0 %	0 %	50 %	50 %	171056951
8019	NC_010524	GCT	2	6	276455	276460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056951
8020	NC_010524	CGAC	2	8	276470	276477	25 %	0 %	25 %	50 %	171056951
8021	NC_010524	TGG	2	6	276479	276484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056951
8022	NC_010524	CGG	2	6	276509	276514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056951
8023	NC_010524	CGA	2	6	276539	276544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056951
8024	NC_010524	GC	3	6	276595	276600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8025	NC_010524	CGC	2	6	276629	276634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8026	NC_010524	ATTGA	2	10	276677	276686	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_010524	GTG	2	6	276722	276727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056952
8028	NC_010524	TCG	2	6	276752	276757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056952
8029	NC_010524	CTG	2	6	276758	276763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056952
8030	NC_010524	CGA	2	6	276784	276789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056952
8031	NC_010524	CGGGC	2	10	276838	276847	0 %	0 %	60 %	40 %	171056952
8032	NC_010524	TCG	2	6	276858	276863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056952
8033	NC_010524	GCGCG	2	10	276931	276940	0 %	0 %	60 %	40 %	171056952
8034	NC_010524	GCGCAC	2	12	276970	276981	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056952
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8037	NC_010524	GCT	3	9	277045	277053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056952
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8042	NC_010524	CGA	2	6	277177	277182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056952
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8052	NC_010524	GCC	2	6	277444	277449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8053	NC_010524	TGA	2	6	277482	277487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056953
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8080	NC_010524	GACCC	2	10	278192	278201	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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8088	NC_010524	CGG	2	6	278602	278607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056954
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8090	NC_010524	GGT	2	6	278661	278666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056954
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8101	NC_010524	GCCG	2	8	279109	279116	0 %	0 %	50 %	50 %	171056955
8102	NC_010524	GC	3	6	279172	279177	0 %	0 %	50 %	50 %	171056955
8103	NC_010524	ACG	2	6	279186	279191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056955
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8121	NC_010524	CGA	2	6	279703	279708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056955
8122	NC_010524	GCT	2	6	279724	279729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056955
8123	NC_010524	TAC	2	6	279815	279820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056955
8124	NC_010524	CGA	2	6	279826	279831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056955
8125	NC_010524	CTA	2	6	279856	279861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056955
8126	NC_010524	GC	3	6	279870	279875	0 %	0 %	50 %	50 %	171056955
8127	NC_010524	TGG	2	6	279876	279881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056955
8128	NC_010524	GCGCC	2	10	279904	279913	0 %	0 %	40 %	60 %	171056955
8129	NC_010524	GCAGC	2	10	279952	279961	20 %	0 %	40 %	40 %	171056955
8130	NC_010524	GGC	2	6	279962	279967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056955
8131	NC_010524	CGC	2	6	279991	279996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056955
8132	NC_010524	GCA	2	6	280003	280008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056955
8133	NC_010524	CGA	2	6	280030	280035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056955
8134	NC_010524	GCC	2	6	280040	280045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056955
8135	NC_010524	CCG	2	6	280059	280064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056955
8136	NC_010524	GCT	2	6	280081	280086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056955
8137	NC_010524	CCG	2	6	280118	280123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056955
8138	NC_010524	GC	3	6	280145	280150	0 %	0 %	50 %	50 %	171056955
8139	NC_010524	TGC	2	6	280179	280184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056955
8140	NC_010524	GGC	2	6	280213	280218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056955
8141	NC_010524	CGA	2	6	280222	280227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056955
8142	NC_010524	GCT	2	6	280228	280233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056955
8143	NC_010524	GGC	2	6	280248	280253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056955
8144	NC_010524	CGA	2	6	280264	280269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056955
8145	NC_010524	CGG	2	6	280282	280287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056955
8146	NC_010524	GCCGCT	2	12	280297	280308	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171056955
8147	NC_010524	CTG	2	6	280331	280336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056955
8148	NC_010524	CGC	3	9	280418	280426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056955
8149	NC_010524	GCTG	2	8	280428	280435	0 %	25 %	50 %	25 %	171056955
8150	NC_010524	TCGC	2	8	280442	280449	0 %	25 %	25 %	50 %	171056955
8151	NC_010524	GCGG	2	8	280456	280463	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8152	NC_010524	CGT	2	6	280467	280472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8153	NC_010524	GGC	2	6	280555	280560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056956
8154	NC_010524	GCT	3	9	280561	280569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056956
8155	NC_010524	CTG	2	6	280574	280579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056956
8156	NC_010524	CGA	2	6	280585	280590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056956
8157	NC_010524	TCGA	2	8	280610	280617	25 %	25 %	25 %	25 %	171056956
8158	NC_010524	CCGCG	2	10	280732	280741	0 %	0 %	40 %	60 %	171056956
8159	NC_010524	GGC	2	6	280747	280752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056956
8160	NC_010524	CCG	2	6	280767	280772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056956
8161	NC_010524	GCCGCG	2	12	280784	280795	0 %	0 %	50 %	50 %	171056956
8162	NC_010524	CGA	2	6	280825	280830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056956
8163	NC_010524	CCG	2	6	280839	280844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056956
8164	NC_010524	GGC	2	6	280876	280881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056956
8165	NC_010524	GCC	2	6	280913	280918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056956
8166	NC_010524	GCG	2	6	280931	280936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056956
8167	NC_010524	GCCGG	2	10	280943	280952	0 %	0 %	60 %	40 %	171056956
8168	NC_010524	CCG	2	6	280962	280967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056956
8169	NC_010524	GCCG	2	8	280972	280979	0 %	0 %	50 %	50 %	171056956
8170	NC_010524	GGCG	2	8	281029	281036	0 %	0 %	75 %	25 %	171056956
8171	NC_010524	TCGG	2	8	281183	281190	0 %	25 %	50 %	25 %	171056956
8172	NC_010524	AGC	2	6	281225	281230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056956
8173	NC_010524	CCG	2	6	281244	281249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056956
8174	NC_010524	GAC	2	6	281281	281286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056956
8175	NC_010524	ATC	2	6	281291	281296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056956
8176	NC_010524	GCCC	2	8	281365	281372	0 %	0 %	25 %	75 %	171056956
8177	NC_010524	GCCA	2	8	281393	281400	25 %	0 %	25 %	50 %	171056956
8178	NC_010524	ATC	2	6	281411	281416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056956
8179	NC_010524	CTG	2	6	281420	281425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056956
8180	NC_010524	ACC	2	6	281426	281431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056956
8181	NC_010524	CGGC	2	8	281432	281439	0 %	0 %	50 %	50 %	171056956
8182	NC_010524	TCGA	2	8	281459	281466	25 %	25 %	25 %	25 %	171056956
8183	NC_010524	GGT	2	6	281512	281517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056956
8184	NC_010524	GTG	3	9	281525	281533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056956
8185	NC_010524	GCCGC	2	10	281572	281581	0 %	0 %	40 %	60 %	171056956
8186	NC_010524	CGCGC	2	10	281582	281591	0 %	0 %	40 %	60 %	171056956
8187	NC_010524	TGC	2	6	281637	281642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056956
8188	NC_010524	CG	3	6	281699	281704	0 %	0 %	50 %	50 %	171056956
8189	NC_010524	GC	3	6	281726	281731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8190	NC_010524	CG	3	6	281732	281737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8191	NC_010524	GCA	2	6	281778	281783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8192	NC_010524	TCG	2	6	281850	281855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056957
8193	NC_010524	GCT	2	6	281962	281967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056957
8194	NC_010524	CGA	2	6	281980	281985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056957
8195	NC_010524	GCC	2	6	282029	282034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056957
8196	NC_010524	ATG	2	6	282050	282055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056957
8197	NC_010524	CGC	2	6	282142	282147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056957
8198	NC_010524	GCG	2	6	282168	282173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056957
8199	NC_010524	ATC	2	6	282203	282208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056957
8200	NC_010524	GCC	2	6	282209	282214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056957
8201	NC_010524	CAT	2	6	282253	282258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056957
8202	NC_010524	ATG	2	6	282338	282343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056957
8203	NC_010524	CGC	2	6	282346	282351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056957
8204	NC_010524	GTG	2	6	282383	282388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056957
8205	NC_010524	GCC	2	6	282392	282397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056957
8206	NC_010524	CTG	2	6	282515	282520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056957
8207	NC_010524	GAAG	2	8	282565	282572	50 %	0 %	50 %	0 %	171056957
8208	NC_010524	CCG	2	6	282599	282604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056957
8209	NC_010524	CACG	2	8	282610	282617	25 %	0 %	25 %	50 %	171056957
8210	NC_010524	GCC	2	6	282634	282639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8211	NC_010524	GTT	2	6	282669	282674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8212	NC_010524	AGGTC	2	10	282684	282693	20 %	20 %	40 %	20 %	171056958
8213	NC_010524	GGC	2	6	282701	282706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056958
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8215	NC_010524	GC	3	6	282808	282813	0 %	0 %	50 %	50 %	171056958
8216	NC_010524	GGC	2	6	282858	282863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056958
8217	NC_010524	TCGATT	2	12	282922	282933	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	171056958
8218	NC_010524	CTT	2	6	283016	283021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056958
8219	NC_010524	TTC	2	6	283077	283082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056958
8220	NC_010524	ACC	2	6	283086	283091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056958
8221	NC_010524	CTC	2	6	283145	283150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056958
8222	NC_010524	GCG	2	6	283160	283165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056958
8223	NC_010524	GCA	2	6	283192	283197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056958
8224	NC_010524	TCG	2	6	283281	283286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056958
8225	NC_010524	TCG	2	6	283338	283343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056958
8226	NC_010524	GGCGAT	2	12	283373	283384	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171056958
8227	NC_010524	GCA	3	9	283390	283398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056958
8228	NC_010524	TGG	2	6	283399	283404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056958
8229	NC_010524	TCGG	2	8	283414	283421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8230	NC_010524	GCG	2	6	283464	283469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8231	NC_010524	CGGCG	2	10	283481	283490	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8232	NC_010524	GC	5	10	283512	283521	0 %	0 %	50 %	50 %	171056959
8233	NC_010524	GCCA	2	8	283523	283530	25 %	0 %	25 %	50 %	171056959
8234	NC_010524	CGGGC	2	10	283591	283600	0 %	0 %	60 %	40 %	171056959
8235	NC_010524	GCG	2	6	283604	283609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056959
8236	NC_010524	GCA	2	6	283617	283622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056959
8237	NC_010524	CAT	2	6	283642	283647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056959
8238	NC_010524	GCG	2	6	283678	283683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056959
8239	NC_010524	TCG	2	6	283694	283699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056959
8240	NC_010524	GCG	2	6	283723	283728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056959
8241	NC_010524	CG	3	6	283727	283732	0 %	0 %	50 %	50 %	171056959
8242	NC_010524	GCA	2	6	283737	283742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056959
8243	NC_010524	GCG	2	6	283814	283819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056959
8244	NC_010524	CAG	2	6	283825	283830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056959
8245	NC_010524	CG	3	6	283862	283867	0 %	0 %	50 %	50 %	171056959
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8309	NC_010524	C	7	7	285996	286002	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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8352	NC_010524	GCG	4	12	287531	287542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056964
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8359	NC_010524	GAT	2	6	287749	287754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056964
8360	NC_010524	GGTCG	2	10	287761	287770	0 %	20 %	60 %	20 %	171056964
8361	NC_010524	CAGC	2	8	287776	287783	25 %	0 %	25 %	50 %	171056964
8362	NC_010524	CCG	3	9	287825	287833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056964
8363	NC_010524	CGC	2	6	287838	287843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056964
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8365	NC_010524	GTC	2	6	287863	287868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056964
8366	NC_010524	GCC	2	6	287894	287899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056964
8367	NC_010524	CAT	2	6	287923	287928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056964
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8371	NC_010524	GC	3	6	288035	288040	0 %	0 %	50 %	50 %	171056964
8372	NC_010524	GC	3	6	288095	288100	0 %	0 %	50 %	50 %	171056964
8373	NC_010524	GTG	2	6	288133	288138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056964
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8382	NC_010524	GAGCC	2	10	288481	288490	20 %	0 %	40 %	40 %	171056964
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8424	NC_010524	GGC	2	6	290150	290155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8468	NC_010524	GAAATC	2	12	291325	291336	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	171056966
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8474	NC_010524	GCC	2	6	291647	291652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056968
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8478	NC_010524	AGACCG	2	12	291733	291744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056968
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8483	NC_010524	CGC	2	6	291916	291921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056968
8484	NC_010524	GC	3	6	291940	291945	0 %	0 %	50 %	50 %	171056968
8485	NC_010524	GGC	2	6	291955	291960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056968
8486	NC_010524	GCGG	2	8	291977	291984	0 %	0 %	75 %	25 %	171056968
8487	NC_010524	GTC	2	6	292019	292024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056968
8488	NC_010524	CG	4	8	292066	292073	0 %	0 %	50 %	50 %	171056968
8489	NC_010524	CG	3	6	292102	292107	0 %	0 %	50 %	50 %	171056968
8490	NC_010524	GCA	2	6	292120	292125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056968
8491	NC_010524	GGC	2	6	292163	292168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056968
8492	NC_010524	AGC	2	6	292194	292199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056968
8493	NC_010524	GCG	3	9	292236	292244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056968
8494	NC_010524	GCGCG	2	10	292285	292294	0 %	0 %	60 %	40 %	171056968
8495	NC_010524	GCT	2	6	292298	292303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056968
8496	NC_010524	ATC	2	6	292308	292313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056968
8497	NC_010524	CGA	2	6	292324	292329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056968
8498	NC_010524	AGG	2	6	292332	292337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056968
8499	NC_010524	CGG	2	6	292443	292448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056969
8500	NC_010524	CAG	2	6	292462	292467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056969

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