MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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84002	NC_010524	C	6	6	2998320	2998325	0 %	0 %	0 %	100 %	171059400
84003	NC_010524	TGC	2	6	2998351	2998356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059400
84004	NC_010524	CGTC	2	8	2998459	2998466	0 %	25 %	25 %	50 %	171059400
84005	NC_010524	CCGGCG	2	12	2998467	2998478	0 %	0 %	50 %	50 %	171059400
84006	NC_010524	ATCG	2	8	2998502	2998509	25 %	25 %	25 %	25 %	171059400
84007	NC_010524	GC	4	8	2998532	2998539	0 %	0 %	50 %	50 %	171059400
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84009	NC_010524	GCC	2	6	2998638	2998643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059400
84010	NC_010524	GCT	2	6	2998670	2998675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059400
84011	NC_010524	ATC	2	6	2998746	2998751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059400
84012	NC_010524	GAG	2	6	2998752	2998757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171059400
84013	NC_010524	GC	3	6	2998760	2998765	0 %	0 %	50 %	50 %	171059400
84014	NC_010524	GTG	2	6	2998782	2998787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059400
84015	NC_010524	GC	3	6	2998889	2998894	0 %	0 %	50 %	50 %	171059400
84016	NC_010524	GTGCG	2	10	2998930	2998939	0 %	20 %	60 %	20 %	171059400
84017	NC_010524	CACCGG	2	12	2999066	2999077	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171059400
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84020	NC_010524	CAT	2	6	2999102	2999107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059400
84021	NC_010524	CGG	2	6	2999117	2999122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059400
84022	NC_010524	CGA	2	6	2999147	2999152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059400
84023	NC_010524	CCGG	2	8	2999185	2999192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84024	NC_010524	GC	3	6	2999196	2999201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84025	NC_010524	GCA	2	6	2999233	2999238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059401
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84027	NC_010524	TCGG	2	8	2999298	2999305	0 %	25 %	50 %	25 %	171059401
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84116	NC_010524	AGC	2	6	3002259	3002264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059403
84117	NC_010524	TCG	2	6	3002295	3002300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059403
84118	NC_010524	ATCG	2	8	3002312	3002319	25 %	25 %	25 %	25 %	171059403
84119	NC_010524	CCCG	2	8	3002320	3002327	0 %	0 %	25 %	75 %	171059403
84120	NC_010524	CGC	2	6	3002344	3002349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059403
84121	NC_010524	GCGCC	2	10	3002357	3002366	0 %	0 %	40 %	60 %	171059403
84122	NC_010524	CCA	2	6	3002416	3002421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059403
84123	NC_010524	CTG	2	6	3002456	3002461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059403
84124	NC_010524	CTG	2	6	3002516	3002521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059403
84125	NC_010524	ACC	2	6	3002547	3002552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059403
84126	NC_010524	GCG	2	6	3002563	3002568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059403
84127	NC_010524	GCCG	2	8	3002573	3002580	0 %	0 %	50 %	50 %	171059403
84128	NC_010524	GCG	2	6	3002588	3002593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059403
84129	NC_010524	CGT	3	9	3002623	3002631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059403
84130	NC_010524	TGGC	2	8	3002703	3002710	0 %	25 %	50 %	25 %	171059403
84131	NC_010524	CAG	2	6	3002711	3002716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059403
84132	NC_010524	GCA	2	6	3002758	3002763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059403
84133	NC_010524	TGCAC	2	10	3002782	3002791	20 %	20 %	20 %	40 %	171059403
84134	NC_010524	GCCG	2	8	3002819	3002826	0 %	0 %	50 %	50 %	171059403
84135	NC_010524	CAG	2	6	3002858	3002863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059403
84136	NC_010524	GCT	2	6	3002887	3002892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059403
84137	NC_010524	CTCGGC	2	12	3002915	3002926	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171059403
84138	NC_010524	ATG	2	6	3002949	3002954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059403
84139	NC_010524	GCC	2	6	3002963	3002968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059403
84140	NC_010524	GCA	2	6	3002995	3003000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059403
84141	NC_010524	GC	4	8	3003001	3003008	0 %	0 %	50 %	50 %	171059403
84142	NC_010524	GC	3	6	3003014	3003019	0 %	0 %	50 %	50 %	171059403
84143	NC_010524	CCG	2	6	3003021	3003026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059403
84144	NC_010524	GCT	2	6	3003088	3003093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059403
84145	NC_010524	GC	3	6	3003099	3003104	0 %	0 %	50 %	50 %	171059403
84146	NC_010524	CAG	2	6	3003110	3003115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059403
84147	NC_010524	GCC	2	6	3003158	3003163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059403
84148	NC_010524	GCT	2	6	3003169	3003174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059403
84149	NC_010524	GC	3	6	3003189	3003194	0 %	0 %	50 %	50 %	171059403
84150	NC_010524	GCCC	2	8	3003202	3003209	0 %	0 %	25 %	75 %	171059403
84151	NC_010524	GCG	2	6	3003232	3003237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059403
84152	NC_010524	CG	3	6	3003262	3003267	0 %	0 %	50 %	50 %	171059403
84153	NC_010524	CG	4	8	3003286	3003293	0 %	0 %	50 %	50 %	171059403
84154	NC_010524	CGG	2	6	3003301	3003306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059403
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84156	NC_010524	CG	3	6	3003371	3003376	0 %	0 %	50 %	50 %	171059403
84157	NC_010524	GCT	2	6	3003412	3003417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059403
84158	NC_010524	CGG	2	6	3003493	3003498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059403
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84161	NC_010524	GC	3	6	3003622	3003627	0 %	0 %	50 %	50 %	171059403
84162	NC_010524	GCA	2	6	3003673	3003678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059403
84163	NC_010524	GGCA	2	8	3003714	3003721	25 %	0 %	50 %	25 %	171059403
84164	NC_010524	TCG	2	6	3003738	3003743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059403
84165	NC_010524	GGCC	2	8	3003765	3003772	0 %	0 %	50 %	50 %	171059403
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84168	NC_010524	GCC	2	6	3003909	3003914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059403
84169	NC_010524	GCA	2	6	3003991	3003996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059403
84170	NC_010524	CAG	2	6	3004045	3004050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059404
84171	NC_010524	CAG	2	6	3004075	3004080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059404
84172	NC_010524	ATG	2	6	3004100	3004105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059404
84173	NC_010524	GTGCC	2	10	3004110	3004119	0 %	20 %	40 %	40 %	171059404
84174	NC_010524	GCT	2	6	3004165	3004170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059404
84175	NC_010524	GCT	2	6	3004233	3004238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059404
84176	NC_010524	GCA	2	6	3004239	3004244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059404
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84181	NC_010524	CGG	2	6	3004347	3004352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059404
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84183	NC_010524	CAG	3	9	3004396	3004404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059404
84184	NC_010524	GCCA	2	8	3004406	3004413	25 %	0 %	25 %	50 %	171059404
84185	NC_010524	CAG	2	6	3004435	3004440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059404
84186	NC_010524	ACG	2	6	3004458	3004463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059404
84187	NC_010524	GAT	2	6	3004597	3004602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059404
84188	NC_010524	TGG	2	6	3004623	3004628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059404
84189	NC_010524	TGA	2	6	3004653	3004658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059404
84190	NC_010524	TCG	2	6	3004661	3004666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059404
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84193	NC_010524	GAA	2	6	3004744	3004749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171059404
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84196	NC_010524	TCG	2	6	3004802	3004807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059404
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84200	NC_010524	GGC	2	6	3004869	3004874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059404
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84202	NC_010524	GCC	2	6	3004901	3004906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059404
84203	NC_010524	ATC	2	6	3004964	3004969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059404
84204	NC_010524	TGG	2	6	3004974	3004979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059404
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84206	NC_010524	CAG	2	6	3005005	3005010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059404
84207	NC_010524	CGG	2	6	3005049	3005054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059404
84208	NC_010524	AGC	2	6	3005078	3005083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059404
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84210	NC_010524	CGTTG	2	10	3005145	3005154	0 %	40 %	40 %	20 %	171059404
84211	NC_010524	G	6	6	3005212	3005217	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84212	NC_010524	GGC	2	6	3005290	3005295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059405
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84215	NC_010524	CGA	2	6	3005455	3005460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059405
84216	NC_010524	GCT	2	6	3005464	3005469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059405
84217	NC_010524	GCG	2	6	3005622	3005627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059405
84218	NC_010524	ACGCC	2	10	3005661	3005670	20 %	0 %	20 %	60 %	171059405
84219	NC_010524	CCG	2	6	3005762	3005767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059405
84220	NC_010524	GCC	2	6	3005810	3005815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059405
84221	NC_010524	GCCGCT	2	12	3005845	3005856	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171059405
84222	NC_010524	GGC	2	6	3005860	3005865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059405
84223	NC_010524	CGG	3	9	3005868	3005876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059405
84224	NC_010524	GC	3	6	3005899	3005904	0 %	0 %	50 %	50 %	171059405
84225	NC_010524	CTG	2	6	3005917	3005922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059405
84226	NC_010524	CGAC	2	8	3005928	3005935	25 %	0 %	25 %	50 %	171059405
84227	NC_010524	TCG	2	6	3005948	3005953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059405
84228	NC_010524	CCG	2	6	3005972	3005977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059405
84229	NC_010524	CGC	2	6	3005994	3005999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059405
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84231	NC_010524	GCC	2	6	3006052	3006057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059405
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84342	NC_010524	GCT	2	6	3009474	3009479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059407
84343	NC_010524	CTGGA	2	10	3009489	3009498	20 %	20 %	40 %	20 %	171059407
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84345	NC_010524	CAG	2	6	3009576	3009581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059408
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