MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_010524	CG	3	6	260854	260859	0 %	0 %	50 %	50 %	171056933
7502	NC_010524	GC	3	6	260870	260875	0 %	0 %	50 %	50 %	171056933
7503	NC_010524	GGC	2	6	260881	260886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056933
7504	NC_010524	GCA	2	6	260887	260892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056933
7505	NC_010524	GCA	2	6	260944	260949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056933
7506	NC_010524	CCT	2	6	260971	260976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056933
7507	NC_010524	CGC	2	6	260977	260982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056933
7508	NC_010524	CCA	2	6	260995	261000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056933
7509	NC_010524	GTC	2	6	261008	261013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056933
7510	NC_010524	GCA	3	9	261025	261033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056933
7511	NC_010524	GTC	2	6	261062	261067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056933
7512	NC_010524	G	7	7	261115	261121	0 %	0 %	100 %	0 %	171056934
7513	NC_010524	CGA	2	6	261123	261128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056934
7514	NC_010524	CGC	2	6	261153	261158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056934
7515	NC_010524	GCC	2	6	261167	261172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056934
7516	NC_010524	CGC	2	6	261192	261197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056934
7517	NC_010524	GGCCG	2	10	261240	261249	0 %	0 %	60 %	40 %	171056934
7518	NC_010524	GGC	2	6	261260	261265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056934
7519	NC_010524	CGT	2	6	261276	261281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056934
7520	NC_010524	GTC	2	6	261307	261312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056934
7521	NC_010524	GGC	2	6	261319	261324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056934
7522	NC_010524	GCG	2	6	261338	261343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056934
7523	NC_010524	GTT	2	6	261361	261366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171056934
7524	NC_010524	CCT	2	6	261372	261377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056934
7525	NC_010524	CAC	2	6	261379	261384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056934
7526	NC_010524	GCC	2	6	261392	261397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056934
7527	NC_010524	CGGC	2	8	261420	261427	0 %	0 %	50 %	50 %	171056934
7528	NC_010524	GCG	2	6	261453	261458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056934
7529	NC_010524	GCC	2	6	261478	261483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056934
7530	NC_010524	CCAGGC	2	12	261507	261518	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056934
7531	NC_010524	GCG	2	6	261531	261536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056934
7532	NC_010524	GCCGC	2	10	261573	261582	0 %	0 %	40 %	60 %	171056934
7533	NC_010524	GCC	2	6	261599	261604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056934
7534	NC_010524	CGG	2	6	261615	261620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056934
7535	NC_010524	TCG	2	6	261692	261697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056934
7536	NC_010524	CG	3	6	261705	261710	0 %	0 %	50 %	50 %	171056934
7537	NC_010524	GCG	2	6	261718	261723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056934
7538	NC_010524	GTG	2	6	261736	261741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056934
7539	NC_010524	GC	3	6	261751	261756	0 %	0 %	50 %	50 %	171056934
7540	NC_010524	GCC	2	6	261797	261802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056934
7541	NC_010524	CCG	2	6	261828	261833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056934
7542	NC_010524	CGAT	2	8	261858	261865	25 %	25 %	25 %	25 %	171056934
7543	NC_010524	GGCG	2	8	261894	261901	0 %	0 %	75 %	25 %	171056934
7544	NC_010524	CGC	2	6	261909	261914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056934
7545	NC_010524	GTC	2	6	262039	262044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056934
7546	NC_010524	GC	3	6	262061	262066	0 %	0 %	50 %	50 %	171056934
7547	NC_010524	ACC	2	6	262082	262087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056934
7548	NC_010524	GCCC	2	8	262092	262099	0 %	0 %	25 %	75 %	171056934
7549	NC_010524	GCG	4	12	262122	262133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056934
7550	NC_010524	CG	3	6	262162	262167	0 %	0 %	50 %	50 %	171056934
7551	NC_010524	CGG	3	9	262183	262191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056934
7552	NC_010524	GCAC	2	8	262241	262248	25 %	0 %	25 %	50 %	171056934
7553	NC_010524	CAG	2	6	262273	262278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056934
7554	NC_010524	AGC	2	6	262322	262327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056934
7555	NC_010524	CTG	2	6	262390	262395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056934
7556	NC_010524	CAG	2	6	262399	262404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056934
7557	NC_010524	CAG	3	9	262435	262443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056934
7558	NC_010524	CGG	3	9	262483	262491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056934
7559	NC_010524	CGT	2	6	262498	262503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056934
7560	NC_010524	GCT	3	9	262543	262551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056934
7561	NC_010524	GCGT	2	8	262572	262579	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7562	NC_010524	CGCCGT	2	12	262587	262598	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7563	NC_010524	CGC	2	6	262667	262672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056935
7564	NC_010524	GCGCCG	2	12	262675	262686	0 %	0 %	50 %	50 %	171056935
7565	NC_010524	GCT	2	6	262710	262715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056935
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7567	NC_010524	CTGC	2	8	262778	262785	0 %	25 %	25 %	50 %	171056935
7568	NC_010524	GCTTCG	2	12	262793	262804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056935
7569	NC_010524	CGC	2	6	262821	262826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056935
7570	NC_010524	GCG	2	6	262849	262854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7571	NC_010524	CG	3	6	262899	262904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7572	NC_010524	CCT	2	6	262930	262935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7573	NC_010524	TGCTCG	2	12	262955	262966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056936
7574	NC_010524	GCC	2	6	262972	262977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056936
7575	NC_010524	GGC	2	6	262981	262986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056936
7576	NC_010524	GC	3	6	263028	263033	0 %	0 %	50 %	50 %	171056936
7577	NC_010524	GC	3	6	263036	263041	0 %	0 %	50 %	50 %	171056936
7578	NC_010524	GC	5	10	263049	263058	0 %	0 %	50 %	50 %	171056936
7579	NC_010524	GTC	2	6	263064	263069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056936
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7581	NC_010524	GC	4	8	263139	263146	0 %	0 %	50 %	50 %	171056936
7582	NC_010524	GC	4	8	263163	263170	0 %	0 %	50 %	50 %	171056936
7583	NC_010524	GTG	2	6	263194	263199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056936
7584	NC_010524	ACCAC	2	10	263219	263228	40 %	0 %	0 %	60 %	171056936
7585	NC_010524	TGC	2	6	263240	263245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056936
7586	NC_010524	GCCGCT	2	12	263259	263270	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171056936
7587	NC_010524	GTG	2	6	263271	263276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056936
7588	NC_010524	CGGC	2	8	263349	263356	0 %	0 %	50 %	50 %	171056936
7589	NC_010524	GTTC	2	8	263378	263385	0 %	50 %	25 %	25 %	171056936
7590	NC_010524	CGC	2	6	263453	263458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056936
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7592	NC_010524	GCG	2	6	263516	263521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056936
7593	NC_010524	TGA	2	6	263576	263581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056936
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7598	NC_010524	CG	4	8	263661	263668	0 %	0 %	50 %	50 %	171056936
7599	NC_010524	GCG	2	6	263690	263695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056936
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7603	NC_010524	GCT	2	6	263745	263750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056936
7604	NC_010524	CAA	2	6	263760	263765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171056936
7605	NC_010524	CGA	2	6	263781	263786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056936
7606	NC_010524	CGC	2	6	263792	263797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056936
7607	NC_010524	CGC	2	6	263800	263805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056936
7608	NC_010524	CGG	2	6	263816	263821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056936
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7610	NC_010524	ATCGAG	2	12	263845	263856	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	171056936
7611	NC_010524	CGAG	2	8	263871	263878	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7612	NC_010524	CCA	2	6	263944	263949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056937
7613	NC_010524	CCA	2	6	264035	264040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056937
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7617	NC_010524	CG	3	6	264171	264176	0 %	0 %	50 %	50 %	171056937
7618	NC_010524	GCG	2	6	264179	264184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056937
7619	NC_010524	ACG	2	6	264211	264216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056937
7620	NC_010524	CG	3	6	264292	264297	0 %	0 %	50 %	50 %	171056937
7621	NC_010524	CGG	2	6	264328	264333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056937
7622	NC_010524	CG	3	6	264365	264370	0 %	0 %	50 %	50 %	171056937
7623	NC_010524	AGG	2	6	264385	264390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056937
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7630	NC_010524	CGATG	2	10	264638	264647	20 %	20 %	40 %	20 %	171056937
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7741	NC_010524	CAG	2	6	268241	268246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056943
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7743	NC_010524	TGC	2	6	268266	268271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056943
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7987	NC_010524	CGC	2	6	275519	275524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056950
7988	NC_010524	GAC	2	6	275534	275539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056950
7989	NC_010524	ACC	2	6	275605	275610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056950
7990	NC_010524	GGT	2	6	275624	275629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056950
7991	NC_010524	GGC	2	6	275630	275635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056950
7992	NC_010524	GCC	2	6	275684	275689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056951
7993	NC_010524	CTG	2	6	275709	275714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056951
7994	NC_010524	GCA	2	6	275792	275797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056951
7995	NC_010524	GGT	2	6	275798	275803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056951
7996	NC_010524	CG	3	6	275843	275848	0 %	0 %	50 %	50 %	171056951
7997	NC_010524	GCA	2	6	275861	275866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056951
7998	NC_010524	GC	4	8	275884	275891	0 %	0 %	50 %	50 %	171056951
7999	NC_010524	GTT	2	6	275913	275918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171056951
8000	NC_010524	GCACCG	2	12	275936	275947	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056951

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