MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010524	TTC	2	6	227995	228000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056906
6502	NC_010524	CAG	2	6	228016	228021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056906
6503	NC_010524	CTTCG	2	10	228054	228063	0 %	40 %	20 %	40 %	171056907
6504	NC_010524	GCT	2	6	228073	228078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056907
6505	NC_010524	CGG	2	6	228089	228094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056907
6506	NC_010524	TCG	2	6	228112	228117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056907
6507	NC_010524	GGC	3	9	228171	228179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056907
6508	NC_010524	GC	4	8	228184	228191	0 %	0 %	50 %	50 %	171056907
6509	NC_010524	GGC	2	6	228216	228221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056907
6510	NC_010524	CGC	2	6	228242	228247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056907
6511	NC_010524	GCT	2	6	228311	228316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056907
6512	NC_010524	CAG	2	6	228363	228368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056907
6513	NC_010524	TGG	2	6	228421	228426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056907
6514	NC_010524	GCC	2	6	228552	228557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056907
6515	NC_010524	CTG	2	6	228561	228566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056907
6516	NC_010524	GTC	2	6	228651	228656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056907
6517	NC_010524	CGA	2	6	228659	228664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056907
6518	NC_010524	TTC	3	9	228676	228684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056907
6519	NC_010524	CGAG	2	8	228704	228711	25 %	0 %	50 %	25 %	171056907
6520	NC_010524	CAC	2	6	228753	228758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056907
6521	NC_010524	CTGGTA	2	12	228759	228770	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171056907
6522	NC_010524	TGC	2	6	228775	228780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056907
6523	NC_010524	GTT	2	6	228792	228797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171056907
6524	NC_010524	GGC	2	6	228840	228845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056907
6525	NC_010524	GC	3	6	228868	228873	0 %	0 %	50 %	50 %	171056907
6526	NC_010524	GCA	2	6	228926	228931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056907
6527	NC_010524	GC	3	6	228932	228937	0 %	0 %	50 %	50 %	171056907
6528	NC_010524	AGT	2	6	228953	228958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056907
6529	NC_010524	GAT	2	6	228972	228977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056907
6530	NC_010524	GGT	2	6	229031	229036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_010524	GCG	2	6	229070	229075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_010524	GC	3	6	229082	229087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6533	NC_010524	GACG	2	8	229112	229119	25 %	0 %	50 %	25 %	171056908
6534	NC_010524	GCG	2	6	229132	229137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056908
6535	NC_010524	GC	3	6	229161	229166	0 %	0 %	50 %	50 %	171056908
6536	NC_010524	GC	3	6	229184	229189	0 %	0 %	50 %	50 %	171056908
6537	NC_010524	CG	3	6	229190	229195	0 %	0 %	50 %	50 %	171056908
6538	NC_010524	CGA	2	6	229201	229206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056908
6539	NC_010524	CGG	2	6	229248	229253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056908
6540	NC_010524	GCG	2	6	229256	229261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056908
6541	NC_010524	CGGCG	2	10	229264	229273	0 %	0 %	60 %	40 %	171056908
6542	NC_010524	GCTGGC	2	12	229315	229326	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171056908
6543	NC_010524	GCCC	2	8	229361	229368	0 %	0 %	25 %	75 %	171056908
6544	NC_010524	GCC	2	6	229370	229375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056908
6545	NC_010524	GCA	2	6	229424	229429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056908
6546	NC_010524	GC	3	6	229454	229459	0 %	0 %	50 %	50 %	171056908
6547	NC_010524	CAGC	2	8	229460	229467	25 %	0 %	25 %	50 %	171056908
6548	NC_010524	GC	3	6	229481	229486	0 %	0 %	50 %	50 %	171056908
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6550	NC_010524	GCC	2	6	229543	229548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056908
6551	NC_010524	GCCGC	2	10	229550	229559	0 %	0 %	40 %	60 %	171056908
6552	NC_010524	AGC	2	6	229626	229631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056908
6553	NC_010524	GCC	2	6	229632	229637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056908
6554	NC_010524	GCC	2	6	229641	229646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056908
6555	NC_010524	GCCA	2	8	229665	229672	25 %	0 %	25 %	50 %	171056908
6556	NC_010524	GCCA	2	8	229674	229681	25 %	0 %	25 %	50 %	171056908
6557	NC_010524	AGCG	2	8	229749	229756	25 %	0 %	50 %	25 %	171056908
6558	NC_010524	CGC	2	6	229766	229771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056908
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6561	NC_010524	CGA	2	6	229996	230001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056909
6562	NC_010524	ACG	2	6	230069	230074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056909
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6564	NC_010524	GCG	2	6	230176	230181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056909
6565	NC_010524	GAC	2	6	230316	230321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056909
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6570	NC_010524	ATC	2	6	230548	230553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056909
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6572	NC_010524	GCA	2	6	230570	230575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056909
6573	NC_010524	GTG	2	6	230587	230592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056909
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6575	NC_010524	CGG	2	6	230624	230629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056909
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6577	NC_010524	GC	3	6	230667	230672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6578	NC_010524	CCGGCG	2	12	230702	230713	0 %	0 %	50 %	50 %	171056910
6579	NC_010524	GCG	2	6	230727	230732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056910
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6582	NC_010524	CAC	2	6	230853	230858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056910
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6584	NC_010524	CGC	2	6	230924	230929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056910
6585	NC_010524	CAT	2	6	230943	230948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056910
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6588	NC_010524	GCA	2	6	231056	231061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056910
6589	NC_010524	CAG	2	6	231069	231074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056910
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6591	NC_010524	TCG	2	6	231112	231117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056910
6592	NC_010524	CG	3	6	231132	231137	0 %	0 %	50 %	50 %	171056910
6593	NC_010524	ACG	2	6	231149	231154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056910
6594	NC_010524	CAG	3	9	231183	231191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056910
6595	NC_010524	TCG	2	6	231229	231234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056910
6596	NC_010524	TGTCT	2	10	231310	231319	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6597	NC_010524	GGC	2	6	231352	231357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_010524	T	6	6	231419	231424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_010524	CCCA	2	8	231473	231480	25 %	0 %	0 %	75 %	171056911
6600	NC_010524	CG	3	6	231497	231502	0 %	0 %	50 %	50 %	171056911
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6603	NC_010524	TGC	2	6	231669	231674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056911
6604	NC_010524	GCT	2	6	231682	231687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056911
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6607	NC_010524	GCT	2	6	231856	231861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056911
6608	NC_010524	GCC	2	6	231863	231868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056911
6609	NC_010524	TCG	2	6	231894	231899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056911
6610	NC_010524	ACC	2	6	231900	231905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056911
6611	NC_010524	ACACCT	2	12	231906	231917	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	171056911
6612	NC_010524	GC	3	6	231963	231968	0 %	0 %	50 %	50 %	171056911
6613	NC_010524	CAA	2	6	231988	231993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171056911
6614	NC_010524	ACG	2	6	232008	232013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056911
6615	NC_010524	TCGA	2	8	232025	232032	25 %	25 %	25 %	25 %	171056911
6616	NC_010524	TCG	2	6	232053	232058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056911
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6619	NC_010524	GCCA	2	8	232541	232548	25 %	0 %	25 %	50 %	171056911
6620	NC_010524	CCG	2	6	232569	232574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056911
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6622	NC_010524	CGG	2	6	232591	232596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056911
6623	NC_010524	GGT	2	6	232672	232677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056911
6624	NC_010524	GCC	2	6	232701	232706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056911
6625	NC_010524	CGG	2	6	232768	232773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056911
6626	NC_010524	CGG	2	6	232786	232791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056911
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6630	NC_010524	GTCG	2	8	232918	232925	0 %	25 %	50 %	25 %	171056911
6631	NC_010524	CGC	2	6	232930	232935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056911
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6635	NC_010524	TGC	2	6	233043	233048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056911
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6650	NC_010524	GCG	3	9	233497	233505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6865	NC_010524	GCA	2	6	240408	240413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056916
6866	NC_010524	CG	4	8	240419	240426	0 %	0 %	50 %	50 %	171056916
6867	NC_010524	TGC	2	6	240440	240445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056916
6868	NC_010524	GCCG	2	8	240483	240490	0 %	0 %	50 %	50 %	171056916
6869	NC_010524	CGA	2	6	240510	240515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056916
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6873	NC_010524	GC	4	8	240627	240634	0 %	0 %	50 %	50 %	171056916
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6877	NC_010524	CGACG	2	10	240813	240822	20 %	0 %	40 %	40 %	171056916
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6894	NC_010524	GTC	2	6	241477	241482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056917
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6921	NC_010524	CG	3	6	242227	242232	0 %	0 %	50 %	50 %	171056918
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6929	NC_010524	GCCG	2	8	242675	242682	0 %	0 %	50 %	50 %	171056918
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6944	NC_010524	GCT	2	6	243130	243135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056919
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6953	NC_010524	GC	5	10	243451	243460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6954	NC_010524	GC	4	8	243465	243472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6956	NC_010524	CCGT	2	8	243569	243576	0 %	25 %	25 %	50 %	171056920
6957	NC_010524	CGTG	2	8	243589	243596	0 %	25 %	50 %	25 %	171056920
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6962	NC_010524	ACG	2	6	243711	243716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056920
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6970	NC_010524	CTGG	2	8	244063	244070	0 %	25 %	50 %	25 %	171056920
6971	NC_010524	CG	3	6	244110	244115	0 %	0 %	50 %	50 %	171056920
6972	NC_010524	CGG	2	6	244117	244122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056920
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6975	NC_010524	CGGG	2	8	244141	244148	0 %	0 %	75 %	25 %	171056920
6976	NC_010524	GAG	2	6	244184	244189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056920
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6979	NC_010524	GAC	3	9	244295	244303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6980	NC_010524	GCGCC	2	10	244309	244318	0 %	0 %	40 %	60 %	171056920
6981	NC_010524	CGAGGC	2	12	244333	244344	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171056920
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6983	NC_010524	GAG	2	6	244391	244396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056920
6984	NC_010524	GCT	2	6	244423	244428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6985	NC_010524	GAC	2	6	244438	244443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6986	NC_010524	GAC	2	6	244486	244491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6987	NC_010524	GAT	2	6	244603	244608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056920
6988	NC_010524	ACA	2	6	244707	244712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171056920
6989	NC_010524	CAT	2	6	244735	244740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056920
6990	NC_010524	TGG	2	6	244797	244802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056920
6991	NC_010524	CGC	2	6	244917	244922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056920
6992	NC_010524	GCTG	2	8	244962	244969	0 %	25 %	50 %	25 %	171056920
6993	NC_010524	AGGACG	2	12	244992	245003	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	171056920
6994	NC_010524	GAG	2	6	245045	245050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056920
6995	NC_010524	CGC	2	6	245061	245066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056920
6996	NC_010524	GCC	2	6	245077	245082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056920
6997	NC_010524	CG	3	6	245083	245088	0 %	0 %	50 %	50 %	171056920
6998	NC_010524	GCT	2	6	245104	245109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6999	NC_010524	CGA	3	9	245140	245148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056920
7000	NC_010524	CG	3	6	245198	245203	0 %	0 %	50 %	50 %	171056920

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