MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lysinibacillus sphaericus C3-41 chromosome

Total Repeats: 104125

< Previous12...197198199200201202203204205206207208209Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
104001	NC_010382	GT	3	6	4634137	4634142	0 %	50 %	50 %	0 %	169830196
104002	NC_010382	GTT	2	6	4634195	4634200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169830196
104003	NC_010382	ATT	2	6	4634269	4634274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169830196
104004	NC_010382	GTG	3	9	4634280	4634288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830196
104005	NC_010382	GTT	2	6	4634355	4634360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169830196
104006	NC_010382	TTA	2	6	4634363	4634368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169830196
104007	NC_010382	AAT	3	9	4634395	4634403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830196
104008	NC_010382	TGT	2	6	4634425	4634430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169830196
104009	NC_010382	ACT	2	6	4634435	4634440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830196
104010	NC_010382	TAA	2	6	4634472	4634477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830196
104011	NC_010382	TTC	2	6	4634509	4634514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830196
104012	NC_010382	TTG	2	6	4634572	4634577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169830196
104013	NC_010382	ACG	2	6	4634711	4634716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830196
104014	NC_010382	ACC	2	6	4634731	4634736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830196
104015	NC_010382	ATGG	2	8	4634738	4634745	25 %	25 %	50 %	0 %	169830196
104016	NC_010382	GCA	2	6	4634816	4634821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830196
104017	NC_010382	TGCC	2	8	4634874	4634881	0 %	25 %	25 %	50 %	169830196
104018	NC_010382	TTG	2	6	4634889	4634894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169830196
104019	NC_010382	CTTT	2	8	4634911	4634918	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104020	NC_010382	AGC	2	6	4635061	4635066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830197
104021	NC_010382	CTT	2	6	4635186	4635191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830197
104022	NC_010382	CTC	2	6	4635208	4635213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169830197
104023	NC_010382	AG	4	8	4635219	4635226	50 %	0 %	50 %	0 %	169830197
104024	NC_010382	T	6	6	4635279	4635284	0 %	100 %	0 %	0 %	169830197
104025	NC_010382	ATA	2	6	4635305	4635310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830197
104026	NC_010382	CAG	2	6	4635357	4635362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830197
104027	NC_010382	ATA	2	6	4635390	4635395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830197
104028	NC_010382	TC	3	6	4635419	4635424	0 %	50 %	0 %	50 %	169830197
104029	NC_010382	CAA	2	6	4635447	4635452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169830197
104030	NC_010382	TCT	2	6	4635455	4635460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830197
104031	NC_010382	AGT	2	6	4635538	4635543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169830197
104032	NC_010382	AGA	2	6	4635598	4635603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830197
104033	NC_010382	TAA	2	6	4635687	4635692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830197
104034	NC_010382	CTA	2	6	4635720	4635725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830197
104035	NC_010382	TCT	2	6	4635743	4635748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830197
104036	NC_010382	CAT	3	9	4635750	4635758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830197
104037	NC_010382	TCCA	2	8	4635844	4635851	25 %	25 %	0 %	50 %	169830197
104038	NC_010382	CATT	2	8	4635867	4635874	25 %	50 %	0 %	25 %	169830197
104039	NC_010382	AAACC	2	10	4636026	4636035	60 %	0 %	0 %	40 %	169830197
104040	NC_010382	ATTT	2	8	4636045	4636052	25 %	75 %	0 %	0 %	169830197
104041	NC_010382	CTA	2	6	4636113	4636118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830197
104042	NC_010382	GTTT	2	8	4636123	4636130	0 %	75 %	25 %	0 %	169830197
104043	NC_010382	ACGA	2	8	4636246	4636253	50 %	0 %	25 %	25 %	169830197
104044	NC_010382	GCA	2	6	4636289	4636294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830197
104045	NC_010382	CCT	2	6	4636319	4636324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104046	NC_010382	TACT	2	8	4636362	4636369	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104047	NC_010382	AAC	2	6	4636432	4636437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104048	NC_010382	T	6	6	4636439	4636444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104049	NC_010382	CAA	2	6	4636459	4636464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104050	NC_010382	A	6	6	4636463	4636468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104051	NC_010382	A	7	7	4636487	4636493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104052	NC_010382	TATT	2	8	4636556	4636563	25 %	75 %	0 %	0 %	169830198
104053	NC_010382	TCAAGA	2	12	4636619	4636630	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	169830198
104054	NC_010382	ATT	2	6	4636652	4636657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169830198
104055	NC_010382	TTTC	2	8	4636658	4636665	0 %	75 %	0 %	25 %	169830198
104056	NC_010382	CTT	2	6	4636749	4636754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830198
104057	NC_010382	TTTA	2	8	4636813	4636820	25 %	75 %	0 %	0 %	169830198
104058	NC_010382	AGC	2	6	4636882	4636887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830198
104059	NC_010382	TAAG	2	8	4636981	4636988	50 %	25 %	25 %	0 %	169830198
104060	NC_010382	TCT	2	6	4637018	4637023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830198
104061	NC_010382	CAT	2	6	4637106	4637111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830198
104062	NC_010382	TTGT	2	8	4637122	4637129	0 %	75 %	25 %	0 %	169830198
104063	NC_010382	T	6	6	4637242	4637247	0 %	100 %	0 %	0 %	169830198
104064	NC_010382	CTT	2	6	4637250	4637255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830198
104065	NC_010382	CTT	2	6	4637319	4637324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830198
104066	NC_010382	GTT	2	6	4637327	4637332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169830198
104067	NC_010382	GTT	2	6	4637349	4637354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169830198
104068	NC_010382	ATA	2	6	4637440	4637445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830199
104069	NC_010382	ATAATG	2	12	4637462	4637473	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	169830199
104070	NC_010382	ATA	2	6	4637515	4637520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830199
104071	NC_010382	CAT	2	6	4637523	4637528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830199
104072	NC_010382	CTG	2	6	4637591	4637596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830199
104073	NC_010382	TGCAGG	2	12	4637607	4637618	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	169830199
104074	NC_010382	ATGTAG	2	12	4637657	4637668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169830199
104075	NC_010382	TCA	2	6	4637765	4637770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830199
104076	NC_010382	TCA	2	6	4637774	4637779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830199
104077	NC_010382	TTG	3	9	4637793	4637801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169830199
104078	NC_010382	CTT	2	6	4637826	4637831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830199
104079	NC_010382	T	7	7	4637867	4637873	0 %	100 %	0 %	0 %	169830199
104080	NC_010382	TTTG	2	8	4637881	4637888	0 %	75 %	25 %	0 %	169830199
104081	NC_010382	AAT	2	6	4637919	4637924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830199
104082	NC_010382	ATTC	2	8	4638011	4638018	25 %	50 %	0 %	25 %	169830199
104083	NC_010382	CTTT	2	8	4638031	4638038	0 %	75 %	0 %	25 %	169830199
104084	NC_010382	TAG	3	9	4638072	4638080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169830199
104085	NC_010382	TGT	2	6	4638112	4638117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169830199
104086	NC_010382	T	6	6	4638117	4638122	0 %	100 %	0 %	0 %	169830199
104087	NC_010382	CTT	2	6	4638127	4638132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104088	NC_010382	TCT	2	6	4638174	4638179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830200
104089	NC_010382	ACTG	2	8	4638186	4638193	25 %	25 %	25 %	25 %	169830200
104090	NC_010382	CAG	2	6	4638227	4638232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830200
104091	NC_010382	CTA	2	6	4638297	4638302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104092	NC_010382	GCC	2	6	4638555	4638560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830201
104093	NC_010382	ATA	2	6	4638573	4638578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830201
104094	NC_010382	ATC	2	6	4638602	4638607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830201
104095	NC_010382	ACA	2	6	4638735	4638740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169830201
104096	NC_010382	T	6	6	4638767	4638772	0 %	100 %	0 %	0 %	169830201
104097	NC_010382	ATC	2	6	4638788	4638793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830201
104098	NC_010382	TTC	3	9	4638795	4638803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830201
104099	NC_010382	T	6	6	4638815	4638820	0 %	100 %	0 %	0 %	169830201
104100	NC_010382	TTTC	2	8	4638823	4638830	0 %	75 %	0 %	25 %	169830201
104101	NC_010382	ATA	2	6	4638843	4638848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104102	NC_010382	A	7	7	4638889	4638895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104103	NC_010382	TTC	2	6	4638942	4638947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830202
104104	NC_010382	ACG	3	9	4638952	4638960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830202
104105	NC_010382	AGC	2	6	4638961	4638966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830202
104106	NC_010382	TGGT	2	8	4639039	4639046	0 %	50 %	50 %	0 %	169830202
104107	NC_010382	TA	3	6	4639061	4639066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104108	NC_010382	CCT	2	6	4639071	4639076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104109	NC_010382	AT	3	6	4639078	4639083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104110	NC_010382	TA	3	6	4639117	4639122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104111	NC_010382	ACT	2	6	4639194	4639199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104112	NC_010382	TCC	2	6	4639226	4639231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104113	NC_010382	A	6	6	4639234	4639239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104114	NC_010382	TAT	2	6	4639245	4639250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104115	NC_010382	ATT	2	6	4639254	4639259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104116	NC_010382	T	8	8	4639288	4639295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104117	NC_010382	T	7	7	4639327	4639333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104118	NC_010382	CAA	2	6	4639339	4639344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104119	NC_010382	TTG	2	6	4639475	4639480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104120	NC_010382	TCA	2	6	4639537	4639542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104121	NC_010382	T	8	8	4639628	4639635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104122	NC_010382	TAG	2	6	4639661	4639666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104123	NC_010382	AGA	2	6	4639679	4639684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104124	NC_010382	AAT	2	6	4639692	4639697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104125	NC_010382	A	6	6	4639717	4639722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...197198199200201202203204205206207208209Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.