MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 44176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_009513	A	6	6	1991502	1991507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44002	NC_009513	AGA	2	6	1991516	1991521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44003	NC_009513	CCT	2	6	1991542	1991547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44004	NC_009513	TGT	2	6	1991568	1991573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545137
44005	NC_009513	T	6	6	1991579	1991584	0 %	100 %	0 %	0 %	148545137
44006	NC_009513	TCA	2	6	1991605	1991610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545137
44007	NC_009513	AAG	2	6	1991650	1991655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545137
44008	NC_009513	ACG	2	6	1991676	1991681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545137
44009	NC_009513	ACCTT	2	10	1991689	1991698	20 %	40 %	0 %	40 %	148545137
44010	NC_009513	ATC	2	6	1991706	1991711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545137
44011	NC_009513	AAT	2	6	1991767	1991772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148545137
44012	NC_009513	CTT	2	6	1991780	1991785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545137
44013	NC_009513	GCAC	2	8	1991812	1991819	25 %	0 %	25 %	50 %	148545137
44014	NC_009513	TTC	2	6	1991856	1991861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545137
44015	NC_009513	GTT	2	6	1991935	1991940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545137
44016	NC_009513	AAG	2	6	1991967	1991972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545137
44017	NC_009513	AT	3	6	1992058	1992063	50 %	50 %	0 %	0 %	148545137
44018	NC_009513	CTT	2	6	1992066	1992071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545137
44019	NC_009513	AGT	2	6	1992164	1992169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545137
44020	NC_009513	CTT	2	6	1992176	1992181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545137
44021	NC_009513	TCT	2	6	1992314	1992319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545137
44022	NC_009513	AACTT	2	10	1992346	1992355	40 %	40 %	0 %	20 %	148545137
44023	NC_009513	AAT	2	6	1992388	1992393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148545137
44024	NC_009513	AGAA	2	8	1992411	1992418	75 %	0 %	25 %	0 %	148545137
44025	NC_009513	AAG	2	6	1992454	1992459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545137
44026	NC_009513	AAC	2	6	1992468	1992473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545137
44027	NC_009513	GTA	2	6	1992501	1992506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545137
44028	NC_009513	CTT	2	6	1992533	1992538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545137
44029	NC_009513	TCA	2	6	1992553	1992558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545137
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44031	NC_009513	GCT	2	6	1992580	1992585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545137
44032	NC_009513	TAT	2	6	1992641	1992646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148545137
44033	NC_009513	AACC	2	8	1992701	1992708	50 %	0 %	0 %	50 %	148545137
44034	NC_009513	AAC	2	6	1992753	1992758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545137
44035	NC_009513	TCA	2	6	1992781	1992786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545137
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44037	NC_009513	AAAG	2	8	1992894	1992901	75 %	0 %	25 %	0 %	148545137
44038	NC_009513	CTT	2	6	1992947	1992952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545137
44039	NC_009513	CTT	2	6	1992963	1992968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545137
44040	NC_009513	GAT	2	6	1992977	1992982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545137
44041	NC_009513	CAA	2	6	1993007	1993012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545137
44042	NC_009513	AAC	2	6	1993134	1993139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545137
44043	NC_009513	TTC	2	6	1993152	1993157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545137
44044	NC_009513	TG	3	6	1993200	1993205	0 %	50 %	50 %	0 %	148545137
44045	NC_009513	TTC	2	6	1993221	1993226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545137
44046	NC_009513	TTC	2	6	1993233	1993238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545137
44047	NC_009513	CAT	3	9	1993352	1993360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545137
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44049	NC_009513	T	7	7	1993412	1993418	0 %	100 %	0 %	0 %	148545137
44050	NC_009513	CAA	2	6	1993454	1993459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545137
44051	NC_009513	CAA	2	6	1993463	1993468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545137
44052	NC_009513	CA	3	6	1993472	1993477	50 %	0 %	0 %	50 %	148545137
44053	NC_009513	CTT	2	6	1993491	1993496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44054	NC_009513	TTA	2	6	1993539	1993544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44055	NC_009513	TAT	2	6	1993588	1993593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44056	NC_009513	ATA	2	6	1993614	1993619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44057	NC_009513	TTAC	2	8	1993677	1993684	25 %	50 %	0 %	25 %	148545138
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44059	NC_009513	GACG	2	8	1993709	1993716	25 %	0 %	50 %	25 %	148545138
44060	NC_009513	ATC	2	6	1993851	1993856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545138
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44062	NC_009513	ATC	2	6	1994103	1994108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545138
44063	NC_009513	GCTTG	2	10	1994109	1994118	0 %	40 %	40 %	20 %	148545138
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44070	NC_009513	GTC	2	6	1994325	1994330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545138
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44072	NC_009513	AT	3	6	1994344	1994349	50 %	50 %	0 %	0 %	148545138
44073	NC_009513	GCT	2	6	1994431	1994436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545138
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44087	NC_009513	TAA	2	6	1995164	1995169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148545138
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44091	NC_009513	GGC	2	6	1995516	1995521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545138
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44095	NC_009513	CAT	2	6	1995760	1995765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545139
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44097	NC_009513	TGG	2	6	1995804	1995809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545139
44098	NC_009513	CATTA	2	10	1995839	1995848	40 %	40 %	0 %	20 %	148545139
44099	NC_009513	GAT	3	9	1996016	1996024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545139
44100	NC_009513	GCT	2	6	1996027	1996032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545139
44101	NC_009513	ATTT	2	8	1996075	1996082	25 %	75 %	0 %	0 %	148545139
44102	NC_009513	ATCA	2	8	1996088	1996095	50 %	25 %	0 %	25 %	148545139
44103	NC_009513	GCG	2	6	1996113	1996118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545139
44104	NC_009513	CTG	2	6	1996183	1996188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545139
44105	NC_009513	TTGACA	2	12	1996215	1996226	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148545139
44106	NC_009513	TTC	2	6	1996229	1996234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545139
44107	NC_009513	GAT	2	6	1996334	1996339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545139
44108	NC_009513	AAG	2	6	1996388	1996393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545139
44109	NC_009513	GTT	2	6	1996405	1996410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545139
44110	NC_009513	GCT	2	6	1996419	1996424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545139
44111	NC_009513	TTC	2	6	1996451	1996456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545139
44112	NC_009513	CAT	2	6	1996462	1996467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545139
44113	NC_009513	GAC	2	6	1996642	1996647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545139
44114	NC_009513	GGTT	2	8	1996726	1996733	0 %	50 %	50 %	0 %	148545139
44115	NC_009513	GC	3	6	1996794	1996799	0 %	0 %	50 %	50 %	148545139
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.