MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 44176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_009513	ATG	2	6	1816966	1816971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544971
40003	NC_009513	TCT	2	6	1817053	1817058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544971
40004	NC_009513	CAC	2	6	1817071	1817076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544971
40005	NC_009513	TTC	2	6	1817079	1817084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544971
40006	NC_009513	GAA	2	6	1817105	1817110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544971
40007	NC_009513	ATT	2	6	1817117	1817122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544971
40008	NC_009513	AAG	2	6	1817187	1817192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544971
40009	NC_009513	AAT	2	6	1817322	1817327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544971
40010	NC_009513	ACA	2	6	1817338	1817343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544971
40011	NC_009513	GAA	2	6	1817376	1817381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544971
40012	NC_009513	CAT	2	6	1817435	1817440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544971
40013	NC_009513	TTG	2	6	1817446	1817451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544971
40014	NC_009513	AAC	2	6	1817467	1817472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544971
40015	NC_009513	CTGATG	2	12	1817485	1817496	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148544971
40016	NC_009513	AGC	2	6	1817552	1817557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544971
40017	NC_009513	TGC	2	6	1817657	1817662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544971
40018	NC_009513	AAG	2	6	1817721	1817726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544971
40019	NC_009513	TGT	2	6	1817753	1817758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544971
40020	NC_009513	AAG	2	6	1817763	1817768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544971
40021	NC_009513	TTG	2	6	1817842	1817847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544971
40022	NC_009513	GC	3	6	1817885	1817890	0 %	0 %	50 %	50 %	148544971
40023	NC_009513	CTT	2	6	1817927	1817932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544971
40024	NC_009513	AAG	2	6	1817949	1817954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544971
40025	NC_009513	ATG	2	6	1817986	1817991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544971
40026	NC_009513	CA	3	6	1818006	1818011	50 %	0 %	0 %	50 %	148544971
40027	NC_009513	TCG	2	6	1818052	1818057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544971
40028	NC_009513	CAG	2	6	1818127	1818132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544971
40029	NC_009513	TAC	2	6	1818193	1818198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40030	NC_009513	T	6	6	1818231	1818236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40031	NC_009513	ATA	2	6	1818237	1818242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40032	NC_009513	GAG	2	6	1818319	1818324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40033	NC_009513	GTT	2	6	1818362	1818367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544972
40034	NC_009513	ACCGTA	2	12	1818444	1818455	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148544972
40035	NC_009513	ATG	2	6	1818464	1818469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544972
40036	NC_009513	AAG	2	6	1818485	1818490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544972
40037	NC_009513	TCG	2	6	1818541	1818546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544972
40038	NC_009513	ATG	2	6	1818554	1818559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544972
40039	NC_009513	CGA	2	6	1818592	1818597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544972
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40041	NC_009513	TGG	2	6	1818637	1818642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148544972
40042	NC_009513	GGT	2	6	1818725	1818730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148544972
40043	NC_009513	GGT	2	6	1818767	1818772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148544972
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40045	NC_009513	TGC	2	6	1818817	1818822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544972
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40048	NC_009513	CGA	2	6	1818934	1818939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544972
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40050	NC_009513	TGA	2	6	1818979	1818984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544972
40051	NC_009513	TTG	2	6	1819035	1819040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544972
40052	NC_009513	CTG	2	6	1819047	1819052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544972
40053	NC_009513	GAC	2	6	1819082	1819087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544972
40054	NC_009513	TTG	2	6	1819101	1819106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544972
40055	NC_009513	GTG	2	6	1819122	1819127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148544972
40056	NC_009513	TGG	2	6	1819171	1819176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148544972
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40058	NC_009513	TTA	2	6	1819191	1819196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544972
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40061	NC_009513	AAG	2	6	1819298	1819303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544972
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40065	NC_009513	GAT	2	6	1819526	1819531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544972
40066	NC_009513	AAG	2	6	1819550	1819555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544972
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40068	NC_009513	GCT	2	6	1819625	1819630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544972
40069	NC_009513	TAC	2	6	1819637	1819642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544972
40070	NC_009513	ACT	2	6	1819695	1819700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544972
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40072	NC_009513	AAT	2	6	1819767	1819772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544972
40073	NC_009513	T	7	7	1819815	1819821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40074	NC_009513	AACAG	2	10	1819956	1819965	60 %	0 %	20 %	20 %	148544973
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40080	NC_009513	TGT	3	9	1820245	1820253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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40084	NC_009513	CAA	2	6	1820435	1820440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544974
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40088	NC_009513	TACCTA	2	12	1820646	1820657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544974
40089	NC_009513	TA	3	6	1820674	1820679	50 %	50 %	0 %	0 %	148544974
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40099	NC_009513	GCT	2	6	1820913	1820918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544974
40100	NC_009513	TGC	2	6	1820921	1820926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544974
40101	NC_009513	CTG	2	6	1820932	1820937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544974
40102	NC_009513	GAA	2	6	1820961	1820966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544974
40103	NC_009513	AAACT	2	10	1820995	1821004	60 %	20 %	0 %	20 %	148544974
40104	NC_009513	ATT	2	6	1821041	1821046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544974
40105	NC_009513	CT	3	6	1821055	1821060	0 %	50 %	0 %	50 %	148544974
40106	NC_009513	ACA	2	6	1821075	1821080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544974
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40108	NC_009513	CT	3	6	1821205	1821210	0 %	50 %	0 %	50 %	148544974
40109	NC_009513	ATT	2	6	1821236	1821241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544974
40110	NC_009513	TTA	2	6	1821273	1821278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544974
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40114	NC_009513	TGGA	2	8	1821482	1821489	25 %	25 %	50 %	0 %	148544974
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40116	NC_009513	ATT	2	6	1821507	1821512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544974
40117	NC_009513	CTG	2	6	1821523	1821528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544974
40118	NC_009513	GCA	2	6	1821537	1821542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544974
40119	NC_009513	CTG	2	6	1821550	1821555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544974
40120	NC_009513	TGC	2	6	1821560	1821565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544974
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40132	NC_009513	A	7	7	1822397	1822403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40133	NC_009513	TAT	2	6	1822414	1822419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40144	NC_009513	AT	3	6	1822945	1822950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40145	NC_009513	T	7	7	1822968	1822974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40147	NC_009513	AAT	2	6	1822999	1823004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40148	NC_009513	AATT	2	8	1823025	1823032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40149	NC_009513	TATAC	2	10	1823050	1823059	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40150	NC_009513	AT	3	6	1823086	1823091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40151	NC_009513	ATT	2	6	1823152	1823157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544976
40152	NC_009513	TCT	2	6	1823160	1823165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544976
40153	NC_009513	A	7	7	1823168	1823174	100 %	0 %	0 %	0 %	148544976
40154	NC_009513	CTT	2	6	1823183	1823188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544976
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40199	NC_009513	CT	3	6	1825068	1825073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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40225	NC_009513	GAT	2	6	1826447	1826452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544980
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40231	NC_009513	GAC	2	6	1826780	1826785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544980
40232	NC_009513	TTA	2	6	1826818	1826823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544980
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