MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 44176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_009513	TCA	2	6	1522099	1522104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544680
33502	NC_009513	TTTG	2	8	1522125	1522132	0 %	75 %	25 %	0 %	148544680
33503	NC_009513	GAC	2	6	1522196	1522201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544680
33504	NC_009513	TCTTGT	2	12	1522211	1522222	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148544680
33505	NC_009513	TTA	2	6	1522251	1522256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33506	NC_009513	TAAA	2	8	1522269	1522276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33507	NC_009513	AAT	2	6	1522286	1522291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33508	NC_009513	TTAC	2	8	1522301	1522308	25 %	50 %	0 %	25 %	148544681
33509	NC_009513	CCTT	2	8	1522317	1522324	0 %	50 %	0 %	50 %	148544681
33510	NC_009513	CAG	2	6	1522399	1522404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544681
33511	NC_009513	TAG	2	6	1522447	1522452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544681
33512	NC_009513	TCT	2	6	1522479	1522484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544681
33513	NC_009513	TTGAG	2	10	1522542	1522551	20 %	40 %	40 %	0 %	148544681
33514	NC_009513	ACCAAC	2	12	1522559	1522570	50 %	0 %	0 %	50 %	148544681
33515	NC_009513	CAA	2	6	1522597	1522602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544681
33516	NC_009513	TGT	2	6	1522615	1522620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544681
33517	NC_009513	AGT	2	6	1522634	1522639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544681
33518	NC_009513	TTA	2	6	1522659	1522664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544681
33519	NC_009513	CCT	2	6	1522845	1522850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33520	NC_009513	T	6	6	1522863	1522868	0 %	100 %	0 %	0 %	148544682
33521	NC_009513	CCA	2	6	1522892	1522897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544682
33522	NC_009513	AAC	2	6	1522927	1522932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544682
33523	NC_009513	AC	3	6	1523079	1523084	50 %	0 %	0 %	50 %	148544682
33524	NC_009513	GAT	2	6	1523086	1523091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544682
33525	NC_009513	CTTG	2	8	1523094	1523101	0 %	50 %	25 %	25 %	148544682
33526	NC_009513	ATC	2	6	1523104	1523109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544682
33527	NC_009513	T	6	6	1523141	1523146	0 %	100 %	0 %	0 %	148544682
33528	NC_009513	CTT	2	6	1523164	1523169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544682
33529	NC_009513	TCC	2	6	1523274	1523279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33530	NC_009513	T	7	7	1523289	1523295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33531	NC_009513	CTT	2	6	1523310	1523315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544683
33532	NC_009513	T	6	6	1523472	1523477	0 %	100 %	0 %	0 %	148544683
33533	NC_009513	CCT	2	6	1523493	1523498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33534	NC_009513	TTC	2	6	1523544	1523549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544684
33535	NC_009513	GTT	2	6	1523563	1523568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544684
33536	NC_009513	AAC	2	6	1523574	1523579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544684
33537	NC_009513	AATT	2	8	1523628	1523635	50 %	50 %	0 %	0 %	148544684
33538	NC_009513	TTAC	2	8	1523683	1523690	25 %	50 %	0 %	25 %	148544684
33539	NC_009513	CATA	2	8	1523747	1523754	50 %	25 %	0 %	25 %	148544684
33540	NC_009513	CAC	2	6	1523759	1523764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544684
33541	NC_009513	GATT	2	8	1523817	1523824	25 %	50 %	25 %	0 %	148544684
33542	NC_009513	TTC	2	6	1523871	1523876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544684
33543	NC_009513	TAG	2	6	1523903	1523908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544684
33544	NC_009513	AGT	2	6	1523972	1523977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544684
33545	NC_009513	TCAA	2	8	1523986	1523993	50 %	25 %	0 %	25 %	148544684
33546	NC_009513	TCC	2	6	1524052	1524057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33547	NC_009513	CTT	2	6	1524091	1524096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544685
33548	NC_009513	CTT	2	6	1524109	1524114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544685
33549	NC_009513	TTG	2	6	1524153	1524158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544685
33550	NC_009513	ATCA	2	8	1524163	1524170	50 %	25 %	0 %	25 %	148544685
33551	NC_009513	CCA	2	6	1524215	1524220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544685
33552	NC_009513	CTT	2	6	1524318	1524323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544685
33553	NC_009513	CCT	2	6	1524391	1524396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33554	NC_009513	GTC	2	6	1524453	1524458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544686
33555	NC_009513	GTT	2	6	1524516	1524521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544686
33556	NC_009513	TCA	2	6	1524541	1524546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544686
33557	NC_009513	ACA	2	6	1524595	1524600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544686
33558	NC_009513	AAC	2	6	1524609	1524614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544686
33559	NC_009513	CAA	2	6	1524662	1524667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544686
33560	NC_009513	ACC	2	6	1524702	1524707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544686
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33562	NC_009513	TTG	2	6	1524771	1524776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544686
33563	NC_009513	TCC	2	6	1524791	1524796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33564	NC_009513	AAT	2	6	1524826	1524831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33565	NC_009513	AGC	2	6	1524861	1524866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544687
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33567	NC_009513	GTT	2	6	1524957	1524962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544687
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33569	NC_009513	ATAG	2	8	1525008	1525015	50 %	25 %	25 %	0 %	148544687
33570	NC_009513	ACA	2	6	1525039	1525044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544687
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33573	NC_009513	TCC	2	6	1525126	1525131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33574	NC_009513	TTG	2	6	1525158	1525163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544688
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33579	NC_009513	ACC	2	6	1525702	1525707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544689
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33587	NC_009513	CAA	2	6	1526097	1526102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544690
33588	NC_009513	CTT	2	6	1526122	1526127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544690
33589	NC_009513	ACC	2	6	1526203	1526208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544690
33590	NC_009513	ATTC	2	8	1526444	1526451	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33591	NC_009513	AAC	2	6	1526467	1526472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544691
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33594	NC_009513	CTTA	2	8	1526819	1526826	25 %	50 %	0 %	25 %	148544692
33595	NC_009513	TCT	2	6	1526831	1526836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544692
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33598	NC_009513	TCT	2	6	1526905	1526910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544692
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33601	NC_009513	TGA	2	6	1527005	1527010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544692
33602	NC_009513	TCT	2	6	1527014	1527019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544692
33603	NC_009513	CTT	2	6	1527029	1527034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544692
33604	NC_009513	CTT	2	6	1527045	1527050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544692
33605	NC_009513	T	6	6	1527078	1527083	0 %	100 %	0 %	0 %	148544692
33606	NC_009513	CCT	2	6	1527107	1527112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33607	NC_009513	TA	3	6	1527129	1527134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33608	NC_009513	TG	3	6	1527198	1527203	0 %	50 %	50 %	0 %	148544693
33609	NC_009513	TCT	2	6	1527210	1527215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544693
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33611	NC_009513	CAC	3	9	1527279	1527287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544693
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33614	NC_009513	TAG	2	6	1527411	1527416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544693
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