MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 44176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_009513	AATCA	2	10	1498909	1498918	60 %	20 %	0 %	20 %	148544652
33002	NC_009513	CAG	2	6	1498929	1498934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544652
33003	NC_009513	AGT	2	6	1498972	1498977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544652
33004	NC_009513	TCCC	2	8	1499103	1499110	0 %	25 %	0 %	75 %	148544652
33005	NC_009513	TCA	2	6	1499135	1499140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544653
33006	NC_009513	AAC	2	6	1499151	1499156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544653
33007	NC_009513	ATTG	2	8	1499245	1499252	25 %	50 %	25 %	0 %	148544653
33008	NC_009513	GTT	2	6	1499256	1499261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544653
33009	NC_009513	TCA	2	6	1499272	1499277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544653
33010	NC_009513	TTC	2	6	1499346	1499351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544653
33011	NC_009513	CTT	2	6	1499376	1499381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544653
33012	NC_009513	AGA	2	6	1499391	1499396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544653
33013	NC_009513	TCAA	2	8	1499410	1499417	50 %	25 %	0 %	25 %	148544653
33014	NC_009513	AGT	2	6	1499510	1499515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544653
33015	NC_009513	ACG	2	6	1499640	1499645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544653
33016	NC_009513	TGG	2	6	1499709	1499714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148544653
33017	NC_009513	ATC	2	6	1499742	1499747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544653
33018	NC_009513	CCTT	2	8	1499752	1499759	0 %	50 %	0 %	50 %	148544653
33019	NC_009513	TCA	2	6	1499791	1499796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544653
33020	NC_009513	ACG	2	6	1499799	1499804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544653
33021	NC_009513	CCA	2	6	1499824	1499829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544653
33022	NC_009513	TTC	2	6	1499856	1499861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544653
33023	NC_009513	TTC	2	6	1499902	1499907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544653
33024	NC_009513	CTT	2	6	1499981	1499986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544653
33025	NC_009513	CTT	2	6	1500053	1500058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544653
33026	NC_009513	TACT	2	8	1500133	1500140	25 %	50 %	0 %	25 %	148544653
33027	NC_009513	TCT	2	6	1500163	1500168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544653
33028	NC_009513	TCT	2	6	1500200	1500205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544653
33029	NC_009513	TTCAAT	2	12	1500216	1500227	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148544653
33030	NC_009513	CAT	2	6	1500233	1500238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544653
33031	NC_009513	AGT	2	6	1500296	1500301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544653
33032	NC_009513	TGG	2	6	1500322	1500327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148544653
33033	NC_009513	ACGA	2	8	1500369	1500376	50 %	0 %	25 %	25 %	148544653
33034	NC_009513	TTG	2	6	1500521	1500526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544653
33035	NC_009513	CCT	2	6	1500551	1500556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148544654
33036	NC_009513	TCT	2	6	1500567	1500572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544654
33037	NC_009513	TGTT	2	8	1500619	1500626	0 %	75 %	25 %	0 %	148544654
33038	NC_009513	GAT	2	6	1500643	1500648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544654
33039	NC_009513	CAG	2	6	1500687	1500692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544654
33040	NC_009513	CAT	2	6	1500825	1500830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544654
33041	NC_009513	GAC	2	6	1500867	1500872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544654
33042	NC_009513	TTA	2	6	1500887	1500892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544654
33043	NC_009513	CAT	2	6	1500900	1500905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544654
33044	NC_009513	CAG	2	6	1500912	1500917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544654
33045	NC_009513	AG	3	6	1500920	1500925	50 %	0 %	50 %	0 %	148544654
33046	NC_009513	CCG	2	6	1500943	1500948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148544654
33047	NC_009513	CTT	2	6	1500954	1500959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544654
33048	NC_009513	GAACGA	2	12	1500974	1500985	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148544654
33049	NC_009513	CAG	2	6	1501014	1501019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544654
33050	NC_009513	AGA	2	6	1501060	1501065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544654
33051	NC_009513	GTA	2	6	1501087	1501092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544654
33052	NC_009513	GT	3	6	1501112	1501117	0 %	50 %	50 %	0 %	148544654
33053	NC_009513	ACTT	2	8	1501123	1501130	25 %	50 %	0 %	25 %	148544654
33054	NC_009513	CAA	2	6	1501134	1501139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544654
33055	NC_009513	AGC	2	6	1501168	1501173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544654
33056	NC_009513	CTT	2	6	1501182	1501187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544654
33057	NC_009513	CTT	2	6	1501287	1501292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544654
33058	NC_009513	TCA	2	6	1501316	1501321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544654
33059	NC_009513	TGA	2	6	1501329	1501334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544654
33060	NC_009513	CAA	2	6	1501342	1501347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544654
33061	NC_009513	ACC	2	6	1501489	1501494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544654
33062	NC_009513	CAG	4	12	1501536	1501547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544654
33063	NC_009513	ACC	2	6	1501549	1501554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544654
33064	NC_009513	GAA	2	6	1501556	1501561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544654
33065	NC_009513	CCA	2	6	1501562	1501567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544654
33066	NC_009513	GAT	2	6	1501625	1501630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544654
33067	NC_009513	TCA	2	6	1501643	1501648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544654
33068	NC_009513	CAA	2	6	1501695	1501700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544654
33069	NC_009513	AGC	2	6	1501744	1501749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544654
33070	NC_009513	CGT	2	6	1501750	1501755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544654
33071	NC_009513	TGA	2	6	1501881	1501886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544654
33072	NC_009513	ATT	2	6	1502012	1502017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544654
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33074	NC_009513	CTT	2	6	1502096	1502101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544655
33075	NC_009513	AAT	2	6	1502220	1502225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544655
33076	NC_009513	TTG	2	6	1502304	1502309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544655
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33082	NC_009513	AT	3	6	1502621	1502626	50 %	50 %	0 %	0 %	148544656
33083	NC_009513	AGT	2	6	1502665	1502670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544656
33084	NC_009513	GAA	2	6	1502743	1502748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544656
33085	NC_009513	TCA	2	6	1502786	1502791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544656
33086	NC_009513	GTT	2	6	1502810	1502815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544656
33087	NC_009513	CTA	2	6	1502867	1502872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544656
33088	NC_009513	ACC	2	6	1502911	1502916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544656
33089	NC_009513	AACTA	2	10	1502917	1502926	60 %	20 %	0 %	20 %	148544656
33090	NC_009513	TTGT	2	8	1502938	1502945	0 %	75 %	25 %	0 %	148544656
33091	NC_009513	T	6	6	1502983	1502988	0 %	100 %	0 %	0 %	148544656
33092	NC_009513	GAC	2	6	1503030	1503035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544656
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33096	NC_009513	CCAATC	2	12	1503113	1503124	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148544656
33097	NC_009513	TTC	2	6	1503175	1503180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544656
33098	NC_009513	TTG	2	6	1503184	1503189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544656
33099	NC_009513	CTT	2	6	1503214	1503219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544656
33100	NC_009513	ACT	2	6	1503289	1503294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544656
33101	NC_009513	CTT	2	6	1503306	1503311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544656
33102	NC_009513	TTG	2	6	1503327	1503332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544656
33103	NC_009513	GAC	2	6	1503506	1503511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544656
33104	NC_009513	TCC	2	6	1503514	1503519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148544656
33105	NC_009513	ATG	2	6	1503528	1503533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544656
33106	NC_009513	GCA	2	6	1503560	1503565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544656
33107	NC_009513	T	8	8	1503576	1503583	0 %	100 %	0 %	0 %	148544656
33108	NC_009513	TCC	2	6	1503608	1503613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148544657
33109	NC_009513	TAC	2	6	1503681	1503686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544657
33110	NC_009513	CAGT	2	8	1503804	1503811	25 %	25 %	25 %	25 %	148544657
33111	NC_009513	ACT	2	6	1503812	1503817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544657
33112	NC_009513	CCATT	2	10	1503824	1503833	20 %	40 %	0 %	40 %	148544657
33113	NC_009513	AATT	2	8	1503904	1503911	50 %	50 %	0 %	0 %	148544657
33114	NC_009513	AAC	2	6	1503913	1503918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544657
33115	NC_009513	TTG	2	6	1503957	1503962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544657
33116	NC_009513	AGC	2	6	1504048	1504053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544657
33117	NC_009513	ATA	2	6	1504086	1504091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544657
33118	NC_009513	ATT	2	6	1504105	1504110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544657
33119	NC_009513	TAT	2	6	1504116	1504121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544657
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33122	NC_009513	CAT	2	6	1504212	1504217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544657
33123	NC_009513	AATT	2	8	1504219	1504226	50 %	50 %	0 %	0 %	148544657
33124	NC_009513	AAT	2	6	1504246	1504251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544657
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33134	NC_009513	CAA	2	6	1504755	1504760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544657
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33142	NC_009513	AACT	2	8	1505215	1505222	50 %	25 %	0 %	25 %	148544657
33143	NC_009513	TGT	2	6	1505312	1505317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544657
33144	NC_009513	TTC	2	6	1505338	1505343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544657
33145	NC_009513	CTC	2	6	1505415	1505420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148544657
33146	NC_009513	GTTGG	2	10	1505427	1505436	0 %	40 %	60 %	0 %	148544657
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33150	NC_009513	CTT	2	6	1505598	1505603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544657
33151	NC_009513	CTCAT	2	10	1505639	1505648	20 %	40 %	0 %	40 %	148544657
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33174	NC_009513	TTC	2	6	1506910	1506915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544658
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33182	NC_009513	TAAC	2	8	1507230	1507237	50 %	25 %	0 %	25 %	148544658
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33186	NC_009513	CTT	2	6	1507446	1507451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544658
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33190	NC_009513	T	6	6	1507620	1507625	0 %	100 %	0 %	0 %	148544658
33191	NC_009513	ACG	2	6	1507633	1507638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544658
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33193	NC_009513	TTG	2	6	1507739	1507744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544658
33194	NC_009513	TTC	2	6	1507786	1507791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544658
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33196	NC_009513	TAA	2	6	1507855	1507860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544658
33197	NC_009513	TCAT	2	8	1507898	1507905	25 %	50 %	0 %	25 %	148544658
33198	NC_009513	TAA	2	6	1507912	1507917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544658
33199	NC_009513	CT	3	6	1507947	1507952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33200	NC_009513	CGC	2	6	1508154	1508159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148544659
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33208	NC_009513	CAT	2	6	1508382	1508387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544659
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33212	NC_009513	ATTG	2	8	1508813	1508820	25 %	50 %	25 %	0 %	148544659
33213	NC_009513	CAT	2	6	1508826	1508831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544659
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33216	NC_009513	ATAA	2	8	1508998	1509005	75 %	25 %	0 %	0 %	148544659
33217	NC_009513	AGTT	2	8	1509031	1509038	25 %	50 %	25 %	0 %	148544659
33218	NC_009513	TCAT	2	8	1509047	1509054	25 %	50 %	0 %	25 %	148544659
33219	NC_009513	GCCT	2	8	1509130	1509137	0 %	25 %	25 %	50 %	148544659
33220	NC_009513	AAT	2	6	1509181	1509186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544659
33221	NC_009513	TAC	2	6	1509195	1509200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544659
33222	NC_009513	TTA	2	6	1509239	1509244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544660
33223	NC_009513	TAT	2	6	1509265	1509270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544660
33224	NC_009513	TAA	2	6	1509407	1509412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544660
33225	NC_009513	ATC	2	6	1509443	1509448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544660
33226	NC_009513	GTT	2	6	1509507	1509512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544660
33227	NC_009513	CAG	2	6	1509535	1509540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544660
33228	NC_009513	TGA	2	6	1509638	1509643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544660
33229	NC_009513	T	6	6	1509796	1509801	0 %	100 %	0 %	0 %	148544660
33230	NC_009513	TA	3	6	1509849	1509854	50 %	50 %	0 %	0 %	148544661
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33232	NC_009513	CTT	2	6	1509918	1509923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544661
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33350	NC_009513	TGC	2	6	1514896	1514901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544667
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