MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 44176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_009513	CTT	3	9	1364592	1364600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544541
30003	NC_009513	CTT	2	6	1364661	1364666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544541
30004	NC_009513	TAT	2	6	1364667	1364672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544541
30005	NC_009513	TCT	2	6	1364778	1364783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544541
30006	NC_009513	CATA	2	8	1364805	1364812	50 %	25 %	0 %	25 %	148544541
30007	NC_009513	AGG	2	6	1364816	1364821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148544541
30008	NC_009513	CTT	2	6	1364841	1364846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544541
30009	NC_009513	TCT	2	6	1364892	1364897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544541
30010	NC_009513	ACT	2	6	1364969	1364974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544541
30011	NC_009513	CTT	2	6	1365000	1365005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544541
30012	NC_009513	GAAC	2	8	1365037	1365044	50 %	0 %	25 %	25 %	148544541
30013	NC_009513	TTG	2	6	1365123	1365128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544541
30014	NC_009513	TTCC	2	8	1365235	1365242	0 %	50 %	0 %	50 %	148544541
30015	NC_009513	TGCAT	2	10	1365383	1365392	20 %	40 %	20 %	20 %	148544541
30016	NC_009513	T	6	6	1365404	1365409	0 %	100 %	0 %	0 %	148544541
30017	NC_009513	TCT	2	6	1365411	1365416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544541
30018	NC_009513	TTC	2	6	1365427	1365432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544541
30019	NC_009513	TAA	2	6	1365505	1365510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544541
30020	NC_009513	AAT	2	6	1365565	1365570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544541
30021	NC_009513	GTG	2	6	1365606	1365611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148544541
30022	NC_009513	TCA	2	6	1365656	1365661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544541
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30024	NC_009513	AAT	2	6	1365702	1365707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544541
30025	NC_009513	CAC	2	6	1365729	1365734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544541
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30029	NC_009513	CAT	2	6	1365930	1365935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544541
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30031	NC_009513	TAG	2	6	1366020	1366025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544541
30032	NC_009513	GTT	2	6	1366031	1366036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544541
30033	NC_009513	TCA	2	6	1366088	1366093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544541
30034	NC_009513	ACT	2	6	1366163	1366168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544541
30035	NC_009513	CTT	2	6	1366195	1366200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544541
30036	NC_009513	ATT	2	6	1366205	1366210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544541
30037	NC_009513	TATC	2	8	1366249	1366256	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30038	NC_009513	TGT	2	6	1366306	1366311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30039	NC_009513	TATTC	2	10	1366343	1366352	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30040	NC_009513	ACG	2	6	1366386	1366391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30041	NC_009513	ATT	2	6	1366402	1366407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30042	NC_009513	ATTT	2	8	1366425	1366432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30043	NC_009513	TAT	2	6	1366442	1366447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30044	NC_009513	TAA	2	6	1366505	1366510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30045	NC_009513	ATT	2	6	1366531	1366536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30046	NC_009513	TTA	2	6	1366539	1366544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30047	NC_009513	A	7	7	1366544	1366550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30048	NC_009513	AAGC	2	8	1366651	1366658	50 %	0 %	25 %	25 %	148544542
30049	NC_009513	ATG	2	6	1366675	1366680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544542
30050	NC_009513	TGC	2	6	1366688	1366693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544542
30051	NC_009513	GCT	2	6	1366756	1366761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544542
30052	NC_009513	AAGT	2	8	1366766	1366773	50 %	25 %	25 %	0 %	148544542
30053	NC_009513	CAA	2	6	1366778	1366783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544542
30054	NC_009513	GTTA	2	8	1366791	1366798	25 %	50 %	25 %	0 %	148544542
30055	NC_009513	AT	3	6	1366803	1366808	50 %	50 %	0 %	0 %	148544542
30056	NC_009513	ATT	2	6	1366813	1366818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544542
30057	NC_009513	TAT	2	6	1366842	1366847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544542
30058	NC_009513	ATT	2	6	1366876	1366881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544542
30059	NC_009513	TTG	2	6	1366945	1366950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544542
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30061	NC_009513	TG	3	6	1367057	1367062	0 %	50 %	50 %	0 %	148544542
30062	NC_009513	TCT	2	6	1367141	1367146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544542
30063	NC_009513	TTAT	2	8	1367149	1367156	25 %	75 %	0 %	0 %	148544542
30064	NC_009513	TATT	2	8	1367165	1367172	25 %	75 %	0 %	0 %	148544542
30065	NC_009513	ATT	2	6	1367245	1367250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544542
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30071	NC_009513	ATT	2	6	1367473	1367478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544542
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30078	NC_009513	ACT	2	6	1368035	1368040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30079	NC_009513	T	6	6	1368058	1368063	0 %	100 %	0 %	0 %	148544543
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30083	NC_009513	AGAA	2	8	1368393	1368400	75 %	0 %	25 %	0 %	148544543
30084	NC_009513	TTG	2	6	1368417	1368422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544543
30085	NC_009513	TAT	2	6	1368550	1368555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544543
30086	NC_009513	A	6	6	1368651	1368656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30087	NC_009513	A	6	6	1368670	1368675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30088	NC_009513	TTTAAT	2	12	1368685	1368696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30089	NC_009513	ATGT	2	8	1368726	1368733	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30090	NC_009513	TGA	2	6	1368833	1368838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30091	NC_009513	AGA	2	6	1368851	1368856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30092	NC_009513	ATG	2	6	1368910	1368915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30093	NC_009513	A	6	6	1368935	1368940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30094	NC_009513	TTAGC	2	10	1368999	1369008	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30095	NC_009513	CTAA	2	8	1369125	1369132	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30096	NC_009513	GGT	2	6	1369135	1369140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30097	NC_009513	GAT	2	6	1369156	1369161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30098	NC_009513	ACC	2	6	1369199	1369204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30099	NC_009513	TAA	2	6	1369222	1369227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30100	NC_009513	GT	3	6	1369287	1369292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30101	NC_009513	TAG	2	6	1369339	1369344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30102	NC_009513	ACC	2	6	1369429	1369434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30103	NC_009513	CCG	2	6	1369518	1369523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30104	NC_009513	AC	3	6	1369524	1369529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30105	NC_009513	TA	3	6	1369584	1369589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30106	NC_009513	GGA	2	6	1369608	1369613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30107	NC_009513	TCC	2	6	1369674	1369679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30108	NC_009513	AAC	2	6	1369759	1369764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30109	NC_009513	CAT	2	6	1369811	1369816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30110	NC_009513	ATG	2	6	1369822	1369827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30111	NC_009513	ACT	2	6	1369944	1369949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30112	NC_009513	CAT	2	6	1370009	1370014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30113	NC_009513	CAC	2	6	1370015	1370020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30114	NC_009513	CTAT	2	8	1370067	1370074	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30115	NC_009513	CACTTC	2	12	1370150	1370161	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
30116	NC_009513	TCA	2	6	1370175	1370180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30117	NC_009513	ATCTC	2	10	1370218	1370227	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30118	NC_009513	CATA	2	8	1370271	1370278	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30119	NC_009513	AAC	2	6	1370303	1370308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30120	NC_009513	ACG	2	6	1370406	1370411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30121	NC_009513	ACC	2	6	1370601	1370606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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30153	NC_009513	TTAA	2	8	1373072	1373079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30365	NC_009513	AGTTGA	2	12	1382597	1382608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544551
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30372	NC_009513	CA	3	6	1382857	1382862	50 %	0 %	0 %	50 %	148544551
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30500	NC_009513	CCT	2	6	1387581	1387586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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